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肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征 被引量:133
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作者 崔爱利 许文波 +7 位作者 李秀珠 胡家瑜 凌华 唐伟 杨智宏 张燕 陈立 Hiroyuki Shimizu 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期160-165,共6页
2002~2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,... 2002~2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%~94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%~84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%~100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%~93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源? 展开更多
关键词 肠道病毒71型 RT-PCR 诊断 基因 分子流行病学
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我国五省斯氏并殖吸虫群体DNA序列分析的研究 被引量:13
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作者 崔爱利 常正山 +4 位作者 陈名刚 David Blair 张永年 陈韶红 冯正 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期71-75,共5页
目的 主要研究我国五省(广东、福建、云南、湖北、四川)斯氏并殖吸虫各群体之间的遗传差异以及四川并殖吸虫独立性问题,并探讨异盘、宫崎、泡囊并殖吸虫在并殖属中的分类地位。方法 以GNT-K法抽提基因组DNA后,用特异引物,PCR扩增ITS2和... 目的 主要研究我国五省(广东、福建、云南、湖北、四川)斯氏并殖吸虫各群体之间的遗传差异以及四川并殖吸虫独立性问题,并探讨异盘、宫崎、泡囊并殖吸虫在并殖属中的分类地位。方法 以GNT-K法抽提基因组DNA后,用特异引物,PCR扩增ITS2和部分CO1基因,将PCR扩增产物纯化后直接进行测序或克隆后测序,分析序列的同源性,并构建种系发生树。结果 从DNA序列结果来看,5省斯氏并殖吸虫群体之间存在的遗传性差异较小,其中四川并殖吸虫与斯氏并殖吸虫之间存在的遗传性差异亦小。遗传关系均比较接近。泡囊并殖吸虫在种系发生树上位于斯氏并殖吸虫各地域株之间。在种系发生树上,日本的宫崎并殖吸虫亦位于斯氏并殖吸虫各地域株之间,并且与福建地域株最为接近。异盘并殖吸虫在种系发生树上虽与斯氏并殖吸虫各地域株之间距离较远,但相对卫氏并殖吸虫而言,仍与斯氏并殖吸虫遗传距离较近。结论 广东、福建、云南、湖北和四川5省斯氏并殖吸虫群体均属斯氏并殖吸虫同一虫种,由于受地理因素影响,种内存在着不同的地域株。四川并殖吸虫与斯氏并殖吸虫系同种异名。泡囊并殖吸虫与日本的宫崎并殖吸虫很可能是斯氏并殖吸虫的同种异名。异盘并殖吸虫在形态上与种系发生树上,与斯氏并殖吸虫亲缘关系近于卫氏并殖吸虫,分类地位处于两? 展开更多
关键词 斯氏并殖吸虫 四川并殖吸虫 DNA序列分析 泡囊并殖吸虫 宫崎并殖吸虫 异盘并殖吸虫 地域株 分类学
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用DNA序列分析我国5种并殖吸虫的分类地位 被引量:21
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作者 崔爱利 常正山 +4 位作者 陈名刚 David Blair 陈韶红 张永年 冯正 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期27-30,共4页
