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杂交导入巴克夏血统对苏紫猪生长育肥性状的影响分析
1
作者 付言峰 廖超 +3 位作者 王学敏 涂枫 李碧侠 程金花 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第8期21-25,共5页
为了探讨含不同巴克夏猪(巴克夏)血统含量(0、25%、50%)的苏紫猪生长育肥性状有无显著改善,选取68头不同类型的苏紫猪,初始体重在30 kg左右,采用全自动种猪生产性能测定系统进行分批次测定。结果显示:试验共获得130700条有效采食和称重... 为了探讨含不同巴克夏猪(巴克夏)血统含量(0、25%、50%)的苏紫猪生长育肥性状有无显著改善,选取68头不同类型的苏紫猪,初始体重在30 kg左右,采用全自动种猪生产性能测定系统进行分批次测定。结果显示:试验共获得130700条有效采食和称重数据,深入分析后发现不同巴克夏血统含量的苏紫猪达相关体重的日龄不同,达60 kg和90 kg体重日龄均为含50%巴克夏血统苏紫猪最大,显著大于无巴克夏血统苏紫猪(P<0.05)。30~60 kg生长阶段的日增重,含25%巴克夏血统和无巴克夏血统苏紫猪显著高于含50%巴克夏血统苏紫猪(P<0.05);30~90 kg和30~110 kg生长阶段的日增重,均为无巴克夏血统苏紫猪最高,显著高于含50%巴克夏血统苏紫猪(P<0.05)。30~90 kg和30~100 kg生长阶段的料重比,均为含50%巴克夏血统苏紫猪最低,且显著低于含25%巴克夏血统和无巴克夏血统苏紫猪(P<0.05)。结论:杂交导入巴克夏血统对苏紫猪的生长速度提升不显著,但对其料重比的改善显著,其中含25%巴克夏血统的苏紫猪生长性能比较均衡,未来可以进行优先培育。 展开更多
关键词 猪 生长 育肥 性能 杂交导入
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苏紫猪血清细胞因子含量对育肥性状的影响
2
作者 付言峰 程金花 +3 位作者 廖超 戴超辉 涂枫 王学敏 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第3期201-206,共6页
为研究育肥期苏紫猪血清中细胞因子含量对育肥性状的影响,本研究选取18头苏紫猪进行生长育肥测定,然后屠宰采集血样,进行CCL4、IL-6和FGF-2这3种细胞因子的检测,同时统计其日龄、体质量、瘦肉率和皮下脂肪,分析两者之间的关系。结果发现... 为研究育肥期苏紫猪血清中细胞因子含量对育肥性状的影响,本研究选取18头苏紫猪进行生长育肥测定,然后屠宰采集血样,进行CCL4、IL-6和FGF-2这3种细胞因子的检测,同时统计其日龄、体质量、瘦肉率和皮下脂肪,分析两者之间的关系。结果发现,CCL4、IL-6和FGF-2的标准曲线拟合度分别为0.9963、0.9958、0.9953,均非常接近于1,说明后面检测的结果可信度高。育肥期苏紫猪血清中,IL-6含量最高,其次为CCL4含量,FGF-2含量最低(P<0.05)。IL-6含量与日增质量、瘦肉率呈负相关(相关系数分别为-0.41、-0.21),与皮下脂肪率呈正相关(相关系数为0.08);CCL4含量与瘦肉率呈负相关(相关系数为-0.44);FGF-2含量最高的猪日增质量最快。研究提示,优质猪血清细胞因子含量对育肥性状有较大的影响,其中,育肥期IL-6和CCL4含量可反映出猪瘦肉率的高低,有利于猪高瘦肉率性状的高效选育。 展开更多
关键词 苏紫猪 趋化因子C-C配体4 成纤维细胞生长因子2 生长育肥
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规模化猪场粪污处理利用现状及案例分析 被引量：1
3
作者 王学敏 廖超 +3 位作者 涂枫 李碧侠 徐小波 付言峰 《中国猪业》 2024年第2期74-81,共8页
规模化猪场在养殖过程中会产生大量的粪污,如果不加以妥善处理与利用,将对环境和公共健康造成严重威胁。粪污处理与资源化利用成为实现养猪业可持续发展的关键环节。本文探讨了规模化猪场粪污的危害,介绍了规模化猪场粪污集中收集系统... 规模化猪场在养殖过程中会产生大量的粪污,如果不加以妥善处理与利用,将对环境和公共健康造成严重威胁。粪污处理与资源化利用成为实现养猪业可持续发展的关键环节。本文探讨了规模化猪场粪污的危害,介绍了规模化猪场粪污集中收集系统及目前规模化猪场在猪舍粪污处理中使用的尿泡粪和机械清粪2种清粪工艺,并详细讨论了生物发酵、厌氧消化、好氧处理等多种方法对固体粪污和液体污水的处理技术,以满足不同规模化养猪场的清粪需求。同时,探讨了规模化猪场种养结合生态循环利用和工业化深度处理2种主要的粪污处理利用模式。展望了未来科技创新对粪污处理与利用的推动作用,呼吁各方共同努力,以实现养猪企业的可持续发展、保障环境和人类健康的计划。本文为规模化养猪场选择粪污处理技术和利用模式提供了有益的参考,有助于环境保护和养猪业可持续发展。 展开更多
