铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因的筛选及生物学功能分析

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作者 刘国红 任雨轩 +2 位作者 邵谦毅 梁硕 王丽萍 《山东医药》 CAS 2024年第12期37-41,共5页

目的筛选铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能。方法12只6周龄雄性SD大鼠随机分为铁蓄积组和对照组,每组6只,铁蓄积组隔天腹腔注射蔗糖铁溶液制备铁蓄积模型,对照组注射等量生理盐水,14周后取血和食管... 目的筛选铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能。方法12只6周龄雄性SD大鼠随机分为铁蓄积组和对照组,每组6只,铁蓄积组隔天腹腔注射蔗糖铁溶液制备铁蓄积模型,对照组注射等量生理盐水,14周后取血和食管、肝等组织,应用血清学、组织学方法鉴定铁蓄积造模是否成功;剥离两组食管黏膜组织,采用转录组测序技术筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)功能富集分析及真核生物蛋白相邻类的聚簇(KOG)分类富集分析。结果筛选出9个差异表达基因,5个上调基因包括昼夜相关转录抑制因子(Ciart)、液泡蛋白质分选因子25(Vps25)、甲状腺激素应答蛋白(Thrsp)、UDP-N-乙酰氨基葡萄糖焦磷酸化酶1(Uap1)、血清解整合素—金属蛋白酶33(Adam33),4个下调基因包括过氧化物酶基因(Pxdn)、硫酸乙酰肝素蛋白多糖基因2(Hspg2)、中心体相关蛋白2(Cep2)、G蛋白信号转导调节因子4(Rgs4)。GO功能富集分析显示,上调基因的生物过程(BP)集中在节律过程、代谢过程、行为、生物过程调节、特定位置运动、生物过程的负调控、生物调节、定位、细胞过程、多细胞生物过程;细胞组成(CC)主要集中在膜封闭腔、细胞器部分、细胞器、膜、细胞外区域部分、膜部分、细胞部分、细胞;分子功能(MF)主要集中在结合、结构分子活性、催化活性。下调基因的BP主要集中在解毒、刺激反应、细胞组成或生物形成、信号、生物过程的负调控、生物过程的正调节、发育过程、细胞过程、生物过程调节、生物调节、代谢过程;CC主要集中在细胞外基质、细胞外基质组成、细胞外区域部分、细胞外区域、细胞器、膜、细胞部分、细胞;MF主要集中在酶调节活性、抗氧化活性、分子功能调节剂、受体调节活性、结构分子活性、结合、催化活性。KOG分类富集分析显示,表达上调的基因中有3个获得功能注释,Uap1被注释到细胞壁/膜/包膜生物形成,Adam33被注释到翻译后修饰,蛋白质折叠和伴侣蛋白,Vps25被注释到功能预测。表达下调的基因中有2个获得功能注释,Rgs4被注释到信号转导机制,Hspg2被注释到翻译后修饰,蛋白质折叠和伴侣蛋白。结论铁蓄积大鼠食管黏膜组织中共筛选出9个差异表达基因,包括5个表达上调基因和4个表达下调基因。GO功能富集分析显示差异表达基因主要参与的BP包括节律过程、代谢过程、细胞过程、生物过程调节等,主要参与的CC包括细胞器、膜、细胞外区域部分等,主要参与的MF包括结合、催化活性、结构分子活性。有5个差异基因获得KOG功能注释,包括翻译后修饰、蛋白质折叠和伴侣蛋白、信号转导等,主要参与细胞周期、细胞代谢、细胞增殖及氧化应激等通路。 展开更多

关键词 铁蓄积 差异表达基因 基因本体功能富集 真核生物蛋白相邻类的聚簇分类富集

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钩端螺旋体OmpR家族相关TCS 鉴定及功能初探

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作者 戴欣珏 夏文浩 +2 位作者 任雨轩 车名花 胡玮琳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期197-202,共6页

