COL1A2在头颈部鳞癌中的差异表达及功能分析

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作者 李钰颖 刘洁兰 +4 位作者 侯沅林 卢诗丽 胡婷 吴彬 唐玉莲 《右江医学》 2024年第2期121-126,共6页

目的 采用生物信息学方法探讨COL1A2在头颈部鳞癌(HNSC)中的表达及相关功能。方法 利用TIMER2.0数据库分析COL1A2基因在泛癌中的表达;通过GEPIA数据库、UALCAN数据库分析该基因在HNSC与正常组织中的差异表达情况;并利用STRING数据库构建... 目的 采用生物信息学方法探讨COL1A2在头颈部鳞癌(HNSC)中的表达及相关功能。方法 利用TIMER2.0数据库分析COL1A2基因在泛癌中的表达;通过GEPIA数据库、UALCAN数据库分析该基因在HNSC与正常组织中的差异表达情况;并利用STRING数据库构建COL1A2基因蛋白互作网,DAVID数据库分析与该基因互作蛋白基因的相关功能;最后通过GCBI基因雷达数据库预测该基因可能参与的调控网络和转录因子。结果 COL1A2在多种肿瘤中高表达,且在头颈部鳞癌组织与正常组织中有差异表达。COL1A2及相关蛋白基因功能富集分析发现其参与了4个细胞组分、5个分子功能、11个生物学程序、7条信号通路,在基因调控网及转录因子预测发现,COL1A2与多种蛋白、转录因子、lncRNA、micRNA等相互调控。结论 COL1A2与HNSC的发生、发展可能是通过PI3K-Akt信号通路等多种途径、多种蛋白、转录因子共同调控的结果。 展开更多

关键词 COL1A2 生物信息学 头颈部鳞癌 基因表达

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基于生物信息学分析TGFBI基因在头颈部鳞癌中的表达及其预后意义

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作者 胡婷 卢诗丽 +4 位作者 李钰颖 刘洁兰 侯沅林 莫丽梅 唐玉莲 《右江医学》 2023年第2期102-108,共7页

目的探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factorβ-induced gene,TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义。方法首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一... 目的探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factorβ-induced gene,TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义。方法首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一步利用UALCAN数据库和GEPIA数据库检索TGFBI基因在HNSC与正常组织中的表达水平,以及TGFBI基因与患者种族、年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移状况等相关临床特征的关系;通过STRING数据库分析TGFBI基因的互作蛋白,借助DAVID数据库对其与互作蛋白基因进行功能富集分析;最后通过GEPIA数据库分析TGFBI基因在HNSC中的生存意义。结果发现TGFBI在HNSC中的表达明显高于正常组织(P<0.05),TGFBI高表达的患者总生存期明显低于低表达的患者(P<0.05)。蛋白互作分析发现,FN1、MMP14、ITGA3、ITGAM、ITGAV、ITGB1、ITGB2、ITGB3、TGIF2和TGIF2LX这10个蛋白基因与TGFBI存在紧密联系,此外,TGFBI及相关基因功能富集分析显示它们主要参与了5个生物学程序、4个细胞组分、3个分子功能、4个信号通路。结论TGFBI在HNSC中的表达水平较正常组织明显升高,且与患者预后不良有关,有望成为HNSC诊断和治疗的生物学靶点。 展开更多

关键词 转化生长因子β诱导基因 头颈部鳞癌 生物信息学 预后

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基于生物信息学分析TUBG1基因在肝细胞肝癌中的表达及其预后价值

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作者 侯沅林 刘洁兰 +4 位作者 李钰颖 卢诗丽 胡婷 莫丽梅 唐玉莲 《赣南医学院学报》 2023年第4期327-332,338,共7页

目的:探讨微管蛋白γ1(Tubulin gamma 1, TUBG1)在肝细胞肝癌(Liver hepatocellular carcinoma, LIHC)中的表达及其预后价值。方法:通过TIMER 2.0数据库对TUBG1基因进行泛癌分析;利用GEPIA和UALCAN数据库分析TUBG1基因在正常肝组织和肝... 目的:探讨微管蛋白γ1(Tubulin gamma 1, TUBG1)在肝细胞肝癌(Liver hepatocellular carcinoma, LIHC)中的表达及其预后价值。方法:通过TIMER 2.0数据库对TUBG1基因进行泛癌分析;利用GEPIA和UALCAN数据库分析TUBG1基因在正常肝组织和肝细胞肝癌中的差异表达;使用UALCAN分析TUBG1基因与临床病理特征的相关性;利用GEPIA数据库分析TUBG1基因与临床预后的关系。最后,通过STRING数据库构建相互作用蛋白网络图并利用DAVID数据库进行功能富集分析。结果:TUBG1基因在多个癌症中均有差异表达,且TUBG1基因在LIHC组织中表达水平高于正常组织(P<0.05);TUBG1基因的表达量与肿瘤分期、患者种族、性别、年龄、体重、肿瘤分级等均紧密相关(P<0.05);在LIHC患者中,高表达的TUBG1总生存率和无病生存率均低于低表达者(P<0.05);与TUBG1关系紧密的20个蛋白,通过功能富集分析发现其编码基因共同参与了10个细胞组分、2个分子功能和9个生物学过程。结论:TUBG1基因在LIHC中的差异表达,与临床病理特征和预后不良均相关,有望成为LIHC诊断和预后的重要指标。 展开更多

