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基于SSR标记的毛豆种质资源遗传多样性分析
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作者 向艳涛 刘昌燕 +4 位作者 韩雪松 李莉 孙龙清 陈宏伟 沙爱华 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1029-1039,共11页
为了解不同毛豆种质资源的遗传基础和群体的亲缘关系,本研究选用212对SSR标记对来自于中国(包括台湾地区、湖北、江西、江苏、辽宁、安徽)和日本的84份毛豆种质材料进行了基因型分析,根据Nei’s遗传距离和非加权配对法(UPGMA)进行聚类分... 为了解不同毛豆种质资源的遗传基础和群体的亲缘关系,本研究选用212对SSR标记对来自于中国(包括台湾地区、湖北、江西、江苏、辽宁、安徽)和日本的84份毛豆种质材料进行了基因型分析,根据Nei’s遗传距离和非加权配对法(UPGMA)进行聚类分析,以structure软件的混合模型聚类法推断材料构成群体的遗传结构。结果表明:SSR引物在群体材料中扩增出的等位位点数为1-6个,平均每对引物为2.08个;有效等位基因1~3.74之间,平均为1.6个;基因多样性平均值为0.29,PIC平均值为0.24。聚类分析将84份材料分为4个组群,主成分分析的二维和三维主坐标分析图验证了聚类分析结果。群体结构分析显示,当K=4时,ΔK出现明显的峰值,说明最佳群体组群数为4个,该结果与聚类分析结果也基本一致;84份材料中有74份Q值大于0.7,说明该群体毛豆种质资源群体内遗传多样性不够丰富,遗传背景单一。因此,需重视对遗传背景差异大、亲缘关系远的种质资源的发掘利用,加强种质材料共享和交流,促进毛豆育种事业的发展。 展开更多
关键词 毛豆 SSR标记 遗传多样性分析 群体结构分析
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基于IBAS和LSTM网络的池塘水溶解氧含量预测 被引量:14
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作者 孙龙清 吴雨寒 +1 位作者 孙希蓓 张松 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期252-260,共9页
为了提高池塘水体中溶解氧含量(DO)预测精度,本文提出了一种基于改进的天牛须搜索算法(Improved beetle antennae search algorithm,IBAS)和长短期记忆网络(Long short-term memory,LSTM)相结合的溶解氧含量预测模型。为了降低模型输入... 为了提高池塘水体中溶解氧含量(DO)预测精度,本文提出了一种基于改进的天牛须搜索算法(Improved beetle antennae search algorithm,IBAS)和长短期记忆网络(Long short-term memory,LSTM)相结合的溶解氧含量预测模型。为了降低模型输入维度,提高模型计算效率,采用皮尔逊(Pearson)相关系数分析法得出各因子与溶解氧含量之间的相关性,提取强关联因子作为模型输入特征;为了使天牛须搜索算法(Beetle antennae search algorithm,BAS)在全局搜索和局部搜索中达到平衡,提高算法的收敛速度,提出衰减因子指数递减策略改进天牛须搜索算法,将衰减因子γ与迭代次数相联系并呈指数函数递减;通过IBAS优化LSTM网络,得到最优参数组合策略,建立P-IBAS-LSTM非线性溶解氧含量预测模型。并利用该模型对江苏省宜兴市水产养殖研究中心某池塘水体溶解氧含量进行验证,预测2 h后的溶解氧含量。在与常见的7种模型对比中发现,本文所提出的方法在各项指标中都取得了最优的性能,均方误差(MSE)为0.6442 mg^(2)/L^(2)、均方根误差(RMSE)为0.8026 mg/L、平均绝对误差(MAE)为0.5306 mg/L。实验结果表明本文所提出的模型预测精度更高,泛化性能更强,可以满足实际对溶解氧含量准确预测的需求,并为池塘养殖中水质预警控制提供参考。 展开更多
关键词 池塘水环境 溶解氧含量预测 长短期记忆网络 改进天牛须搜索算法 因子筛选 参数优化
