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一个与水稻直立穗基因qPE9-1关联的InDel标记的设计与验证 被引量:4

Development and Application for a Functional Marker for Erect Panicle Gene qPE9-1 of Rice
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摘要 水稻穗型是重要的农艺性状,也是水稻高产的重要决定因素之一。本研究根据水稻弯曲穗品种与直立穗品种在直立穗基因qpe9-1第5外显子处存在的核苷酸差异设计了1对插入-缺失标记(Insert/Delection),InDel-E5。利用该功能标记对24份水稻品种资源材料及直立穗分离群体F2进行标记基因型分析,研究结果表明,直立穗品种均表现为缺失带型,弯曲穗品种均表现为非缺失带型,F2群体中杂合带型和非缺失带型均为弯曲穗,而缺失带型均为直立穗,说明利用该标记可以快速、准确的鉴定出直立穗品种和单株。 Rice plant architecture is an important agronomic trait and a major determinant in high productivity. In this study, one InDel marker, InDel-ES, was designed based on the difference of extron 5 between curved panicle gene qPE9-1 and erect panicle qpe9-1.24 rice varieties and F2 segregated populations were detected for genotype analysis using InDel-E5 marker. The results showed that InDel-E5 was cosegregated with the rice panicle erectness, allowing to identify the homozygous erect panicle genotype, homozygous curved panicle genotype and heterozygous curved panicle genotype individuals. Therefore, InDel-E5 can be used to determined rice panicle genotype rapidly and exactly.
出处 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期583-588,共6页 Molecular Plant Breeding
基金 国家与江苏省粮食丰产科技工程(2011BAD16B03/BE2009425) 江苏省农业科技自主创新基金(CX[11]4020)共同资助
关键词 水稻 直立穗 弯曲穗 功能标记 Rice, Erect panicle, Curved panicle, Functional marker
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