目的 采用分子生物学技术分析河口并殖吸虫、白水河并殖吸虫、勐腊并殖吸虫、曼谷并殖吸虫及象山并殖吸虫的分类地位。 方法 用明胶、乙基苯基聚乙二醇 (NP4 0 )、聚山梨酸 2 0 0法抽提基因组 DNA,用特异引物 ,PCR扩增 ITS2和部分 CO... 目的 采用分子生物学技术分析河口并殖吸虫、白水河并殖吸虫、勐腊并殖吸虫、曼谷并殖吸虫及象山并殖吸虫的分类地位。 方法 用明胶、乙基苯基聚乙二醇 (NP4 0 )、聚山梨酸 2 0 0法抽提基因组 DNA,用特异引物 ,PCR扩增 ITS2和部分 CO 基因的目的基因。PCR扩增产物纯化后直接测序分析其同源性 ,构建种系发生树。 结果与结论  DNA序列分析结果表明 ,白水河并殖吸虫、勐腊并殖吸虫、曼谷并殖吸虫及象山并殖吸虫之间存在较小的差异。种系发生树可见 ,这 4种并殖吸虫在并殖吸虫属中彼此比较接近 ,分类地位位于卫氏并殖吸虫与斯氏并殖吸虫之间。河口并殖吸虫与斯氏并殖吸虫在进化及亲缘关系上非常接近。 展开更多
关键词 DNA序列分析 并殖吸虫 分类 中国
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并殖吸虫分类学研究进展 被引量:9
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作者 崔爱利 常正山 冯正 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期312-315,共4页
关键词 并殖吸虫 分类学 肺吸虫 研究进展
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我国五省斯氏并殖吸虫群体形态学的分类地位研究 被引量:5
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作者 崔爱利 常正山 +4 位作者 陈名刚 David.Blair 陈韶红 张永年 冯正 《中国兽医寄生虫病》 2003年第1期4-7,F003,共5页
 目的在于从形态学角度研究我国五省(广东、福建、云南、湖北、四川)斯氏并殖吸虫各群体之间的种内差异以及四川并殖吸虫独立性问题。并比较宫崎、泡囊并殖吸虫与斯氏并殖吸虫在形态学方面的种间差异。应用光镜方法分别观察五省斯氏并...  目的在于从形态学角度研究我国五省(广东、福建、云南、湖北、四川)斯氏并殖吸虫各群体之间的种内差异以及四川并殖吸虫独立性问题。并比较宫崎、泡囊并殖吸虫与斯氏并殖吸虫在形态学方面的种间差异。应用光镜方法分别观察五省斯氏并殖吸虫成虫染色标本的主要形态特征并对表型观察指标(成虫长宽比例、睾丸长度与体长比例、口腹吸盘比例)进行统计学分析。从形态学方面观察结果来看,五省斯氏并殖吸虫群体之间存在的差异较小,其中四川并殖吸虫与斯氏并殖吸虫之间存在的差异也不大。泡囊并殖吸虫在形态学方面与斯氏并殖吸虫各地域株也较为相似。日本的宫崎并殖吸虫在形态学方面与斯氏并殖吸虫福建地域株最为接近。结论,其一综合以上形态学的研究结果,广东、福建、云南、湖北和四川五省斯氏并殖吸虫群体可能均属斯氏并殖吸虫同一虫种,由于受地理因素影响,种内可能存在着不同的地域株。四川并殖吸虫与斯氏并殖吸虫可能系同种异名。其二泡囊并殖吸虫与日本的宫崎并殖吸虫很可能也是斯氏并殖吸虫的同种异名。为进一步明确五省斯氏并殖吸虫群体及泡囊并殖吸虫与日本的宫崎并殖吸虫的分类地位尚需结合分子生物学的研究进行综合分析。 展开更多
关键词 斯氏并殖吸虫 形态学 分类地位 地域株 中国 省份
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一起传染病暴发中肠道病毒血清型鉴定和ECHO30基因特征分析 被引量:30
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作者 王海岩 许文波 +6 位作者 徐爱强 朱贞 杨会利 李岩 纪峰 崔爱利 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期106-112,共7页
2003年5~9月,山东省泰安市发生了由肠道病毒(Enterovirus,EV)感染所致的传染病暴发,临床症状以手足口病(HFMD)为主,同时有心肌炎和无菌性脑膜炎等中枢神经系统症状患者也占较大比例。131份病人(粪便、咽拭子、脑脊液)标本中共分离到EV6... 2003年5~9月,山东省泰安市发生了由肠道病毒(Enterovirus,EV)感染所致的传染病暴发,临床症状以手足口病(HFMD)为主,同时有心肌炎和无菌性脑膜炎等中枢神经系统症状患者也占较大比例。131份病人(粪便、咽拭子、脑脊液)标本中共分离到EV62株,其中ECHO1939株,EV716株,ECHO304株,其它肠道病毒13株。4株ECHO30病毒中的2株分离自2个患者的粪便标本,但用WHO肠道组合血清中和试验未能定出型别。另外2株分离自同一患者的粪便和脑脊液标本。