目的:采用网络药理学方法及分子对接技术探讨苍膝通痹胶囊治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,...目的:采用网络药理学方法及分子对接技术探讨苍膝通痹胶囊治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选苍膝通痹胶囊的活性成分及对应靶点;运用Drugbank、人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)、比较毒理基因组学数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)检索OA的已知疾病靶点;使用Venny平台得到苍膝通痹胶囊治疗OA的药效靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,运用STRING数据库建立蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI),利用CytoHubba工具对所得PPI网络进行拓扑分析筛选出关键靶点。借助DAVID数据库对作用靶点进行基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)获取其潜在作用机制,构建苍膝通痹胶囊“通路-靶点”作用网络。从RCSBPDB数据库获取靶点的晶体结构文件,从Pubchem数据库获取活性成分的结构文件,利用Auto vina软件进行分子对接验证。结果:共得到苍膝通痹胶囊活性成分60个、作用靶点140个。OA疾病靶点469个,苍膝通痹胶囊治疗OA的靶点52个。核心成分有槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、木犀草素等。核心靶点包括IL-1β、IL-6、VEGFA、MAPK、JUN等。通路主要涉及PI3K-Akt、NF-κB、FoxO、雌激素、MAPK通路等。有效成分在与核心靶点对接中具有较强的结合能力。结论:苍膝通痹胶囊通过调控细胞增殖、抑制炎症等多成分、多靶点、多通路治疗OA。展开更多
文摘目的:采用网络药理学方法及分子对接技术探讨苍膝通痹胶囊治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选苍膝通痹胶囊的活性成分及对应靶点;运用Drugbank、人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)、比较毒理基因组学数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)检索OA的已知疾病靶点;使用Venny平台得到苍膝通痹胶囊治疗OA的药效靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,运用STRING数据库建立蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI),利用CytoHubba工具对所得PPI网络进行拓扑分析筛选出关键靶点。借助DAVID数据库对作用靶点进行基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)获取其潜在作用机制,构建苍膝通痹胶囊“通路-靶点”作用网络。从RCSBPDB数据库获取靶点的晶体结构文件,从Pubchem数据库获取活性成分的结构文件,利用Auto vina软件进行分子对接验证。结果:共得到苍膝通痹胶囊活性成分60个、作用靶点140个。OA疾病靶点469个,苍膝通痹胶囊治疗OA的靶点52个。核心成分有槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、木犀草素等。核心靶点包括IL-1β、IL-6、VEGFA、MAPK、JUN等。通路主要涉及PI3K-Akt、NF-κB、FoxO、雌激素、MAPK通路等。有效成分在与核心靶点对接中具有较强的结合能力。结论:苍膝通痹胶囊通过调控细胞增殖、抑制炎症等多成分、多靶点、多通路治疗OA。