目的建立钩端螺旋体(钩体)OmpR家族双组分系统(TCS)的鉴定方法,初步探讨OmpR家族TCS在钩体感染人巨噬细胞过程中对钩体主要外膜蛋白(OMPs)表达水平的调控作用。方法采用生物信息学技术预测致病性钩体赖株TCS的组氨酸激酶(HK)和应答调节... 目的建立钩端螺旋体(钩体)OmpR家族双组分系统(TCS)的鉴定方法,初步探讨OmpR家族TCS在钩体感染人巨噬细胞过程中对钩体主要外膜蛋白(OMPs)表达水平的调控作用。方法采用生物信息学技术预测致病性钩体赖株TCS的组氨酸激酶(HK)和应答调节蛋白(RR)OmpR功能结构域。采用激酶活性检测试剂盒和细菌双杂交技术进一步验证各HK激酶活性以及各HK与RR的相互作用。采用qRT-PCR法检测HK抗血清封闭前后钩体主要OMPs基因mRNA水平的变化。结果钩体56601株中LA2828、LA1710含有HATPase_c激酶催化结构域,LA2827、LA1709含有Response_reg与OmpR功能结构域,提示其分别可构成HK/OmpR-TCS。体外重组HK-2828和HK-1710蛋白均具有激酶活性,且分别与OmpR-2827和OmpR-1709存在直接的相互作用。HK-2828抗体封闭处理可使感染过程中显著下降的外膜蛋白编码基因lipL32、lipL41和ompL1的mRNA水平明显回升。结论成功构建钩体OmpR家族-TCS鉴定及功能探究体系,为阐明感染过程中问号钩体OMPs表达改变调控机制,以及制定基因工程疫苗OMPs抗原筛选新策略提供依据。 展开更多

关键词 钩端螺旋体 双组分系统 外膜蛋白

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城市公共空间雨水径流的景观化循环利用策略

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作者 王皖杰 肖栋 +3 位作者 谢圣楠 任雨轩 张军 郝云涛 《自然科学》 2024年第3期561-570,共10页

城市公共空间作为城市中重要且独特的空间资源,在提升城市环境、传承历史风貌和推进城市发展上有着巨大的价值,城市公共空间的存量资源活化与更新设计研究具有重要的现实意义。以景观小品式径流雨水循环利用系统设计为研究目标,采用煤... 城市公共空间作为城市中重要且独特的空间资源,在提升城市环境、传承历史风貌和推进城市发展上有着巨大的价值,城市公共空间的存量资源活化与更新设计研究具有重要的现实意义。以景观小品式径流雨水循环利用系统设计为研究目标,采用煤矸石和玉米秸秆为主要基质共炭化制备高通孔型生态砌块并对材料的吸附性能、水理性能、力学性能进行表征,以生态砌块为核心构建了联合循环系统(EBCCS)并通过柱实验方法优化了系统设计条件和对雨水径流溶解性有机质(DOM)的去除效率,并以EBCCS为核心提出了面向城市公共空间微更新的功能型装配式景观小品设计方案,为深入挖掘城市空间的多元价值和盘活公共空间存量资源提供新思路。 展开更多

关键词 生态砌块 雨水径流 景观小品 城市公共空间 城市微更新

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2022年诺贝尔化学奖解读——点击化学和生物正交化学

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作者 宋新强 张玉 +3 位作者 程永明 任雨轩 田梓煜 张牧 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2023年第3期509-516,共8页

2022年诺贝尔化学奖授予美国化学家卡尔·巴里·夏普利斯(K.Barry SHARPLESS)、丹麦化学家摩顿·梅尔达尔(Morten MELDAL)和美国化学家卡罗琳·贝尔托西(Carolyn R.BERTOZZI),以表彰他们为发明和发展点击化学和生物正... 2022年诺贝尔化学奖授予美国化学家卡尔·巴里·夏普利斯(K.Barry SHARPLESS)、丹麦化学家摩顿·梅尔达尔(Morten MELDAL)和美国化学家卡罗琳·贝尔托西(Carolyn R.BERTOZZI),以表彰他们为发明和发展点击化学和生物正交化学所做出的突出贡献。详细介绍了点击化学和生物正交化学在生物学科领域中的应用,并展望了其在化学学科和生物学科领域面临的新挑战和新机遇。点击化学和生物正交化学是人类探究生物化学过程本质的高效分子水平构建工具。 展开更多