病原学分析表明,ECHO30是引起该患者无菌性脑膜炎的病原。抗E-CHO30标准株的血清中和这4株病毒的滴度低于标准株5~20倍。VP1区全基因序列测定和同源性比较分析表明,4株ECHO30分离株病毒核苷酸同源性在98.0%~98.5%,氨基酸同源性在98.9%~99.3%,提示这4株病毒来源于同一传播链,2003年5-9月ECHO30在该地区可能有局部流行。系统进化树分析表明,ECHO30病毒可以划分为6个基因型,其中基因型1~5为GenBank中已发表的ECHO30分离株,山东分离株与其它5个基因型成员核苷酸差异分别在9.4%~24.4%,在进化树上形成了较独立的分支,是一个新基因型,将其划分为第6基因型。 展开更多
关键词 患者 肠道病毒 暴发 无菌性脑膜炎 传染病 脑脊液 基因型 分离株 血清型鉴定 粪便
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江苏省不明原因轻型呼吸道传染病暴发的病因学研究 被引量:37
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作者 许文波 崔爱利 +7 位作者 史智扬 汪华 张勇 唐震 刘和平 李显 朱贞 唐浏英 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期325-331,共7页
自2004年4月18日起至6月末,江苏省东台市发生以发热、咽部充血、扁桃体肿大为临床表现的原因不明的疫情暴发,发病人群以中小学生、幼儿为主,地域以许河镇、新街镇以及临近乡镇为主.疫情涉及东台市9个镇,合计报告709例,分布在75个学校,24... 自2004年4月18日起至6月末,江苏省东台市发生以发热、咽部充血、扁桃体肿大为临床表现的原因不明的疫情暴发,发病人群以中小学生、幼儿为主,地域以许河镇、新街镇以及临近乡镇为主.疫情涉及东台市9个镇,合计报告709例,分布在75个学校,240个班级.暴发的特点为传染性强,短期内出现大量的患者,发病有班级聚集性特点,未发现成人感染.临床表现以发烧(100%)、咽部充血(91.40%)、扁桃体肿大(60.22%)、咽痛(50.00%)为主;X线检查可发现肺纹理增强(90.3%).用Hep-2细胞从患儿20份咽拭子标本中分离到12株病毒,经PCR扩增腺病毒L3部分基因及其PCR产物的序列测定和分析,证实这12株病毒为腺病毒3型;对28份咽拭子标本直接进行DNA提取和PCR扩增,有17份标本PCR扩增L3部分基因呈阳性,经序列测定和分析,也为腺病毒3型.这29个阳性标本L3基因的1 446个核苷酸的序列与GenBank上所发表的腺病毒3型序列同源性高达99.5%.双份血IgG检测:对江苏省采集10份患儿急性期和恢复期双份血清,以从患儿咽拭子分离到的腺病毒3型作为抗原,进行病毒抗体测定,6份患儿的双份血清腺病毒总IgG滴度呈4倍以上增高.患儿急性期血IgA检测:对暴发疫情34例患儿急性期血清(发病时间为1~3天)进行腺病毒IgA抗体测定,结果有9份标本为阳性,1份标本为可疑阳性,阳性率为26.47%.IgA阳性率低可能与血清采集时间过早有关,机体还未全部产生IgA.另外,还对江苏省送检的从患儿血培养基培养的细菌毒株进行了鉴定,对其16S rRNA基因进行了基因扩增及序列分析,序列测定和分析提示为A组M3型化脓性链球菌.实验研究结果并结合此次疫情的流行病学和患儿的临床表现,证实腺病毒3型是引起此次儿童不明原因轻型呼吸道传染病暴发的病原体,部分病例伴有原发或继发化脓性链球菌感染. 展开更多
关键词 暴发 腺病毒3型 L3基因
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检测人血清中SARS冠状病毒IgG抗体的ELISA方法建立及其应用 被引量:5
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作者 毛乃颖 张燕 +9 位作者 朱贞 崔爱利 刘中华 杨建国 严汉民 蒋小泓 张建 阮力 陈彪 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期73-78,共6页
