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基于线粒体Cyt b基因序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
1
作者
刘士力
陈大伟
+7 位作者
朱鹏灿
郑建波
夏冯博
程顺
蒋文枰
迟美丽
杭小英
李飞
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第2期342-347,共6页
黄尾鲴(Xenocypris davidi)是浙江省自然水域增殖放流的主要鱼类,为了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,利用线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)对4个养殖群体的遗传多样性进行研究,旨在为黄尾鲴增殖放流策略制定和实施提供基础数据。结...
黄尾鲴(Xenocypris davidi)是浙江省自然水域增殖放流的主要鱼类,为了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,利用线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)对4个养殖群体的遗传多样性进行研究,旨在为黄尾鲴增殖放流策略制定和实施提供基础数据。结果显示,在编码Cyt b的1 140 bp序列中,检测到157个变异位点,界定了21种单倍型,其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为10个、11个、7个和2个,单倍型多样性介于0.226~0.794,核苷酸多样性介于0.006 14~0.023 86。除醴陵群体遗传多样性较低外,其余3个养殖群体的遗传多样性具有高单倍型数和高核苷酸多样性的特点。4个黄尾鲴养殖群体间的遗传距离为0.018 74~0.092 74,遗传分化指数为0.808 63(P<0.01),其中长兴和八里店群体的分化程度较低,双浦和醴陵群体的分化程度较高,且遗传变异主要发生在群体间。本研究结果可从分子水平为黄尾鲴的资源保护和人工增殖放流提供参考依据。
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关键词
黄尾鲴
养殖群体
Cyt
b基因
遗传多样性
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职称材料
基于线粒体D-loop区序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
2
作者
刘士力
陈大伟
+5 位作者
郑建波
程顺
蒋文枰
迟美丽
夏冯博
李飞
《广东农业科学》
CAS
2023年第11期139-145,共7页
【目的】黄尾鲴(Xenocypris davidi)是以腐殖质、有机碎屑为饵料,兼食浮游生物和底栖动物的的淡水经济鱼类,是浙江省自然水域鱼类增殖放流的主要品种之一。了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,可为自然水域黄尾鲴的增殖放流策略设计...
【目的】黄尾鲴(Xenocypris davidi)是以腐殖质、有机碎屑为饵料,兼食浮游生物和底栖动物的的淡水经济鱼类,是浙江省自然水域鱼类增殖放流的主要品种之一。了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,可为自然水域黄尾鲴的增殖放流策略设计和实施提供参考。【方法】对浙江长兴、八里店、双浦和湖南醴陵4个黄尾鲴养殖群体的线粒体DNA(mtDNA)D-loop序列进行PCR扩增和测序,通过序列分析研究4个群体的遗传多样性。【结果】黄尾鲴线粒体D-loop序列长度为1038~1093 bp,碱基A+T含量(65.3%)显著高于C+G含量(34.7%),平均转换/颠换比值(TS/TV)为4.6。在128条黄尾鲴的D-loop序列中共检测到101个变异位点,包括97个简约信息位点;界定了19种单倍型,其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为5、12、4和2;单倍型多样性(h)介于0.226~0.915之间,核苷酸多样性(π)介于0.00640~0.01433之间。4个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异,不同养殖群体间遗传距离为0.03782~0.88756,遗传分化系数为0.78903(P<0.01),群体内变异占整个遗传变异的21.10%,其中长兴群体和八里店群体的遗传分化系数最低,双浦和醴陵群体的遗传分化系数最高,遗传变异主要发生在群体间。【结论】4个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异。黄尾鲴遗传变异和种群结构的信息可为其遗传多样性变化的研究提供参考,有助于黄尾鲴的资源保护。
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关键词
黄尾鲴
线粒体DNA(mtDNA)
D-loop序列
遗传多样性
遗传结构
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职称材料
题名
基于线粒体Cyt b基因序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
1
作者
刘士力
陈大伟
朱鹏灿
郑建波
夏冯博
程顺
蒋文枰
迟美丽
杭小英
李飞
机构
浙江省淡水水产研究所农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室
上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室