关键词 点击化学 生物正交化学 铜催化的叠氮-炔环加成反应 蛋白质标记

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信阳市入侵植物空心莲子草群落数量分类及功能群研究 被引量：8

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作者 吴昊 蔡东章 +2 位作者 高靓文 任雨轩 饶本强 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2020年第2期250-257,共8页

在信阳市空心莲子草(Alternanthera philoxeroides)广泛入侵的区域设置20个样地进行群落学调查,利用TWINSPAN分类和DCA排序等数量生态学技术划分其群丛类型及功能群结构,并探讨功能群多样性与空心莲子草入侵态势的关系.结果表明:20个样... 在信阳市空心莲子草(Alternanthera philoxeroides)广泛入侵的区域设置20个样地进行群落学调查,利用TWINSPAN分类和DCA排序等数量生态学技术划分其群丛类型及功能群结构,并探讨功能群多样性与空心莲子草入侵态势的关系.结果表明:20个样地群落可划分为3组群丛类型.分别为:空心莲子草+马唐群丛、空心莲子草+稻稗群丛和空心莲子草+麦冬+婆婆纳群丛.群落中的78种植物可划分为3组功能群,分别为:禾本科功能群、菊科功能群和其他类杂草功能群.随着群落中伴生植物总属数和总种数的上升,空心莲子草入侵重要值显著下降.随着禾本科和菊科功能群物种数目的上升,群落的4个α物种多样性指数显著上升,且禾本科功能群对于多样性的提升作用高于菊科功能群. 展开更多

关键词 生物入侵 空心莲子草 群落 分类 功能群

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雷公藤红素治疗类风湿关节炎的组学联合分析 被引量：3

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作者 宋新强 任雨轩 +6 位作者 代二琴 张玉 何欢欢 范金克 赵丽君 彭涛 王磊 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2022年第2期202-209,共8页

用雷公藤红素处理成纤维样滑膜细胞,通过RNA测序、定量蛋白质组学、分子对接、qPCR和Western blot检测和验证,筛选到差异基因和蛋白质,获得7803个基因和3372个蛋白质,雷公藤红素作用机制与氧化应激和氧气水平高低相关,也涉及细胞组分和... 用雷公藤红素处理成纤维样滑膜细胞,通过RNA测序、定量蛋白质组学、分子对接、qPCR和Western blot检测和验证,筛选到差异基因和蛋白质,获得7803个基因和3372个蛋白质,雷公藤红素作用机制与氧化应激和氧气水平高低相关,也涉及细胞组分和细胞外基质蛋白的稳定和合成通路。结果显示,雷公藤红素可通过这些机制来抑制类风湿关节炎的发病。 展开更多

关键词 类风湿关节炎 成纤维样滑膜细胞 雷公藤红素 RNA测序 蛋白质组 分子对接

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2021年诺贝尔生理学或医学奖解读 被引量：2

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作者 宋新强 任雨轩 +5 位作者 张玉 何欢欢 范金克 赵丽君 朱晓雯 彭涛 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2022年第3期510-516,共7页

