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广州市某医院2021-2023年临床分离耐碳青霉烯大肠埃希菌的流行病学特征
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作者 陈雨顺 张丽玲 +5 位作者 苏敏璇 吴玫娜 徐浩祥 敖小君 陈茶 沈聪 《中国热带医学》 CAS 2024年第11期1328-1334,共7页
目的探讨广州市某医院2021—2023年临床分离的耐碳青霉烯大肠埃希菌(carbapenem-resistant Escherichia coli,CREC)的流行病学特征,为CREC感染的防控提供科学依据。方法收集2021—2023年该院分离的非重复CREC菌株,分析其临床特征。随机... 目的探讨广州市某医院2021—2023年临床分离的耐碳青霉烯大肠埃希菌(carbapenem-resistant Escherichia coli,CREC)的流行病学特征,为CREC感染的防控提供科学依据。方法收集2021—2023年该院分离的非重复CREC菌株,分析其临床特征。随机挑选42株进行物种鉴定、抗微生物药物敏感性试验和多位点序列分型。通过全基因组测序及生物信息学分析,探究CREC携带的耐药基因、毒力基因、复制子及碳青霉烯耐药基因所在质粒类型。结果2021—2023年该院共分离大肠埃希菌(Escherichia coli,EC)2887株,其中CREC 105株。3年间CREC的检出率分别为1.76%、2.80%和5.69%,呈显著上升趋势(P<0.001)。该院CREC对多种抗生素耐药,其中阿莫西林-克拉维酸、头孢他啶和头孢吡肟的耐药率均为100.00%,厄他培南和亚胺培南的耐药率为97.62%,左氧氟沙星为83.33%,阿米卡星为45.24%。所有CREC分离株均对替加环素敏感。42株CREC分为14种ST型,主要的ST型为ST167(28.57%)、ST410(26.19%)和ST131(9.52%)。ST410型CREC携带的fim、algA、icsP/sopA和高致病性毒力岛(high-pathogenicity island,HPI)相关毒力基因显著高于ST167型CREC(P<0.05),而aslA、hcp-2显著低于ST167(P<0.05)。该院CREC携带的碳青霉烯耐药基因主要为bla_(NDM-5)(n=34),其次是bla_(NDM-1)(n=6),仅有1株携带bla_(KPC-2),上述耐药基因主要位于IncF(n=27)和IncX3(n=11)型质粒。结论2021—2023年该院CREC检出率显著上升,以ST167和ST410型为主。ST410型CREC是一种新流行的高危克隆,携带了黏附、生物膜形成和HPI相关毒力基因,亟需监测其流行现状和传播特征,为防控措施的制定提供依据。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯大肠埃希菌 ST410 细菌耐药 全基因组测序
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