目的利用生物信息学及分子对接,探讨天牛止眩胶囊治疗原发性高血压(essential hypertension,EH)的潜在活性成分及分子机制。方法利用中药系统药理学数据库和分析平台、BATMAN-TCM平台筛选天牛止眩胶囊的活性成分及药物靶点,使用GeneCard...目的利用生物信息学及分子对接,探讨天牛止眩胶囊治疗原发性高血压(essential hypertension,EH)的潜在活性成分及分子机制。方法利用中药系统药理学数据库和分析平台、BATMAN-TCM平台筛选天牛止眩胶囊的活性成分及药物靶点,使用GeneCards、PharmGkb、TTD、DrugBank检索EH的疾病相关靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“药物–成分–靶点”网络图,应用STRING平台进行蛋白质–蛋白质相互作用分析,使用R软件包进行基因本体论(gene ontology,GO)与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,运用AutoDockTools及AutoDock Vina进行分子对接验证,使用PyMol软件进行可视化分析。结果共筛选出天牛止眩胶囊有效成分53种,涉及相关靶点基因422个。筛选出关键活性化合物217个,拓扑分析得出核心靶点蛋白AKT1、MAPK8、NFKB1、FOS、MAPK1、JUN等10个,GO及KEGG富集分析结果提示天牛止眩胶囊干预EH主要涉及细胞对外的刺激、对活性氧的反应、氧化应激反应等多种生物学途径与涉及脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等相关通路。分子对接结果显示FOS与槲皮素及山柰酚结合力最强。结论天牛止眩胶囊中的槲皮素、山柰酚等多种关键活性成分可作用于FOS、JUN、AKT等多个核心靶点蛋白,发挥调控血压、降低心脑血管并发症危险等级、保护靶器官的作用。展开更多
文摘目的利用生物信息学及分子对接,探讨天牛止眩胶囊治疗原发性高血压(essential hypertension,EH)的潜在活性成分及分子机制。方法利用中药系统药理学数据库和分析平台、BATMAN-TCM平台筛选天牛止眩胶囊的活性成分及药物靶点,使用GeneCards、PharmGkb、TTD、DrugBank检索EH的疾病相关靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“药物–成分–靶点”网络图,应用STRING平台进行蛋白质–蛋白质相互作用分析,使用R软件包进行基因本体论(gene ontology,GO)与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,运用AutoDockTools及AutoDock Vina进行分子对接验证,使用PyMol软件进行可视化分析。结果共筛选出天牛止眩胶囊有效成分53种,涉及相关靶点基因422个。筛选出关键活性化合物217个,拓扑分析得出核心靶点蛋白AKT1、MAPK8、NFKB1、FOS、MAPK1、JUN等10个,GO及KEGG富集分析结果提示天牛止眩胶囊干预EH主要涉及细胞对外的刺激、对活性氧的反应、氧化应激反应等多种生物学途径与涉及脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等相关通路。分子对接结果显示FOS与槲皮素及山柰酚结合力最强。结论天牛止眩胶囊中的槲皮素、山柰酚等多种关键活性成分可作用于FOS、JUN、AKT等多个核心靶点蛋白,发挥调控血压、降低心脑血管并发症危险等级、保护靶器官的作用。