关键词 规模化养猪 粪污处理 污水 有机肥 资源化利用
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PolyI:C刺激猪PK15细胞后病毒感染应答基因未注释转录本鉴定及其特征分析
4
作者 赵为民 王红 +5 位作者 徐盼 陈哲 陶晓莉 李碧侠 付言峰 程金花 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1622-1631,共10页
【目的】鉴定猪PK15细胞在类病毒聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后病毒感染应答基因的未注释转录本的数量、剪接类型、新蛋白编码与分子结构,为进一步研究这些未注释转录本的功能奠定基础。【方法】将猪PK15细胞分为对照组和试验组,每组3个重... 【目的】鉴定猪PK15细胞在类病毒聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后病毒感染应答基因的未注释转录本的数量、剪接类型、新蛋白编码与分子结构,为进一步研究这些未注释转录本的功能奠定基础。【方法】将猪PK15细胞分为对照组和试验组,每组3个重复;试验组加入终浓度为20μg/mL的PolyI:C,对照组加入等体积(2μL)的PBS,两组在37℃、5%CO_(2)条件下分别刺激6 h后进行Nanopore测序,鉴定两组的总转录本与差异表达基因。对差异表达基因进行GO功能分析,进一步筛选病毒感染的应答基因。对总转录本与Ensemble注释的转录本序列进行比较,发现未注释转录本。将病毒感染应答基因的未注释转录本与其对应的Ensemble注释转录本序列进行比对,分析未注释转录本的剪接类型和编码蛋白。【结果】PolyI:C刺激后,两组共鉴定蛋白编码的转录本61505个,其中有Ensemble数据库注释的39497个,未注释的转录本22008个,未注释转录本数量占总数的35.78%。同时两组鉴定到71个差异蛋白编码基因,与对照组相比,试验组上调表达基因57个,下调表达基因14个。GO功能富集分析显示,这些差异表达基因富集到20个生物过程,其中前3个生物过程分别是防御病毒反应、Ⅰ型干扰素信号通路和病毒应答,均与病毒感染应答相关。24个病毒感染应答的基因有16个基因存在未注释转录本,其中CCL 5、IFI 6、BST 2和MX 1基因未注释转录本的数量多于其Ensemble注释的总转录本数量,且大部分未注释转录本产生新的蛋白序列。IFIT 3、OAS 2、RSAD 2、CCL 5、IFI 44、CD 40、IFI 6、BST和MX 19个基因的未注释转录本有差异表达。【结论】本研究系统地鉴定了猪PK15细胞受PolyI:C刺激后病毒感染应答基因的未注释转录本的分子特征,筛选的IFIT 3、OAS 2、RSAD 2、CCL 5、IFI 44、CD 40、IFI 6、BST和MX 19个基因的差异表达的未注释转录本可能具有重要生物学作用,为进一步解析宿主基因在抗病毒反应中的复杂转录调控机制提供了依据。 展开更多
关键词 Nanopore测序 PolyI:C 病毒感染 转录本 选择性剪接
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大型连体猪舍臭气多级处理系统
5
作者 王学敏 廖超 +4 位作者 程金花 李碧侠 徐小波 付言峰 涂枫 《中国畜牧业》 2024年第9期45-46,共2页
近年来,随着农业产业化和城市化的迅猛发展,中国规模化养猪业迅速崛起,成为畜牧业领域的重要支柱。规模化养猪业在我国畜牧业生产中具有重要作用,不仅是农村经济的支柱产业,也是农业现代化进程中不可或缺的一部分,在国家农业和经济发展... 近年来,随着农业产业化和城市化的迅猛发展,中国规模化养猪业迅速崛起,成为畜牧业领域的重要支柱。规模化养猪业在我国畜牧业生产中具有重要作用,不仅是农村经济的支柱产业,也是农业现代化进程中不可或缺的一部分,在国家农业和经济发展中发挥着至关重要的作用。随着我国社会经济的迅速发展,规模化养猪业也面临着新的机遇和挑战,其中之一是与猪场臭气排放相关的环境问题。目前,社会大众对环保的重视程度不断提高,环境保护相关法规也在不断完善,因此,养殖业臭气排放问题日益受到广泛关注。 展开更多
关键词 农业现代化进程 农业产业化 支柱产业 规模化养猪业 环境保护 畜牧业 城市化 养殖业
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导入巴克夏血统苏紫猪生长曲线拟合研究 被引量：1
6
作者 廖超 程金花 +4 位作者 李娟 赵为民 李辉 戴超辉 付言峰 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期138-142,共5页
