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企鹅珍珠贝微卫星标记与生长性状的相关性研究
被引量:
1
1
作者
刘二田
陈一
+2 位作者
战欣
顾志峰
王爱民
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期332-338,共7页
研究利用5个高度多态性的微卫星标记,对500个企鹅珍珠贝(Pteria penguin)的4个生长性状进行了关联分析。结果显示, QEB-D15和CL-232两个微卫星标记与企鹅珍珠贝的壳宽呈极显著相关(P<0.01);位点QEBD15基因型是239/263的个体壳宽为最...
研究利用5个高度多态性的微卫星标记,对500个企鹅珍珠贝(Pteria penguin)的4个生长性状进行了关联分析。结果显示, QEB-D15和CL-232两个微卫星标记与企鹅珍珠贝的壳宽呈极显著相关(P<0.01);位点QEBD15基因型是239/263的个体壳宽为最大值,基因型是239/273的个体壳宽为最小值,推测263 bp等位基因与壳宽之间存在正相关关系,而273 bp等位基因与壳宽之间存在负相关关系;位点CL-232基因型为157/174的个体壳长、壳宽、总重的均值较同一位点的其他基因型均为最大值,该基因型推测为优势基因型;而基因型为177/192的个体壳长、壳宽、壳高和总重的均值较同一位点的其他基因型均为最小值,推测该基因型为劣势基因型,上述结果可为企鹅珍珠贝分子标记辅助选择育种提供理论依据和参考。
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关键词
微卫星
生长性状
相关性
企鹅珍珠贝
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职称材料
企鹅珍珠贝非致死性DNA提取方法的研究
2
作者
陈一
刘二田
+2 位作者
战欣
顾志峰
王爱民
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期55-62,共8页
在企鹅珍珠贝遗传育种研究中,为保证在贝类存活的条件下获得其DNA信息,采用企鹅珍珠贝(Pteria penguin)贝壳边缘和足丝研究非致死性DNA提取方法。不同于贝壳获取过程中会对实验贝体产生一定损伤,足丝是无生命的细胞外纤维束,其获取方法...
在企鹅珍珠贝遗传育种研究中,为保证在贝类存活的条件下获得其DNA信息,采用企鹅珍珠贝(Pteria penguin)贝壳边缘和足丝研究非致死性DNA提取方法。不同于贝壳获取过程中会对实验贝体产生一定损伤,足丝是无生命的细胞外纤维束,其获取方法简单且属于非损伤性取样,对实验贝几乎无伤害,是潜在的获取具足丝贝类基因组DNA的优良材料。本研究采用脱钙与未脱钙两种处理方式,并结合海洋动物组织基因组DNA提取试剂盒法及有机溶剂萃取法(OSE)提取贝壳及足丝DNA,对获得的贝壳DNA及足丝DNA进行PCR扩增。结果显示,足丝有机溶剂法(OSE法)提取效率显著高于贝壳DNA提取方法,脱钙足丝与未脱钙足丝的DNA提取效率无显著差异,分别为(0.0167±0.0029)μg/mg和(0.0161±0.0031)μg/mg。未脱钙足丝的OSE法获得的DNA产物纯度最优,A260/280值为1.4000±0.0400,A260/230值显著高于贝壳DNA及足丝DNA的其他提取方法,为0.9100±0.0800。除脱钙贝壳OSE法外,其他所有DNA提取方法均可用于后续PCR扩增,测序结果表明产物DNA来源于企鹅珍珠贝,且贝壳及足丝取样方式均未导致企鹅珍珠贝死亡。综上,未脱钙足丝的OSE法优于其他方法,研究结果可为非致死性DNA提取提供参考,也为企鹅珍珠贝的选择育种研究及珍稀贝类保护奠定前期基础。
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关键词
企鹅珍珠贝
非致死性
贝壳DNA提取
足丝DNA提取
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职称材料
光照强度对番红砗磲外套膜颜色变化的影响
3
作者
刘二田
何园园
+3 位作者
顾志峰
石耀华
王爱民
刘春胜
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期70-75,共6页
以蓝色、棕黄色和绿色三种不同外套膜颜色的番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,设置5000 lx、10000 lx和15000 lx三组光照强度,探究了番红砗磲外套膜颜色变化与光照强度的相关性。结果表明:(1)在不同光照强度下,蓝色个体外套膜颜色加...