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多目标鱼体对象提议检测算法研究 被引量:13
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作者 孙龙清 刘婷 +1 位作者 陈帅华 吴雨寒 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第12期260-267,共8页
鱼的行为变化除了可以反映其自身健康状况外,还对分析水质变化具有重要意义,而精确、快速的鱼体目标检测是行为变化分析的基础。针对现有多目标鱼体检测算法存在检测定位精确度低的问题,提出了一种简单、有效的多目标鱼体对象提议检测... 鱼的行为变化除了可以反映其自身健康状况外,还对分析水质变化具有重要意义,而精确、快速的鱼体目标检测是行为变化分析的基础。针对现有多目标鱼体检测算法存在检测定位精确度低的问题,提出了一种简单、有效的多目标鱼体对象提议检测算法。提取鱼体图像的骨架和边缘信息,制定新的窗口打分策略生成候选窗口,训练PCA卷积核提取鱼体图像前景和背景特征,利用支持向量机(Support vector machine,SVM)识别得到鱼体目标所在的候选窗口,运用非极大值抑制算法剔除冗余窗口完成目标检测。实验表明,基于新的窗口打分策略生成的候选窗口比Edge Boxes算法得到的候选窗口具有更高的召回率,召回率最高可达96.9%,对候选窗口的最高识别准确率可达95.71%。通过本文算法和Edge Boxes-PCANet算法得到的漏检率、误检率和平均检测时间表明,本文算法的综合表现更优,说明本文算法可以高效精确地实现多目标鱼体检测。 展开更多
关键词 鱼体 目标检测 边缘 骨架 支持向量机
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基于改进Graph Cut算法的生猪图像分割方法 被引量:17
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作者 孙龙清 李玥 +1 位作者 邹远炳 李亿杨 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第16期196-202,共7页
生猪图像分割为生猪行为特征提取、参数测量、图像分析、模式识别等提供易于理解和分析的图像表示,准确有效的生猪图像分割是生猪行为理解和分析的基础。针对传统Graph Cut算法分割精度差、分割效率低及不能准确分割特定目标的问题,该... 生猪图像分割为生猪行为特征提取、参数测量、图像分析、模式识别等提供易于理解和分析的图像表示,准确有效的生猪图像分割是生猪行为理解和分析的基础。针对传统Graph Cut算法分割精度差、分割效率低及不能准确分割特定目标的问题,该文结合交互分水岭算法,提出基于改进Graph Cut算法的生猪图像分割方法。采用交互分水岭算法对图像进行区域划分,划分的各个区域块看作超像素,用超像素替代传统加权图中的像素点,构造新的网络图替代传统加权图,重新构造能量函数以完成前景背景的有效分割。试验结果表明:该方法峰值信噪比平均范围为[30,40],结构相似度平均范围为[0.9,1],两种评价准则的结果与主观评价一致,图像分割质量、精度得到明显提升;平均耗时缩短到传统Graph Cut算法的33.7%,提高了分割效率;在复杂背景、噪声干扰、光照强度弱等条件下可以快速分割出特定目标生猪,具有较高鲁棒性。 展开更多
关键词 图像处理 图像分割 算法 改进 GraphCut算法 超像素 交互分水岭算法
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基于G-RepVGG和鱼类运动行为的水质监测方法 被引量:10
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作者 孙龙清 王泊宁 +1 位作者 王嘉煜 王新龙 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第S02期210-218,共9页
