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泛素连接酶SMURF1催化ADAR1的多聚泛素化修饰
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作者 周文淼 王红霞 +3 位作者 刘昆梅 刘菁 屈昱良 郭乐 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1630-1637,共8页
既往研究发现,SMAD特异性E3泛素蛋白连接酶1(SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1,SMURF1)通过其E3泛素连接酶活性介导自噬进程,然而SMURF1的泛素化底物蛋白质仍有待进一步挖掘。本文利用免疫共沉淀(Co-IP)联合蛋白质谱分析捕... 既往研究发现,SMAD特异性E3泛素蛋白连接酶1(SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1,SMURF1)通过其E3泛素连接酶活性介导自噬进程,然而SMURF1的泛素化底物蛋白质仍有待进一步挖掘。本文利用免疫共沉淀(Co-IP)联合蛋白质谱分析捕获并鉴定THP-1细胞中SMURF1的相互作用蛋白质集合物,发现在THP-1细胞中SMURF1可与222种蛋白质物理性结合,RNA腺苷脱氨酶1(adenosine deaminase acting on RNA 1,ADAR1)具有较高的肽段结合分数。构建SMURF1过表达载体并转染到HEK-293T细胞中,Co-IP和Western印迹检测验证外源性SMURF1与内源性ADAR1存在相互作用。qRT-PCR和Western印迹检测结果显示,在HEK-293T细胞中过表达SMURF1后ADAR 1 mRNA水平差异无统计学意义、蛋白质水平明显降低(P<0.05)。用放线菌酮(CHX)分别处理正常和过表达SMURF1的HEK-293T细胞,Western印迹检测显示,过表达SMURF1后ADAR1的半衰期缩短(P<0.05)。进一步在HEK-293T细胞中共转染泛素(Ub)过表达载体和SMURF1过表达载体,通过Co-IP和Western印迹检测结果证实,过表达SMURF1后ADAR1的多聚泛素化水平显著增加(P<0.05)。在蛋白酶体抑制剂(MG132)作用后,Western印迹检测结果表明,蛋白酶体降解途径受抑制后SMURF1对ADAR1的负调控作用减弱(P<0.05)。本研究表明,SMURF1可以与ADAR1相互作用,催化ADAR1的多聚泛素化修饰并介导其蛋白酶体途径降解,为探索SMURF1通过影响ADAR1蛋白质稳定性而具备的多种生物学功能提供理论基础。 展开更多
关键词 SMAD特异性E3泛素蛋白连接酶1 RNA腺苷脱氨酶1 泛素化 翻译后修饰
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宁夏高校教师心理健康现状调查研究 被引量:6
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作者 哈丽娜 张学平 +3 位作者 哈力君 戴秀英 高玉珍 屈昱良 《长治医学院学报》 2012年第5期321-323,共3页
目的:调查宁夏高校教师心理健康状况及其相关因素,为高校教师队伍建设,高校师生心理问题的预防及干预提供理论依据。方法:对宁夏10所高校1 461名教师进行精神症状自评量表(SCL-90)及自制人口学问卷测查,测查结果运用SPSS11.5统计软件进... 目的:调查宁夏高校教师心理健康状况及其相关因素,为高校教师队伍建设,高校师生心理问题的预防及干预提供理论依据。方法:对宁夏10所高校1 461名教师进行精神症状自评量表(SCL-90)及自制人口学问卷测查,测查结果运用SPSS11.5统计软件进行处理。结果:高校教师症状量表SCL-90总检出率为31.21%,相当重及严重症状者123人,占被调查人数的8.42%;高校教师的心理健康水平低于全国常模;男性教师躯体化、强迫、焦虑因子与女性教师比较存在差异,人际关系、敌对、恐怖、偏执、精神病性因子比较存在显著性差异;不同民族教师各因子分比较回族高于汉族,均存在差异。结论:宁夏高校教师心理健康状况低于一般人群,心理健康教育工作需要加强重视。 展开更多