以蓝色、棕黄色和绿色三种不同外套膜颜色的番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,设置5000 lx、10000 lx和15000 lx三组光照强度,探究了番红砗磲外套膜颜色变化与光照强度的相关性。结果表明:(1)在不同光照强度下,蓝色个体外套膜颜色加深,棕黄色个体颜色变化不大,而绿色个体外套膜颜色变浅。(2)蓝色个体在光照刺激2周后外套膜颜色即出现显著变化,0~2周色差为13.81~21.59;在不同光照强度刺激下,棕黄色和绿色个体的外套膜颜色的色差随时间延长而逐渐增强,4~6周外套膜颜色色差最大。(3)番红砗磲原外套膜颜色类别对其外套膜颜色红绿特征数值(a)和黄蓝特征数值(b)影响显著(P<0.05);光照强度对番红砗磲外套膜颜色黄蓝特征数值(b)影响显著(P<0.05);光照强度和番红砗磲原外套膜颜色类别的交互作用对红绿特征数值(a)的影响显著。上述结果可为定向培育外套膜颜色鲜艳的番红砗磲以及解析砗磲环境适应机制提供参考。
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关键词
番红砗磲
光照强度
外套膜颜色
色差
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职称材料
番红砗磲外套膜颜色多态性及其与生长性状相关性研究
被引量:
2
4
作者
何园园
刘二田
+3 位作者
顾志峰
石耀华
王爱民
刘春胜
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第2期176-182,共7页
本研究以南海西沙海域番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,通过CSE-1成像色度检测分析系统和聚类分析方法研究其外套膜颜色多态性,同时,比较外套膜颜色与形态性状的相关性。结果显示,大部分番红砗磲外套膜颜色分布在蓝原色和红原色区...
本研究以南海西沙海域番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,通过CSE-1成像色度检测分析系统和聚类分析方法研究其外套膜颜色多态性,同时,比较外套膜颜色与形态性状的相关性。结果显示,大部分番红砗磲外套膜颜色分布在蓝原色和红原色区域,少部分个体分布在绿原色区域,且偏亮绿色;番红砗磲外套膜颜色共聚为6个颜色类群,各类群间颜色色差均>15,其中,第4类深蓝色和第6类黄色色差最大,为74.68;第3类浅蓝色和第4类深蓝色色差最小,为18.98;番红砗磲外套膜颜色L、a、b值与壳高呈显著正相关(P<0.05),相关系数分别为0.2080、0.2210和0.2375。本研究结果可为砗磲资源保护和珊瑚礁生态系统恢复提供参考。
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关键词
番红砗磲
外套膜颜色
多态性
相关性
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职称材料
番红砗磲外套膜色素提取条件优化及成分分析
被引量:
1
5
作者
付正祎
刘二田
+4 位作者
顾志峰
石耀华
王爱民
吴川良
刘春胜
《海洋科学》
CAS
北大核心
2019年第6期71-77,共7页
以番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,通过单因素对比实验对其外套膜色素的提取条件进行了优化,并利用薄层层析色谱法对色素组成进行了初步分析。结果表明:丙酮和乙醇为适宜的番红砗磲外套膜色素提取剂;使用丙酮为提取剂时,浸提时间...
