目的 运用网络药理学和分子对接的方法研究“茯苓-半夏”干预抑郁症的作用机制,旨在为基础研究及临床应用提供依据。方法 通过TCMSP、pubchem和pharmmapper数据库检索并筛选药对“茯苓-半夏”的活性成分以及作用靶点,利用DrugBank、Gene...目的 运用网络药理学和分子对接的方法研究“茯苓-半夏”干预抑郁症的作用机制,旨在为基础研究及临床应用提供依据。方法 通过TCMSP、pubchem和pharmmapper数据库检索并筛选药对“茯苓-半夏”的活性成分以及作用靶点,利用DrugBank、GeneCards、OMIM数据库筛选抑郁症相关的疾病靶点,取两者的交集靶点;利用STRING11.5数据库获得蛋白互作关系,并通过Cytoscape3.8.2软件构建PPI网络以及构建“茯苓-半夏”-活性成分-靶点-疾病网络;运用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析;采用Autodock Tools1.5.6工具进行分子对接研究。结果 本文以“茯苓-半夏”作为核心药对,共筛选得到28个活性成分,其中涉及抑郁症作用靶点的中药活性成分有23个,如松柏苷、常春藤素、曲美烯酸、β-谷甾醇等,涉及抑郁症作用靶点14个,分别为ALB、MAOB、MAPK14、GSTP1、AKR1B1、CASP3、PPARG、AR、ESR1、HSD11B1、TNNC1、GBA、IMPA1、TTR。主要涉及生物学进程的信号转导(signal transduction)、对雌激素的反应(response to estrogen)、对雌二醇的反应(response to estradiol)、对甲状腺激素的反应(response to thyroid hormone)等,KEGG的通路包括癌症的途径(Pathways in cancer)、癌症中的蛋白多糖(Proteoglycans in cancer)、肌萎缩侧索硬化症(Amyotrophic lateral sclerosis)。分子对接验证结果均≤-5.0(k J/mol),表明靶点与成分的结合活性良好。结论 本文探讨了“茯苓-半夏”干预抑郁症多成分-多靶点-多通路的作用特点,其中MAOB是胺氧化酶[含黄素]B在中枢神经系统和外周组织中神经活性胺和血管活性胺的代谢中具有重要作用,MAOB优先降解苄胺和苯乙胺,可能具有直接发挥抗抑郁作用,为今后临床应用和基础研究提供了一定的思路和参考。展开更多
文摘目的 运用网络药理学和分子对接的方法研究“茯苓-半夏”干预抑郁症的作用机制,旨在为基础研究及临床应用提供依据。方法 通过TCMSP、pubchem和pharmmapper数据库检索并筛选药对“茯苓-半夏”的活性成分以及作用靶点,利用DrugBank、GeneCards、OMIM数据库筛选抑郁症相关的疾病靶点,取两者的交集靶点;利用STRING11.5数据库获得蛋白互作关系,并通过Cytoscape3.8.2软件构建PPI网络以及构建“茯苓-半夏”-活性成分-靶点-疾病网络;运用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析;采用Autodock Tools1.5.6工具进行分子对接研究。结果 本文以“茯苓-半夏”作为核心药对,共筛选得到28个活性成分,其中涉及抑郁症作用靶点的中药活性成分有23个,如松柏苷、常春藤素、曲美烯酸、β-谷甾醇等,涉及抑郁症作用靶点14个,分别为ALB、MAOB、MAPK14、GSTP1、AKR1B1、CASP3、PPARG、AR、ESR1、HSD11B1、TNNC1、GBA、IMPA1、TTR。主要涉及生物学进程的信号转导(signal transduction)、对雌激素的反应(response to estrogen)、对雌二醇的反应(response to estradiol)、对甲状腺激素的反应(response to thyroid hormone)等,KEGG的通路包括癌症的途径(Pathways in cancer)、癌症中的蛋白多糖(Proteoglycans in cancer)、肌萎缩侧索硬化症(Amyotrophic lateral sclerosis)。分子对接验证结果均≤-5.0(k J/mol),表明靶点与成分的结合活性良好。结论 本文探讨了“茯苓-半夏”干预抑郁症多成分-多靶点-多通路的作用特点,其中MAOB是胺氧化酶[含黄素]B在中枢神经系统和外周组织中神经活性胺和血管活性胺的代谢中具有重要作用,MAOB优先降解苄胺和苯乙胺,可能具有直接发挥抗抑郁作用,为今后临床应用和基础研究提供了一定的思路和参考。
