摘要
目的 通过研究肽脱甲酰酶与配基相互作用,来模拟化合物的活性的规律,为设计酶抑制剂提供理论基础。方法 采用分子对接方法得到肽脱甲酰酶(1bs8)与两个典型配体(act和ro06)的对接结构,然后用分子动力学方法对复合结构分别进行了50ps的模拟。结果 Act和ro06与受体的相互作用总能量分别为-70.552和-50.198(kcal/mol),其中,范德华作用力分辨为-46.848和-38.148(kcal/mol),静电相互作用力分别为-23.704和-12.050(kcal/mol)。