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基于再抽样模拟表达谱研究Meta分析的假设检验方法
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作者 何杰宇 孙金芳 +2 位作者 王莉娜 闵捷 余小金 《循证医学》 CSCD 2017年第3期175-179,183,共6页
目的介绍基于再抽样模拟表达谱研究Meta分析的假设检验方法及其软件实现。方法采用经验分布模拟抽样方法实现表达谱研究Meta分析中计数效应指标的假设检验,以甲状腺癌表达谱研究Meta分析为例,说明实现过程,并采用SAS软件编程实现。结果... 目的介绍基于再抽样模拟表达谱研究Meta分析的假设检验方法及其软件实现。方法采用经验分布模拟抽样方法实现表达谱研究Meta分析中计数效应指标的假设检验,以甲状腺癌表达谱研究Meta分析为例,说明实现过程,并采用SAS软件编程实现。结果基于经验分布的再抽样方法可得到某特定重复报道研究数下基因数的分布,从而对分析中得到的计数效应指标进行假设检验。结论基于再抽样模拟表达谱研究Meta分析的假设检验,可用于无理论分布效应量的假设检验,基因表达谱研究的系统评价与Meta分析为其主要应用领域,可推广到其他类似研究。 展开更多
关键词 META分析 再抽样模拟 表达谱研究 假设检验
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槐角黄酮的体外抗氧化活性研究 被引量:16
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作者 陈明珠 申艳艳 +3 位作者 赵越 秦伟 何杰宇 许茜 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期94-96,共3页
选用回流法提取槐角中黄酮类化合物,采用DPPH.法、邻苯三酚自氧化法和邻二氮菲法,测定了槐角黄酮对DPPH.、O2-.、.OH的清除率,并与维生素C(VC)比较,进行槐角黄酮的体外抗氧化活性研究。结果表明,槐角黄酮具有一定的抗氧化能力,在一定浓... 选用回流法提取槐角中黄酮类化合物,采用DPPH.法、邻苯三酚自氧化法和邻二氮菲法,测定了槐角黄酮对DPPH.、O2-.、.OH的清除率,并与维生素C(VC)比较,进行槐角黄酮的体外抗氧化活性研究。结果表明,槐角黄酮具有一定的抗氧化能力,在一定浓度范围内,清除自由基能力与其浓度呈正相关性。与阳性对照VC相比,槐角黄酮对DPPH.的清除作用较弱,IC50为0.0192mg/mL;而对O2-.、.OH的清除作用较强,IC50分别为0.0127、0.0160mg/mL。这表明槐角黄酮具有一定的抗氧化能力。 展开更多
关键词 槐角 黄酮 抗氧化活性
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血清胰腺再生蛋白水平预测2型糖尿病及其慢性并发症发生的价值 被引量:6
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作者 李玲 杨家悦 +3 位作者 祝祥云 吴春华 何杰宇 黄灏 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期159-163,共5页
目的检测不同临床阶段2型糖尿病(T2DM)患者胰腺再生蛋白(Reg)水平,分析血清Reg与T2DM及其慢性并发症的关系。方法选取2012年9月—2014年12月东南大学附属中大医院及南京6个社区医院(红山、玄武、莫愁、夫子庙、中华门和徐家巷)收治的门... 目的检测不同临床阶段2型糖尿病(T2DM)患者胰腺再生蛋白(Reg)水平,分析血清Reg与T2DM及其慢性并发症的关系。方法选取2012年9月—2014年12月东南大学附属中大医院及南京6个社区医院(红山、玄武、莫愁、夫子庙、中华门和徐家巷)收治的门诊、住院患者以及健康体检者,根据诊断标准与排除标准共纳入950名参与者,将其分为5组:健康对照组(HC组,n=97)、高危人群组(HR组,n=209)、糖调节受损组(IGR组,n=292)、初发T2DM组(Onset组,n=188)和长程T2DM无并发症组(LD-无并发症组,n=94)、长程T2DM有并发症组(LD-有并发症组,n=70)。采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定受试者清晨空腹状态下的血清Reg水平,分析Reg与T2DM病程及慢性并发症的关系。结果各组年龄、糖尿病家族史、吸烟史、收缩压比较,差异均无统计学意义(P>0.05);各组性别、体质指数(BMI)、舒张压、空腹血糖(FPG)、餐后2 h血糖(2 h PG)、糖化血红蛋白(Hb A1c)、Reg比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。T2DM患者血清Reg水平与病程呈正相关(rs=0.284,P<0.01)。在所有受试者中血清Reg水平与Hb A1c、FPG、2 h PG呈正相关(rs=0.188、0.115、0.111,P<0.001)。Reg诊断T2DM的ROC曲线下面积为0.640〔95%CI(0.605,0.674)〕,最佳截点为25 ng/ml,其灵敏度为46%,特异度为76%,阳性似然比为1.92,阴性似然比为0.71。Reg诊断T2DM慢性并发症的ROC曲线下面积为0.754〔95%CI(0.694,0.813)〕,最佳截点为27 ng/ml,其灵敏度为65%,特异度为74%,阳性似然比为2.50,阴性似然比为0.47。结论检测血清Reg水平有助于预测T2DM及其慢性并发症,Reg将来可能成为T2DM及其进展的一种预测因子。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 胰腺再生蛋白 胰岛素分泌细胞