湖州融晟渔业科技有限公司
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第2期342-347,共6页
基金
浙江省财政专项(2024CZZX02)
国家淡水水产种质资源库项目(FGRC18537)。
文摘
黄尾鲴(Xenocypris davidi)是浙江省自然水域增殖放流的主要鱼类,为了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,利用线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)对4个养殖群体的遗传多样性进行研究,旨在为黄尾鲴增殖放流策略制定和实施提供基础数据。结果显示,在编码Cyt b的1 140 bp序列中,检测到157个变异位点,界定了21种单倍型,其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为10个、11个、7个和2个,单倍型多样性介于0.226~0.794,核苷酸多样性介于0.006 14~0.023 86。除醴陵群体遗传多样性较低外,其余3个养殖群体的遗传多样性具有高单倍型数和高核苷酸多样性的特点。4个黄尾鲴养殖群体间的遗传距离为0.018 74~0.092 74,遗传分化指数为0.808 63(P<0.01),其中长兴和八里店群体的分化程度较低,双浦和醴陵群体的分化程度较高,且遗传变异主要发生在群体间。本研究结果可从分子水平为黄尾鲴的资源保护和人工增殖放流提供参考依据。
关键词
黄尾鲴
养殖群体
Cyt
b基因
遗传多样性
Keywords
Xenocypris davidi
cultured population
Cyt b gene
genetic diversity
分类号
S965.124 [农业科学—水产养殖]
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于线粒体D-loop区序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
2
作者
刘士力
陈大伟
郑建波
程顺
蒋文枰
迟美丽
夏冯博
李飞
机构
浙江省淡水水产研究所/农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室
上海海洋大学水产与生命学院/农业农村部淡水水产种质资源重点实验室
湖州师范学院生命科学学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2023年第11期139-145,共7页
基金
浙江省科技厅财政专项(2022CZZX005)
国家淡水水产种质资源库长江流域种质资源分库建设项目(2022)。
文摘
【目的】黄尾鲴(Xenocypris davidi)是以腐殖质、有机碎屑为饵料,兼食浮游生物和底栖动物的的淡水经济鱼类,是浙江省自然水域鱼类增殖放流的主要品种之一。了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,可为自然水域黄尾鲴的增殖放流策略设计和实施提供参考。【方法】对浙江长兴、八里店、双浦和湖南醴陵4个黄尾鲴养殖群体的线粒体DNA(mtDNA)D-loop序列进行PCR扩增和测序,通过序列分析研究4个群体的遗传多样性。【结果】黄尾鲴线粒体D-loop序列长度为1038~1093 bp,碱基A+T含量(65.3%)显著高于C+G含量(34.7%),平均转换/颠换比值(TS/TV)为4.6。在128条黄尾鲴的D-loop序列中共检测到101个变异位点,包括97个简约信息位点;界定了19种单倍型,其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为5、12、4和2;单倍型多样性(h)介于0.226~0.915之间,核苷酸多样性(π)介于0.00640~0.01433之间。4个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异,不同养殖群体间遗传距离为0.03782~0.88756,遗传分化系数为0.78903(P<0.01),群体内变异占整个遗传变异的21.10%,其中长兴群体和八里店群体的遗传分化系数最低,双浦和醴陵群体的遗传分化系数最高,遗传变异主要发生在群体间。【结论】4个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异。黄尾鲴遗传变异和种群结构的信息可为其遗传多样性变化的研究提供参考,有助于黄尾鲴的资源保护。
关键词
黄尾鲴
线粒体DNA(mtDNA)
D-loop序列
遗传多样性
遗传结构
Keywords
Xenocypris davidi
mitochondrial DNA(mtDNA)
D-loop sequence
genetic diversity
genetic structure
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q343.5 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体Cyt b基因序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
刘士力
陈大伟
朱鹏灿
郑建波
夏冯博
程顺
蒋文枰
迟美丽
杭小英
李飞
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
基于线粒体D-loop区序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
刘士力
陈大伟
郑建波
程顺
蒋文枰
迟美丽
夏冯博
李飞
《广东农业科学》
CAS
2023
0
下载PDF
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