为了建立方便、敏感和特异的SARS病毒血清学诊断方法 ,利用PQE30表达系统在大肠杆菌M1 5中分段高效表达了SARS病毒N蛋白。通过金属鏊合亲和层析纯化了目的蛋白N - 1和N - 2 ,Westernblot结果显示 ,两个表达蛋白均具有较好的抗原性。然后... 为了建立方便、敏感和特异的SARS病毒血清学诊断方法 ,利用PQE30表达系统在大肠杆菌M1 5中分段高效表达了SARS病毒N蛋白。通过金属鏊合亲和层析纯化了目的蛋白N - 1和N - 2 ,Westernblot结果显示 ,两个表达蛋白均具有较好的抗原性。然后将N - 1和N - 2蛋白共同包被 ,建立了检测人血清中SARS病毒IgG抗体的间接ELISA法。用此方法检测 1 2 0例临床诊断为SARS的病人和 2 4 4个不同年龄组正常人血清IgG抗体 ,结果 1 2 0例SARS病人的第一份血清IgG抗体总阳性率为 6 0 0 % ,发病第 0~ 7、8~ 1 0、1 1~ 1 4、1 5~ 2 7和 2 8天后的血清中 ,SARS病毒IgG抗体阳性率分别为 0、1 1 1 %、6 0 0 %、6 0 5 %和 70 3% ;而 2 4 4份正常人血清检测结果均为阴性 ,包括 1 0 0份1 4岁以下儿童血清也未发现假阳性。结果表明 ,利用大肠杆菌表达的N蛋白完全能够替代全病毒灭活抗原 ,所建立的间接ELISA方法简单 ,价格低廉 ,能保证生物安全 ,对SARS可疑病例的确诊和排除具有重要的实际应用价值 ,可用于SARS高危人群的血清流行病学监测 ,SARS疫情的控制和预防 。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征 SARS 冠状病毒 N蛋白 ELISA IgG 抗体
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急性下呼吸道感染患儿病毒病原学及其临床特征 被引量:11
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作者 张丽丽 唐浏英 +8 位作者 谢正德 檀晓娟 李崇山 崔爱利 姬奕昕 许松涛 毛乃颖 许文波 申昆玲 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第22期1743-1744,1756,共3页
目的了解急性下呼吸道感染(ALRI)住院患儿病毒感染情况及其临床特征。方法收集2004-2006年冬季(11月至次年2月)因ALRI在北京儿童医院住院治疗的<5岁患儿鼻咽吸出物333份。男230例,女103例;年龄1个月~4.8岁。采用PCR技术和病毒分离... 目的了解急性下呼吸道感染(ALRI)住院患儿病毒感染情况及其临床特征。方法收集2004-2006年冬季(11月至次年2月)因ALRI在北京儿童医院住院治疗的<5岁患儿鼻咽吸出物333份。男230例,女103例;年龄1个月~4.8岁。采用PCR技术和病毒分离方法对鼻咽吸出物进行呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(AdV)、副流感病毒(PIV)1~4型、鼻病毒(RhV)、人偏肺病毒(hMPV)、冠状病毒(HCoV)及人博卡病毒(HBoV)检测。采用人喉上皮癌细胞和非洲猴肾细胞对鼻咽吸出物进行病毒分离,对阳性结果进行序列测定和鉴定。结果ALRI333例患儿中,病毒检测阳性123份(36.94%),其中RSV阳性102例,AdV、HBoV阳性各16例,RhV阳性1例,其中12例为双重阳性。未检测到PIV、hMPV及HCoV。333份鼻咽吸出物中病毒分离得到11株病毒株,经PCR扩增及序列测定证实均为AdV,包括AdV1型2株,AdV2型、AdV3型、AdV7型各3株。肺炎患儿病毒阳性检出率为30.35%,毛细支气管炎患儿病毒阳性检出率为62.50%,急性支气管炎患儿病毒阳性检出率为23.08%,毛细支气管炎患儿病毒阳性检出率高于肺炎和急性支气管炎患儿(χ2=24.75,19.66Pa<0.01)。结论RSV感染在北京儿童医院2004-2006年冬季ALRI住院患儿中占首位;感染的AdV血清型包括AdV1型、AdV2型、AdV3型及AdV7型;HBoV可能是ALRI的重要病原。毛细支气管炎患儿病毒感染检出率最高。 展开更多
关键词 病毒 博卡病毒 呼吸道感染 聚合酶链反应 儿童
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在传染性非典型肺炎患者组织和血液中发现冠状病毒 被引量:6
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作者 李德新 于建石 +22 位作者 胡孔新 段淑敏 毕胜利 许文波 崔爱利 张燕 洪涛 吴昊 窦志勇 何雅慧 韩玉霞 刘刚 杜润蕾 张全福 刘琴芝 梁米芳 王建伟 郭元吉 徐红 戴淑玲 董小平 梁国栋 阮力 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期97-99,共3页