关键词 高校教师 心理健康 精神症状自评
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结核分枝杆菌H37Ra感染的THP-1细胞TGF-β1、Smad2、Smad3、TNF-α、IL-6 mRNA表达变化 被引量:5
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作者 王立楠 李艳宁 +4 位作者 刘建 屈昱良 郭乐 杨宗强 牛宁奎 《山东医药》 CAS 2022年第3期44-49,共6页
目的观察结核分枝杆菌H37Ra在不同感染复数及不同感染时间感染的THP-1细胞内TGF-β1/Smad2、3信号通路活化以及炎症因子TNF-αmRNA、IL-6 mRNA的表达变化,明确TGF-β1/Smads经典信号通路的激活程度是否与结核分枝杆菌感染的细菌量有关... 目的观察结核分枝杆菌H37Ra在不同感染复数及不同感染时间感染的THP-1细胞内TGF-β1/Smad2、3信号通路活化以及炎症因子TNF-αmRNA、IL-6 mRNA的表达变化,明确TGF-β1/Smads经典信号通路的激活程度是否与结核分枝杆菌感染的细菌量有关以及在结核分枝杆菌感染后的哪个时间阶段发挥主要作用。方法培养THP-1巨噬细胞及结核分枝杆菌H37Ra,建立H37Ra在相同时间点(感染24 h)不同感染复数(MOI=0、1、10、100)和在MOI=10,不同感染时间点(T=0 h、6 h、12 h、24 h)感染THP-1细胞的感染模型;用qRT-PCR检测不同感染复数及不同感染时间THP-1细胞中TGF-β1 mRNA、Smad2 mRNA、Smad3 mRNA、TNF-αmRNA、IL-6 mRNA。结果H37Ra感染24 h时,与空白对照比较,当MOI=1、10、100时,TGF-β1 mRNA的相对表达量先升高后降低,在MOI=10时表达最高(P<0.05);Smad2 mRNA的相对表达量降低(P<0.05);Smad3 mRNA相对表达量升高(P<0.05);TNF-αmRNA和IL-6 mRNA表达变化趋势基本一致,在MOI=1、10时升高不明显(P>0.05),MOI=100时升高(P<0.05)。H37Ra MOI=10时,随感染时间(T=6 h、12 h、24 h)延长,TGF-β1 mRNA的相对表达量呈现升高趋势(P均<0.05);Smad2 mRNA的相对表达量呈降低趋势(P<0.05);Smad3 mRNA相对表达量呈先升高后降低趋势,在T=6 h最高(P<0.05);TNF-αmRNA和IL-6 mRNA表达变化趋势基本一致,呈先升高后降低趋势,在T=12 h时最高(P<0.05)。结论相同感染时间,随着MOI值增加,结核分枝杆菌H37Ra感染的THP-1巨噬细胞中TGF-β1 mRNA表达先上调后降低,Smad2 mRNA表达下调,Smad3 mRNA表达上调,TNF-αmRNA、IL-6 mRNA相对表达量在MOI=100时升高;MOI=10时,随着感染时间延长,结核分枝杆菌H37Ra感染的THP-1巨噬细胞中TGF-β1 mRNA相对表达量升高,Smad2 mRNA表达下调,Smad3 mRNA表达先升高,6 h后降低,TNF-αmRNA和IL-6 mRNA表达早期上调,12 h后降低。结核分枝杆菌感染的细菌量与TGF-β1/Smads经典信号通路的激活程度有关,结核分枝杆菌感染后的12 h内TGF-β1/Smads经典信号通路发挥主要作用。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 巨噬细胞 转化生长因子β1/Smads信号通路 肿瘤坏死因子 白细胞介素6
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嵌合抗原受体T(CAR-T)细胞体外培养体系及慢病毒侵染条件的优化 被引量:1
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作者 王红霞 潘俊斐 +6 位作者 蒋丹 屈昱良 李艳宁 李光琪 楚元奎 张晓春 徐广贤 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期390-397,共8页
