摘要
为了研究牛樟芝(Antrodia camphorata)倍半萜的生物合成,通过对牛樟芝基因组分析获得倍半萜类合成酶基因(AcTPS2),利用RT-PCR克隆获得其全长cDNA,对其进行生物信息学分析和表达谱分析。结果显示:AcTPS2基因cDNA全长1 068bp,Blast比对发现,AcTPS2含倍半萜类合成酶所独具的富含天冬氨酸序列DXXXD及萜类合成酶特有的RRDTSG-LDL保守序列;系统进化分析显示,AcTPS2基因与其他真菌的倍半萜聚为一类;表达谱分析显示,以甘露糖作为碳源、以酪蛋白胨作为氮源能够有效促进AcTPS2基因的诱导表达。研究结果可为以后牛樟芝倍半萜类生物合成提供一定的参考依据。
In order to study the biosynthesis of sesquiterpene,this text analyzed the sesquiterpene synthetases gene（AcTPS2）through genome analysis of Antrodia camphorata,and obtained the full length cDNA with RT-PCR,carried on bioinformatics and mRNA analysis.The results showed that AcTPS2 cDNA has1 086bp;Blast analysis revealed that AcTPS2 included abundant asparagic acid motif DXXXD that is specific motif of sesquiterpene synthetase,and terpene synthetase special conserved sequence RRDTSG-LDL;phylogenetic trees showed AcTPS2 and other fungus sesquiterpene synthetase amino acid sequence clustered in one clade;mRNA analysis showed manitol as carbon source,casein peptone as nitrogen source could promote AcTPS2 effectively,and the results could supply some basis in sesquiterpene biosynthesis.
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期2398-2404,共7页
Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica
基金
云南省科技厅对外科技合作计划(2015IA004)
国家自然科学基金(31400488)
云南省应用基础研究项目(2016FB055)
关键词
牛樟芝
倍半萜类合成酶
基因克隆
系统进化
诱导表达
Antrodia camphorata
sesquiterpene synthetases
gene cloning
phylogenetic tree
inducible expression