用RT-PCR从广东两例传染性非典型肺炎(非典型肺炎)死亡病例的肺和脾标本中,以及北京、辽宁和宁夏非典型肺炎患者血清中,扩增出冠状病毒核苷酸序列。这些PCR产物为冠状病毒RNA聚合酶基因部分片段,所有测定的序列和国内外SARS病毒序列相... 用RT-PCR从广东两例传染性非典型肺炎(非典型肺炎)死亡病例的肺和脾标本中,以及北京、辽宁和宁夏非典型肺炎患者血清中,扩增出冠状病毒核苷酸序列。这些PCR产物为冠状病毒RNA聚合酶基因部分片段,所有测定的序列和国内外SARS病毒序列相同。这些发现提示,冠状病毒和非典型肺炎关系密切,有助于确定我国非典型肺炎的病因。所建立的套式PCR方法可以用于检测临床标本。由于血液中存在SARS病毒,进行血清操作时需要注意安全保护。 展开更多
关键词 传染性非典型肺炎 冠状病毒 PCR 核苷酸序列
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2004年中国四省市腺病毒疫情的流行病学和病原学研究 被引量:15
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作者 唐浏英 熊英 +4 位作者 霍佃香 刘秀云 史智扬 崔爱利 许文波 《疾病监测》 CAS 2006年第6期285-287,共3页
目的对2004年发生在湖北省、江西省、江苏省和北京市的腺病毒暴发及散发的疫情进行流行病学总结和分析以及病原学研究,以了解中国腺病毒感染状况。方法对各地分离的共16株腺病毒毒株进行了病原学研究,包括病毒的培养,提取病毒核酸,针对H... 目的对2004年发生在湖北省、江西省、江苏省和北京市的腺病毒暴发及散发的疫情进行流行病学总结和分析以及病原学研究,以了解中国腺病毒感染状况。方法对各地分离的共16株腺病毒毒株进行了病原学研究,包括病毒的培养,提取病毒核酸,针对Hexon蛋白基因的PCR扩增以及PCR产物的序列测定和分析,并根据流行病学资料对腺病毒的疫情特点进行总结和分析。结果2004年引起湖北省、江西省、江苏省和北京市的腺病毒暴发及散发的疫情均为腺病毒3型;分离到的16株腺病毒毒株,在所选的900bpHexon基因片段,基因变异较小,核苷酸和氨基酸的同源性在98.5% ̄100%。结论目前我国学龄儿童以及低年龄组儿童的腺病毒感染主要为3型所致,各地分离的病毒株未观察到明显的基因变异。 展开更多
关键词 腺病毒 暴发 病原学
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2004年冬至2005年春引起北京地区儿童肺炎的腺病毒基因特点分析 被引量:12
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作者 唐浏英 刘秀云 +5 位作者 芦起 崔爱利 江载芳 谢正德 申昆玲 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期286-291,共6页
为了解北京地区腺病毒的流行毒株,从北京儿童医院收集25份儿童肺炎患者的痰洗液标本(2004年冬到2005年春),患者的年龄在2个月到2岁,临床表现以持续高热、咳喘和气促为主。对25份标本分别用Hep-2细胞进行了病毒分离培养、腺病毒属特异性... 为了解北京地区腺病毒的流行毒株,从北京儿童医院收集25份儿童肺炎患者的痰洗液标本(2004年冬到2005年春),患者的年龄在2个月到2岁,临床表现以持续高热、咳喘和气促为主。对25份标本分别用Hep-2细胞进行了病毒分离培养、腺病毒属特异性引物PCR扩增以及PCR产物的序列测定分析。结果发现25份标本中有9份PCR扩增阳性,其中2份病毒培养物观察到典型的细胞病变;将9份PCR阳性产物纯化后进行序列测定,结果7份标本核苷酸序列完全一致,同源性100%,并与GenBank发表的序列相比较,发现与腺病毒7型最为接近,同源性皆为99.7%;2份与腺病毒3型最接近,同源性为99.6%。结果表明,此次病毒分离株为腺病毒B亚群。北京儿童医院2004年12月至2005年3月腺病毒引起的肺炎主要以7型和3型为主,7型占优势,与国内其它地区的情况相似。 展开更多
关键词 腺病毒 基因型
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浙江华溪蟹体内一种大型囊蚴的ITS2基因序列分析 被引量:1
13
作者 石君帆 钱凯先 +5 位作者 陈翠娥 常正山 David Blair 曾肖芃 崔爱利 闻礼永 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期125-125,共1页
浙江省宁海县自1979年以来先后发现了卫氏并殖吸虫、斯氏并殖吸虫、哈氏并殖吸虫,以及卫氏并殖吸虫的嵌合体型(2n/3n/4n).