水质恶化会直接造成水产养殖产量下降,严重时会导致水产动物大量死亡,给养殖企业造成严重经济损失。因此对水产养殖中水质参数进行实时监测具有重要意义。本文以斑石鲷为研究对象,提出了一种基于鱼类行为的水质监测方法。该方法通过摄... 水质恶化会直接造成水产养殖产量下降,严重时会导致水产动物大量死亡,给养殖企业造成严重经济损失。因此对水产养殖中水质参数进行实时监测具有重要意义。本文以斑石鲷为研究对象,提出了一种基于鱼类行为的水质监测方法。该方法通过摄像机拍摄到的图像数据就可以非侵入地完成水质参数的实时监测,避免了安装复杂设备、对鱼类行为进行量化等繁琐过程。为了增加推理速度和降低模型参数量,通过将RepVGG block与GhostNet相结合构建了G-RepVGG模型,使该模型更适用于移动设备的部署。提出了计算量较少、推理速度快、更适合水质快速监测的Cheap Ghost操作和计算量大、精确率高、更适合水质的精确监测Expensive Ghoost操作。由于多分支网络适合进行训练但是在推理速度上低于单分支网络,因此通过模型重参数化首先将卷积层以及批归一化(Batch normalization,BN)层合并,随后再将3路卷积合并为1路,大大降低模型参数量、提高了模型推理速度,使模型更加适用于移动设备的推理。结果表明:使用Cheap Ghost操作的G-RepVGG在测试集中准确率达到96.21%,图像处理速度达到442.27 f/s,使用Expensive Ghost操作的G-RepVGG模型在测试集中准确率达到97.63%,图像处理速度达到349.42 f/s,从而在保证较高精度的前提下依旧具有较高的推理速度,在多个数据集中测试具有较好的鲁棒性。 展开更多
关键词 斑石鲷 运动行为 水质监测 深度学习 卷积神经网络
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基于DRN-Faster R-CNN的复杂背景多目标鱼体检测模型 被引量:7
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作者 孙龙清 孙希蓓 +1 位作者 吴雨寒 罗冰 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期245-251,315,共8页
针对现有多目标鱼体检测大多针对受控环境进行,泛化能力有限的问题,提出了一种简单、有效的复杂背景下多目标鱼体检测模型。通过迁移学习构建基于DRN的特征提取方法,对原始图像进行特征提取,结合RPN进一步生成候选检测框;构建基于Faster... 针对现有多目标鱼体检测大多针对受控环境进行,泛化能力有限的问题,提出了一种简单、有效的复杂背景下多目标鱼体检测模型。通过迁移学习构建基于DRN的特征提取方法,对原始图像进行特征提取,结合RPN进一步生成候选检测框;构建基于Faster R-CNN的复杂背景多目标鱼体检测模型。在ImageNet2012数据集上的实验结果表明:该模型对复杂背景下金鱼的检测平均精度达到89.5%,远高于R-CNN+AlexNet模型、Faster R-CNN+VGG16模型和Faster R-CNN+ResNet101的检测精度,表明该模型可以高效精确地实现复杂背景下的多目标鱼体检测。 展开更多
关键词 鱼体 目标检测 特征 卷积神经网络 深度残差网络
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基于ResNet-CA的鱼群饱腹程度识别方法 被引量:6
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作者 孙龙清 王新龙 +2 位作者 王泊宁 王嘉煜 孟新宇 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第S02期219-225,277,共8页
投喂作为水产养殖过程中的一个关键环节,饵料的投喂量直接影响水产品的质量和养殖成本。然而,目前的投喂方法包括人工投喂和机器定时定量投喂,大多依靠人工经验,很难实现精准投喂。本文基于改进的ResNet34识别鱼群不同的饱腹程度。根据... 投喂作为水产养殖过程中的一个关键环节,饵料的投喂量直接影响水产品的质量和养殖成本。然而,目前的投喂方法包括人工投喂和机器定时定量投喂,大多依靠人工经验,很难实现精准投喂。本文基于改进的ResNet34识别鱼群不同的饱腹程度。根据鱼群在不同饱腹阶段表现的摄食行为创建了含有5种不同饱腹程度的数据集,并采用数据增强操作对图像进行预处理。其次在原始模型ResNet34的基础上,本文提出使用坐标注意力机制,使模型在对图像进行特征提取的过程中能够做到专注于更大区域范围。