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ITS片段作为轮枝菌DNA条形码的评价研究 被引量：5
1
作者 段维军 张慧丽 +4 位作者 郭立新 顾建锋 陈先锋 张祥林 夏侯阳 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期72-77,89,共7页
以轮枝菌属中的重要植物病原性轮枝菌及其近似种共13种35个菌株为材料,探讨ITS片段作为轮枝菌DNA条形码的可行性。结果表明,ITS成功区分了研究涉及的10个种,其PCR扩增和测序成功率为97.1%,序列鉴定成功率为94.5%,但对个别亲缘关系较近... 以轮枝菌属中的重要植物病原性轮枝菌及其近似种共13种35个菌株为材料,探讨ITS片段作为轮枝菌DNA条形码的可行性。结果表明,ITS成功区分了研究涉及的10个种,其PCR扩增和测序成功率为97.1%,序列鉴定成功率为94.5%,但对个别亲缘关系较近种的物种鉴别能力较弱。 展开更多
关键词 轮枝菌属 种内与种间差异 PCR扩增与测序成功率 邻接树
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检疫性轮枝菌及其近似种的鉴定 被引量：16
2
作者 段维军 郭立新 +3 位作者 张祥林 夏侯阳 张慧丽 陈先锋 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期274-285,277-285,共12页
大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)和黑白轮枝菌(V.albo-atrum)在世界范围内引起多种作物的黄萎病,属于我国重要进境植物检疫对象。本研究对采自我国部分地区和CBS保存的多种植物病原性轮枝菌,包括黑白轮枝菌、大丽轮枝菌及其变种大丽... 大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)和黑白轮枝菌(V.albo-atrum)在世界范围内引起多种作物的黄萎病,属于我国重要进境植物检疫对象。本研究对采自我国部分地区和CBS保存的多种植物病原性轮枝菌,包括黑白轮枝菌、大丽轮枝菌及其变种大丽轮枝菌长孢变种(V.dahliae var.longisporum)、三体轮枝菌(V.tricorpus)、变黑轮枝菌(V.nigrescens)和云状轮枝菌(V.nubilum),采用生物学特性观察,结合rDNA-ITS序列分析的方法,进行了比较和分析。结果表明:不同种类轮枝菌在休眠结构形态上具有一定差异,部分菌株不产生任何休眠结构。各供试菌株在15～25℃范围内均可生长,但黑白轮枝菌在30℃下生长受到强烈抑制,而其他菌株受影响较小。对供试菌株rDNA-ITS序列分析结果表明植物病原性轮枝菌可聚为9个分支,包括三体轮枝菌、变黑轮枝菌、云状轮枝菌、V.theobromae、大丽轮枝菌、大丽轮枝菌长孢变种和3个不同的黑白轮枝菌分支,黑白轮枝菌、大丽轮枝菌及其长孢变种亲缘关系较近。采用生物学性状结合rDNA-ITS序列分析能够更加有效地将两种检疫性轮枝菌从其他植物病原性轮枝菌中区分出来。 展开更多
关键词 大丽轮枝菌 黑白轮枝菌 生物学特性 分子鉴定
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进境台湾芹菜上一株变黑轮枝菌的鉴定 被引量：5
3
作者 段维军 郭立新 +3 位作者 张慧丽 刘培源 夏侯阳 陈先锋 《植物检疫》 北大核心 2012年第4期30-34,共5页
从进境台湾芹菜组织中分离出一株菌株F03718,经形态学观察和rDNA ITS序列分析,将该分离物鉴定为变黑轮枝菌(Verticillium nigrescens)。这是首次从我国台湾进境旅客携带物芹菜中检出变黑轮枝菌。
关键词 进境 芹菜 变黑轮枝菌 鉴定 致病性
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基于COI基因分析的植物病原性轮枝菌条形码评价 被引量：2
4
作者 段维军 郭立新 +4 位作者 顾建锋 张慧丽 张祥林 夏侯阳 陈先锋 《植物检疫》 北大核心 2013年第6期41-45,共5页
数以百万计的真菌种类对真菌识别构成了巨大的挑战。本研究以轮枝菌属中的重要植物病原性轮枝菌及其近似种共13种34个菌株为材料,探讨COI基因作为该属DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段不存在内含子,PCR扩增与测序成功率较高,但部... 数以百万计的真菌种类对真菌识别构成了巨大的挑战。本研究以轮枝菌属中的重要植物病原性轮枝菌及其近似种共13种34个菌株为材料,探讨COI基因作为该属DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段不存在内含子,PCR扩增与测序成功率较高,但部分测试菌种的COI基因存在种内差异大于种间差异的情况,种间和种内距离存在交叉重叠,序列鉴定成功率为73.5%,难以达到便捷、准确鉴定植物病原性轮枝菌种类的目的。因此,COI基因不宜作为植物病原性轮枝菌的DNA条形码。 展开更多
关键词 轮枝菌 细胞色素c氧化酶亚基I DNA条形码 邻接树
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