为了解导入巴克夏血统后苏紫猪(后称苏紫猪)的生长发育规律,从而提高苏紫猪的生长性能和饲养管理水平,本研究选取62头苏紫猪进行体重监测,并对产生的40 700条有效数据进行生长性能分析。利用3种非线性模型(Gompertz、Logistic和Bertalan... 为了解导入巴克夏血统后苏紫猪(后称苏紫猪)的生长发育规律,从而提高苏紫猪的生长性能和饲养管理水平,本研究选取62头苏紫猪进行体重监测,并对产生的40 700条有效数据进行生长性能分析。利用3种非线性模型(Gompertz、Logistic和Bertalanffy)对苏紫猪进行生长曲线拟合分析。结果发现:在100日龄之前公猪和母猪群体的体重差异不显著,100日龄以后公猪的体重显著大于母猪,且差距逐渐变大,在160日龄后差异极显著;Gompertz模型对苏紫猪的拟合效果均优于Bertalanffy和Logistic模型;在Gompertz模型下,苏紫猪公猪和母猪的拐点日龄及拐点体重分别是140.36 d、80.41 kg和123.3 d、56.61 kg。本研究结果表明运用Gompertz模型可预测苏紫猪的生长拐点,为其精准饲养和选育提供参考依据。 展开更多
关键词 苏紫猪 生长曲线 生长拐点 拟合
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猪TGF-βⅡ型受体胞外域的表达及生物活性验证
7
作者 赵蕾 李辉 +6 位作者 覃水平 李碧侠 戴超辉 赵为民 付言峰 邓彦飞 程金花 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第7期1268-1275,共8页
转化生长因子β1Ⅱ型受体(TGFⅡR)是TGF-β家族的主要受体。现有研究发现,TGF-β1在家畜繁殖活动中起着负调控作用,因此我们提出通过重组TGFⅡR胞外域蛋白质竞争性结合体内TGF-β1以改善家畜繁殖性能的新思路。首先,对猪TGFⅡR胞外域蛋... 转化生长因子β1Ⅱ型受体(TGFⅡR)是TGF-β家族的主要受体。现有研究发现,TGF-β1在家畜繁殖活动中起着负调控作用,因此我们提出通过重组TGFⅡR胞外域蛋白质竞争性结合体内TGF-β1以改善家畜繁殖性能的新思路。首先,对猪TGFⅡR胞外域蛋白质编码序列进行密码子优化并进行人工合成,将合成的基因片段插入原核表达载体pET-32a(+)中。然后,将重组表达载体转入BL21(DE3)表达菌株中,并筛选合适的乳糖诱导浓度、诱导时间,以获得最高表达效率。再然后,对重组蛋白质进行纯化、复性及质谱鉴定。最后,通过体外细胞试验对重组蛋白质的生物活性进行测定。结果表明,在培养温度为37℃、培养时间为8 h、乳糖诱导质量浓度为2.0 g/L的条件下,可以诱导重组蛋白质的高表达,用8 mol/L尿素对包涵体蛋白质进行溶解,再以生理盐水为透析液透析24 h后,可以获得纯度达80%以上的重组猪TGFⅡR胞外域蛋白,用该重组蛋白质处理猪颗粒细胞后,可显著抑制TGF-β1诱导的信号分子Smad3的磷酸化水平。可以看出,本研究中表达的重组猪TGFⅡR胞外域蛋白质具有较好的生物活性。研究结果可为进一步研究和开发有利于提高猪繁殖效率的产品奠定工作基础。 展开更多
关键词 转化生长因子β1Ⅱ型受体(TGFⅡR) 原核表达 TGF-Β1 生物活性
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利用全基因组选择培育高繁猪新品系初步研究 被引量：1
8
作者 付言峰 任守文 +4 位作者 涂枫 王学敏 廖超 俞正玉 程金花 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期99-103,109,共6页
为了帮助江苏省某规模种猪场进行高繁大白猪新品系培育,本研究采用猪PorcineSNP50K基因组芯片,对同一猪场186头核心群母猪进行了全基因组SNP分析,再利用一步基因组最佳线性无偏估计法计算出这些猪的基因组估计育种值(GEBV)。实验母猪共... 为了帮助江苏省某规模种猪场进行高繁大白猪新品系培育,本研究采用猪PorcineSNP50K基因组芯片,对同一猪场186头核心群母猪进行了全基因组SNP分析,再利用一步基因组最佳线性无偏估计法计算出这些猪的基因组估计育种值(GEBV)。实验母猪共有8个胎次的960窝产仔记录,其中总产仔数平均12.52头,产活仔数平均10.94头,产仔数高峰在第3~4胎。在实验猪4个繁殖性状和1个生长性状中,达100 kg体重日龄的遗传力最高,且这5个性状间的遗传相关和表型相关都是正相关。核心群和参考群间SNPs基因型主成分有部分聚类到一起。在5个性状中,GEBV平均值中产活仔数最高,GEBV最高值中达100 kg体重日龄最高,GEBV中位数中出生窝重最高,达100 kg体重日龄的最高值和最低值间差异最大。考虑到5个性状间遗传相关和表型相关都是正相关,且达100 kg体重日龄有较高的遗传力,后期可以通过这几个性状的联动正向选育,更高效地获得加系大白猪高繁新品系。 展开更多