并且使用深度可分离卷积的方式来代替传统卷积,减少模型参数量。为了评估改进的有效性,分析了改进后的模型在鱼群饱腹程度数据集上的性能,并将其与原模型ResNet34、AlexNet、VGG16、MobileNet-v2、GoogLeNet等经典卷积神经网络架构进行比较。综合实验结果表明,该模型相较于原模型参数量减少46.7%,准确率达到93.4%,相较于原模型提升3.4个百分点,同时改进后的模型在准确率、精确度、召回率等方面也都优于其他卷积神经网络。综上所述,本模型实现了性能与参数量之间的良好平衡,为后续模型在实际养殖环境中的部署并指导养殖户改善和制定投喂策略提供了可能。 展开更多
关键词 鱼群 摄食行为 注意力机制 深度可分离卷积 卷积神经网络 饱腹程度
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高产多抗小麦新品种鄂710818的特征特性及栽培技术
8
作者 许甫超 彭敏 +4 位作者 徐晴 秦丹丹 彭严春 孙龙清 董静 《湖北农业科学》 2023年第S01期53-55,共3页
鄂710818系采用双亲杂交经多年系谱法选育而成的高产多抗小麦(Triticum aestivum L.)新品种,该品种在湖北省小麦区域试验中丰产性、综合抗病性、适应性等表现突出,已通过湖北省小麦区域试验,进入审定程序。介绍了鄂710818的品种来源、... 鄂710818系采用双亲杂交经多年系谱法选育而成的高产多抗小麦(Triticum aestivum L.)新品种,该品种在湖北省小麦区域试验中丰产性、综合抗病性、适应性等表现突出,已通过湖北省小麦区域试验,进入审定程序。介绍了鄂710818的品种来源、选育经过、特征特性及栽培技术要点,以期为该品种的推广应用提供依据。介绍了鄂710818的选育经过、特征特性及栽培技术要点。 展开更多
关键词 小麦(Triticum aestivum L.) 新品种 高产 多抗 鄂710818 特征特性 栽培技术
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基于OMT的快速原型法及其在决策支持系统开发中的应用
9
作者 孙龙清 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期72-76,共5页
结合决策支持系统——最低限制价格计算系统 PRCSYS0 1的研究和开发过程 ,探讨了以 OMT(Ob-ject Modeling Technique)方法作指导 ,将系统界面的开发与系统内部功能的开发分离 ,快速开发用户驱动需求分析原型系统的方法。
关键词 决策支持系统 面向对象 OMT 原型系统 快速原型法
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基于紫外光谱的水产养殖水质总氮含量快速检测研究 被引量:14
10
作者 李鑫星 周婧 +3 位作者 唐红 孙龙清 曹霞敏 张小栓 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期195-201,共7页
应用紫外(Ultraviolet,UV)光谱技术对水产养殖水质总氮含量进行快速检测。为了消除各种系统误差与偶然误差对模型预测性能造成的影响,将88个水样的总氮浓度实测值数据和光谱吸光度数据作为原始数据,将模型建立分为样本集划分、数据预处... 应用紫外(Ultraviolet,UV)光谱技术对水产养殖水质总氮含量进行快速检测。为了消除各种系统误差与偶然误差对模型预测性能造成的影响,将88个水样的总氮浓度实测值数据和光谱吸光度数据作为原始数据,将模型建立分为样本集划分、数据预处理、特征波段提取、模型选择与LV数量选择5个阶段,以求达到最优预测效果,其中前4个阶段分别使用多种方法进行比较。结果证明每个阶段都是必不可少的,只有通过对比其优劣才能找到最适合总氮含量测定的建模过程及方法。首先用浓度梯度(CG)法对原始数据进行相同的样本集划分处理,然后在此基础上分别建立主成分回归(PCR)、逐步回归(SR)和偏最小二乘回归(PLSR)三种模型,选择预测效果最好的PLSR作为本文的预测模型。PLSR的建模效果会在很大程度上受到潜在变量(LVs)数量的影响,通常选取模型预测均方根误差RMSEP值最小时所对应的LV个数为最优LV个数。