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单细胞转录组测序技术在肝纤维化中的研究进展
1
作者 万令飞 潘文婷 +3 位作者 雍雨婷 李元帅 赵悦 阎新龙 《生物技术进展》 2024年第5期793-804,共12页
肝纤维化是一种严重威胁人类健康的疾病,单细胞转录组测序技术为揭示其复杂的病理机制提供了全新途径。传统的研究方法在识别肝纤维化中不同细胞亚群及其基因表达变化方面存在局限,难以深入理解疾病机制。概述了单细胞转录组测序技术在... 肝纤维化是一种严重威胁人类健康的疾病,单细胞转录组测序技术为揭示其复杂的病理机制提供了全新途径。传统的研究方法在识别肝纤维化中不同细胞亚群及其基因表达变化方面存在局限,难以深入理解疾病机制。概述了单细胞转录组测序技术在肝纤维化过程中对不同细胞亚群类型的研究进展,单细胞RNA测序技术能够精确地解析不同细胞类型的基因表达及异质性,揭示肝纤维化过程中细胞亚群的动态变化及相关基因的表达,进而有助于理解各类细胞亚型在肝纤维化中的功能、相互作用及其对疾病进展的贡献。进一步探讨了该技术在肝纤维化研究中的重要意义与应用前景,通过这一技术,可以鉴定出与纤维化相关的关键基因和信号通路,为早期诊断、治疗靶点的发现以及新疗法的制定提供理论依据。此外,结合空间转录组测序技术,研究者可以在空间维度上观察细胞在组织中的分布,进一步提升对肝纤维化微环境的理解。该技术有助于深入理解肝纤维化的病理机制,为寻找新的治疗靶点和制定早期诊断及治疗策略提供了创新思路。 展开更多
关键词 肝纤维化 单细胞测序 空间转录组 纤维化机制 细胞相互作用
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水稻黄绿叶突变体ygl-63的特征和基因定位 被引量：2
2
作者 张亮行 张帆涛 +5 位作者 聂丽 万令飞 梁剑秋 张雨佳 马羊帅 谢建坤 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期891-896,914,共7页
叶绿体的正常发育对于植物至关重要,突变体研究是探明叶绿体发育过程中基因功能的有效途径。叶色突变体已引起人们广泛的关注,通过对各种植物材料的研究,叶色突变的分子机制已取得一定进展,但远未被阐明,尤其在水稻当中。目前,已报道的... 叶绿体的正常发育对于植物至关重要,突变体研究是探明叶绿体发育过程中基因功能的有效途径。叶色突变体已引起人们广泛的关注,通过对各种植物材料的研究,叶色突变的分子机制已取得一定进展,但远未被阐明,尤其在水稻当中。目前,已报道的水稻叶色突变体,主要表现为黄化、白化、亮绿、条斑条纹、温敏变色、转绿和转紫等。该研究使用甲基磺酸乙酯(EMS)处理粳稻日本晴,获得一份遗传稳定的突变体ygl-63,其整个生育期叶片均表现为黄绿色。通过测定ygl-63和野生型苗期叶片的叶绿素含量发现,ygl-63中叶绿素a、叶绿素b和总叶绿素含量与野生型相比分别下降了31.9%、42.2%和34.1%,同时叶绿素a/b值较野生型增加。这表明叶绿素含量的降低是导致ygl-63黄绿叶突变性状的主要原因,并且叶绿素b的降幅大于叶绿素a。在成熟后调查主要农艺性状发现ygl-63单株有效穗数和结实率分别减少8.9%和8.5%;千粒重增加10.4%;而株高,穗长和每穗着粒数和野生型相比差异并不显著。通过测量微量元素发现,ygl-63种子中的铁和锌含量较野生型显著降低,分别减少85.7%和64.8%。将ygl-63与正常绿色品种明恢63杂交获得F_1和F_2群体,进行遗传分析发现,ygl-63突变性状受1对隐性基因控制,通过基因定位,将该基因定位到水稻第11染色体长臂的分子标记InDel-3和InDel-5之间约2.4 cM范围内。该基因被认为是一个新的水稻叶色突变基因,暂命名为ygl-63(g)。所得结果为今后对ygl-63(g)基因的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 叶色突变体 甲基磺酸乙酯 微量营养元素 分子标记 遗传分析 基因定位
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癌相关成纤维细胞的特性及其调控肿瘤进程的研究进展
3
作者 万令飞 杨慧 +4 位作者 葛晨 刘蕴慧 岳文 裴雪涛 阎新龙 《生物技术通讯》 CAS 2020年第1期75-82,共8页
肿瘤组织是由恶性上皮细胞及其周围的基质细胞微环境形成的复杂混合体。在肿瘤的发生发展过程中,肿瘤细胞与肿瘤微环境相互作用相互影响,其中癌相关成纤维细胞(CAF)是肿瘤微环境的重要组成部分。CAF不仅促进肿瘤细胞的增殖与转移、肿瘤... 肿瘤组织是由恶性上皮细胞及其周围的基质细胞微环境形成的复杂混合体。在肿瘤的发生发展过程中,肿瘤细胞与肿瘤微环境相互作用相互影响,其中癌相关成纤维细胞(CAF)是肿瘤微环境的重要组成部分。CAF不仅促进肿瘤细胞的增殖与转移、肿瘤微血管生成以及耐药性产生,还能抑制机体的抗肿瘤免疫,从而促进肿瘤的恶性进展。本文简要综述癌相关成纤维细胞的特性及其在调控肿瘤发生发展中的作用。 展开更多
关键词 癌相关成纤维细胞 肿瘤微环境 靶向治疗
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肌苷生产菌枯草芽孢杆菌ATCC 13952的全基因组测序及序列分析 被引量：9
4
作者 李尔汉 杨慧林 +3 位作者 王筱兰 万令飞 潘红梅 朱笃 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1560-1567,共8页
