问答题
SH3区约由60个氨基酸组成，存在于许多不同的蛋白质中——包括非受体酪氨酸激酶的Src、Abl和Sem5，Scm5是线虫信号转导中的小接头蛋白。同SH2一样，SH3区可识别并结合其他蛋白质中的结构基序。
为鉴定出与SH3区结合的结构基序，可构建SH3的氨基酸顺序区域与谷光甘肽-S转移酶(GST)的融合蛋白，从而可在细菌中得到大量的融合蛋白。你要用纯化的生物素标记GST-SH3融合蛋白，从E.coli表达的cDNA文库中筛选(用生物素标记的GST-SH3融合蛋白检测固定在虑膜上的能与它相互作用的蛋白的方法灵敏度高)。为了作一对照，可用生物素标记GST来同时探测两张同样的膜。
从文库中筛选分离到两个不同的克隆，分别命名为3BP-1、3BP-2，进一步的分析证明这些克隆均编码与SH3区结合的蛋白质，且这些蛋白质与SH3结合的区域是在一富含脯氨酸的短序列内。
【正确答案】这样做是为了挑除一些不合要求的克隆，其编码的蛋白质或能结合到融合蛋白的GST蛋白上，或能结合到生物素标记上。而你所需要的是能结合到生物素标记上的GST-SH3上的克隆或噬菌体。
【答案解析】
【正确答案】这种方法不能用于寻找结合的SH2区蛋白。理由是这种结合要求靶蛋白携带一个磷酸化了的酪氨酸残基。在这种方法中靶蛋白在E.coli中表达出来，而大肠杆菌中没有磷酸化修饰所需的酪氨酸激酶。有一种解决方式是先将滤膜与酪氨酸蛋白激酶和ATP温育，或者往E.coli内导入一酪氨酸蛋白激酶使之在cDNA文库被表达的同时启动表达。
【答案解析】
【正确答案】多亚基酶中短蛋白质序列间相互作用与亚基相互作用的主要区别在于其稳定性和可逆性，这很大程度上依赖于它们构型中弱链的数量和凝聚力。亚基之间较大的结合区产生非常稳定的结构，大部分情况下短片段识别是短暂的，某些特定的情况下如同SH2区与含磷酸化酪氨酸蛋白间的作用。
【答案解析】