以番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,通过单因素对比实验对其外套膜色素的提取条件进行了优化,并利用薄层层析色谱法对色素组成进行了初步分析。结果表明:丙酮和乙醇为适宜的番红砗磲外套膜色素提取剂;使用丙酮为提取剂时,浸提时间为 4 h,提取温度为 25℃,料液比为 1 40。使用乙醇为提取剂时,浸提时间为 4 h,提取温度为 30℃,料液比为 1 200;利用薄层色谱法分离外套膜颜色为蓝色和红棕色的番红砗磲外套膜色素后发现,蓝色番红砗磲外套膜色素由 9 种色素组分构成,红棕色个体番红砗磲外套膜色素由 10 种色素组分构成。
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关键词
番红砗磲(Tridacna
crocea)
外套膜色素
提取条件
薄层层析色谱
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职称材料
题名
企鹅珍珠贝微卫星标记与生长性状的相关性研究
被引量:
1
1
作者
刘二田
陈一
战欣
顾志峰
王爱民
机构
海南大学海洋学院
海南大学南海海洋资源利用国家重点实验室
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期332-338,共7页
基金
国家自然科学基金(31772847)资助。
文摘
研究利用5个高度多态性的微卫星标记,对500个企鹅珍珠贝(Pteria penguin)的4个生长性状进行了关联分析。结果显示, QEB-D15和CL-232两个微卫星标记与企鹅珍珠贝的壳宽呈极显著相关(P<0.01);位点QEBD15基因型是239/263的个体壳宽为最大值,基因型是239/273的个体壳宽为最小值,推测263 bp等位基因与壳宽之间存在正相关关系,而273 bp等位基因与壳宽之间存在负相关关系;位点CL-232基因型为157/174的个体壳长、壳宽、总重的均值较同一位点的其他基因型均为最大值,该基因型推测为优势基因型;而基因型为177/192的个体壳长、壳宽、壳高和总重的均值较同一位点的其他基因型均为最小值,推测该基因型为劣势基因型,上述结果可为企鹅珍珠贝分子标记辅助选择育种提供理论依据和参考。
关键词
微卫星
生长性状
相关性
企鹅珍珠贝
Keywords
Microsatellite
Growth traits
Correlation
Pteria penguin
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
企鹅珍珠贝非致死性DNA提取方法的研究
2
作者
陈一
刘二田
战欣
顾志峰
王爱民
机构
海南大学海洋学院
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期55-62,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31860727)。
文摘
在企鹅珍珠贝遗传育种研究中,为保证在贝类存活的条件下获得其DNA信息,采用企鹅珍珠贝(Pteria penguin)贝壳边缘和足丝研究非致死性DNA提取方法。不同于贝壳获取过程中会对实验贝体产生一定损伤,足丝是无生命的细胞外纤维束,其获取方法简单且属于非损伤性取样,对实验贝几乎无伤害,是潜在的获取具足丝贝类基因组DNA的优良材料。本研究采用脱钙与未脱钙两种处理方式,并结合海洋动物组织基因组DNA提取试剂盒法及有机溶剂萃取法(OSE)提取贝壳及足丝DNA,对获得的贝壳DNA及足丝DNA进行PCR扩增。结果显示,足丝有机溶剂法(OSE法)提取效率显著高于贝壳DNA提取方法,脱钙足丝与未脱钙足丝的DNA提取效率无显著差异,分别为(0.0167±0.0029)μg/mg和(0.0161±0.0031)μg/mg。未脱钙足丝的OSE法获得的DNA产物纯度最优,A260/280值为1.4000±0.0400,A260/230值显著高于贝壳DNA及足丝DNA的其他提取方法,为0.9100±0.0800。除脱钙贝壳OSE法外,其他所有DNA提取方法均可用于后续PCR扩增,测序结果表明产物DNA来源于企鹅珍珠贝,且贝壳及足丝取样方式均未导致企鹅珍珠贝死亡。综上,未脱钙足丝的OSE法优于其他方法,研究结果可为非致死性DNA提取提供参考,也为企鹅珍珠贝的选择育种研究及珍稀贝类保护奠定前期基础。
关键词
企鹅珍珠贝
非致死性
贝壳DNA提取
足丝DNA提取
Keywords
Pteria penguin
non-lethal
shell DNA extraction
byssus DNA extraction
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
光照强度对番红砗磲外套膜颜色变化的影响
3
作者
刘二田
何园园
顾志峰
石耀华
王爱民
刘春胜
机构
海南大学海洋学院
海南大学南海海洋资源利用国家重点实验室
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期70-75,共6页
基金
海南省自然科学基金项目(417004,317029)
海南省重点研发计划项目(ZDYF2019153)
国家重点研发计划项目(2018YFD0900704)。
文摘
