【答案解析】(1)基本原理：在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得能真实、完整地反映蛋白质与DNA相互作用的信息。
(2)基本过程：甲醛处理细胞，使DNA和蛋白质固定在交联状态→超声或酶法等处理，获得一定长度范围内的染色质小片段→加入目的蛋白的抗体，与靶蛋白-DNA复合物相互结合→加入ProteinA，结合抗体-靶蛋白-DNA复合物，并沉淀→对沉淀下来的复合物进行清洗，除去一些非特异性结合→得到富集的靶蛋白-DNA复合物→解除交联，对纯化富集的DNA-片断进行PCR检测与分析，获得蛋白质与DNA相互作用的信息。