关键词 猪 遗传力 遗传相关 全基因组选择 基因组估计育种值
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CRISPR/dCas9-KRAB系统沉默猪LncRNA-NEAT1基因
9
作者 赵为民 戴超辉 +6 位作者 陈哲 涂枫 李辉 付言峰 李碧侠 任守文 程金花 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期1036-1042,共7页
本研究利用RT-PCR检测LncRNA-NEAT1基因表达在细胞中的亚定位,采用5′RACE获得LncRNA-NEAT1基因的转录起始位点;利用CRISPOR软件对-300~0 bp区域的LncRNA-NEAT1启动子序列设计sgRNA并构建到px330载体,通过转染细胞与T7E1酶切验证sgRNA效... 本研究利用RT-PCR检测LncRNA-NEAT1基因表达在细胞中的亚定位,采用5′RACE获得LncRNA-NEAT1基因的转录起始位点;利用CRISPOR软件对-300~0 bp区域的LncRNA-NEAT1启动子序列设计sgRNA并构建到px330载体,通过转染细胞与T7E1酶切验证sgRNA效率;利用酶切和亚克隆方法将dCas9-KRAB-BSD片段替换px330载体的Cas9序列,形成重组px330-dCas9-KRAB载体;将验证有效的sgRNA构建到px330-dCas9-KRAB载体,形成px330-sgRNA-dCas9-KRAB载体。添加不同质量浓度的Blasticidin S处理细胞,以最小致死质量浓度来确定筛选质量浓度。转染px330-sgRNA-dCas9-KRAB载体并用Blasticidin S筛选细胞7 d后进行LncRNA-NEAT1基因的表达检测,同时对sgRNA在LncRNA-NEAT1基因启动子上的结合位点进行Sanger测序,以进一步验证上述结合位点是否发生切割。结果显示LncRNA-NEAT1主要表达于细胞核,而在细胞质中几乎不表达。5′RACE获得了LncRNA-NEAT15′端大约270 bp的序列。qPCR检测结果显示,与对照组相比,sgRNA1和sgRNA2能够显著抑制LncRNA-NEAT1的表达(P<0.05)。Sanger测序结果表明sgRNA1和sgRNA2所在的位点并没有发生碱基缺失和插入。研究结果为后续进一步研究LncRNA-NEAT1在先天性免疫反应中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 CRISPR dCas9-KRAB LncRNA-NEAT1基因 猪 基因沉默
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芳香烃受体与动物繁殖关系的研究进展
10
作者 李辉 赵为民 +6 位作者 莫殿宝 沈婕 赵蕾 戴超辉 付言峰 李碧侠 程金花 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期16-23,共8页
芳香烃受体(Aryl Hydrocarbon Receptor,AHR)是一种细胞内受体,也是一种重要的配体依赖性转录因子。现有研究发现AHR的配体和其生物学功能具有多样性,并且对动物繁殖活动有重要的调控作用,但具体机制尚不清晰。本文对AHR的配体、AHR在... 芳香烃受体(Aryl Hydrocarbon Receptor,AHR)是一种细胞内受体,也是一种重要的配体依赖性转录因子。现有研究发现AHR的配体和其生物学功能具有多样性,并且对动物繁殖活动有重要的调控作用,但具体机制尚不清晰。本文对AHR的配体、AHR在动物机体的分布与表达调控、AHR对激素分泌及生殖系统的作用、AHR多态性和拷贝数与产仔数关系等方面进行归纳分析,为扩展动物繁殖理论提供新思路和参考。 展开更多
关键词 芳香烃受体 配体 动物繁殖
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江苏省楼房养猪模式调研与发展分析
11
作者 程金花 还红华 +6 位作者 王学敏 廖超 付言峰 李碧侠 张海涛 路璐 朱慈根 《农业科技管理》 2023年第1期74-77,共4页
楼房养猪是在破解经济发达地区土地资源紧缺、稳产保供任务重等问题的新形势下迅速发展起来的一种养猪模式。文章采用问卷访谈与实地走访相结合的方式,开展了江苏省内10个县区的楼房猪场调研,分别从养殖类型、猪群转移、饲料输送等饲养... 楼房养猪是在破解经济发达地区土地资源紧缺、稳产保供任务重等问题的新形势下迅速发展起来的一种养猪模式。文章采用问卷访谈与实地走访相结合的方式,开展了江苏省内10个县区的楼房猪场调研,分别从养殖类型、猪群转移、饲料输送等饲养工艺,通风、温湿度等环境控制,以及臭气处理、生物安全管理、粪便管理等方面总结了省内楼房养猪的主要模式,从建筑结构与工艺、建材选择、养殖工艺、成本收益等方面分析了存在的共性问题,并从集智攻关、科学评估两个方面对楼房养猪未来的发展布局提出了相关建议。 展开更多