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控制混杂因素的基于随机森林方法评价
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作者 梁君雅 赵杨 +3 位作者 段巍巍 何杰宇 魏永越 陈峰 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2022年第6期844-849,共6页
目的在高维组学研究中,混杂因素常常影响着随机森林筛选出与研究结局相关联的变量的能力,因此控制混杂因素具有非常重要的作用。方法通过模拟试验和实例验证,我们比较了以下四种方法在筛选与研究结局相关联的变量中控制混杂因素的效果:... 目的在高维组学研究中,混杂因素常常影响着随机森林筛选出与研究结局相关联的变量的能力,因此控制混杂因素具有非常重要的作用。方法通过模拟试验和实例验证,我们比较了以下四种方法在筛选与研究结局相关联的变量中控制混杂因素的效果:随机森林(random forest,RF);Ranger法;加权Ranger,给予每个混杂因素以100%的权重;残差法,将去除混杂因素的因变量和自变量作为新的因变量和自变量纳入Ranger分析。研究采用危险因素在重要性评分排序中排在第一位的比例作为评价指标。结果基于大量的模拟试验,我们发现残差法和加权Ranger法有效提高了危险因素在重要性评分排序中排在第一位的比例。GWAS实例证实,在使用这两种方法校正混杂因素之后,危险因素的排序有所提前。结论校正混杂因素对于筛选与研究结局相关联的变量十分必要,且残差法在混杂因素校正上表现优于加权Ranger法,RF和Ranger几乎无混杂校正作用。 展开更多
关键词 混杂 随机森林 RANGER 加权 重要性评分
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基于随机森林算法和多因素logistic回归分析模型的孕期抑郁影响因素 被引量:2
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作者 邓淦元 杨中婷 +7 位作者 杜兴梅 邓春燕 宋婷 李瑞雨 何杰宇 邓睿 黄源 陈莹 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1003-1009,共7页
目的分析孕期抑郁检出率探讨可能的影响因素,识别高危人群为预防抑郁症提供科学依据。方法对云南省某县2022年5月处于孕期的女性人群采用爱丁堡产后抑郁症量表(Edinburgh Postnatal Depression Scale,EPDS)进行抑郁筛查,利用随机森林算... 目的分析孕期抑郁检出率探讨可能的影响因素,识别高危人群为预防抑郁症提供科学依据。方法对云南省某县2022年5月处于孕期的女性人群采用爱丁堡产后抑郁症量表(Edinburgh Postnatal Depression Scale,EPDS)进行抑郁筛查,利用随机森林算法对影响因素进行重要性排序,用滑动窗口序贯向前选择法降维,将重要性评分最高且平均袋外估算误差率最小的影响因素纳入多因素logistic回归分析模型,估计影响因素的作用方向及效应值。结果732名孕妇接受问卷筛查,孕期抑郁检出率为13.8%(101/732)。随机森林算法分析显示,变量数为7时平均袋外估算误差率最小。将重要性排名前7的影响因素纳入多因素logistic回归分析模型,结果显示:孕期焦虑、既往不良情绪史、生孩子的经济担忧、家人对孩子有性别期盼是孕期抑郁的危险因素,第2次怀孕、高社会支持水平是孕期抑郁的保护因素,孕妇自评健康状况不满意与孕期抑郁无关。结论孕期有焦虑的女性很可能伴有抑郁,对生育费用、孩子性别的担忧和既往的不良情绪史会增加孕期抑郁的风险,足够的社会支持和既往的孕育史可以减少孕期抑郁发生的风险。建议加强孕期抑郁筛查,早期识别孕期抑郁症的高危人群。 展开更多
关键词 孕期抑郁 随机森林算法 多因素logistic回归分析模型 影响因素
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基于贝叶斯模型平均的基准剂量估计及其在白银市人群镉暴露评估中的应用 被引量:1
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作者 贺娜娜 孙金芳 +1 位作者 何杰宇 余小金 《环境与职业医学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1004-1010,共7页