关键词 肝细胞肝癌 微管蛋白γ1 差异表达 生物信息学

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PDGFA 在鼻咽癌中的差异表达及其功能分析 被引量：3

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作者 唐玉莲 陈启威 +5 位作者 韦贵将 李玉颖 候沅林 卢诗丽 刘洁兰 王太重 《右江民族医学院学报》 2021年第1期46-50,共5页

目的探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor subunit A,PDGFA)在鼻咽癌中的差异表达和可能的功能作用。方法利用基因芯片数据库(GEO数据库)中的基因表达谱数据,通过GEO2R在线分析工具分析PDGFA基因在正常鼻咽黏膜组... 目的探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor subunit A,PDGFA)在鼻咽癌中的差异表达和可能的功能作用。方法利用基因芯片数据库(GEO数据库)中的基因表达谱数据,通过GEO2R在线分析工具分析PDGFA基因在正常鼻咽黏膜组织与鼻咽癌组织中的差异表达情况,并通过STRING数据库和DAVID数据库分析该基因及其相关基因的功能作用,最后通过GCBI在线实验室分析其可能参与的共表达调控网络,并预测其转录调控因子。结果发现PDGFA基因在正常鼻咽黏膜组织与鼻咽癌组织中具有差异表达。PDGFA基因及其相关基因功能富集分析发现,它们共同参与了12个生物学过程、4个细胞组分、3个分子功能和11个信号通路,并在肿瘤的发生、发展和转移过程中均具有显著的富集作用,如MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路、细胞增殖的正调控、细胞迁移的正调控、黏着、ERK1和ERK2级联的正调节、蛋白质自磷酸化的正调控等。另基因共表达调控网络和转录因子预测发现,PDGFA基因与许多基因、蛋白、转录因子以及microRNA具有相互作用。结论PDGFA可能通过多种途径,如细胞增殖和迁移的正调控、信号转导、蛋白质自磷酸化以及分子间的相互作用等参与鼻咽癌的发生、发展和迁移。 展开更多

关键词 PDGFA 鼻咽肿瘤 差异表达 功能分析 基因芯片 调控网络

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秋茄内生拮抗真菌鉴定 被引量：1

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作者 卢诗丽 朱艳秋 +3 位作者 钟飞腾 张佳瑞 叶伟颖 刘月廉 《现代农业科技》 2021年第24期93-94,97,共3页

以秋茄健康植株的叶片和茎为试验材料,对其中的内生真菌进行分离,并筛选内生真菌拮抗菌株,进行形态学研究和分子生物学鉴定。结果表明:从秋茄的叶片和茎共分离获得15株内生真菌,经对峙培养试验,有53.33%的菌株对目标病原菌蓖麻枯萎病菌... 以秋茄健康植株的叶片和茎为试验材料,对其中的内生真菌进行分离,并筛选内生真菌拮抗菌株,进行形态学研究和分子生物学鉴定。结果表明:从秋茄的叶片和茎共分离获得15株内生真菌,经对峙培养试验,有53.33%的菌株对目标病原菌蓖麻枯萎病菌有拮抗作用,其中从叶片组织中分离的内生真菌菌株MKA-5作用最明显;形态学研究显示,该菌株菌落浅灰色至深灰黑色,分生孢子暗褐色,倒棒形或椭圆形,多数无喙或短喙,有纵横隔膜,壁光滑,形态特征与链格孢(Alternaria alternata)一致;分子生物学研究显示,该菌株的ITS系列与链格孢模式菌株的同源性为100%。综合分析,拮抗菌株MKA-5鉴定为链格孢。该菌株的鉴定对蓖麻枯萎病的生物防治有重要作用。 展开更多

关键词 秋茄 内生真菌 链格孢 拮抗

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基于生物信息学分析NAA15在肝脏肝细胞癌中的表达及其预后价值 被引量：1

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作者 刘洁兰 李钰颖 +3 位作者 卢诗丽 侯沅林 胡婷 唐玉莲 《中国医药科学》 2022年第23期153-156,177,共5页