关键词 浙江华溪蟹 囊蚴 ITS2基因 基因序列分析 遗传距离
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重庆市SARS病例及疑似病例病原检测
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作者 凌华 贾庆良 +3 位作者 韩梅 崔爱利 张敏 许文波 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期1033-1033,共1页
关键词 重庆市 SARS 疑似病例 血清学 病原学 病毒
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2009—2023年中国16个省份急性呼吸道感染病例中人呼吸道合胞病毒的流行特征分析 被引量:3
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作者 崔爱利 夏百成 +22 位作者 朱贞 谢智博 孙利伟 徐瑾 许晶 李忠 赵林清 龙晓茹 于德山 朱冰 张凤 穆敏 谢会 蔡亮 朱云 田晓灵 王冰 郜振国 刘晓庆 任斌知 韩光跃 胡孔新 张燕 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期945-951,共7页
目的了解2009—2023年我国16个省份急性呼吸道感染(ARI)病例中人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征。方法研究资料来源于2009—2023年我国16个省份ARI病例监测数据,共有28 278例ARI病例纳入研究。监测病例的临床标本进行了HRSV核酸筛查,... 目的了解2009—2023年我国16个省份急性呼吸道感染(ARI)病例中人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征。方法研究资料来源于2009—2023年我国16个省份ARI病例监测数据,共有28 278例ARI病例纳入研究。监测病例的临床标本进行了HRSV核酸筛查,并分析不同年龄组、不同地区和不同月份病例的HRSV检出率差异。结果 2009年1月至2023年9月,共纳入28 278例ARI病例。病例年龄范围为<1月龄~112岁,年龄M(Q1,Q3)为3岁(1岁,9岁)。28 278例ARI病例中有3 062例HRSV核酸阳性,总检出率为10.83%。2009—2019年HRSV检出率为9.33%,病毒主要以冬春季流行为主。在新型冠状病毒感染(COVID-19)流行期间,HRSV检出率在6.32%~18.67%之间波动;2022年底至2023年初未出现HRSV传统的冬季流行高峰,在2023年4—5月出现了HRSV反季节流行。87.95%(2 693/3 062)HRSV阳性病例为 5岁以下的儿童,不同年龄组中HRSV检出率的差异具有统计学意义(P<0.001),呈现出随着年龄增加HRSV检出率降低的趋势(P<0.001),其中以<6月龄组患儿的HRSV检出率最高(25.69%)。和2009—2019年相比,2020—2023年期间不同年龄组的HRSV检出率从高到低的排序发生变化,HRSV阳性病例的年龄M(Q1,Q3)从1岁(6月龄,3岁)增加至2岁(11月龄,3岁)。结论通过连续15年的HRSV监测分析发现,5岁以下的儿童,尤其是<6月龄婴幼儿是HRSV感染的主要高发人群。COVID-19流行期间,我国HRSV流行水平和流行模式发生了变化。 展开更多
关键词 人呼吸道合胞病毒 急性呼吸道感染 流行特征 监测
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关于麻疹 这些知识要知晓
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作者 王慧玲 崔爱利 +1 位作者 侯芊 郝利新 《保健与生活》 2024年第14期39-39,共1页
麻疹是由麻疹病毒引起的急性出疹性呼吸道传染病,四季均可发病,儿童是主要易感人群。麻疹是传染性强的疾病之一,患者为麻疹的传染源,在疾病的潜伏末期到出疹后5天均具有传染性。凡未患过麻疹又未接种过麻疹疫苗的人,在接触麻疹患者后,... 麻疹是由麻疹病毒引起的急性出疹性呼吸道传染病,四季均可发病,儿童是主要易感人群。麻疹是传染性强的疾病之一,患者为麻疹的传染源,在疾病的潜伏末期到出疹后5天均具有传染性。凡未患过麻疹又未接种过麻疹疫苗的人,在接触麻疹患者后,均易被感染而发病。 展开更多
关键词 呼吸道传染病 麻疹疫苗 麻疹病毒 易感人群 传染源 麻疹患者 出疹 未接种
