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安庆市商品猪戊型肝炎病毒的分子流行病学调查 被引量：3
1
作者 夏玉刚 胡安群 +2 位作者 陆一涵 刘海燕 郑英杰 《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期676-679,共4页
目的了解安徽省安庆市商品猪戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)的流行病学特征。方法 2009年3月26日、6月20日9、月15日和12月8日分别在安庆市安庆屠宰场收集商品猪胆汁100份,共400份,并按采样时间将400份商品猪胆汁标本分为A、B、C... 目的了解安徽省安庆市商品猪戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)的流行病学特征。方法 2009年3月26日、6月20日9、月15日和12月8日分别在安庆市安庆屠宰场收集商品猪胆汁100份,共400份,并按采样时间将400份商品猪胆汁标本分为A、B、C、D 4组。用巢氏RT-PCR方法对HEV ORF2区域内150-nt序列进行扩增,测序后参照GenBank下载的参考序列作系统进化分析。结果 400份猪胆汁中有22份(5.5%)检测出HEV RNA,其中,A^D各组的HEV携带率分别为9.00%、6.00%、3.00%、4.00%,各组间的HEV携带率差异无统计学意义(χ2=4.04,ν=3,P=0.26)。系统进化分析结果显示,检测到的猪HEV病毒株均属于基因4型,与1、2、3和4型参考病毒株的核苷酸同源性分别为80.40%~95.78%、82.10%~95.72%、77.31%~96.76%和89.51%~96.71%。基因4型样本病毒株内部又归为a或d两个亚型,且以a型为主。结论安庆市商品猪的HEV携带率较高,基因4a型为该地区商品猪HEV的主要基因型,未煮熟的猪肉制品存在着食用安全隐患。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 基因型 人兽共患病 流行病学
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戊型肝炎病毒不同生物标志物的关联和基因分型 被引量：2
2
作者 刘海燕 胡安群 +3 位作者 郑英杰 陆一涵 夏玉刚 黄升海 《临床输血与检验》 CAS 2011年第2期104-107,共4页
目的分析戊型肝炎病毒不同生物标志物的相关性及其基因型和流行病学特点。方法收集2007~2009年安庆市立医院临床检测为急性散发性肝炎患者的系列血清,采用酶联免疫(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)试剂检测HEV-IgG抗体、HEV-... 目的分析戊型肝炎病毒不同生物标志物的相关性及其基因型和流行病学特点。方法收集2007~2009年安庆市立医院临床检测为急性散发性肝炎患者的系列血清,采用酶联免疫(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)试剂检测HEV-IgG抗体、HEV-IgM抗体,采用巢氏逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reac-tion,RT-PCR)法检测HEV RNA,比较各指标间的相关性,并对HEV RNA阳性的序列进行测序和基因分型。结果在46例安庆地区临床确诊为急性散发性戊型肝炎患者中,HEV-IgG抗体滴度有升高趋势、HEV-IgM抗体阳性和HEV RNA阳性的患者分别为36例、41例和39例。HEV-IgM抗体变化与HEV-IgG抗体变化的符合率为88.2%,HEV-IgM抗体变化与HEV RNA阳性的符合率为85.3%,HEV-IgG抗体变化与HEV RNA阳性的符合率为83.8%;扩增ORF2区域150-nt核苷酸片段15条,系统进化分析显示为HEV基因型。结论同时进行HEV-IgG、HEV-IgM抗体和核酸的检测... 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 RT-PCR 基因型
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安庆市人与猪群中戊型肝炎病毒的系统进化分析 被引量：4
3
作者 夏玉刚 胡安群 +2 位作者 陆一涵 刘海燕 郑英杰 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期888-892,共5页