目的优化嵌合抗原受体T(CAR-T)细胞的体外培养体系及慢病毒侵染条件。方法CD3磁珠分离纯化健康人外周血单个核细胞(PBMC)及健康孕妇脐带血单个核细胞(UCBMC),于8种不同培养体系进行扩增培养,培养体系包括以下成分的不同组合:重组人白细... 目的优化嵌合抗原受体T(CAR-T)细胞的体外培养体系及慢病毒侵染条件。方法CD3磁珠分离纯化健康人外周血单个核细胞(PBMC)及健康孕妇脐带血单个核细胞(UCBMC),于8种不同培养体系进行扩增培养,培养体系包括以下成分的不同组合:重组人白细胞介素2(rhIL-2)、rhIL-12、rhIL-18、rhIL-7、rhIL-21、TWS119。分别于第0、3、5、7、10、18天进行细胞计数检测细胞增殖情况,流式细胞术检测细胞程序性死亡蛋白1(PD-1)的表达,ELISA检测γ干扰素(IFN-γ)释放,优化T细胞体外培养体系。采用(0、20、50)μg/mL重组人纤连蛋白(RetroNectin^■),(250、500、1000)ng/mL抗人CD3/CD28抗体包被培养板,以感染复数(MOI)=3、5的阴性对照慢病毒侵染T细胞72 h,于荧光显微镜下观察绿色荧光蛋白(GFP)表达情况,初步判断病毒侵染效率;流式细胞术检测CD3/GFP阳性率,以获得慢病毒侵染条件。包装CD19 CAR慢病毒,实时荧光定量PCR、Western blot法检测是否成功构建CD19 CAR慢病毒载体,采用以上优化的病毒侵染条件及T细胞培养体系,包括建立rhIL-2、rhIL-12联合rhIL-18培养体系,使用1μg/mL抗人CD3/CD28,20μg/mLRetroNectin^■包被培养板,制备CD19 CAR-T细胞。结果细胞增殖能力较佳体系为rhIL-2联合rhIL-18,IFN-γ释放最强体系为rhIL-2、rhIL-12联合rhIL-18。抗CD3/CD28抗体剂量为1μg/mL,RetroNectin^■20μg/mL,MOI为3时病毒侵染效率最优。该优化条件下CAR-T细胞阳性率达34%。结论获得优化的CD19 CAR-T细胞体外培养体系及慢病毒侵染原代T细胞条件。 展开更多
关键词 增殖 活化 脐带血 嵌合抗原受体T(CAR-T)细胞
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TGF-β1、Smad2及Smad3在脊柱结核诊疗中的价值 被引量:1
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作者 王辉 王立楠 +5 位作者 林剑文 郭乐 蒋丹 屈昱良 翟学峰 牛宁奎 《中国脊柱脊髓杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期56-66,共11页
目的:研究转化生长因子β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)、Smad2(drosophila mothers against decapentaplegic 2)及Smad3在脊柱结核诊断及疗效评价中的价值。方法:纳入2018年9月~2019年6月在宁夏医科大学总医院治疗的确诊... 目的:研究转化生长因子β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)、Smad2(drosophila mothers against decapentaplegic 2)及Smad3在脊柱结核诊断及疗效评价中的价值。方法:纳入2018年9月~2019年6月在宁夏医科大学总医院治疗的确诊为脊柱结核(观察组)和椎间盘退变(对照组)患者各35例,分析两组患者临床资料并收集椎间盘病变组织,同时收集观察组术前、术后6个月和术后1年(分别定义为A组、B组和C组)及对照组术前的外周血标本。提取椎间盘组织及外周血标本的RNA,荧光定量PCR法扩增TGF-β1、Smad2、Smad3的mRNA,免疫组化染色法检测其在椎间盘组织中的表达水平,ELISA法测定其在外周血中的蛋白表达水平。t检验分析各指标在组间及组内的表达差异;ROC曲线分析各指标单独及分别联合ESR、CRP诊断脊柱结核的价值;曲线回归分析各指标与脊柱结核患者临床资料的相关性。结果:在椎间盘mRNA水平,观察组TGF-β1、Smad2及Smad3表达高于对照组(P<0.05)。