目的:基于网络药理学方法探讨丹参治疗血管性痴呆(vascular dementia,VD)的作用机制。方法:在TCMSP平台检索和筛选丹参的有效成分,运用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)和在线孟德尔人类遗传数据库(online mendelian ...目的:基于网络药理学方法探讨丹参治疗血管性痴呆(vascular dementia,VD)的作用机制。方法:在TCMSP平台检索和筛选丹参的有效成分,运用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)和在线孟德尔人类遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)检索VD的作用靶点,绘制韦恩图,构建蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interactions,PPI),并对靶点涉及的生物功能和通路进行分析,构建可视化通路图。结果:从丹参中筛选出54个有效成分,作用于86个VD靶点,丹参治疗VD的核心基因主要有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine protein kinase 1,Akt1)、白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)、原癌基因(C-FOS)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen activated protein kinase 1,MAPK1)等。中药-疾病靶点通过基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)功能共富集到130条生物过程,主要包括G蛋白偶联胺受体活性、肾上腺素能受体活性、核受体活性、转录因子活性,直接配体调节的序列特异性DNA、儿茶酚胺结合等。中药-疾病靶点通过KEGG富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路共有134条,主要包括卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染通路、非小细胞肺癌、乙型肝炎病毒通路、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路等。结论:丹参通过多成分、多靶点和多途径调控VD,该研究结果能为VD的临床治疗及丹参的临床与实验研究提供理论依据。展开更多
目的:基于网络药理学探讨人参抗痴呆的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索中药有效成分和相关靶点,利用GeneCards和OMI...目的:基于网络药理学探讨人参抗痴呆的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索中药有效成分和相关靶点,利用GeneCards和OMIM数据库检索痴呆的基因靶点,构建蛋白互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,构建可视化的信号通路。结果:从人参中筛选出22个有效成分,76个痴呆疾病作用靶点,112条GO生物学过程,127条KEGG通路。人参抗痴呆的核心基因主要有AKT1、CASP3、JUN、MAPK8、PTGS2、IL1B、PPARG等,这些基因可通过影响肽结合、酰胺结合、G蛋白偶联胺受体活性等来调控痴呆的发生。KEGG通路主要包括刺激神经组织的中的交互通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、肿瘤坏死因子信号通路等。结论:人参可通过多成分、多靶点、多途径抗痴呆,为将来提取人参有效成分治疗痴呆病提供了理论基础。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨丹参治疗血管性痴呆(vascular dementia,VD)的作用机制。方法:在TCMSP平台检索和筛选丹参的有效成分,运用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)和在线孟德尔人类遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)检索VD的作用靶点,绘制韦恩图,构建蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interactions,PPI),并对靶点涉及的生物功能和通路进行分析,构建可视化通路图。结果:从丹参中筛选出54个有效成分,作用于86个VD靶点,丹参治疗VD的核心基因主要有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine protein kinase 1,Akt1)、白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)、原癌基因(C-FOS)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen activated protein kinase 1,MAPK1)等。中药-疾病靶点通过基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)功能共富集到130条生物过程,主要包括G蛋白偶联胺受体活性、肾上腺素能受体活性、核受体活性、转录因子活性,直接配体调节的序列特异性DNA、儿茶酚胺结合等。中药-疾病靶点通过KEGG富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路共有134条,主要包括卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染通路、非小细胞肺癌、乙型肝炎病毒通路、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路等。结论:丹参通过多成分、多靶点和多途径调控VD,该研究结果能为VD的临床治疗及丹参的临床与实验研究提供理论依据。
文摘目的:基于网络药理学探讨人参抗痴呆的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索中药有效成分和相关靶点,利用GeneCards和OMIM数据库检索痴呆的基因靶点,构建蛋白互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,构建可视化的信号通路。结果:从人参中筛选出22个有效成分,76个痴呆疾病作用靶点,112条GO生物学过程,127条KEGG通路。人参抗痴呆的核心基因主要有AKT1、CASP3、JUN、MAPK8、PTGS2、IL1B、PPARG等,这些基因可通过影响肽结合、酰胺结合、G蛋白偶联胺受体活性等来调控痴呆的发生。KEGG通路主要包括刺激神经组织的中的交互通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、肿瘤坏死因子信号通路等。结论:人参可通过多成分、多靶点、多途径抗痴呆,为将来提取人参有效成分治疗痴呆病提供了理论基础。