目的 了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒（hepatitis E Virus,HEV）的基因型和系统进化特征.方法 收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组（每组各100份）... 目的 了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒（hepatitis E Virus,HEV）的基因型和系统进化特征.方法 收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组（每组各100份）.应用巢氏逆转录聚合酶链反应（reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR）方法检测HEV开放式阅读框架（open reading frame,ORF）2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性.使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系.结果 患者的男女性别比例为2.86∶1,平均年龄为56.78岁.27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26%.安庆市人HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为74.75%～82.99%、75.26%～83.64%、72.77%～80.57%和88.03%～91.63%.400份猪胆汁中有22份（5.5%）分离出HEV RNA,A、B、C、D各组的HEV携带率分别为7.00%、3.00%、9.00%、3.00%,各组间的猪HEV携带率差异无统计学意义（x2=5.20,P=0.16）.安庆市猪HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.24%～83.42%、75.93%～84.19%、72.86%～80.64%和88.15%～91.79%.系统进化树分析结果显示,安庆市人和猪HEV病毒株均属于基因Ⅳ型,且错落分布于进化分支上,无明显的物种聚集现象.结论 基因Ⅳ型HEV为安庆市人和猪的优势病毒株,且有可能在该地区人和猪群中跨物种传播. 展开更多
关键词 肝炎病毒 戊型 基因型 进化 序列分析
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华东地区散发性戊型肝炎病毒系统进化分析 被引量：4
4
作者 夏玉刚 李燕婷 +6 位作者 陆一涵 任红 胡安群 朱建福 王学才 姜庆五 郑英杰 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1269-1272,共4页
目的 了解华东地区散发性戊型肝炎病毒（HEV）的系统进化特征。方法2005—2008年收集华东地区14家二级或三级医院413份散发戊型肝炎患者血清，应用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA并测序。参照GenBank相关序列，分析各序列之间的同源性，并构... 目的 了解华东地区散发性戊型肝炎病毒（HEV）的系统进化特征。方法2005—2008年收集华东地区14家二级或三级医院413份散发戊型肝炎患者血清，应用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA并测序。参照GenBank相关序列，分析各序列之间的同源性，并构建进化树。结果413例患者的男女性别比为1．75：1，40～69岁患者居多（61．5％）。413份患者血清有140份分离出HEVRNA，阳性分离率为34％。所有分离的140份病毒株均属于HEVⅣ型，与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为77．9％～88．3％、80．8％～90．6％、73．4％～85．2％和91．0％～95．4％。结论基因Ⅳ型HEV是引起华东地区散发性戊型肝炎的优势病毒株，其起源和进化等问题仍需进一步研究。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 系统进化 基因型
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华东和华南地区商品猪戊型肝炎病毒携带率和基因分型分析 被引量：2
5
作者 夏玉刚 陆一涵 +5 位作者 胡安群 秦雪 董晓莲 朱建福 姜庆五 郑英杰 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期791-794,共4页
目的 了解华东和华南地区商品猪戊型肝炎病毒（HEV）的携带率和基因分型.方法 2007-2009年收集华东和华南地区5家屠宰场商品猪胆汁600份,应用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA,测序后做系统进化分析.结果 600份猪胆汁中有47份（7.83%）分离出HE... 目的 了解华东和华南地区商品猪戊型肝炎病毒（HEV）的携带率和基因分型.方法 2007-2009年收集华东和华南地区5家屠宰场商品猪胆汁600份,应用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA,测序后做系统进化分析.结果 600份猪胆汁中有47份（7.83%）分离出HEVRNA.基于HEV ORF2区域内150-nt序列的系统进化分析结果,分离的47份HEV病毒株均属于Ⅳ型,与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.0%～83.4%、75.0%～84.6%、71.9%～80.7%和88.1%～91.5%,且大部分病毒株按采样地区来源表现出地区聚集性.结论 HEV在华东和华南地区的商品猪中广泛存在,应加强对商品猪食用安全问题的关注. 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 携带率 基因型 猪