以蓝色、棕黄色和绿色三种不同外套膜颜色的番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,设置5000 lx、10000 lx和15000 lx三组光照强度,探究了番红砗磲外套膜颜色变化与光照强度的相关性。结果表明:(1)在不同光照强度下,蓝色个体外套膜颜色加深,棕黄色个体颜色变化不大,而绿色个体外套膜颜色变浅。(2)蓝色个体在光照刺激2周后外套膜颜色即出现显著变化,0~2周色差为13.81~21.59;在不同光照强度刺激下,棕黄色和绿色个体的外套膜颜色的色差随时间延长而逐渐增强,4~6周外套膜颜色色差最大。(3)番红砗磲原外套膜颜色类别对其外套膜颜色红绿特征数值(a)和黄蓝特征数值(b)影响显著(P<0.05);光照强度对番红砗磲外套膜颜色黄蓝特征数值(b)影响显著(P<0.05);光照强度和番红砗磲原外套膜颜色类别的交互作用对红绿特征数值(a)的影响显著。上述结果可为定向培育外套膜颜色鲜艳的番红砗磲以及解析砗磲环境适应机制提供参考。
关键词
番红砗磲
光照强度
外套膜颜色
色差
Keywords
Tridacna crocea
Light intensity
Mantle color
Correlation
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
番红砗磲外套膜颜色多态性及其与生长性状相关性研究
被引量:
2
4
作者
何园园
刘二田
顾志峰
石耀华
王爱民
刘春胜
机构
海南大学海洋学院
海南大学南海海洋资源利用国家重点实验室
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第2期176-182,共7页
基金
海南省自然科学基金项目(317029)
国家重点研发计划(2018YFD0900704)共同资助。
文摘
本研究以南海西沙海域番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,通过CSE-1成像色度检测分析系统和聚类分析方法研究其外套膜颜色多态性,同时,比较外套膜颜色与形态性状的相关性。结果显示,大部分番红砗磲外套膜颜色分布在蓝原色和红原色区域,少部分个体分布在绿原色区域,且偏亮绿色;番红砗磲外套膜颜色共聚为6个颜色类群,各类群间颜色色差均>15,其中,第4类深蓝色和第6类黄色色差最大,为74.68;第3类浅蓝色和第4类深蓝色色差最小,为18.98;番红砗磲外套膜颜色L、a、b值与壳高呈显著正相关(P<0.05),相关系数分别为0.2080、0.2210和0.2375。本研究结果可为砗磲资源保护和珊瑚礁生态系统恢复提供参考。
关键词
番红砗磲
外套膜颜色
多态性
相关性
Keywords
Tridacna crocea
Mantle colour
Polymorphism
Correlation
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
番红砗磲外套膜色素提取条件优化及成分分析
被引量:
1
5
作者
付正祎
刘二田
顾志峰
石耀华
王爱民
吴川良
刘春胜
机构
海南大学海洋学院
海南大学南海海洋资源利用国家重点实验室
三亚珊瑚礁生态研究所
出处
《海洋科学》
CAS
北大核心
2019年第6期71-77,共7页
基金
海南省重点研发计划项目(ZDYF2019153)
国家重点研发计划项目(2018YFD0900704)
海南省自然科学基金项目(317029)~~
文摘
以番红砗磲(Tridacna crocea)为实验对象,通过单因素对比实验对其外套膜色素的提取条件进行了优化,并利用薄层层析色谱法对色素组成进行了初步分析。结果表明:丙酮和乙醇为适宜的番红砗磲外套膜色素提取剂;使用丙酮为提取剂时,浸提时间为 4 h,提取温度为 25℃,料液比为 1 40。使用乙醇为提取剂时,浸提时间为 4 h,提取温度为 30℃,料液比为 1 200;利用薄层色谱法分离外套膜颜色为蓝色和红棕色的番红砗磲外套膜色素后发现,蓝色番红砗磲外套膜色素由 9 种色素组分构成,红棕色个体番红砗磲外套膜色素由 10 种色素组分构成。
关键词
番红砗磲(Tridacna
crocea)
外套膜色素
提取条件
薄层层析色谱
Keywords
Tridacna crocea
pigment of mantle
extraction condition
thin layer chromatography
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
企鹅珍珠贝微卫星标记与生长性状的相关性研究
刘二田
陈一
战欣
顾志峰
王爱民
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
企鹅珍珠贝非致死性DNA提取方法的研究
陈一
刘二田
战欣
顾志峰
王爱民
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
3
光照强度对番红砗磲外套膜颜色变化的影响
刘二田
何园园
顾志峰
石耀华
王爱民
刘春胜
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
4
番红砗磲外套膜颜色多态性及其与生长性状相关性研究
何园园
刘二田
顾志峰
石耀华
王爱民
刘春胜
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020
2
下载PDF
职称材料
5
番红砗磲外套膜色素提取条件优化及成分分析
付正祎
刘二田
顾志峰
石耀华
王爱民
吴川良
刘春胜
《海洋科学》
CAS
北大核心
2019
1
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职称材料
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