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金针菇转运蛋白基因fv-mfs1的序列与表达分析 被引量:10

Sequence and Expression Analysis of Transporter Protein Gene fv-mfs1 in Flammulina velutipes
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摘要 通过分析金针菇(Flammulina velutipes)子实体原基期、伸长期、成熟期的转录组数据,得到一个差异表达基因fv-msf1。对其结构、序列特征及表达情况进行分析,结果显示该基因全长2709 bp,包含13个外显子,12个内含子,开放阅读框长1770 bp,编码589个氨基酸。结构域分析表明该基因编码的蛋白含主要协助转运蛋白超家族(major facilitator superfamily,MFS)保守结构域。通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative fluorescence PCR,q-PCR)对子实体不同发育阶段以及菌盖不同发育时期的表达量进行分析,结果显示该基因在金针菇伸长期的菌盖(尤其是0.3~0.9cm)中高表达,由此推断该基因在金针菇菌盖发育中发挥一定作用。 Through comparative transcriptome analysis of Flammulina velutipes at different developmental stages of fruit body(primordial stage,elongation stage,and maturation stage),a differentially expressed gene fv-msf1was identified.Sequence analysis indicated that fv-msf1was 2709bp in length,contained 13exons and 12introns,and had an open reading frame of 1770bp encoding 589amino acids.Domain analysis indicated this gene contained a major facilitator superfamily conservative domain.Using real-time quantitative fluorescence PCR,the gene transcription levels of fv-msf1at different developmental stages of fruit body and pileus were measured respectively.The results showed that fv-msf1was intensively transcribed in pileus at elongation stage(pileus diameter 0.3~0.9cm),suggesting its role in pileus development of F.velutipes.
出处 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期1-6,共6页 Acta Edulis Fungi
基金 国家重点基础研究发展计划(2014CB138302) 福建省现代农业食用菌产业技术体系项目(K83139295)资助
关键词 金针菇 子实体 主要协助转运蛋白超家族 实时定量PCR Flammulina velutipes fruit body major facilitator superfamily real-time quantitative fluorescence PCR
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参考文献6

二级参考文献140

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共引文献63

同被引文献123

引证文献10

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