基于机器学习的miRNA靶基因预测算法研究概况
摘要
首先小结目前所发现的miRNA:mRNA对的统计特征,然后对基于机器学习的各类靶基因预测算法逐一作研究,最后对现有靶基因预测算法的研究现状及优缺点给出系统的结论。
出处
《软件导刊》
2011年第12期47-48,共2页
Software Guide
参考文献3
-
1S SINHA,E VAN NIMWEGEN,E D SIGGIA.A probabilistic methodto detect regulatory modules[].Bioinformatics.2003
-
2G. L. Papadopoulos,M. Reczko,V. A. Simossis, et al.The database of experimentally supported targets: a functional update of TarBase[].Nucleic Acids Research.2008
-
3G Paris,D Robilliard,C Fonlupt.Applying Boosting Techniques to Genetic Programming[].Lecture Notes in Computer Science.2002
-
1高松,秦殿刚,冯铁男,马成荣,王翼飞.二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用[J].应用科学学报,2010,28(3):307-312. 被引量：5
-
2张俊鹏,孙少平,贺建峰,马磊.miRNA研究的计算机方法[J].计算机应用与软件,2012,29(1):159-163. 被引量：2
-
3张洪礼,赵培培,王常武,王宝文,刘文远.偏置判别SVM预测microRNA靶基因[J].燕山大学学报,2013,37(2):153-158.
-
4徐宝林,于大川,高冬,张浩,刘元宁.siRNA序列特征的RNA干扰效率预测的新方法[J].吉林大学学报（信息科学版）,2011,29(5):436-443. 被引量：3
-
5徐海军,印遇龙,孔祥峰,黄瑞林.基因网络中基因关系图谱的构建及其应用(英文)[J].生物信息学,2008,6(2):75-79.
-
6Paula H.Reyes~Herrera,Elisa Ficarra.One Decade of Development and Evolution of MicroRNA Target Prediction Algorithms[J].Genomics, Proteomics & Bioinformatics,2012,10(5):254-263. 被引量：1
-
7高永珍,金奇.RNA干扰抗病毒研究进展[J].病毒学报,2005,21(4):314-317. 被引量：6
-
8孙秋凤.microRNA计算识别中的模式识别技术[J].计算机技术与发展,2010,20(6):97-100.
-
9沈哲旎,罗志娟.RNA干扰及其抗病毒应用的可行性探讨[J].生命科学,2006,18(1):41-44. 被引量：2
-
10彭杰军,燕飞,陈海如,陈剑平.Dicer结构和功能研究进展[J].遗传,2008,30(12):1550-1556. 被引量：7