在椎间盘蛋白水平,观察组TGF-β1、Smad2及Smad3均为阳性表达,对照组均为阴性表达。在外周血mRNA水平,A组TGF-β1和Smad3表达高于对照组,B组表达低于A组(P<0.01),C组表达低于B组(P>0.05);Smad2表达水平在组间及组内比较时均为P>0.05。在外周血蛋白水平,A组TGF-β1表达高于对照组(P<0.01),B组表达低于A组(P<0.01),C组表达低于B组(P>0.05);Smad2和Smad3表达水平在组间及组内比较时均为P>0.05。ROC曲线显示外周血TGF-β1 mRNA、TGF-β1蛋白、Smad3 mRNA单独及分别联合ESR、CRP诊断脊柱结核的AUC分别是0.7800、0.8000、0.8352、0.8219、0.8705、0.8819、0.7410、0.7552、0.8000,敏感性分别是93.33%、73.33%、86.67%、70.00%、90.00%、80.00%、46.67%、46.67%、80.00%,特异性分别是54.29%、80.00%、80.00%、91.43%、88.57%、94.29%、100.00%、100.00%、85.71%(均为P<0.01)。曲线回归分析表明外周血TGF-β1和Smad3在mRNA水平表达呈显著正相关(R2=0.8534,P<0.01),外周血TGF-β1蛋白表达水平与脊柱结核患者的年龄、病程、病变椎体数量、ESR、CRP并无相关性。结论:TGF-β1/Smads信号通路与脊柱结核发病相关,其中TGF-β1/Smad3可能发挥主要作用;外周血及椎间盘组织TGF-β1、Smad3 mRNA检测可用于辅助脊柱结核诊断及疗效评价;外周血TGF-β1蛋白高表达,且与预后相关,可作为脊柱结核的诊断及疗效评价指标,与CRP联合诊断时价值更高。 展开更多
关键词 脊柱结核 转化生长因子Β1 SMAD2 SMAD3 诊断及疗效评价
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RAW264.7细胞自噬相关circRNA检测及分析 被引量:1
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作者 张爱君 李艳宁 +4 位作者 高倩 屈昱良 蒋丹 王丽燕 徐广贤 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期177-184,共8页
目的探讨环状RNA(circRNA)表达谱在RAW264.7细胞自噬模型中的差异表达及其在细胞自噬过程中的调控作用。方法利用雷帕霉素(rapamycin,RAPA)和3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA)分别作用于小鼠单核巨噬细胞RAW264.7细胞,建立自噬诱导... 目的探讨环状RNA(circRNA)表达谱在RAW264.7细胞自噬模型中的差异表达及其在细胞自噬过程中的调控作用。方法利用雷帕霉素(rapamycin,RAPA)和3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA)分别作用于小鼠单核巨噬细胞RAW264.7细胞,建立自噬诱导模型和自噬抑制模型;提取各组细胞总RNA,基于高通量测序技术获得差异表达的circRNA;运用生物信息学分析对circRNA可能结合的微小RNA(miRNA)及其可能参与自噬的分子通路进行预测。结果在RAPA组和3-MA组中呈现相反表达趋势的circRNA共有42个,差异显著的前5个circRNA分别是circRNAmmu_circ_0000353、mmu_circ_0001704、mmu_circ_0013108、mmu_circ_0001528和mmu_circ_0015842,分别对其结合匹配值较高的3个miRNA位点进行预测,GO分析表明这些miRNA与转录调控、炎症反应及免疫应答相关;KEGG分析表明与多条自噬相关通路有关。结论本研究筛选到的circRNA以及与之结合的miRNA与细胞自噬的发生发展相关,可以此为靶点进行自噬相关的研究,并为自噬调控机制提供基础。 展开更多
关键词 细胞自噬 circRNA 高通量测序 生物信息学
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miR-506-3p对PIK3CA基因的靶向调控作用 被引量:1
