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PCR与G-四链体联用可视化鉴别人参与西洋参
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作者 刘墨祎 汪香君 +2 位作者 汪洺卉 李迎 刘丽梅 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第17期69-74,共6页
人参和西洋参作为我国常用名贵中药,其价值很高,由于它们为人参属近缘物种,因此二者在形态和化学成分方面较为相似。然而人参和西洋参的药性和药效有较大区别,二者在临床上不可混用,所以对二者进行鉴定就尤为重要。该研究基于人参与西... 人参和西洋参作为我国常用名贵中药,其价值很高,由于它们为人参属近缘物种,因此二者在形态和化学成分方面较为相似。然而人参和西洋参的药性和药效有较大区别,二者在临床上不可混用,所以对二者进行鉴定就尤为重要。该研究基于人参与西洋参基因组DNA上的特异性snp位点,设计了5′端含有G-四链体互补序列的上下游引物,通过PCR扩增出大量含G-四链体的双链DNA,与氯高铁血红素(Hemin)结合形成具有过氧化物酶活性的DNA酶(DNAzyme),并在H_(2)O_(2)存在的情况下催化ABTS发生颜色变化。通过对PCR体系以及显色体系的优化,达到快速、简便地鉴别人参与西洋参,灵敏度可达到0.1 ng/μL。研究建立了针对人参和西洋参的PCR与G-四链体联用的可视化鉴别方法,为人参与西洋参的鉴别提供了新的途径。 展开更多
关键词 PCR G-四链体 人参 西洋参 可视化鉴别
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基于锦灯笼对白血病作用机制的网络药理学和分子对接技术的生物信息学分析 被引量:1
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作者 汪洺卉 刘墨祎 +6 位作者 王鹤霖 李迎 汪香君 惠赫童 范馨元 王添琦 刘丽梅 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期74-83,共10页
目的:基于网络药理学探讨锦灯笼(PCF)在白血病发生发展过程的作用,阐明其生物活性成分主要作用靶点和信号通路相关机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库以“锦灯笼”为关键词检索其生物活性成分及对应的潜在靶点... 目的:基于网络药理学探讨锦灯笼(PCF)在白血病发生发展过程的作用,阐明其生物活性成分主要作用靶点和信号通路相关机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库以“锦灯笼”为关键词检索其生物活性成分及对应的潜在靶点,并采用蛋白质数据库(PDB)和小分子药物靶点预测在线平台(Swiss Target Prediction)网站对其潜在靶点进行评估预测。采用GeneCards、OMIM和DrugBank数据库以“Leukemia”为关键词对相关靶点进行检索。利用Draw Veen Diagram在线软件将PCF生物活性成分靶点与白血病靶点交集,得到的交集靶点即为PCF作用于白血病的靶点;利用基因/蛋白相互作用检索搜查工具(STRING)数据库获取交集靶点蛋白的蛋白-蛋白互作(PPI)网络信息并进行可视化处理;采用注释可视化和集成发现数据库(DAVID)对交集基因进行基因本体(GO)生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行拓扑分析筛选核心靶点和核心活性成分,采用AutoDock和PyMol软件进行分子对接验证。结果:对TCMSP数据库检索结果进行筛选后得到6个PCF活性成分,收集PCF与白血病的共同靶点29个。GO富集分析主要涉及造血或淋巴器官的发育、蛋白代谢调控和细胞凋亡等生物进程;KEGG信号通路富集分析主要包括癌症通路、肿瘤坏死因子(TNF)和T细胞受体(TCR)等信号通路。拓扑网络分析得到蛋白激酶B1(AKT1)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3(Caspase-3)等10个核心靶点,结合KEGG信号通路筛选出核心活性成分谷甾醇和禾本甾醇。分子对接,PCF活性成分谷甾醇与原癌基因JUN及禾本甾醇与AKT1和Caspase-3对接能均<-6.0 kcal·mol-1,表明对接较好。结论:PCF的主要活性成分谷甾醇和禾本甾醇可能通过调控JUN、AKT1和Caspase-3等基因参与癌症通路和TCR等信号通路,进而影响白血病的发生发展。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接技术 锦灯笼 白血病
