摘要
本实验以红豆杉叶为唯一碳源进行富集培养,故富集到的菌群均为红豆杉叶际共生菌,以排除其他杂菌的干扰。而后通过宏基因组技术分析其菌种组成,并证实这些菌种与紫杉醇合成代谢的关系。分析结果:物种注释显示Ascomycota(子囊菌门)为样本的绝对优势菌门,优势菌属有Wickerhamomyces(威克罕默氏属)、Clavispora(棒孢酵母属)等,Wickerhamomycesanomalus(威克罕默氏菌)、Clavisporalusitaniae(葡萄牙棒孢酵母)、Meyerozymaguilliermondii(季也蒙念珠菌)、Aspergillusnidulans(构巢曲霉)等为样品的优势菌种;经KEGG数据库分析表明,样本的功能基因主要位于氨基酸代谢(Amino acid metabolism)和碳水化合物代谢(Carbohydrate metabolism)中,这2个代谢通路不仅与菌种的生长和存活密不可分,也为紫杉醇的合成提供前体物质。在紫杉醇合成代谢途径中,能够分泌相关酶的微生物均处于子囊菌门,且其中也存在Clavispora lusitaniae(葡萄牙棒孢酵母)这一优势菌种,故推测样本中检测到的菌种能够参与紫杉醇的合成代谢;基于CAZy数据库的结果表明,样本中有6类碳水化合物活性酶的活性较高,这些碳水化合物活性酶均属于糖苷水解酶和糖苷转移酶。在微生物的次级代谢过程中,糖基化是重要的反应,可以改变某些抗生素和紫杉醇的特性,从而使其发挥更大的作用。为后续对合成紫杉醇的菌种的筛选具有指导意义,以期缩短提取紫杉醇的时间,提高提取率。
出处
《农业与技术》
2022年第12期4-9,共6页
Agriculture and Technology
基金
烟台市重点研发计划(项目编号:2018ZDCX018)。
