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面向湍流大数据的高效存储与访问关键技术研究
1
作者 程文迪 张晓 +5 位作者 潘兆辉 赵友军 孙晨光 单学强 金雨展 赵晓南 《大数据》 2024年第4期3-20,共18页
随着测量技术和数值模拟技术的发展,数据驱动的湍流研究成为该领域的新研究方法。我国已建立了多个风洞实验室和多个超算中心来模拟湍流,这些研究积累了大量的湍流数据,但是国内没有集中的湍流数据管理平台,耗资巨大的实验和仿真数据难... 随着测量技术和数值模拟技术的发展,数据驱动的湍流研究成为该领域的新研究方法。我国已建立了多个风洞实验室和多个超算中心来模拟湍流,这些研究积累了大量的湍流数据,但是国内没有集中的湍流数据管理平台,耗资巨大的实验和仿真数据难以实现交流和共享。湍流数据具有数据量大、维度高、精度高和多源异构等特点,其存储、访问与管理存在数据集成困难、数据访问低效和存储效率低等问题。设计了一个面向航空、航天和航海典型流动问题的湍流大数据分布式存储系统TDFS。结合湍流大数据的访问特点,在TDFS中设计了新的元数据组织方式和数据访问接口。实验结果表明,与HDFS和GlusterFS相比,TDFS分别实现了54.38%和57.7%的接口响应速度提升。同时,为了降低湍流大数据的存储开销,设计了基于HDF5的副本延迟压缩机制,相比原有的副本存储方式,节省了34%的存储空间。 展开更多
关键词 湍流大数据 分布式存储系统 副本延迟压缩 性能优化
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传染性法氏囊病病毒VP2基因原核表达及抗原性分析 被引量：5
2
作者 单学强 李明义 高轩 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2012年第5期18-21,共4页
从辽宁省某鸡场分离到一株传染性法氏囊病病毒(IBDV)。以该毒株基因组核酸为模板,应用RT-PCR扩增得到VP2基因,构建表达质粒pET28a-VP2,再将其转化至大肠埃希菌BL21(DE3)用IPTG进行诱导表达。表达产物经SDS-PAGE分析在48ku处出现特异性... 从辽宁省某鸡场分离到一株传染性法氏囊病病毒(IBDV)。以该毒株基因组核酸为模板,应用RT-PCR扩增得到VP2基因,构建表达质粒pET28a-VP2,再将其转化至大肠埃希菌BL21(DE3)用IPTG进行诱导表达。表达产物经SDS-PAGE分析在48ku处出现特异性蛋白条带;经Western blot分析VP2蛋白可以与IBDV阳性血清发生特异性反应。用VP2蛋白制备的油乳剂疫苗免疫接种SPF鸡,2周后体内可以检测到特异性抗体。证明VP2蛋白具有重要的应用价值,为IBDV基因工程亚单位疫苗的研制奠定了基础。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 VP2基因 原核表达 抗原性分析
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稳定表达犬瘟热病毒Nectin4受体的Vero细胞系构建 被引量：2
3
作者 于泽坤 段笑笑 +2 位作者 只勇 栾志舫 单学强 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第10期3334-3342,共9页
为提高病毒的分离效率,本试验设计构建了能够表达犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)上皮细胞Nectin4受体的Vero细胞。为增加蛋白定位的准确性并易于鉴定,使用Igκ信号肽替换原有信号肽序列并添加了HA标签,在Nectin4 ORF后串联IRES... 为提高病毒的分离效率,本试验设计构建了能够表达犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)上皮细胞Nectin4受体的Vero细胞。为增加蛋白定位的准确性并易于鉴定,使用Igκ信号肽替换原有信号肽序列并添加了HA标签,在Nectin4 ORF后串联IRES-Puro序列并连入pCI-Neo真核表达载体,得到完整的转染载体pCI-N4。不同浓度嘌呤霉素孵育Vero细胞得到最小筛选浓度为6μg/mL。pCI-N4重组质粒转染Vero细胞后使用6μg/mL嘌呤霉素筛选,5~7 d后出现具有抗性的细胞簇,有限稀释法连续单克隆纯化3代后获得稳定表达的细胞系。构建细胞系传代至15代能检测到Nectin4 mRNA转录,Western blotting检测筛选细胞得到约60 ku目的蛋白表达,间接免疫荧光检测显示纯化细胞蛋白表达丰度高且表达均一,激光共聚焦观察Nectin4目的蛋白定位于细胞膜,说明筛选的Vero-Nectin4细胞系能够稳定表达,表达蛋白能够满足作为CDV受体的结构要求。临床CDV阳性病料经研磨滤菌处理后接种构建细胞系能够产生典型的合胞体细胞病变,Vero对照组盲传3次未有病变。分离毒株TICD50=10-5.9/0.1 mL。构建的Vero-Nectin4细胞系可用于CDV分离。 展开更多
关键词 犬瘟热病毒(CDV) Nectin4 受体 Vero细胞系
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伪狂犬病病毒流行株gE/gI双基因缺失弱毒株的制备 被引量：1
4
作者 于泽坤 只勇 +4 位作者 张伦 段笑笑 李思菲 马广斌 单学强 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第13期75-80,147,148,共8页
为了降低伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)QD株毒力,获得候选疫苗株,试验通过同源重组方法同时缺失非必需蛋白gE和gI,构建含同源臂及EGFP表达盒片段的重组质粒pB-arm、pB-EGFP-arm,将重组质粒pB-EGFP-arm与母本毒株PRV QD基因组共... 为了降低伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)QD株毒力,获得候选疫苗株,试验通过同源重组方法同时缺失非必需蛋白gE和gI,构建含同源臂及EGFP表达盒片段的重组质粒pB-arm、pB-EGFP-arm,将重组质粒pB-EGFP-arm与母本毒株PRV QD基因组共转染至PK-15细胞后通过蚀斑纯化得到PRV QD-gE^(-)/gI^(-)/EGFP+株,再将重组质粒pB-arm与PRV QD-gE^(-)/gI^(-)/EGFP+株基因组共转染至PK-15细胞,通过蚀斑纯化删除EGFP基因得到PRV QD-gE^(-)/gI^(-)株;采用PCR扩增和Western-blot分别测定PRV QD-gE^(-)/gI^(-)株gE、gI基因mRNA转录和gE蛋白表达情况;绘制缺失毒株的增殖曲线并测定缺失基因的传代稳定性,比较缺失毒株与母本毒株的小鼠半数致死量(LD50)差异。结果表明:PRV QD-gE^(-)/gI^(-)株无gE和gI基因mRNA转录,gE蛋白未表达。缺失毒株对PK-15细胞的半数感染量(TCID50)为1×10^(-8.65)/0.1 mL,与母本毒株比较差异不显著(P>0.05),连续传至15代时缺失基因未改变。缺失毒株对小鼠的LD50为1×10^(-1.84)/0.2 mL,低于母本毒株的1×10^(-4.16)/0.2 mL。说明PRV QD株通过缺失gE和gI基因后毒力减弱,可作为制备PRV疫苗的候选毒株。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 非必需蛋白 糖蛋白E 糖蛋白I 基因缺失 致弱毒株
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