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二维分子动力学程序(MDP)的并行与优化 被引量:6

PARALLELIZATION AND OPTIMIZATION FOR A TWO DIMENSIONAL MOLECULAR DYNAMICS CODE(MDP)
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摘要 基于消息传递并行程序设计平台MPI ,结合当前微处理器的高性能特征 ,探讨了二维分子动力学数值模拟程序的优化和并行 ,且具体应用到高速碰撞物理模型问题。其中 ,串行优化的性能提高了两倍 ,并行效率在由 8台高性能微机构成的微机机群上 ,均大于 90 %。 On the basis of the message passing parallel programming platform MPI,and with the high performance characteristics of contemporary microprocessors,it describes the parallelization and optimization for a two dimensional molecular dynamics code(MDP) to simulate the high speed collision physical model problems.The serial optimization has shown to be of double performance improvements,and the parallel efficiencies being above 90% under the cluster consisted of 8 Pentium\|Ⅱ microprocessors. [
出处 《计算物理》 CSCD 北大核心 2000年第1期193-198,共6页 Chinese Journal of Computational Physics
关键词 分子动力学 优化 并行计算 MDP molecular dynamics optimization parallel computing
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