2021年诺贝尔生理学或医学奖授予美国神经生理学家David JULIUS(戴维·朱利叶斯)和美国神经生物学家Ardem PATAPOUTIAN(阿德姆·帕塔普蒂安),以表彰他们在温度和触觉感受器方面做出的杰出贡献。他们分别发现瞬时受体电位(TRP)... 2021年诺贝尔生理学或医学奖授予美国神经生理学家David JULIUS(戴维·朱利叶斯)和美国神经生物学家Ardem PATAPOUTIAN(阿德姆·帕塔普蒂安),以表彰他们在温度和触觉感受器方面做出的杰出贡献。他们分别发现瞬时受体电位(TRP)和机械压力受体(PIEZO)通道,研究它们在温觉、痛觉、触觉、压力和身体位置的感知中发挥的不同作用,为理解机体如何感知温度和机械刺激奠定了基础,并进一步理解感知觉与其他生理病理活动的内在关系。探讨了如何以此为靶点,开发出有效药物,推动医学与生理学的发展。 展开更多

关键词 2021年诺贝尔生理学或医学奖 温度感受器 触觉感受器 辣椒素 瞬时受体电位

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空心莲子草内生真菌多样性研究 被引量：5

8

作者 卢东升 任雨轩 +1 位作者 周营 陈阳 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2018年第2期227-232,共6页

通过采样、组织分离、培养和鉴定,对入侵植物空心莲子草(Alternanthera philoxeroides)内生真菌的种类组成、分布规律及其生物多样性进行了初步研究.结果表明:空心莲子草内生真菌种类丰富,从茎、叶中共分离得到16种内生真菌.产孢真菌有1... 通过采样、组织分离、培养和鉴定,对入侵植物空心莲子草(Alternanthera philoxeroides)内生真菌的种类组成、分布规律及其生物多样性进行了初步研究.结果表明:空心莲子草内生真菌种类丰富,从茎、叶中共分离得到16种内生真菌.产孢真菌有12属15种,非产孢真菌1种.产孢真菌全部为半知菌.曲霉1(Aspergillus sp.1)、曲霉2(Aspergillus sp.2)、刺盘孢菌(Colletotrichum sp.)、大茎点霉(Macrophoma sp.)、弯孢霉菌(Curvularia sp.)在供试的各种组织均有分布,且分离率较高,是空心莲子草的优势内生真菌.内生真菌广泛分布于各种组织,总定殖率为81.5%,老茎组织定殖率最高,达90.9%.生境及组织类型对空心莲子草内生真菌的群落结构及定殖率有重要影响. 展开更多

关键词 空心莲子草 内生真菌 多样性

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钢渣/硅藻土复合吸附材料的制备及其性能表征

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作者 张婕 李瑞元 +2 位作者 白浩 任雨轩 王雨馨 《科技资讯》 2020年第2期1-3,共3页

该实验首先对硅藻土原粉进行物理-化学提纯,以钢渣和硅藻土为基体材料,外加黏合剂、造孔剂进行复配,制备出吸附性能优于硅藻土和钢渣单独作为吸附剂使用的一种复合吸附材料。根据复合吸附材料对甲基橙溶液的吸附能力,确定出最佳制备配比... 该实验首先对硅藻土原粉进行物理-化学提纯,以钢渣和硅藻土为基体材料,外加黏合剂、造孔剂进行复配,制备出吸附性能优于硅藻土和钢渣单独作为吸附剂使用的一种复合吸附材料。根据复合吸附材料对甲基橙溶液的吸附能力,确定出最佳制备配比:硅藻土质量分数占36%;钢渣质量分数占36%;钠基膨润土为黏合剂,质量分数占20%;碳酸钠和淀粉(碳酸钠∶淀粉=7∶3)为造孔剂,质量分数占8%。通过SEM和XRD对硅藻土和复合材料的微观形貌和物相组成进行分析。结果发现提纯后硅藻土具有明显均匀的微孔结构,与钢渣复配后,钢渣粒子均匀分布在硅藻土表面,增大吸附材料的孔隙结构,有利于增加比表面积和吸附点,提高了吸附染色剂的能力。 展开更多

关键词 硅藻土 钢渣 吸附

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钢渣/硅藻土复合吸附材料吸附条件的确定

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作者 张婕 李瑞元 +2 位作者 白浩 任雨轩 王雨馨 《山东化工》 CAS 2019年第23期134-135,共2页