其次,选用CG法、随机抽样(RS)法、 Kennard Stone(KS)法和SPXY法4种样本集划分算法对样本进行处理,并对所建立的PLSR模型预测效果进行比较,最终选择SPXY算法作为最优样本划分算法。然后在对样本集进行SPXY法划分的基础上,运用多种预处理算法对光谱吸光度数据进行预处理,包括小波变换(WT)、一阶导数法(Der1st)与二阶导数法(Der2nd)三种单一算法和小波变换与两种导数法的组合预处理算法WT-Der1st和WT-Der2nd。然后在预处理的基础上分别使用连续投影变换(SPA)和逐步回归(SR)两种特征波段提取方法,对比可知, SPA特征提取方法比SR的提取效率高且建模效果好。SPA算法既可以大大地简化模型,又可以在一定程度上提升模型的预测精度。基于WT-Der1st-SPA提取的特征波段为218 nm,与总氮特征波段区间相一致,由此说明该方法比较科学。综合上述建立的10个PLSR模型,考虑到预测精度与模型复杂度2个因素,最终选择基于WT-Der1st-SPA建立的PLSR模型作为最优模型,该模型预测决定系数r2为0.996,预测均方根误差RMSEP为0.042 mg·L-1。由此可见,所建立的模型预测效果非常好,可以快速准确地测定水体的总氮含量,为实现光谱技术在水产养殖其他水质监测指标的在线检测以及快速测定提供了经验。 展开更多
关键词 紫外光谱 总氮 小波变换 连续投影变换 潜在变量 偏最小二乘回归
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光谱技术在水产养殖水质监测中的应用进展及趋势 被引量:18
11
作者 李鑫星 朱晨光 +3 位作者 周婧 孙龙清 曹霞敏 张小栓 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第19期184-194,共11页
水产养殖的水质是关乎水产养殖经济效益和水产品品质的关键因素,与传统的水质检测方法相比,光谱技术具有无创性、快速性、可重复性、准确性等优点,已成为水质监测的重要发展方向。该文总结和整理现有国内外研究文献,对基于光谱技术的水... 水产养殖的水质是关乎水产养殖经济效益和水产品品质的关键因素,与传统的水质检测方法相比,光谱技术具有无创性、快速性、可重复性、准确性等优点,已成为水质监测的重要发展方向。该文总结和整理现有国内外研究文献,对基于光谱技术的水质重要参数监测、数据预处理方法、特征波段提取、预测模型算法进行了系统的分析与讨论。综述结果表明,实时在线的水产养殖水质监测将成为重点研究方向;多源光谱融合、多参数的水产养殖水质监测将会成为新的发展方向;对于光谱数据的处理,将多种数据处理算法相结合,仍将占据主导;而非线性建模将成为水产养殖水质数据分析的主流方法非线性数据建模,将成为光谱技术应用于水产养殖水质监测的主流建模发方法。 展开更多
关键词 光谱技术 水产养殖 水质 监测模型
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基于Struts+Spring+iBATIS的轻量级Web应用框架研究 被引量:30
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作者 孙强 孙龙清 邱小彬 《计算机应用与软件》 CSCD 北大核心 2008年第10期135-137,共3页
在分析基于J2EE的重量级Web应用系统开发面临的一系列问题的基础上,对当前流行的Web应用框架进行比较,给出基于Struts,Spring和iBATIS的轻量级开发策略,简称"SSi"。通过对三种框架技术特点的分析,设计出集成三种框架技术的We... 在分析基于J2EE的重量级Web应用系统开发面临的一系列问题的基础上,对当前流行的Web应用框架进行比较,给出基于Struts,Spring和iBATIS的轻量级开发策略,简称"SSi"。通过对三种框架技术特点的分析,设计出集成三种框架技术的Web应用框架,并通过一个成功案例,对开发过程中几个关键点的实现进行阐述,为采用此集成框架进行Web应用系统的设计与开发提供了参考。 展开更多
关键词 STRUTS SPRING IBATIS SSi轻量级
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近红外光谱的河蟹新鲜度快速检测研究 被引量:5