关键词 江苏省 楼房养猪 多层建筑 饲养模式
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苏紫猪运动量与生长性能关系的研究
12
作者 王学敏 廖超 +3 位作者 程金花 涂枫 李碧侠 付言峰 《猪业科学》 2023年第12期114-115,共2页
苏紫猪是在江苏省自主培育品种苏钟猪与江苏地方猪种淮猪杂交后,再与引进的巴克夏外种猪杂交选育而成的优质黑猪培育新品系,具有繁殖力高、肉质好、抗逆性强特点,另外产肉率及瘦肉率适中、肉品质优且耐贮藏,以其优良的产肉性能和出色的... 苏紫猪是在江苏省自主培育品种苏钟猪与江苏地方猪种淮猪杂交后,再与引进的巴克夏外种猪杂交选育而成的优质黑猪培育新品系,具有繁殖力高、肉质好、抗逆性强特点,另外产肉率及瘦肉率适中、肉品质优且耐贮藏,以其优良的产肉性能和出色的肉质品质受到广泛关注。但与外种猪相比,地方优良培育品种猪生长性能不突出,严重制约了优质猪产业的发展。 展开更多
关键词 培育品种 地方猪种 产肉性能 巴克夏 猪杂交 生长性能 肉质品质 外种猪
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脱氧雪腐镰刀菌烯醇对猪毒害作用及毒理机制研究进展 被引量：3
13
作者 戴超辉 李辉 +5 位作者 赵为民 付言峰 廖超 李碧侠 王学敏 程金花 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期24-35,共12页
脱氧雪腐镰刀菌烯醇(deoxynivalenol, DON)是一种常见的污染粮食、饲料和食品的霉菌毒素,严重影响人和牲畜的健康。猪对DON非常敏感,DON可造成猪拒食、生长抑制、呕吐以及器官损伤、细胞毒性、免疫毒性等毒害作用。本文主要综述了DON对... 脱氧雪腐镰刀菌烯醇(deoxynivalenol, DON)是一种常见的污染粮食、饲料和食品的霉菌毒素,严重影响人和牲畜的健康。猪对DON非常敏感,DON可造成猪拒食、生长抑制、呕吐以及器官损伤、细胞毒性、免疫毒性等毒害作用。本文主要综述了DON对猪的毒害作用、毒理机制以及解毒剂开发等方面的研究进展,尤其关注DON毒理作用的遗传调控研究,旨在为从遗传本质提高猪对脱氧雪腐镰刀菌烯醇的抵抗力提供更全面的参考。 展开更多
关键词 猪 脱氧雪腐镰刀菌烯醇 毒害作用 毒理机制 解毒剂 遗传调控
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苏紫猪SLA-1基因多态性及其抗病潜能分析 被引量：1
14
作者 王泽平 王飞飞 +6 位作者 张芮铭 付言峰 赵为民 戴超辉 程金花 廖超 李辉 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1918-1927,共10页
【目的】探究苏紫猪白细胞抗原-1(swine leukocyte antigen-1,SLA-1)基因多态性,并对其抗病潜能进行分析,以期为苏紫猪分子育种提供理论基础。【方法】以苏紫猪血细胞cDNA为模板,用PCR法扩增苏紫猪SLA-1基因并测序,利用DNAStar和Mega 5.... 【目的】探究苏紫猪白细胞抗原-1(swine leukocyte antigen-1,SLA-1)基因多态性,并对其抗病潜能进行分析,以期为苏紫猪分子育种提供理论基础。【方法】以苏紫猪血细胞cDNA为模板,用PCR法扩增苏紫猪SLA-1基因并测序,利用DNAStar和Mega 5.0软件分别进行相似性分析及系统进化树构建;利用NetMHCpan 4.1 server分析SLA-1与非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)抗原表位结合的能力及特征;运用生物学软件对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区、结构和功能等进行预测。【结果】试验成功扩增6条苏紫猪SLA-1等位基因序列,分别为SLA-1*sz01、SLA-1*sz02、SLA-1*sz03、SLA-1*sz04、SLA-1*sz05和SLA-1*sz06,其高变异位点主要位于肽结合沟(peptide-binding groove,PBG)α1区和α2区;相似性比对结果显示,6条苏紫猪SLA-1等位基因核苷酸、氨基酸序列相似性分别在92.9%~96.9%、87.0%~94.8%之间,与不同品种猪核苷酸、氨基酸序列相似性分别在92.8%~98.8%、84.3%~98.0%之间;ASFV来源多肽结合能力的预测结果显示,SLA-1*sz01蛋白具有较强的ASFV抗原呈递能力,与ASFV来源B354L蛋白多肽片段FIDKTTVLY具有最高亲和力;SLA-1*sz01蛋白功能域及三级结构预测结果显示,SLA-1*sz01与免疫系统相关,具有经典的SLA-1三级结构。【结论】本研究扩增得到6条苏紫猪SLA-1基因序列,其中SLA-1*sz01能够限制性结合较多的ASFV来源抗原表位多肽,与多肽片段FIDKTTVLY具有最高亲和力,可作为苏紫猪抗病育种的候选基因。研究结果为ASFV疫苗的研发提供参考基础。 展开更多
