摘要
目的以细菌16S rDNA和23Sr DNA基因为靶序列,建立可检测临床7种常见病原菌寡核苷酸芯片系统。方法采用双重PCR扩增标本中靶细菌16S rDNA和23S rDNA基因片段。构建能同时检测肠出血性大肠埃希菌O157:H7、副溶血性弧菌、沙门菌、霍乱弧菌、产单核李斯特菌、空肠弯曲菌和志贺菌的寡核苷酸芯片,并考核芯片的检测特异性、灵敏度和重复性。采用所建立的寡核苷酸芯片检测81例腹泻和呕吐病人粪便样本。结果双重PCR可同时扩增上述7种病原菌的16S rDNA和23S rDNA基因靶序列。所研制的寡核苷酸芯片检测灵敏度可达103cfu/ml,非靶细菌无阳性结果,不同批间和批内芯片的变异系数为3.89%~5.81%。寡核苷酸芯片检测粪便样本的阳性率为39.5%(32/81),与常规细菌学检查法检测结果的一致率达到96.3%(78/81),菌种鉴定结果一致率为96.8%(31/32)。结论本研究中建立的寡核苷酸芯片法在检测上述7种病原菌时,具有简便、快速、准确、稳定、高通量等优点,适合于临床样本检测及流行病学的现场调查。
出处
《浙江检验医学》
2008年第3期32-35,共4页
Zhejiang Journal of Laboratory Medicine
基金
湖州市社发科研计划(2006YS12)
关键词
寡核苷酸芯片
病原菌
检测
Oligonucleotide microarray
Pathogenic bacteria
Detection