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作者 李鑫星 姚久彬 +3 位作者 成建红 孙龙清 曹霞敏 张小栓 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期189-194,共6页
河蟹的新鲜度是大多数消费者在购买时所考虑的最重要的因素,挥发性盐基氮(TVB-N)是当前国际通用的评价肉类新鲜度的指标,但其检测工序繁琐、耗费时间长,无法满足当前市场对河蟹新鲜度评价的迫切需求。因此,建立一种快速检测河蟹新鲜度... 河蟹的新鲜度是大多数消费者在购买时所考虑的最重要的因素,挥发性盐基氮(TVB-N)是当前国际通用的评价肉类新鲜度的指标,但其检测工序繁琐、耗费时间长,无法满足当前市场对河蟹新鲜度评价的迫切需求。因此,建立一种快速检测河蟹新鲜度的方法是当前急需解决的一大难题。将购于水产市场的河蟹,采用聚乙烯充氧袋快速运至实验室,样本数共126只。在洁净的工作台上处理后,将螃蟹分为42个实验样品,每个样品3只鲜活螃蟹;42个实验样品放在低温4℃的恒温生化培养箱中贮藏,每天从培养箱中按时取出6个螃蟹样品进行光谱数据采集及新鲜度指标TVB-N的测定,历时7 d。采用近红外光谱(NIRS)对贮藏在不同时间下的河蟹新鲜度进行评价,使用挥发性盐基氮(TVB-N)作为评价河蟹新鲜度的指标,首先通过比较经五折交叉验证(5-fold CrossValidation)算法、 kennard-stone(KS)算法、光谱-理化值共生距离(SPXY)算法三种样本划分方法处理后所建模型的预测效果确定最优样本划分方法,最终采用五折交叉验证(5-fold CrossValidation)算法对样本进行划分。其中的32个样品被划分为训练集进行模型构建,其余的10个样品被划分为测试集用于模型检验。然后在经过五折交叉验证法对样本进行划分的基础上,分别采用小波变换(WT)、 Savitzky-Golay平滑、一阶导数法(Db1)、二阶导数法(Db2)这4种单一算法以及小波变换(WT)与Savitzky-Golay平滑相结合的算法进行预处理,通过比较预处理后所建模型的预测效果,确定了小波变换(WT)预处理为最优光谱预处理方法,从而消除了光谱中的无用信息并提高了信噪比。再次,在WT预处理的基础上,分别采用主成分分析(PCA)法和连续投影(SPA)算法提取光谱特征波段,通过建模比较确定主成分分析(PCA)法为最优波长选择方法,以所选的16个特征波长作为模型的输入,不仅提高了模型的运行速度还可以提高模型的稳定性。最后,在经过PCA特征提取后,分别采用偏最小二乘回归(PLSR)算法和多元线性回归(MLR)算法构建TVB-N定量预测模型,通过比较两种模型的预测效果,确定了偏最小二乘回归(PLSR)模型为最优建模方法,最终确定的最优模型为基于WT-PCA-PLSR建立的模型,模型预测决定系数R^2为0.89,预测均方根误差RMSEP为3.00。综上所述,所建立的预测模型具有较高的精度,可以实现对河蟹新鲜度的快速检测,具有较好的市场应用前景。 展开更多
关键词 近红外光谱 挥发性盐基氮 新鲜度 小波变换 主成分分析 偏最小二乘回归
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基于模糊模式识别的籽棉品级分级模型 被引量:4
14
作者 袁荣昌 孙龙清 +1 位作者 董晨曦 王利 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2011年第8期2097-2100,共4页
籽棉品级分类问题是对农业经济有着重要影响的一个问题。在对籽棉图像黄度、亮度和杂质等特征提取分析基础上,基于模糊模式识别,运用模糊贴近度,构建籽棉品级分级模型,利用统计分布计算得出模型参数选取方法。利用图像欧拉数求得了不同... 籽棉品级分类问题是对农业经济有着重要影响的一个问题。在对籽棉图像黄度、亮度和杂质等特征提取分析基础上,基于模糊模式识别,运用模糊贴近度,构建籽棉品级分级模型,利用统计分布计算得出模型参数选取方法。利用图像欧拉数求得了不同大小杂质数量的近似值,运用神经网络对模型进行有效求解,通过调整模型参数使籽棉品级分级精度不断提高,分级模型在充分学习后,籽棉品级分级准确率达到92%,满足了实际应用的需要。 展开更多
关键词 籽棉 品级 模糊数学 模式识别 神经网络
