摘要
本研究旨在从基因组水平研究郏县红牛Y染色体遗传多样性与父系血统来源,为郏县红牛品种遗传资源的保护与利用提供科学依据。利用全基因组重测序数据,对16头郏县红牛Y染色体基因组X-退化区单拷贝基因区进行扫描和分析,共覆盖到Y染色体上7个单拷贝基因。使用发表的5头黄牛Y染色体基因组单倍型作对照,构建郏县红牛Y染色体单倍型最大似然法(ML)系统进化树及网络图,结果表明:16头郏县红牛在Y染色体X-退化区单拷贝基因区域中共发现有178个位点具有多态性,涵盖7个Y染色体单拷贝基因;并定义了5种郏县红牛Y染色体单倍型,分别将其命名为JXR1~5,其中JXR4为优势单倍型,占50.0%;郏县红牛Y染色体单倍型多样度为0.717±0.095,核苷酸多样度为0.0618±0.0198;系统发育树和单倍型网络图表明,郏县红牛有Y2a、Y2b和Y3a 3种亚单倍型组,其中Y2b为主要亚单倍型组。本研究从Y染色体基因组水平证实郏县红牛有Y2和Y32个父系起源。
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2022年第10期175-178,共4页
Chinese Journal of Animal Science
基金
渭南职业技术学院2019年度院级科研立项课题(WZ YY201906)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-37)
楚雄师范学院博士科研启动项目(BSQD2101)。