关键词 苏紫猪 SLA-1基因 多态性 抗原结合位点 抗病潜能
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苏钟猪脂蛋白脂肪酶的组织表达谱及其生物信息学分析 被引量：13
15
作者 付言峰 李碧侠 +3 位作者 李兰 方晓敏 王学敏 任守文 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1871-1878,共8页
为进一步了解猪LPL基因的结构和功能,本研究以苏钟猪为试验对象,利用实时荧光定量PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(心脏、肝脏、肾脏、皮下脂肪和背最长肌)中RNA水平的表达谱信息;对苏钟猪LPL基因的CDS区域进行了克隆测序,并用... 为进一步了解猪LPL基因的结构和功能,本研究以苏钟猪为试验对象,利用实时荧光定量PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(心脏、肝脏、肾脏、皮下脂肪和背最长肌)中RNA水平的表达谱信息;对苏钟猪LPL基因的CDS区域进行了克隆测序,并用生物信息学方法分析了苏钟猪LPL蛋白水平的结构和功能。结果表明:LPL基因在各组织中的mRNA表达丰度为:皮下脂肪>心脏>肾脏>背最长肌>肝脏,其中皮下脂肪的表达量显著高于其他组织(P<0.01),且公猪背最长肌中的表达量显著高于母猪(P<0.01),公猪与母猪间的眼肌面积和瘦肉率性状均差异显著(P<0.05)。猪LPL基因编码含479个氨基酸的蛋白,理论等电点为4.99,具有疏水性,存在信号肽,是分泌型蛋白,与牛、绵羊、家猫等的亲缘关系较近。LPL对苏钟猪的皮下脂肪、心脏、肾脏、肌肉等组织的脂肪沉积有重要影响,可成为苏钟猪肉质改良育种中的重要候选基因。 展开更多
关键词 苏钟猪 脂蛋白脂肪酶 表达谱 生物信息学 脂肪沉积
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苏钟猪FTO基因的mRNA表达、克隆测序及其生物信息学分析 被引量：13
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作者 付言峰 李兰 +4 位作者 王学敏 李碧侠 方晓敏 赵芳 任守文 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2013年第1期128-134,共7页
脂肪肥胖相关基因(FTO)在控制食欲和能量消耗方面具有重要作用。为进一步了解猪FTO基因的结构和功能,以苏钟猪为试验对象,利用RT-PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(肺脏、肝脏、心脏、背膘和背最长肌)RNA水平的表达谱信息;对苏钟... 脂肪肥胖相关基因(FTO)在控制食欲和能量消耗方面具有重要作用。为进一步了解猪FTO基因的结构和功能,以苏钟猪为试验对象,利用RT-PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(肺脏、肝脏、心脏、背膘和背最长肌)RNA水平的表达谱信息;对苏钟猪FTO基因的编码序列(CDS)进行了克隆测序,并用生物信息学方法分析了苏钟猪FTO蛋白的结构和不同物种间的同源性。结果表明,FTO基因在苏钟猪各组织中的mRNA表达丰度表现为:背膘>心脏>肺脏>肝脏>背最长肌,其中背膘中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。苏钟猪FTO的CDS区发现了8个SNPs,分别为G52A、C523T、G628A、A655G、A810G、A886G、G1002A和A1344G。苏钟猪FTO基因编码一个含505个氨基酸的蛋白,理论等电点为5.23,具有亲水性,不存在信号肽,是非分泌型蛋白,与牛、绵羊、狗等物种的亲缘关系最近。FTO的mRNA表达对苏钟猪的皮下脂肪、心脏、肌肉等组织的脂肪沉积有一定影响,其编码序列中丰富的SNPs可成为苏钟猪肉质改良育种中的重要分子标记。 展开更多
关键词 苏钟猪 脂肪肥胖相关基因 克隆测序 遗传变异 生物信息学
