目的 分析柳州市2016—2020年引起手足口病的柯萨奇病毒A6型(CVA6)VP1的基因特征,为手足口病防控提供科学依据。方法 收集柳州市2016—2020年临床诊断手足口病病例标本,采用real-time RT-PCR法进行肠道病毒核酸检测,随机抽取50份CVA6阳...目的 分析柳州市2016—2020年引起手足口病的柯萨奇病毒A6型(CVA6)VP1的基因特征,为手足口病防控提供科学依据。方法 收集柳州市2016—2020年临床诊断手足口病病例标本,采用real-time RT-PCR法进行肠道病毒核酸检测,随机抽取50份CVA6阳性标本进行VP1序列扩增、序列测定,用MEGA 5.0和Interaction Tree of Life V5(iTOLV5)构建进化树,用DNAstar V8.1.3软件对核苷酸和氨基酸同源性及氨基酸位点突变进行分析。结果 柳州市50株CVA6流行株均属于D3亚型,核苷酸同源性为90.1%~99.7%,氨基酸同源性为93.8%~97.5%;流行株VP1区共有16个位点的氨基酸发生了变异,在已确认的关键抗原表位存在两种变异方式;氨基酸变异还存在5T、30A、137N和242V共变异;有15株流行株发生了抗原表位氨基酸缺失;CVA6流行从单一传播链向多个传播链发展。结论 柳州市2016—2020年引起手足口病的CVA6属于D3亚型,VP1区基因存在关键抗原表位氨基酸变异及缺失,有多个CVA6传播链在柳州市共循环。展开更多
文摘目的 分析柳州市2016—2020年引起手足口病的柯萨奇病毒A6型(CVA6)VP1的基因特征,为手足口病防控提供科学依据。方法 收集柳州市2016—2020年临床诊断手足口病病例标本,采用real-time RT-PCR法进行肠道病毒核酸检测,随机抽取50份CVA6阳性标本进行VP1序列扩增、序列测定,用MEGA 5.0和Interaction Tree of Life V5(iTOLV5)构建进化树,用DNAstar V8.1.3软件对核苷酸和氨基酸同源性及氨基酸位点突变进行分析。结果 柳州市50株CVA6流行株均属于D3亚型,核苷酸同源性为90.1%~99.7%,氨基酸同源性为93.8%~97.5%;流行株VP1区共有16个位点的氨基酸发生了变异,在已确认的关键抗原表位存在两种变异方式;氨基酸变异还存在5T、30A、137N和242V共变异;有15株流行株发生了抗原表位氨基酸缺失;CVA6流行从单一传播链向多个传播链发展。结论 柳州市2016—2020年引起手足口病的CVA6属于D3亚型,VP1区基因存在关键抗原表位氨基酸变异及缺失,有多个CVA6传播链在柳州市共循环。