本实验在确定出钢渣,硅藻土复合最佳制备配比:硅藻土质量分数占36%;钢渣质量分数占36%;钠基膨润土为黏合剂,质量分数占20%;碳酸钠和淀粉(碳酸钠∶淀粉=7∶3)为造孔剂,质量分数占8%的前提下,通过改变pH值、温度、吸附时间确定出钢渣/硅... 本实验在确定出钢渣,硅藻土复合最佳制备配比:硅藻土质量分数占36%;钢渣质量分数占36%;钠基膨润土为黏合剂,质量分数占20%;碳酸钠和淀粉(碳酸钠∶淀粉=7∶3)为造孔剂,质量分数占8%的前提下,通过改变pH值、温度、吸附时间确定出钢渣/硅藻复合吸附材料对甲基橙染料的最佳吸附条件。 展开更多

关键词 硅藻土 钢渣 PH值 温度 吸附时间

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仿生涂层在多孔聚氨酯泡沫介电层中的应用 被引量：1

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作者 马竹玉 成俊鹏 +2 位作者 任雨轩 邓华 傅强 《高分子材料科学与工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第10期117-123,132,共8页

近来,柔性压力传感器在感知机械刺激方面的潜力引发了人们对可穿戴电子设备等前沿应用的巨大兴趣。其中电容式压力传感器具有超快响应、较低功耗和较小的信号漂移的优点,被认为是高性能柔性传感器的最佳选择。目前,电容式传感器在大应... 近来,柔性压力传感器在感知机械刺激方面的潜力引发了人们对可穿戴电子设备等前沿应用的巨大兴趣。其中电容式压力传感器具有超快响应、较低功耗和较小的信号漂移的优点,被认为是高性能柔性传感器的最佳选择。目前,电容式传感器在大应变下依旧具有明显电容变化还是十分有挑战性的。文中报道了在多孔介电层中引入介电常数较高的钛酸钡(BaTiO,BT),通过介电谱仪测量多孔介电层的介电常数时发现其值从2.51提升至3.83,这有利于传感信号(S=0.075 kPa)的放大。针对在实际应用中,该类泡沫基传感器因填料和基体脱粘导致循环稳定性较差的问题,尝试改变填料的形貌来改善上述问题并初步获得了一定的效果。这一方法旨在为泡沫基电容式传感器在柔性电子领域中的应用提供新思路。 展开更多

关键词 柔性电容传感器 高灵敏度 钛酸钡纳米填料 树枝状涂层 复合泡沫

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芯片法筛选钩端螺旋体外膜蛋白抗原表位 被引量：1

12

作者 胡玮琳 夏文浩 任雨轩 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期970-974,共5页

目的通过芯片法筛选钩端螺旋体主要外膜蛋白中抗原表位,为后续研制有广泛交叉保护作用的通用钩体疫苗提供科学依据。方法采用PCR及测序法检测主要外膜蛋白编码基因在不同血清群钩体中的分布情况及其序列相似性。采用生物信息学软件预测... 目的通过芯片法筛选钩端螺旋体主要外膜蛋白中抗原表位,为后续研制有广泛交叉保护作用的通用钩体疫苗提供科学依据。方法采用PCR及测序法检测主要外膜蛋白编码基因在不同血清群钩体中的分布情况及其序列相似性。采用生物信息学软件预测钩体外膜蛋白抗原表位。采用抗体纯化磁珠试剂盒纯化大鼠抗不同血清群钩体抗血清IgG。采用抗原芯片法检测各抗原肽的免疫反应性,确定优势抗原表位。结果候选抗原蛋白编码基因均广泛存在于不同血清群的致病性钩体中且序列保守。综合生物信息学软件结果预测出30个候选T-B联合抗原表位。合成短肽结合芯片检测方法共筛选出9个优势抗原表位,各抗原肽对不同血清群钩体抗血清IgG反应性基本一致。结论芯片法可高效筛选钩体外膜蛋白优势表位,为表位肽疫苗的研制提供支持。 展开更多