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基于干旱胁迫转录组信息的蚕豆ASPAT基因家族分析 被引量:2
15
作者 魏正欣 刘昌燕 +5 位作者 陈宏伟 李莉 孙龙清 韩雪松 焦春海 沙爱华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1871-1881,共11页
蚕豆(Vicia faba L.)是一种重要的食用豆作物,干旱会导致蚕豆产量降低。鉴定蚕豆耐旱基因,有利于通过分子标记辅助育种和基因工程手段培育抗旱品种。在前期研究中,我们通过转录组测序鉴定出了一类天冬氨酸转氨酶基因(ASPAT)响应蚕豆干... 蚕豆(Vicia faba L.)是一种重要的食用豆作物,干旱会导致蚕豆产量降低。鉴定蚕豆耐旱基因,有利于通过分子标记辅助育种和基因工程手段培育抗旱品种。在前期研究中,我们通过转录组测序鉴定出了一类天冬氨酸转氨酶基因(ASPAT)响应蚕豆干旱胁迫。ASPAT催化天冬氨酸(ASP)和α-酮戊二酸的可逆转氨反应,生成草酰乙酸和谷氨酸,是参与植物体代谢的关键酶。本文基于转录组测序数据,通过生物信息学方法全基因组鉴定了蚕豆ASPAT基因家族成员,并分析了各基因家族成员的理化性质、亚细胞定位、基因结构、蛋白结构域、保守基序、系统进化、蛋白质互作和基因表达模式。结果显示,蚕豆转录参考基因组中共有8个ASPAT基因家族成员,包括3个真核型ASPAT(AAT)基因和5个原核型ASPAT(PAT)基因,分别定位于线粒体和叶绿体。系统发育分析表明,蚕豆ASPAT蛋白主要可分为2个亚族Iα和Iβ。Iα为AAT蛋白,包括VfASPAT1~VfASPAT3。Iβ为PAT蛋白,包括VfASPAT4~VfASPAT8。蚕豆ASPAT家族成员均含有motif1、motif3、motif9,且具有相似的基因结构和共同的蛋白结构域Aminotran-1-2。VfASPAT蛋白互作网络分析表明该家族成员可能参与逆境胁迫代谢过程。转录组和荧光定量PCR分析表明该家族8个成员在干旱处理16h和64h表达模式不同,除VfASPAT4和VfASPAT6外其他基因表达量都呈上调趋势,表明VfASPAT基因可能对干旱胁迫有正向调控作用。本文研究结果为进一步分析蚕豆ASPAT的抗旱功能,应用ASPAT提高蚕豆抗旱性奠定了基础。 展开更多
关键词 蚕豆 天冬氨酸转氨酶 基因家族 干旱胁迫 基因表达
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畜禽养殖物联网关键技术创新与应用展望 被引量:6
16
作者 韩书庆 孙龙清 +4 位作者 陈英义 曲绪仙 南雪梅 王众 孔繁涛 《农业展望》 2020年第9期74-78,共5页
信息化水平不高是中国畜牧业生产效率低于国际平均水平的主要原因之一。针对现代信息技术与畜牧业深度融合难、畜禽养殖复杂环境多特征联动监测难等问题,创新提出了“物联牧场”理论方法与畜牧业物联网技术体系,研制了超声波风速风向、... 信息化水平不高是中国畜牧业生产效率低于国际平均水平的主要原因之一。针对现代信息技术与畜牧业深度融合难、畜禽养殖复杂环境多特征联动监测难等问题,创新提出了“物联牧场”理论方法与畜牧业物联网技术体系,研制了超声波风速风向、非侵入式肉牛维生素A缺乏诊断、奶牛发情监测、奶牛体征测量等畜禽“生态-生理-生长”多通量专用传感技术,并在畜牧养殖物联网标准建设、决策云平台构建、智能装备研发等方面提出了发展建议。未来,畜禽养殖物联网技术的发展与应用将促进信息技术与畜禽养殖的深度融合发展,助推畜牧业节本增效与转型升级。 展开更多
关键词 畜禽养殖 物联网 畜牧业 传感技术
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利用接口技术的基于OO的冲裁模CAD/CAM系统的建模
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作者 郑立华 孙龙清 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期69-71,76,共4页