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作者 李振昊 徐广贤 +3 位作者 高倩 蒋丹 徐向荣 屈昱良 《宁夏医科大学学报》 2017年第5期492-496,共5页
目的研究miR-506-3p对PI3K-Akt信号通路中关键基因PIK3CA的靶向调控机制。方法化学合成miR-506-3p过表达模拟物mimic及miR-506-3p抑制剂inhibitor;构建含有PIK3CA基因3’-UTR野生型及突变体到荧光素酶报告载体中;将测序结果正确的p MIR-... 目的研究miR-506-3p对PI3K-Akt信号通路中关键基因PIK3CA的靶向调控机制。方法化学合成miR-506-3p过表达模拟物mimic及miR-506-3p抑制剂inhibitor;构建含有PIK3CA基因3’-UTR野生型及突变体到荧光素酶报告载体中;将测序结果正确的p MIR-Report-PIK3CA-Wt和p MIR-Report-PIK3CA-Mut重组质粒,与miR-506-3p的mimic/inhibitor及p RL-TK共转染至HEK-293T细胞,利用双荧光素酶报告系统和Western blot验证miR-506-3p与PIK3CA的靶向关系。结果测序结果显示p MIR-Report-PIK3CAWt和p MIR-Report-PIK3CA-Mut两个重组质粒构建成功,Western blot结果显示转染miR-506-3p mimic的293T细胞中PIK3CA蛋白表达下调(P<0.05);而转染miR-506-3p inhibitors的PIK3CA蛋白表达上调(P<0.05)。结论 miR-506-3p可作用于PI3K-AKt信号通路,通过靶向PIK3CA发挥其负性调控作用。 展开更多
关键词 miR-506-3p PI3K-AKT信号通路 PIK3CA基因
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雷帕霉素和3-甲基腺嘌呤对RAW264.7细胞中8种miRNAs表达的影响
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作者 徐向荣 马占兵 +5 位作者 蒋丹 屈昱良 王羡 方媛 郭乐 徐广贤 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期800-806,共7页
目的探究雷帕霉素(Rapamycin,Rapa)和3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA)处理对RAW264.7细胞中miR-181c,miR-101b和miR-1192等8种自噬相关miRNAs的表达水平,为研究miRNAs在细胞自噬中的功能提供理论基础。方法生物信息学预测分析与细... 目的探究雷帕霉素(Rapamycin,Rapa)和3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA)处理对RAW264.7细胞中miR-181c,miR-101b和miR-1192等8种自噬相关miRNAs的表达水平,为研究miRNAs在细胞自噬中的功能提供理论基础。方法生物信息学预测分析与细胞自噬相关的miRNAs并构建miRNAs调控细胞自噬的网络图;分别用Rapa和3-MA对RAW264.7细胞做不同条件处理,通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,q RT-PCR)检测不同条件处理后RAW264.7细胞中miR-181b、miR-181c、miR-101b、miR-1192、miR-362-3p、miR-590-3p、miR-875-5p和miR-335-5p的相对表达量。结果生物信息学预测结果显示8种miRNAs可能分别靶向作用于细胞自噬通路中多个关键蛋白,对细胞自噬起到促进或抑制作用;与正常对照组相比,miR-181c、miR-101b、miR-1192、miR-362-3p、miR-335-5p、miR-875-5p在Rapa处理RAW264.7细胞组中表达显著下调(P<0.05),而在3-MA处理组则都显著上调(P<0.05);miR-181b在Rapa组表达显著上调,在3-MA组表达下调(P<0.05);miR-590-3p在Rapa组和3-MA组都无显著性变化(P>0.05)。结论 miR-181c、miR-101b等7种miRNAs可能在RAW264.7巨噬细胞自噬过程中发挥重要调控作用。 展开更多
