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魔芋糖外排转运蛋白基因家族鉴定及表达分析
1
作者
李效贤
冉丹丹
+5 位作者
曾周婷
赵佳莹
叶苏婵
岑欣颖
何佳奇
俞振明
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1857-1867,共11页
糖外排转运蛋白(SWEETs)是一类不依赖能量的新型糖转运蛋白,在调节植物生长发育等方面具有重要作用。为探究SWEETs家族在魔芋生长发育中的作用,对魔芋AkSWEETs家族成员的蛋白理化性质、系统发育、基因结构、染色体定位及共线性关系进行...
糖外排转运蛋白(SWEETs)是一类不依赖能量的新型糖转运蛋白,在调节植物生长发育等方面具有重要作用。为探究SWEETs家族在魔芋生长发育中的作用,对魔芋AkSWEETs家族成员的蛋白理化性质、系统发育、基因结构、染色体定位及共线性关系进行分析,并分析各成员在魔芋不同组织器官、球茎不同生长发育时期的表达水平,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测筛选出的目标AkSWEETs在镧诱导下的表达情况。结果表明,16个魔芋AkSWEETs基因随机分布在10条染色体上,其蛋白序列的氨基酸长度为205~987,多为碱性蛋白。系统进化树显示,魔芋AkSWEETs被分为4个亚家族,与水稻OsSWEETs亲缘关系较近,且存在基因串联复制现象。启动子调控元件分析结果显示,AkSWEETs含多个与植物激素、生长发育等相关的顺式元件。结合转录组数据与镧诱导后的qRT-PCR分析,筛选出与魔芋球茎膨大及其葡甘聚糖积累密切相关的AkSWEET9/13。本研究结果为魔芋AkSWEETs基因及其生物学功能的深入研究提供了理论参考。
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关键词
魔芋
AkSWEETs
生物信息学
表达分析
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职称材料
题名
魔芋糖外排转运蛋白基因家族鉴定及表达分析
1
作者
李效贤
冉丹丹
曾周婷
赵佳莹
叶苏婵
岑欣颖
何佳奇
俞振明
机构
浙江中医药大学药学院
浙江中医药大学附属第一医院(浙江省中医院)药学部
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1857-1867,共11页
基金
中央本级重大增减支项目(2060302)
浙江中医药大学校级科研项目(2020ZG20)
+1 种基金
国家自然科学基金项目(32000257)
浙江省自然科学基金项目(LY23H280003)。
文摘
糖外排转运蛋白(SWEETs)是一类不依赖能量的新型糖转运蛋白,在调节植物生长发育等方面具有重要作用。为探究SWEETs家族在魔芋生长发育中的作用,对魔芋AkSWEETs家族成员的蛋白理化性质、系统发育、基因结构、染色体定位及共线性关系进行分析,并分析各成员在魔芋不同组织器官、球茎不同生长发育时期的表达水平,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测筛选出的目标AkSWEETs在镧诱导下的表达情况。结果表明,16个魔芋AkSWEETs基因随机分布在10条染色体上,其蛋白序列的氨基酸长度为205~987,多为碱性蛋白。系统进化树显示,魔芋AkSWEETs被分为4个亚家族,与水稻OsSWEETs亲缘关系较近,且存在基因串联复制现象。启动子调控元件分析结果显示,AkSWEETs含多个与植物激素、生长发育等相关的顺式元件。结合转录组数据与镧诱导后的qRT-PCR分析,筛选出与魔芋球茎膨大及其葡甘聚糖积累密切相关的AkSWEET9/13。本研究结果为魔芋AkSWEETs基因及其生物学功能的深入研究提供了理论参考。
关键词
魔芋
AkSWEETs
生物信息学
表达分析
Keywords
Amorphophallus konjac
AkSWEETs
bioinformatics
expression analysis
分类号
S632.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
魔芋糖外排转运蛋白基因家族鉴定及表达分析
李效贤
冉丹丹
曾周婷
赵佳莹
叶苏婵
岑欣颖
何佳奇
俞振明
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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