目的 基于多数据库探讨N-α-乙酰转移酶15(NAA15)在肝脏肝细胞癌(LIHC)中的表达及其预后价值。方法 应用TIMER 2.0数据库分析NAA15基因在泛癌组织中的表达;利用UALCAN数据库分析NAA15在LIHC和正常组织中的表达及其与临床病理特征的相关... 目的 基于多数据库探讨N-α-乙酰转移酶15(NAA15)在肝脏肝细胞癌(LIHC)中的表达及其预后价值。方法 应用TIMER 2.0数据库分析NAA15基因在泛癌组织中的表达;利用UALCAN数据库分析NAA15在LIHC和正常组织中的表达及其与临床病理特征的相关性;利用KM Plotter数据库分析NAA15基因的表达及其与临床LIHC预后的关系;最后,利用STRING数据库构建蛋白质网络,并利用DAVID数据库进行功能富集分析。结果 NAA15基因在多种癌症中的表达存在差异,在LIHC中的表达水平显著高于正常组织,并且与LIHC患者的多种临床病理特征和不良预后密切相关。NAA15及其相关基因的功能富集表明,它们主要参与3条信号通路、8个分子功能、10个细胞成分和9个生物过程。结论 NAA15在LIHC中高表达,可能是LIHC患者预后不良的危险因素,为今后深入探讨LIHC发病机制以及预后价值提供一定的理论依据。 展开更多

关键词 NAA15 肝细胞癌 生物信息学 预后

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3种组合抑菌剂对桉树组培苗黑曲霉抑菌效果评价 被引量：1

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作者 程晓欣 吴浪峰 +5 位作者 徐旭华 胡莉娜 牛静薇 钟飞腾 卢诗丽 刘月廉 《现代园艺》 2021年第21期83-85,共3页

黑曲霉是桉树组培苗的主要污染菌之一。为了寻找有效的抑菌方法,依次采用PDA平板抑菌法、1/2MS+IBA 0.5mg/L培养基抑制法以及1/2MS+IBA0.5 mg/L培养基组培苗抑菌法,分别测定3种组合抑菌剂对黑曲霉的抑制效果。结果表明,PDA平板上,除组... 黑曲霉是桉树组培苗的主要污染菌之一。为了寻找有效的抑菌方法,依次采用PDA平板抑菌法、1/2MS+IBA 0.5mg/L培养基抑制法以及1/2MS+IBA0.5 mg/L培养基组培苗抑菌法,分别测定3种组合抑菌剂对黑曲霉的抑制效果。结果表明,PDA平板上,除组合抑菌剂M6050μL/L处理抑菌率较低,与对照无显著性差异外,其他处理抑菌率均为100%,与对照有显著性差异(p<0.05)。1/2MS+IBA 0.5mg/L培养基上,组合抑菌剂M20100μL/L和JM0650μL/L、100μL/L处理抑菌率达80.46%~100%,与对照有显著性差异(p<0.05),其余处理与对照无显著性差异。1/2MS+IBA0.5 mg/L培养基组培苗上,所有组合抑菌剂处理的污染率均为0,抑菌率均为100%,与对照有显著性差异(p<0.05)。其中组合抑菌剂M2025μL/L、50μL/L处理的生根率与对照无显著性差异,其他处理与对照有显著性差异(p<0.05)。因此综合评价,以组合M2050μL/L作为桉树植物组织培养的抑菌剂具有良好的应用前景。 展开更多

关键词 桉树 黑曲霉 组培 污染 抑菌率

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PDGFB基因多态性与鼻咽癌易感性的相关性分析

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作者 丁科 卢诗丽 +4 位作者 刘洁兰 莫丽梅 仇雯丽 唐任光 唐玉莲 《右江民族医学院学报》 2021年第4期450-455,共6页

目的研究PDGFB基因rs1800817和rs1800818多态性与鼻咽癌(NPC)易感性的关系。方法采用多重PCR及高通量测序方法,检测120例NPC患者与126例健康对照者的rs1800817和rs1800818基因型,分析两组基因型和等位基因与NPC易感性的关系。并将126例... 目的研究PDGFB基因rs1800817和rs1800818多态性与鼻咽癌(NPC)易感性的关系。方法采用多重PCR及高通量测序方法,检测120例NPC患者与126例健康对照者的rs1800817和rs1800818基因型,分析两组基因型和等位基因与NPC易感性的关系。并将126例健康人群与来自ensembl数据库的其他地区健康人群进行基因型和等位基因分布频率比较。结果rs1800817和rs1800818位点基因型和等位基因在两组中差异均无统计学意义(P>0.05);男性rs1800817和rs1800818位点TT基因型在两组中差异有统计学意义(P<0.05),而不同性别两位点的其他基因型在两组中差异无统计学意义(P>0.05);广西人群rs1800817和rs1800818位点基因型和等位基因频率与欧洲、日本、非洲、美国及南亚人群之间差异均有统计学意义(P<0.05),但与北京汉族人群比较,差异无统计学意义(P>0.05);此外,rs1800817和rs1800818位点多态性和NPC患者组织类型、临床分期、淋巴转移和远处转移比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论PDGFB基因rs1800817和rs1800818多态性在不同地域人群分布存在差异,并且其TT基因型可增加桂西地区男性NPC的发病风险。 展开更多