关键词 自噬 MIRNAS REAL-TIME PCR
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噬菌体纳米抗体展示库构建中电转化条件的优化
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作者 李艳宁 李光琪 +4 位作者 屈昱良 潘俊斐 楚元奎 张晓春 徐广贤 《宁夏医科大学学报》 2021年第5期481-485,共5页
目的对DNA电转化条件进行优化,以达到高的转化效率。方法测定不同生长阶段的大肠杆菌TG1、不同电压、不同外源基因(噬菌体质粒pCANTAB5e与驼源VHH片段的连接产物)质量、T4 DNA连接酶去除前后及转化孵育后不同培养温度等条件下的电转化效... 目的对DNA电转化条件进行优化,以达到高的转化效率。方法测定不同生长阶段的大肠杆菌TG1、不同电压、不同外源基因(噬菌体质粒pCANTAB5e与驼源VHH片段的连接产物)质量、T4 DNA连接酶去除前后及转化孵育后不同培养温度等条件下的电转化效率,寻找最适电转化条件。结果当大肠杆菌TG1处于生长对数期(OD600为0.4左右)时制备电感受态细胞,取用乙醇沉淀法去除T4 DNA连接酶后的0.7μg连接产物,在电压2.3 kV、电容25μF、电阻200Ω的条件下,采用0.2 cm的电击杯进行电转化,将获得高的转化效率,达7.9×10^(7)CFU/μg DNA,而转化后的培养温度(30℃和37℃)对电转化效率并没有明显影响。结论经优化电转化条件后得到了高的电转化效率,为构建抗体库奠定基础。 展开更多
关键词 噬菌体抗体库 电转化 转化效率
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苯并[a]芘对人羊膜上皮细胞AQP-8表达的影响
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作者 刘丽媛 曹彩霞 +2 位作者 蒋丹 屈昱良 贾咏存 《宁夏医科大学学报》 2021年第12期1215-1220,共6页
目的探讨苯并[a]芘(BaP)对人羊膜上皮细胞水通道蛋白-8(AQP-8)表达的影响及其作用机制。方法分离培养人羊膜上皮细胞建立细胞模型进行机制研究。Western blot检测BaP处理的细胞中AQPs表达与相关信号通路分子表达。结果与对照组[二甲基亚... 目的探讨苯并[a]芘(BaP)对人羊膜上皮细胞水通道蛋白-8(AQP-8)表达的影响及其作用机制。方法分离培养人羊膜上皮细胞建立细胞模型进行机制研究。Western blot检测BaP处理的细胞中AQPs表达与相关信号通路分子表达。结果与对照组[二甲基亚砜(DMSO)溶剂]相比,人羊膜上皮细胞中AQP-8、蛋白激酶A(PKA)以及环磷酸腺苷(cAMP)随着BaP浓度的增加呈剂量依赖性降低(P均<0.01),细胞色素P4501A1(CYP1A1)随着BaP浓度的增加呈剂量依赖性升高(P均<0.01)。当加入cAMP信号通路激活剂毛喉素(Forskolin),AQP-8、PKA以及cAMP表达与BaP处理组相比均升高(P均<0.01)。结论环境污染物BaP通过cAMP-PKA信号通路影响人羊膜上皮细胞AQP-8表达,可能是羊水平衡失调的机制之一。 展开更多
关键词 苯并[A]芘 人羊膜上皮细胞 水通道蛋白-8
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脊柱结核患者椎间盘病灶组织中环状RNA表达的初步筛选和功能分析 被引量:3
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作者 王立楠 郭乐 +5 位作者 张旭 屈昱良 刘建 师志云 杨宗强 牛宁奎 《中华实验外科杂志》 CAS 北大核心 2021年第11期2115-2119,共5页
