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酒精性肝炎自噬关键基因的筛选及生物信息学分析 被引量：3
1
作者 袁超 练庆海 +3 位作者 尼贝贝 许燕 张彤 张剑 《器官移植》 CSCD 北大核心 2024年第1期90-101,共12页
目的筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点。方法采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取关键基因。... 目的筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点。方法采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取关键基因。对筛选的关键基因进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,蛋白质相互作用(PPI)分析,免疫浸润分析,构建信使RNA(mRNA)-微小RNA(miRNA)网络,进行酒精性肝病不同分期的自噬相关关键基因的表达差异分析,并进一步通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)在AH患者和小鼠肝脏组织中验证。结果本研究筛选得到了11个与AH自噬相关的基因(EEF1A2、CFTR、SOX4、TREM2、CTHRC1、HSPB8、TUBB3、PRKAA2、RNASE1、MTCL1、HGF),均为上调基因。在AH患者和小鼠肝脏组织中,SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2在AH组中的相对表达量均高于对照组。结论SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2可能是AH潜在的生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 酒精性肝炎 自噬 关键基因 生物信息学 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 基因本体(GO) 京都基因和基因组百科全书(KEGG) 蛋白质相互作用(PPI)
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脾酪氨酸激酶在实体肿瘤中的研究进展 被引量：1
2
作者 尼贝贝 李诗 《医学综述》 2017年第22期4414-4418,共5页
脾酪氨酸激酶(SYK)一度被认为是造血细胞特有的信号分子,在淋巴细胞成熟和免疫细胞激活中发挥重要作用,并在很多恶性血液病中被标识为致癌驱动因子。目前认为SYK在多种实体肿瘤中也发挥重要作用,尤其在肿瘤的增生及浸润转移方面有重要影... 脾酪氨酸激酶(SYK)一度被认为是造血细胞特有的信号分子,在淋巴细胞成熟和免疫细胞激活中发挥重要作用,并在很多恶性血液病中被标识为致癌驱动因子。目前认为SYK在多种实体肿瘤中也发挥重要作用,尤其在肿瘤的增生及浸润转移方面有重要影响,越来越多关于SYK在实体肿瘤中的研究陆续展开。SYK在不同肿瘤中发挥着不同甚至相反的作用,在一些肿瘤中是候选抑癌基因,在另外一些肿瘤中发挥癌基因的作用。对SYK基因深入研究,有望为发现肿瘤防治的新靶点提供线索。 展开更多
关键词 脾酪氨酸激酶 实体肿瘤 抑癌基因 癌基因
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人脐带间充质干细胞通过线粒体转移减轻肝细胞缺血-再灌注损伤的机制研究 被引量：1
3
作者 单佳柔 尼贝贝 +2 位作者 李翠平 徐睿璇 陈文捷 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期294-301,共8页
目的探讨人脐带间充质干细胞(HUC-MSC)通过线粒体转移减轻肝细胞缺血-再灌注损伤(IRI)的作用机制。方法将正常人肝细胞株L02分为空白对照组、氧糖剥夺(OGD)组、实验对照组、L02与HUCMSC共培养组(L02+HUC-MSC组),其中L02+HUC-MSC组根据L0... 目的探讨人脐带间充质干细胞(HUC-MSC)通过线粒体转移减轻肝细胞缺血-再灌注损伤(IRI)的作用机制。方法将正常人肝细胞株L02分为空白对照组、氧糖剥夺(OGD)组、实验对照组、L02与HUCMSC共培养组(L02+HUC-MSC组),其中L02+HUC-MSC组根据L02与HUC-MSC不同共培养比例分为101共培养组(A组)、41共培养组(B组)、21共培养组(C组)、11共培养组(D组)和12共培养组(E组)。采用流式细胞术检测L02细胞凋亡率和细胞内活性氧簇(ROS)相对量;采用流式细胞术检测L02的MitoTracker阳性率;采用激光共聚焦显微镜观察HUC-MSC向L02转移线粒体的情况。结果OGD组L02细胞凋亡率和细胞内ROS相对量高于空白对照组(均为P<0.05);与OGD组比较,B、C、D、E组L02细胞凋亡率均降低(均为P<0.05),E组L02细胞内ROS相对量降低(P<0.05)。A组L02的MitoTracker阳性率与实验对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05),B、C、D、E组均较实验对照组增加(均为P<0.05),并呈浓度依赖性。在激光共聚焦显微镜下可观察到线粒体通过隧道纳米管(TNT)从HUC-MSC向L02转移。结论HUC-MSC可通过细胞间直接转移线粒体的方式减轻肝细胞IRI后细胞凋亡和降低细胞内ROS水平。 展开更多
关键词 缺血-再灌注损伤(IRI) 人脐带间充质干细胞(HUC-MSC) 氧糖剥夺(OGD) 活性氧簇(ROS) 线粒体转移 隧道纳米管(TNT) 细胞凋亡 免疫治疗
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