关键词 血小板衍生生长因子 鼻咽肿瘤 多态性 易感性

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碱性硅肥对香蕉枯萎病的影响

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作者 钟飞腾 王诗霖 +2 位作者 卢诗丽 袁梅婷 刘月廉 《中国南方果树》 北大核心 2022年第5期79-82,共4页

以香蕉枯萎病菌尖镰孢古巴专化型4号小种(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,Foc4)为目标菌,采用PDA平板培养、土壤平板培养和盆栽试验等3种方法测定碱性硅肥对香蕉枯萎病菌的影响。结果表明,PDA平板培养5 d,碱性硅肥1×10~1 mol/L... 以香蕉枯萎病菌尖镰孢古巴专化型4号小种(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,Foc4)为目标菌,采用PDA平板培养、土壤平板培养和盆栽试验等3种方法测定碱性硅肥对香蕉枯萎病菌的影响。结果表明,PDA平板培养5 d,碱性硅肥1×10~1 mol/L处理对Foc4菌丝生长均具有明显抑制作用。其中1 mol/L处理抑制率最高,达到27.00%;与其他浓度处理差异显著(p<0.01)。土壤平板培养结果与PDA平板培养结果类似,仍以碱性硅肥1 mol/L处理的菌丝抑制率最高,达到24.00%。盆栽试验中,碱性硅肥处理的香蕉苗病情指数为43.85%,普通肥处理为68.57%。说明碱性硅肥对香蕉枯萎病菌有一定的抑制作用,具有生产应用潜力。 展开更多

关键词 香蕉枯萎病菌 碱性硅肥 平板试验 盆栽 抑制率 病情指数

原文传递

5种组合杀菌剂在开放式香蕉组织培养中的抑菌试验

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作者 牛静薇 胡莉娜 +5 位作者 徐旭华 吴浪峰 程晓欣 钟飞腾 卢诗丽 刘月廉 《现代园艺》 2021年第17期34-36,共3页

黑曲霉是香蕉组织培养时的主要污染菌之一,为了控制该菌的污染,提高生产效率,采用5种组合杀菌剂对黑曲霉进行抑菌效果研究。结果表明:5种组合试剂在PDA平板上抑菌效果良好,培养13d黑曲霉污染率均为0,与对照有显著性差异(平均菌落数21.5... 黑曲霉是香蕉组织培养时的主要污染菌之一,为了控制该菌的污染,提高生产效率,采用5种组合杀菌剂对黑曲霉进行抑菌效果研究。结果表明:5种组合试剂在PDA平板上抑菌效果良好,培养13d黑曲霉污染率均为0,与对照有显著性差异(平均菌落数21.5个)。香蕉MS培养基抑菌效果表明,M20、JM07和JM06的抑菌效果显著,在浓度20mg/L时培养13d的菌落平均数低于2个,而其他组合和对照的菌落为多不可计。进一步应用于开放式香蕉组培生产测定,结果表明:在培养浓度50mg/L条件下,JM06和JM24效果较好,培养13d菌落数仍为0,与其他试剂有显著差异(平均菌落数M20为40.20个;M60为21.00个;JM07为1.20个)。但5种组合杀菌剂均与对照(平均菌落数为81.80个)有显著性差异(p<0.05)。综合考虑其稳定性,认为JM06在香蕉的开放式组培上更具有潜在的应用前景。 展开更多

关键词 组合杀菌剂 开放式组培 香蕉 黑曲霉

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基于Nature杂志医学论文摘要的翻译原则与方法探究

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作者 谢翠曼 石颖 卢诗丽 《英语广场（学术研究）》 2022年第24期11-15,共5页

Nature是科学界普遍关注的、国际性、跨学科的周刊类杂志,具有独创性、及时性、权威性等特点,是一本重要的学术交流刊物。本研究采用功能目的论,从Nature杂志中选取医学领域的论文对其摘要进行研究,从而得出相关的翻译原则和技巧,以促... Nature是科学界普遍关注的、国际性、跨学科的周刊类杂志,具有独创性、及时性、权威性等特点,是一本重要的学术交流刊物。本研究采用功能目的论,从Nature杂志中选取医学领域的论文对其摘要进行研究,从而得出相关的翻译原则和技巧,以促进学术交流。 展开更多

关键词 医学论文摘要 功能目的论 翻译原则 翻译方法 NATURE

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