目的利用基因芯片技术筛选脊柱结核患者椎间盘病灶组织中差异表达的环状RNA(circRNA)并分析其在脊柱结核发生发展中可能的分子作用机制。方法选取2019年1月至2020年12月就诊于宁夏医科大学总医院脊柱骨科手术治疗的脊柱结核患者3例作为... 目的利用基因芯片技术筛选脊柱结核患者椎间盘病灶组织中差异表达的环状RNA(circRNA)并分析其在脊柱结核发生发展中可能的分子作用机制。方法选取2019年1月至2020年12月就诊于宁夏医科大学总医院脊柱骨科手术治疗的脊柱结核患者3例作为实验组,腰椎间盘退变手术治疗的患者3例作为对照组,收集术中切除的间盘组织,利用Arraystar Human circRNA Array V2芯片检测并采用独立样本t检验进行数据分析筛选出两组差异表达的circRNA;用生物信息学软件预测差异circRNA可能靶向作用的微小RNA(miRNA);对差异表达的circRNA分子的亲本基因进行基因本体(GO)生物学过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果脊柱结核患者的间盘病灶组织中差异表达的circRNA(差异倍数>2,P<0.05)共有1 396条,其中有757种表达上调,639种表达下调;hsacirc0031968、hsacirc0001806、hsacirc0077607、hsacirc0071312、hsacirc0062683表达显著上调;hsacirc0004183、hsacirc0000367、hsacirc0000691、hsacirc0006220、hsacirc0043278表达显著下调;对所有差异表达的circRNA的亲本基因进行GO分析发现其主要参与细胞蛋白分解代谢、三磷酸鸟苷(GTP)酶结合、组蛋白修饰、转录因子结合、蛋白激酶激活等过程;经KEGG通路分析发现其主要富集在内质网中的蛋白质加工、细胞凋亡、蛋白水解、环鸟苷酸-蛋白激酶G、腺苷酸活化蛋白激酶、EB病毒感染等信号通路。结论脊柱结核患者椎间盘病灶组织中差异表达的circRNA可能与脊柱结核的发生和发展密切相关。 展开更多
关键词 环状RNA 脊柱结核 基因芯片 功能注释 信号通路
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RAW264.7细胞不同自噬模型中miRNA表达谱的分析
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作者 张爱君 李艳宁 +4 位作者 高倩 屈昱良 蒋丹 吴珊 徐广贤 《生物技术》 CAS 2021年第5期437-443,457,共8页
[目的]旨在研究RAW264.7细胞不同自噬模型中miRNA表达谱的差异,并探究miRNA在细胞自噬过程中的作用和调控机制。[方法]利用雷帕霉素(rapamycin,RAPA)和3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA)分别作用于小鼠单核巨噬细胞RAW264.7细胞,建立... [目的]旨在研究RAW264.7细胞不同自噬模型中miRNA表达谱的差异,并探究miRNA在细胞自噬过程中的作用和调控机制。[方法]利用雷帕霉素(rapamycin,RAPA)和3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA)分别作用于小鼠单核巨噬细胞RAW264.7细胞,建立自噬诱导模型和自噬抑制模型,以未处理组作为对照组;提取各组总RNA,构建miRNA文库,通过高通量测序技术筛选出差异表达的miRNA,对其靶基因mRNA进行GO和KEGG分析;随机选取5个差异表达的miRNA进行RT-PCR验证。[结果]通过miRNA差异分析发现,mmu-miR-210-5p、mmu-miR-7648-3p、mmu-miR-34b-3p、mmu-miR-7038-5p等8个miRNA在RAPA组和3-MA组中呈现显著相反表达趋势;对其靶基因进行预测分析,发现部分靶基因与自噬发生发展过程相关;RT-PCR验证其中5个差异miRNA的表达水平,发现与高通量测序结果相一致。[结论]不同自噬模型中的miRNA表达谱存在明显差异,可能参与细胞自噬的调控,可以此为靶点为自噬分子调节机制的相关研究提供基础。 展开更多
关键词 MIRNAS 细胞自噬 表达谱 高通量测序
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