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鸡胚胎期肌纤维分化lncRNA相关ceRNA网络构建

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摘要 肌纤维的分化直接影响肌肉类型。本研究旨在筛选肌肉中差异表达的长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)和小RNA(microRNA, miRNA),构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。试验利用玫瑰冠鸡和科宝鸡胚胎期肌肉组织建立lncRNA、miRNA文库,筛选与肌纤维分化相关的胚胎期骨骼肌差异表达的lncRNA和miRNA,进行靶向关系预测、GO和KEGG富集分析并构建lncRNA相关的ceRNA调控网络。结果显示,共有953个lncRNA和909个miRNA在胚胎期8 d和14 d组间差异表达。基于靶向关系预测、靶基因功能富集分析,筛选出与肌纤维分化相关的lncRNA和miRNA,成功构建包含41个lncRNAmiRNA-mRNA关系对的lncRNA相关ceRNA网络。研究结果为丰富后续ceRNA在肌纤维分化的研究提供理论依据,为改善家禽肌肉品质奠定了基础。
出处 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期178-188,共11页 Chinese Journal of Animal Science
基金 国家自然科学基金(31860641)。
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