利用面向对象技术进行软件开发是目前软件开发的趋势。为了构建基于面向对象的冲裁模CAD/CAM系统 ,利用VB平台提供的接口技术 ,通过实现接口继承来实现类的继承性和多态性 ,并使用GUIDS方法层层深入地组织系统结构 ,最终以零件类为基类 ... 利用面向对象技术进行软件开发是目前软件开发的趋势。为了构建基于面向对象的冲裁模CAD/CAM系统 ,利用VB平台提供的接口技术 ,通过实现接口继承来实现类的继承性和多态性 ,并使用GUIDS方法层层深入地组织系统结构 ,最终以零件类为基类 ,建立了较为科学的系统模型。将该模型应用于应用软件的设计中可增强应用软件的可维护性和可扩展性。 展开更多
关键词 接口技术 OO 冲裁模 CAD/CAM系统 建模技术 对象技术 VB平台
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统计数据加载模型的研究与实现 被引量:1
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作者 孙强 孙龙清 《微计算机信息》 2009年第18期155-157,共3页
通过对统计信息化过程中遇到的问题进行分析,将统计元数据引入统计信息系统,推进统计数据标准化,并提出基于SDMX(统计数据元数据交换)标准的数据加载模型。数据加载模型将源于不同业务系统以及外部共享的数据按照统一的标准加载到统计... 通过对统计信息化过程中遇到的问题进行分析,将统计元数据引入统计信息系统,推进统计数据标准化,并提出基于SDMX(统计数据元数据交换)标准的数据加载模型。数据加载模型将源于不同业务系统以及外部共享的数据按照统一的标准加载到统计共享数据库,将不同数据源的数据的集成到一个数据库中。模型基于国际上广泛使用的SDMX标准,方便了我国统计数据与国际统计数据的交换与共享。模型的实现为统计共享数据库的构建提供了数据保障。 展开更多
关键词 统计元数据 统计数据 数据加载 SDMX
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加权对差法的本质
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作者 陈奎孚 李辉 孙龙清 《大学物理实验》 2017年第1期120-123,共4页
加权对差法是传统逐差法的一种改进方法。通过与基于线性变化规律的最小二乘法计算式相比,本文发现加权对差法就是最小二乘法的一个实现,因此加权对差法对该类数据是最优的。然而,对匀加速直线运动的实验数据,因其模型不符合线性变化规... 加权对差法是传统逐差法的一种改进方法。通过与基于线性变化规律的最小二乘法计算式相比,本文发现加权对差法就是最小二乘法的一个实现,因此加权对差法对该类数据是最优的。然而,对匀加速直线运动的实验数据,因其模型不符合线性变化规律,故无论逐差法还是对差法,都不是最优的。 展开更多
关键词 逐差法 对差法 最小二乘法 偶然误差
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基于多特征融合的粒子滤波生猪采食行为跟踪 被引量:15
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作者 李亿杨 孙龙清 孙鑫鑫 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第S1期246-252,共7页
针对中国养猪业规模化、集约化迅猛发展过程中,人工观察监测记录生猪生长情况需损耗大量人力和物力,得到数据误差大的问题,该文提出将颜色特征与目标轮廓形心特征融合,基于粒子滤波算法实现生猪采食行为跟踪,当目标跟踪矩形框中心坐标... 针对中国养猪业规模化、集约化迅猛发展过程中,人工观察监测记录生猪生长情况需损耗大量人力和物力,得到数据误差大的问题,该文提出将颜色特征与目标轮廓形心特征融合,基于粒子滤波算法实现生猪采食行为跟踪,当目标跟踪矩形框中心坐标和跟踪目标轮廓形心坐标之间的横坐标偏差大于跟踪目标轮廓横坐标方向的最大值与最小值的差的一半时,或其之间的纵坐标偏差大于跟踪目标轮廓纵坐标方向的最大值与最小值的差一半时,对基于颜色特征粒子滤波算法得到的跟踪矩形框的中心坐标进行二次修正,提高了目标生猪跟踪的可靠性和鲁棒性;通过对比试验,结果表明:该方法能够对目标生猪的采食行为进行自动跟踪、记录和分析,记录的目标生猪一天内的采食次数和采食时间与人工记录结果基本相同,有效跟踪平均精度为93.4%。 展开更多
关键词 采食 跟踪 算法 粒子滤波 颜色特征 轮廓形心 验证 生猪
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