[背景]最优模型法估计基准剂量(BMD)时未考虑模型选择的不确定性,国内暂无使用贝叶斯模型平均(BMA)估计BMD的研究。[目的]将BMA应用于我国镉污染的暴露评估研究,讨论BMA在基于剂量-反应模型的BMD估计中的作用,为有害物质健康风险评估提... [背景]最优模型法估计基准剂量(BMD)时未考虑模型选择的不确定性,国内暂无使用贝叶斯模型平均(BMA)估计BMD的研究。[目的]将BMA应用于我国镉污染的暴露评估研究,讨论BMA在基于剂量-反应模型的BMD估计中的作用,为有害物质健康风险评估提供方法学支持。[方法]模拟研究基于甘肃省白银市某镉污染区数据获得的不同剂量-反应模型(Gamma、Loglogistic、Log-probit、Two-stage和Weibull模型)的参数和中国5个镉污染区的尿镉范围,模拟不同正确模型、不同剂量组数(5、8)、不同样本量(50、100、200)的模拟数据,比较BMA和最优模型法的优劣。实例分析使用甘肃省白银市某镉污染区的镉暴露数据。模拟研究和实例分析均以尿镉为镉暴露指标,β_(2)-微球蛋白异常率为效应指标,基准反应设定为10%,分别使用正确模型(模拟数据时使用的模型)、最优模型法[赤池信息准则(AIC)最小的模型]和BMA估计BMD及其95%置信区间下限(BMDL);比较不同方法估计的BMD、BMDL及相对偏差。[结果]对于模拟研究,随着样本量或剂量组数增加,BMD的第5百分位数和第90百分位数区间大致呈现变窄趋势;当正确模型为单一模型时,BMA估计的BMD相对偏差大于最优模型法;当正确模型为等权重混合模型时,BMA估计的BMD相对偏差小于最优模型法。基于实例数据,最优模型为Log-probit模型(AIC=1814.46),其次为Log-logistic模型(AIC=1814.57);Log-probit模型、Log-logistic模型和BMA估计的BMD(BMDL)分别为3.46(2.68)、3.16(2.33)和2.92(2.07)μg·g^(−1)。[结论]在正确模型已知时,最优模型法依然是值得推荐的方法;但在有害物质剂量-反应关系高度不确定或来源人群、暴露分组等不同时,BMA与最优模型法相比,理论上更充分地考虑了可能存在的多个备选模型,能提供更为稳定的BMD和BMDL估计。 展开更多
关键词 基准剂量 剂量-反应模型 贝叶斯模型平均 尿镉 暴露评估
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1990-2019年中国20~84岁人群胰腺癌发病趋势分析 被引量:10
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作者 冯程程 许传志 +3 位作者 何杰宇 梁雪萌 孙浩 常巍 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2022年第18期1323-1329,共7页
目的了解1990-2019年中国20~84岁人群胰腺癌的发病趋势,分析年龄、时期和出生队列效应对中国胰腺癌发病率变化的影响。方法利用全球健康数据交换库收集1990-2019年中国20~84岁人群胰腺癌的发病数据并计算中标率,采用Joinpoint软件分析... 目的了解1990-2019年中国20~84岁人群胰腺癌的发病趋势,分析年龄、时期和出生队列效应对中国胰腺癌发病率变化的影响。方法利用全球健康数据交换库收集1990-2019年中国20~84岁人群胰腺癌的发病数据并计算中标率,采用Joinpoint软件分析胰腺癌标化发病率的变化趋势,应用年龄-时期-队列模型对数据进行拟合,利用内生因子算法估计年龄、时期和队列参数效应。结果1990-2019年,20~84岁人群胰腺癌标化发病率从1990年的4.54/10万上升至2019年的7.95/10万,增长了75.11%;男性胰腺癌标化发病率从5.47/10万上升至10.04/10万,增长了83.55%;女性胰腺癌标化发病率从3.63/10万上升至5.91/10万,增长了62.81%。男性胰腺癌标化发病率的平均年度变化百分比(AAPC)为2.10%(95%CI:1.78%~2.41%),女性胰腺癌标化发病率的AAPC为1.71%(95%CI:1.55%~1.87%)。APC模型结果显示,胰腺癌发病风险的年龄效应和时期效应呈递增趋势,发病风险的队列效应呈递减趋势,差异均有统计学意义,P<0.05。其中男性和女性均为20~24岁年龄组发病风险最小,效应值分别为-2.82和-2.35;80~84岁年龄组发病风险最大,效应值分别为1.44和1.66;1992年时期效应最低,效应值分别为-0.61和-0.45,2017年时期效应最高,效应值分别为0.57和0.43;1908-1912年出生的男性胰腺癌发病风险最高,为1.01。结论中国20~84岁人群胰腺癌发病率呈上升趋势,胰腺癌发病风险随年龄和时期的增加而增长,随出生队列的增加而降低,今后应加强对中老年人群的胰腺癌防控工作,进一步减轻我国胰腺癌的疾病负担。 展开更多
关键词 胰腺癌 发病率 时间趋势 joinpoint回归分析 年度变化百分比模型
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