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高中生乙型肝炎血清学及S基因序列进化分析 被引量：1
6
作者 王静霓 姚晴青 +6 位作者 袁权 夏玉刚 陆一涵 高眉扬 葛胜祥 姜庆五 郑英杰 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期65-66,共2页
目的了解江苏省海门市高中生乙型肝炎感染情况及其HBV S基因的变异情况。方法采用整群抽样方法抽取江苏省海门市职业中心校的407名高三学生进行乙肝血清学调查;采用酶联免疫吸附法(ELISA)和巢氏聚合酶链式反应(PCR)扩增方法检测血清样... 目的了解江苏省海门市高中生乙型肝炎感染情况及其HBV S基因的变异情况。方法采用整群抽样方法抽取江苏省海门市职业中心校的407名高三学生进行乙肝血清学调查;采用酶联免疫吸附法(ELISA)和巢氏聚合酶链式反应(PCR)扩增方法检测血清样本的乙型肝炎表面抗原(HBsAg)、乙型肝炎病毒表面抗体(抗-HBs)和乙型肝炎病毒(HBV)S基因并进行进化分析。结果 407名高中生中乙肝表面抗原(HBsAg)阳性率为6.39%;在家中、乡镇卫生院和县级及以上医院出生学生的HBsAg阳性率分别为11.76%、8.02%和2.27%,差异有统计学意义(P<0.05);抗-HBs滴度≥10U/L者占72.5%,且呈U形分布;不同乡镇、不同性别学生抗-HBs滴度差异有统计学意义(P<0.01);407名高中生HBV S基因均为C基因型,主要变异在蛋白疏水区,抗原决定簇a区未发生免疫原性改变。结论出生时接受的医疗水平对HBV感染有影响;海门市高中生HBV S基因受到正选择作用而出现变异,但未发生免疫原性改变。 展开更多
关键词 乙型肝炎 血清学 S基因 进化分析 免疫原性
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青岛奥林匹克帆船中心医学媒介生物调查 被引量：1
7
作者 夏玉刚 赵风源 +1 位作者 吕昆仑 唐灿 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2015年第2期132-135,148,共5页
目的了解青岛奥林匹克帆船中心(以下简称"奥帆中心")鼠、蚊、蝇、蜚蠊4类医学媒介生物的种群构成、生境分布和季节消长等特征。方法 2012—2013年,分别采用诱捕器诱捕法捕获鼠、蚊、蝇、蜚蠊类医学媒介生物,并进行计数和分类... 目的了解青岛奥林匹克帆船中心(以下简称"奥帆中心")鼠、蚊、蝇、蜚蠊4类医学媒介生物的种群构成、生境分布和季节消长等特征。方法 2012—2013年,分别采用诱捕器诱捕法捕获鼠、蚊、蝇、蜚蠊类医学媒介生物,并进行计数和分类鉴定。结果此次调查共捕获鼠类3只,经分类鉴定隶属于1科2属2种;捕获蚊类170只,经分类鉴定隶属于1科3属4种,优势种群为淡色库蚊、中华按蚊和东乡伊蚊,7-9月为高峰期;蝇类4 614只,经分类鉴定隶属于4科12属16种,优势种为丝光绿蝇、大头金蝇、厩腐蝇,月平均成蝇密度为38.45只/(笼·日),5-9月为高峰期;捕获蜚蠊19只,经分类鉴定隶属1科1属1种。垃圾场和餐饮区为上述医学媒介生物的重要滋生区域。结论本次调查比较全面地掌握了青岛奥帆中心医学媒介生物情况,为积极开展该口岸医学媒介生物的防治工作提供了科学依据。 展开更多
关键词 医学媒介生物 种群构成 季节消长 生境分布
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青岛奥林匹克帆船中心蝇类本底调查 被引量：1
8
作者 夏玉刚 吕昆仑 +1 位作者 唐灿 赵风源 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2014年第1期29-32,共4页
目的了解青岛奥林匹克帆船中心(以下简称"奥帆中心")蝇类的种群构成、季节消长和生境分布等特征。方法采用诱蝇笼捕集法捕获蝇类,每月调查2次,对捕获的蝇类进行计数和分类鉴定。利用圆形分布法验证蝇类是否有季节性聚集趋势,... 目的了解青岛奥林匹克帆船中心(以下简称"奥帆中心")蝇类的种群构成、季节消长和生境分布等特征。方法采用诱蝇笼捕集法捕获蝇类,每月调查2次,对捕获的蝇类进行计数和分类鉴定。利用圆形分布法验证蝇类是否有季节性聚集趋势,并估算高峰时点和高峰时期。结果此次调查共捕获蝇类4614只,隶属于4科12属16种,优势种群为丝光绿蝇、大头金蝇、厩腐蝇、家蝇和棕尾别麻蝇。成蝇密度和气温、降水量之间存在正相关关系。蝇类消长有季节性,呈单峰分布,高峰时点为7月18日,高峰时期为5月29日-9月12日。垃圾场和餐饮区为蝇类的重要滋生区域。结论本次调查填补了青岛奥帆中心蝇类本底资料的空白,为积极开展该口岸蝇类防治工作提供了科学依据。 展开更多
关键词 蝇类 种群构成 季节消长 生境分布
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