埃博拉病毒属丝状病毒科，为单股负链RNA病毒，长约19kb，分子量约为4.6x10⁶，病毒长度差并很大，平均长度为300~1500nm，最长可达14000nm。病毒有螺旋状核衣壳，外有包膜，形态多样，呈分支形、“U”形、“6”形或环形等，以分支形最为多见。