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转录组测序分析猪胚胎附植的中期和后期卵巢差异表达基因 被引量：7
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作者 付言峰 李兰 +5 位作者 赵为民 方晓敏 李碧侠 王学敏 周李生 任守文 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1879-1888,共10页
胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素,本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因。选用5~7胎次梅山猪母猪4头,在其妊娠第18和24天分别屠宰2头,采集其卵巢组织进行转录组测序(RNA-seq)分析,GO功能富集分析及Pathway分析。结果表明:1)... 胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素,本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因。选用5~7胎次梅山猪母猪4头,在其妊娠第18和24天分别屠宰2头,采集其卵巢组织进行转录组测序(RNA-seq)分析,GO功能富集分析及Pathway分析。结果表明:1)猪胚胎附植中期卵巢(卵_18d)和后期卵巢(卵_24d)两个组织样检测到的表达基因中最多的序列(reads)均为外显子序列;卵_18d测得reads最多的染色体依次为6、14、1和7号,卵_24d依次为1、7、14和M号;卵_24d相较于卵_18d有更多的基因表达,且表达量更高;两个时期卵巢组织中表达量前50位的基因中,线粒体基因占60%以上。2)卵_24d相较于卵_18d,有581个基因上调和103个基因下调,其中二者之间表达差异最大的基因为EN19684,位于线粒体中;表达差异最大的染色体基因为EN11278,位于14号染色体中。3)差异表达基因显著富集于内皮细胞活化等38个生物学过程,宿主细胞质等19个细胞学分区和FAD-AMP裂解酶活性等16个分子功能;差异表达基因在185条生物通路上存在差异,其中前3位极显著差异的生物通路依次为PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路和昼夜周期。综上表明,在卵巢组织表达的基因,重点参与了胚胎附植后期的调控,且高表达量基因多集中在细胞线粒体中,差异表达基因功能以内皮细胞活化为主,生物通路以PI3K-Akt信号通路为主。 展开更多
关键词 猪 胚胎附植 转录组测序 基因 表达
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瘦素受体对苏钟猪脂肪沉积调控的影响 被引量：5
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作者 付言峰 李兰 +4 位作者 周艳红 李碧侠 方晓敏 王学敏 任守文 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期986-992,共7页
[目的]研究瘦素受体(leptin receptor,LEPR)的mRNA表达和编码序列单核苷酸多态性(c SNPs)对猪脂肪沉积性状的影响。[方法]本文旨在利用实时荧光定量PCR(RT-q PCR)方法和免疫印迹方法检测了该基因在高脂猪和低脂猪背最长肌、背膘、心、... [目的]研究瘦素受体(leptin receptor,LEPR)的mRNA表达和编码序列单核苷酸多态性(c SNPs)对猪脂肪沉积性状的影响。[方法]本文旨在利用实时荧光定量PCR(RT-q PCR)方法和免疫印迹方法检测了该基因在高脂猪和低脂猪背最长肌、背膘、心、肝和肾共5种组织样中的mRNA和蛋白表达量,利用直接测序方法检测了LEPR第18外显子c SNPs,并对LEPR表达量、编码序列单核苷酸多态位点与苏钟猪脂肪沉积相关性状进行了关联分析。[结果]RT-q PCR结果表明:LEPR mRNA在这5种组织中均有表达,且差异显著(P<0.05),其中背膘组织中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),其次为背最长肌中的表达量,高脂猪的mRNA表达量显著高于低脂猪(P<0.05)。Western blot结果表明,LEPR蛋白在背膘和背最长肌中显著表达,且高脂猪的蛋白表达量显著高于低脂猪(P<0.05),说明猪脂肪沉积量越高,LEPR mRNA和蛋白表达量越高。PCR-sequencing结果表明,在LEPR c DNA的c.2841C>T位点处,T等位基因为脂肪沉积的优势等位基因。[结论]LEPR的表达对苏钟猪脂肪沉积调控有显著影响,其c.2841C>T位点可作为苏钟猪脂肪沉积肉质性状改良育种的分子标记。 展开更多