【目的】枯草芽孢杆菌ATCC 13952是一株肌苷工业生产菌株。为深入研究ATCC 13952菌株积累肌苷的分子机制以及为进一步分子育种研究提供序列背景信息,有必要解析ATCC 13952菌株的基因组序列信息。【方法】本研究采用高通量测序和Sanger... 【目的】枯草芽孢杆菌ATCC 13952是一株肌苷工业生产菌株。为深入研究ATCC 13952菌株积累肌苷的分子机制以及为进一步分子育种研究提供序列背景信息,有必要解析ATCC 13952菌株的基因组序列信息。【方法】本研究采用高通量测序和Sanger测序相结合对ATCC 13952菌株进行全基因组测序,然后使用相关软件对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、GO/COG聚类分析、共线性分析等。【结果】枯草芽孢杆菌ATCC 13952整个基因组大小为3876276 bp,GC含量为45.8%,序列已提交至Gen Bank数据库,登录号为CP009748。比较基因组及嘌呤代谢相关基因分析结果显示:枯草芽孢杆菌ATCC 13952与其他几株芽孢杆菌具有较好的基因组共线性关系,嘌呤代谢相关基因编码的蛋白与标准菌株比较发生了一些缺失和突变。【结论】本研究首次报道了一株肌苷生产菌枯草芽孢杆菌ATCC 13952的全基因组序列,分析了基因组基本特征,初步探讨了该菌株积累肌苷的分子机制,为后续的进一步分子育种提供了理论基础。 展开更多
关键词 肌苷 枯草芽孢杆菌 全基因组测序 分子机制 比较基因组分析
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β-拉帕醌联合帕博西尼抑制肝内胆管细胞癌细胞及肿瘤干细胞球的增殖 被引量：1
5
作者 杨慧 韩瑞刚 +9 位作者 万令飞 葛晨 刘蕴慧 王海洋 张彪 曾泉 范增 阎新龙 岳文 裴雪涛 《军事医学》 CAS 北大核心 2019年第10期761-766,共6页
目的探讨β-拉帕醌以及联合帕博西尼对肝内胆管细胞癌(ICC)细胞、肿瘤干细胞球的抑制作用及其作用机制。方法首先,利用CCK-8和克隆形成实验检测β-拉帕醌单药及与帕博西尼联用对人ICC HuCCT1和QBC939细胞系增殖的影响;其次利用肿瘤干细... 目的探讨β-拉帕醌以及联合帕博西尼对肝内胆管细胞癌(ICC)细胞、肿瘤干细胞球的抑制作用及其作用机制。方法首先,利用CCK-8和克隆形成实验检测β-拉帕醌单药及与帕博西尼联用对人ICC HuCCT1和QBC939细胞系增殖的影响;其次利用肿瘤干细胞球形成实验检测β-拉帕醌单药,帕博西尼单药及联合用药对人ICC细胞中肿瘤干细胞球形成的影响;进一步应用qRT-PCR和Western印迹检测β-拉帕醌处理组与对照组的肿瘤干性相关基因mRNA和蛋白表达水平的影响。结果β-拉帕醌单药及与帕博西尼联用对人ICC肿瘤干细胞球的形成具有显著的抑制作用,且协同效果更加显著。结论β-拉帕醌联合帕博西尼能够显著抑制人ICC细胞及肿瘤干细胞球的增殖。 展开更多
关键词 肝内胆管细胞癌 β-拉帕醌 帕博西尼 肿瘤干细胞球
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抗GPC3/NKG2D双特异性融合蛋白的制备及其功能研究 被引量：1
6
作者 刘蕴慧 葛晨 +5 位作者 徐勤枝 钱尼良 杨慧 万令飞 阎新龙 高新 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第21期1975-1981,共7页
目的:构建靶向磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3(glypican-3,GPC3)和NKG2D的双特异性融合蛋白,并初步评价其在体外对肝癌细胞的杀伤功能。方法:通过基因工程技术,将NKG2D的配体人主要组织相容性复合物Ⅰ类相关蛋白A(MHC classⅠchain-related A,MI... 目的:构建靶向磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3(glypican-3,GPC3)和NKG2D的双特异性融合蛋白,并初步评价其在体外对肝癌细胞的杀伤功能。方法:通过基因工程技术,将NKG2D的配体人主要组织相容性复合物Ⅰ类相关蛋白A(MHC classⅠchain-related A,MICA)胞外区融合到Fab形式的抗人GPC3抗体GC33的重链末端,构建双特异性融合蛋白(Fab GC33-MICA,FabGM)表达载体;转染FreeStyle;293-F细胞,收集细胞培养上清,经亲和纯化获得FabGM蛋白;利用分子相互作用技术(Fortebio)和流式细胞术检测FabGM的靶向亲和力;细胞实时动态成像分析系统测定FabGM介导的外周血单个核细胞(PBMCs)对高表达GPC3的人肝癌细胞HepG2的杀伤效应,ELISA法检测杀伤过程中PBMCs分泌人干扰素-γ(hIFN-γ)情况。结果:本研究成功地表达并纯化了FabGM,明确FabGM可特异性结合GPC3和NKG2D。经检测FabGM能有效介导PBMCs靶向杀伤HepG2肝癌细胞,诱导PBMCs分泌IFN-γ。结论:双特异性融合蛋白FabGM能够在体外有效介导效应细胞PBMCs杀伤肝癌细胞HepG2,为FabGM成为肝细胞肝癌的潜在靶向治疗药物提供了实验依据。 展开更多
关键词 双特异性融合蛋白 双特异性抗体 肝细胞肝癌 磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3 NKG2D
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