关键词 钩端螺旋体 抗原表位 芯片

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基于单次曝光多光谱关联成像系统带通滤波器的研究 被引量：2

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作者 李美萱 张斯淇 +3 位作者 李宏 李楠 任雨轩 田嘉龙 《红外与激光工程》 EI CSCD 北大核心 2020年第9期243-249,共7页

多光谱关联成像与传统点到点的成像方式不同,该技术是采用调制、解调的方式获取目标的图像信息。搭建了一套基于固定相位板的单次曝光多光谱关联成像系统,完成了多光谱关联成像系统中薄膜器件的研制。选择BK7玻璃作为基底材料,氧化铌(Nb... 多光谱关联成像与传统点到点的成像方式不同,该技术是采用调制、解调的方式获取目标的图像信息。搭建了一套基于固定相位板的单次曝光多光谱关联成像系统,完成了多光谱关联成像系统中薄膜器件的研制。选择BK7玻璃作为基底材料,氧化铌(Nb2O5)和二氧化硅(SiO2)为高、低折射率材料。根据光学薄膜基础理论,结合膜系设计软件进行膜系设计和模拟分析,通过建立膜系优化评价函数,实现了0°~30°入射450~700 nm带通滤光膜的设计,并在OZZSQ900型箱式真空镀膜机上完成了该薄膜的研制。通过优化SiO2膜沉积速率,改善了薄膜表面缺陷,降低了散射损耗。对膜层的残余蒸镀进行分析,利用最小二乘法建立膜层厚度与残余蒸镀量之间拟合函数,调整监控方式,减小残余蒸镀,提高了制备过程中膜厚控制精度。采用安捷伦Cary5000分光光度计测试,在350~440 nm和710~800 nm波段透过率T<0.5%,450~700 nm范围内,光线入射角0°~30°时平均透过率T>98%的带通滤波器,满足系统使用要求,该研究具有重要的实际意义和工程价值。 展开更多

关键词 多光谱 关联成像 单次曝光 带通滤波器

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创伤弧菌转录调控因子OmpR的致病相关功能鉴定

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作者 夏文浩 任雨轩 +1 位作者 徐雨露 胡玮琳 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期784-790,共7页

目的研究转录调控因子OmpR在创伤弧菌中致病相关的生物学功能及分子机制。方法通过基因无痕敲除技术构建创伤弧菌ompR基因敲除株(ΔompR)。通过生长曲线测定法检测不同渗透压下菌株的耐受力,细菌泳动试验检测运动性,结晶紫染色试验检测... 目的研究转录调控因子OmpR在创伤弧菌中致病相关的生物学功能及分子机制。方法通过基因无痕敲除技术构建创伤弧菌ompR基因敲除株(ΔompR)。通过生长曲线测定法检测不同渗透压下菌株的耐受力,细菌泳动试验检测运动性,结晶紫染色试验检测细菌生物膜形成能力,菌落计数法测定创伤弧菌ΔompR株黏附细胞的变化,乳酸脱氢酶释放法测定创伤弧菌ΔompR株对细胞毒性的变化,以明确ΔompR株的致病性相关生物学表型;实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)法检测创伤弧菌ΔompR株和野生株中毒力相关靶基因ompN、ompU、ompA、hcp2的mRNA水平变化。结果成功构建创伤弧菌ΔompR株。与野生株相比,ΔompR株在高渗透压培养基中生长缓慢,生物膜形成能力减弱,细菌运动性未有明显差异,ΔompR株对细胞的黏附率和毒性显著低于野生株。ΔompR株中渗透压调节及生物膜形成相关ompN基因mRNA水平显著下调(P<0.05),其他靶基因mRNA水平无明显变化。结论OmpR参与调控创伤弧菌高渗透压环境下生长、生物膜形成、对细胞的黏附及毒性。 展开更多

关键词 创伤弧菌 OMPR 功能鉴定

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