关键词 瘦素受体 表达 编码序列单核苷酸多态 脂肪沉积 苏钟猪
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梅山猪胚胎附植期EphB2的组织表达及RNA-seq分析 被引量：4
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作者 付言峰 周艳红 +4 位作者 王爱国 李兰 刘红林 李碧侠 任守文 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1243-1248,共6页
猪产仔数是一个重要的经济和繁殖性状,而胚胎附植是影响猪产仔数的重要因素。为了研究促红细胞生成素产生肝细胞受体B2(Eph B2)对猪胚胎附植过程中子宫内膜迁移和粘附活动的影响,文章以太湖流域梅山猪为研究对象,利用实时荧光定量PCR(q ... 猪产仔数是一个重要的经济和繁殖性状,而胚胎附植是影响猪产仔数的重要因素。为了研究促红细胞生成素产生肝细胞受体B2(Eph B2)对猪胚胎附植过程中子宫内膜迁移和粘附活动的影响,文章以太湖流域梅山猪为研究对象,利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)方法,检测Eph B2基因在梅山猪胚胎附植前、中、后期子宫内膜附植点/非附植点和卵巢组织的m RNA和蛋白表达谱,并用转录组测序(RNA-seq)方法分析了不同附植时期子宫内膜附植点和卵巢组织的差异表达基因。q RT-PCR和Western blot结果表明,Eph B2在胚胎附植前、中、后期子宫内膜附植点和非附植点的m RNA和蛋白均呈现先升高后降低的表达趋势,且附植中期的表达量显著高于前期和后期(P<0.01);Eph B2在附植前、中、后期卵巢中的m RNA和蛋白表达趋势则相反,为先降低后升高,且不同时期间表达差异显著(P<0.05)。RNA-seq结果表明,Eph B2在子宫内膜附植点的m RNA表达,附植中期极显著高于附植前期(P<0.01);Eph B2在卵巢的m RNA表达,附植中期显著高于附植后期(P<0.05)。综上所述,Eph B2很可能在猪胚胎附植过程中发挥着重要的调控作用,为潜在的猪产仔数性状候选基因。 展开更多
关键词 EPHB2 胚胎附植 表达 转录组测序 梅山猪
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猪胚胎附植部分因子研究进展 被引量：6
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作者 付言峰 方晓敏 +4 位作者 李碧侠 赵为民 王学敏 陈哲 任守文 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第9期2676-2682,共7页
产仔数性状是养猪业中一个重要的经济性状,而胚胎附植对猪产仔数的高低有重要的影响。胚胎附植的调控涉及到多个生物学过程,在其中发挥作用的物质(附植因子)很多。作者针对孕酮、孕酮受体、雌二醇、雌激素受体α(ESR1)和促红细胞生成素... 产仔数性状是养猪业中一个重要的经济性状,而胚胎附植对猪产仔数的高低有重要的影响。胚胎附植的调控涉及到多个生物学过程,在其中发挥作用的物质(附植因子)很多。作者针对孕酮、孕酮受体、雌二醇、雌激素受体α(ESR1)和促红细胞生成素产生肝细胞受体配体(Eph-ephrin)系统这几种附植因子的相关研究进行了归纳总结,重点阐述了这些因子在母胎对话过程中的时空表达、功能、突变、调控等方面的研究进展。其中,孕酮及其受体在猪胚胎附植活动中全程发挥着重要作用,黄体分泌的孕酮与母猪子宫内膜腔上皮、腺上皮、基质和肌细胞中的孕酮受体结合发挥作用,使这些组织细胞分泌多种附植因子,这些附植因子进一步参与胚胎附植过程。雌二醇是雌激素中含量最多、活性最强的一种激素,主要由卵巢颗粒细胞分泌,雌激素受体α是子宫内雌二醇的主要受体,二者结合可使母猪发情;此外,附植中处于游离状态的胚泡也分泌雌二醇,其是一个让母猪子宫内膜得以识别的信号,允许胚泡附植。Eph-ephrin系统作用广泛,其在人、小鼠和猪的胚胎附植过程中发挥着重要作用。系统中的EphA1、ephrin A1、EphA4等基因在猪的胚胎附植期表达量显著高于空怀猪,它们在子宫内膜附植点的表达量显著高于附植点间的部位,且ephrin A1的抑制表达会降低子宫内膜上皮细胞的迁移和黏附能力。这些附植因子都在猪胚胎附植活动中发挥着重要作用,对它们的深入研究将有利于明确猪胚胎附植调控机理,进一步揭示猪高繁机理。 展开更多
关键词 猪 胚胎附植 孕酮 雌激素 Eph-ephrin
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