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水稻CIPK基因家族的鉴定及OsCIPK5受稻瘟病菌诱导的qRT-PCR分析
被引量：
5
1
作者
喻丝丝
罗曦
+6 位作者
连玲
许惠滨
陈丽萍
魏毅东
蔡秋华
谢华安
张建福
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期1237-1245,共9页
【目的】植物通过启动一系列信号传导过程来应对外部环境,这些过程通常涉及多种蛋白激酶,包括钙调神经磷酸酶B样蛋白互作激酶(calcineurin B-like protein-interacting protein kinases, CIPKs)。为更加清晰全面地了解水稻CIPK基因家族...
【目的】植物通过启动一系列信号传导过程来应对外部环境,这些过程通常涉及多种蛋白激酶,包括钙调神经磷酸酶B样蛋白互作激酶(calcineurin B-like protein-interacting protein kinases, CIPKs)。为更加清晰全面地了解水稻CIPK基因家族,本研究根据最新的基因组测序数据对水稻基因组中的CIPKs进行了鉴定。【方法】通过探讨拟南芥和水稻中CIPKs蛋白家族的结构特点,结合生物信息学和qRT-PCR技术系统分析水稻中CIPKs家族蛋白的结构。结合转录组数据,比较了粳稻云引受稻瘟病菌诱导后的表达情况。【结果】根据最新的水稻基因组数据,鉴定出31个水稻OsCIPK基因。系统发育树分析结果表明,31个OsCIPK基因可分为5个亚家族,这些亚家族具有不同的外显子-内含子和UTR的结构特点。从广谱抗稻瘟病品种粳稻云引受稻瘟病菌诱导的基因表达谱的趋势聚类中筛选出了OsCIPK5基因并对其进行了表达分析,结果表明,云引中OsCIPK5基因受稻瘟病菌的诱导表达。【结论】内含子缺失和片段重复在水稻OsCIPK基因家族的扩展中起到重要作用,同时OsCIPK5受到稻瘟病菌的诱导表达。
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关键词
水稻
CIPK
基因家族
OsCIPK5
稻瘟病菌
QRT-PCR
下载PDF
职称材料
MATE转运蛋白在水稻抗逆作用中的研究进展
被引量：
4
2
作者
喻丝丝
魏林艳
+1 位作者
谢华安
张建福
《福建农业学报》
CAS
2014年第4期398-405,共8页
水稻Oryza sativa在生长发育过程中需要面对自然环境中多重不利因素的影响,包括非生物胁迫和生物胁迫。为了抵御这些不利因子,水稻在自然选择过程中形成了多种机制以保护植株的健康生长。多药物有毒化合物排出家族转运蛋白(Multidrug an...
水稻Oryza sativa在生长发育过程中需要面对自然环境中多重不利因素的影响,包括非生物胁迫和生物胁迫。为了抵御这些不利因子,水稻在自然选择过程中形成了多种机制以保护植株的健康生长。多药物有毒化合物排出家族转运蛋白(Multidrug and toxic compound extrusion family,MATE family)是植物体中一类新型大家族蛋白,它们在细胞的解毒机制中起重要作用。本文介绍了MATE蛋白的基本特征、分子机制和生物学功能以及目前在水稻抗逆作用中的研究概况,以期为水稻抗胁迫研究提供新的思路和理论参考。
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关键词
水稻
MATE家族
转运蛋白
抗逆性
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职称材料
题名
水稻CIPK基因家族的鉴定及OsCIPK5受稻瘟病菌诱导的qRT-PCR分析
被引量：
5
1
作者
喻丝丝
罗曦
连玲
许惠滨
陈丽萍
魏毅东
蔡秋华
谢华安
张建福
机构
福建农林大学农学院
福建省农业科学院水稻研究所
闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室/农业部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州(国家)水稻改良分中心/福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/杂交水稻国家重点实验室华南研究基地/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室/水稻国家工程实验室
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期1237-1245,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0300508)
福建省科技计划公益类专项(2018R1021-5)
福建省财政专项——福建省农业科学院科技创新团队建设项目(STIT2017-1-1)
文摘
【目的】植物通过启动一系列信号传导过程来应对外部环境,这些过程通常涉及多种蛋白激酶,包括钙调神经磷酸酶B样蛋白互作激酶(calcineurin B-like protein-interacting protein kinases, CIPKs)。为更加清晰全面地了解水稻CIPK基因家族,本研究根据最新的基因组测序数据对水稻基因组中的CIPKs进行了鉴定。【方法】通过探讨拟南芥和水稻中CIPKs蛋白家族的结构特点,结合生物信息学和qRT-PCR技术系统分析水稻中CIPKs家族蛋白的结构。结合转录组数据,比较了粳稻云引受稻瘟病菌诱导后的表达情况。【结果】根据最新的水稻基因组数据,鉴定出31个水稻OsCIPK基因。系统发育树分析结果表明,31个OsCIPK基因可分为5个亚家族,这些亚家族具有不同的外显子-内含子和UTR的结构特点。从广谱抗稻瘟病品种粳稻云引受稻瘟病菌诱导的基因表达谱的趋势聚类中筛选出了OsCIPK5基因并对其进行了表达分析,结果表明,云引中OsCIPK5基因受稻瘟病菌的诱导表达。【结论】内含子缺失和片段重复在水稻OsCIPK基因家族的扩展中起到重要作用,同时OsCIPK5受到稻瘟病菌的诱导表达。
关键词
水稻
CIPK
基因家族
OsCIPK5
稻瘟病菌
QRT-PCR
Keywords
Rice
CIPK
Gene families
OsCIPK5
M.grisea
qRT-PCR
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
MATE转运蛋白在水稻抗逆作用中的研究进展
被引量：
4
2
作者
喻丝丝
魏林艳
谢华安
张建福
机构
福建师范大学生命科学学院
农业部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州(国家)水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室
福建省农业科学院水稻研究所
福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地
水稻国家工程实验室
杂交水稻国家重点实验室华南基地
出处
《福建农业学报》
CAS
2014年第4期398-405,共8页
基金
国家"973"计划资助项目(2010CB723003)
福建省财政专项--福建省农业科学院科技创新团队建设项目(CXTD-1-1301)
文摘
水稻Oryza sativa在生长发育过程中需要面对自然环境中多重不利因素的影响,包括非生物胁迫和生物胁迫。为了抵御这些不利因子,水稻在自然选择过程中形成了多种机制以保护植株的健康生长。多药物有毒化合物排出家族转运蛋白(Multidrug and toxic compound extrusion family,MATE family)是植物体中一类新型大家族蛋白,它们在细胞的解毒机制中起重要作用。本文介绍了MATE蛋白的基本特征、分子机制和生物学功能以及目前在水稻抗逆作用中的研究概况,以期为水稻抗胁迫研究提供新的思路和理论参考。
关键词
水稻
MATE家族
转运蛋白
抗逆性
Keywords
rice （Oryza sativa L. ）
MATE families
transporters
stress resistance
分类号
Q945 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻CIPK基因家族的鉴定及OsCIPK5受稻瘟病菌诱导的qRT-PCR分析
喻丝丝
罗曦
连玲
许惠滨
陈丽萍
魏毅东
蔡秋华
谢华安
张建福
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
下载PDF
职称材料
2
MATE转运蛋白在水稻抗逆作用中的研究进展
喻丝丝
魏林艳
谢华安
张建福
《福建农业学报》
CAS
2014
4
下载PDF
职称材料
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