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人参、三七和西洋参多重PCR方法建立及应用 被引量:5
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作者 汪香君 刘墨祎 +4 位作者 李迎 汪洺卉 范馨元 王添琦 刘丽梅 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第24期288-293,共6页
采用多重PCR方法建立一种快速准确鉴别人参、三七和西洋参的检测体系,并将其用于市售样品的检测。利用筛选的人参、三七和西洋参特异的单核苷酸多态性位点设计引物,在引物3′末端进行锁核酸修饰和碱基错配以封闭末端,增强引物特异性。... 采用多重PCR方法建立一种快速准确鉴别人参、三七和西洋参的检测体系,并将其用于市售样品的检测。利用筛选的人参、三七和西洋参特异的单核苷酸多态性位点设计引物,在引物3′末端进行锁核酸修饰和碱基错配以封闭末端,增强引物特异性。建立多重PCR检测体系,并对反应条件进行优化。对市售样品进行验证。建立的多重PCR检测体系,人参、三七和西洋参特异性条带分别为249、366、212 bp。在59℃的退火温度,35个循环,40 ng的DNA,人参、三七、西洋参引物量体积比为0.15μL∶1.25μL∶0.3μL的反应条件最佳。对于不同参类产品进行检测,结果表明,粗加工产品的阳性率高于深加工产品。选取市场上不同来源的粗加工产品进行多重PCR检测阳性率达到80%以上。多重PCR检测体系灵敏度高,重复性好,可用于市售样品的检测。 展开更多
关键词 人参 三七 西洋参 多重PCR 单核苷酸多态性
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成人不同采血体位对血常规检验结果的影响 被引量:3
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作者 惠陈敏 潘宇航 +6 位作者 宋旭东 丁锦秋 孙雨剑 黄瑾 蒋安琪 刘墨祎 郭素红 《吉林医药学院学报》 2018年第3期200-201,共2页
血常规检查参数包括红细胞(red blood cell,RBC)、白细胞(white blood cell,WBC)、血小板(blood platelet,PLT)、血红蛋白(haemoglobin,Hb)、血细胞比容(hematocrit,HCT)等指标。检验能发现细胞数量和形态的变化,其结果常有... 血常规检查参数包括红细胞(red blood cell,RBC)、白细胞(white blood cell,WBC)、血小板(blood platelet,PLT)、血红蛋白(haemoglobin,Hb)、血细胞比容(hematocrit,HCT)等指标。检验能发现细胞数量和形态的变化,其结果常有助于发现全身性疾病的早期迹象,有助于临床病情的诊断。 展开更多
关键词 采血体位 血常规 静脉血
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MicroRNA体外检测的研究进展
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作者 汪香君 李迎 +2 位作者 刘墨祎 汪洺卉 刘丽梅 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期444-450,共7页
MicroRNA (miRNA)是一类内源性、进化高度保守的小分子非编码RNA,通过识别同源序列及干扰转录、翻译或表观遗传以调节基因的表达。研究发现,某些miRNA的异常表达与疾病相关,可作为生物标志物或药物靶点为疾病诊断、治疗及预后提供新思路... MicroRNA (miRNA)是一类内源性、进化高度保守的小分子非编码RNA,通过识别同源序列及干扰转录、翻译或表观遗传以调节基因的表达。研究发现,某些miRNA的异常表达与疾病相关,可作为生物标志物或药物靶点为疾病诊断、治疗及预后提供新思路,而准确测定miRNA的表达是其应用于临床的关键。本文结合近年来研究成果对传统检测方法及其改进和等温核酸扩增的新技术进行概述,分析这些方法的优势与不足。 展开更多
关键词 MIRNA 传统检测方法 等温核酸扩增技术
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