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2009-2021年全国5岁以下儿童发热伴出疹症候群病原构成及流行特征分析 被引量:1
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作者 林帆 郭玉清 +5 位作者 李开明 吴彦霖 李柏松 郑亚明 崔爱利 王丽萍 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期681-687,共7页
目的了解我国5岁以下儿童发热伴出疹症候群(RFS)的病原构成及流行特征,为儿童出疹性传染病的诊疗和和科学防控提供参考。方法基于国家传染病监测技术平台RFS监测数据,监测病原包括肠道病毒、麻疹病毒、风疹病毒、水痘–带状疱疹病毒、... 目的了解我国5岁以下儿童发热伴出疹症候群(RFS)的病原构成及流行特征,为儿童出疹性传染病的诊疗和和科学防控提供参考。方法基于国家传染病监测技术平台RFS监测数据,监测病原包括肠道病毒、麻疹病毒、风疹病毒、水痘–带状疱疹病毒、登革病毒、人细小病毒B19、埃博拉病毒、寨卡病毒、人疱疹病毒6型、EB病毒、A组链球菌、伤寒、副伤寒沙门菌、伯氏疏螺旋体和立克次体。采用描述性流行病学方法分析2009—2021年全国5岁以下儿童RFS病原构成及流行特征。结果我国5岁以下儿童RFS患者以病毒感染为主,主要是肠道病毒(85.78%)、麻疹病毒(10.03%)和水痘-带状疱疹病毒(1.45%),合计占比为97.26%,风疹病毒等其余病原在2018—2021年占比有所增加。2009—2021年肠道病毒优势血清型从肠道病毒A组71型(EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)转换为柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)和柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)。RFS总体病原检出率在1~2岁年龄组(70.53%)高于其他年龄组(χ2=292.336,P<0.001),南方地区(71.12%)高于北方地区(65.35%)(χ2=305.946,P<0.001);肠道病毒在1~2岁年龄组患儿、南方地区检出率较高,麻疹病毒在<1岁患儿、北方地区检出率较高,水痘–带状疱疹病毒在北方地区检出率较高。RFS总体病原在春夏季检出率高于秋冬季(χ2=295.060,P<0.001),其中肠道病毒夏秋季高发,麻疹病毒冬春季高发,水痘–带状疱疹病毒冬季高发,3种病毒南、北方地区季节性分布峰有所差异。结论2009—2021年全国5岁以下儿童RFS患儿以病毒感染为主,尤其以肠道病毒、麻疹病毒和水痘–带状疱疹病毒感染较为常见,RFS患儿病原体感染呈现多样化趋势,肠道病毒优势血清型发生转变,应持续加强对儿童RFS病原谱的监测。 展开更多
关键词 发热伴出疹症候群 5岁以下儿童 病原学和流行病学特征
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急性呼吸道感染病例中人冠状病毒229E感染情况及病毒基因特征分析
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作者 李丰辰 蒋豪然 +14 位作者 夏百成 马洪滨 朱汝南 许晶 黄艳智 郜振国 胡孔新 李岩 向星宇 吴巨龙 许红梅 张凤 王文慧 张燕 崔爱利 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期13-26,共14页
为阐明我国全人群急性呼吸道感染(Acute respiratory infection,ARI)病例中人冠状病毒229E(Human coronavirus 229E,HCoV-229E)感染情况及病毒基因特征,本研究对2009-2021年间中国十一省份15,335例ARI监测病例中HCoV-229E核酸阳性病例... 为阐明我国全人群急性呼吸道感染(Acute respiratory infection,ARI)病例中人冠状病毒229E(Human coronavirus 229E,HCoV-229E)感染情况及病毒基因特征,本研究对2009-2021年间中国十一省份15,335例ARI监测病例中HCoV-229E核酸阳性病例进行描述性流行病学分析,同时对HCoV-229E阳性病例的临床标本进行S基因扩增和测序,阳性序列用于病毒系统发育和进化分析。本研究中共检测出316例HCoV阳性病例,其中38例为HCoV-229E阳性。HCoV-229E检出率在不同季节中差异无统计学意义(χ^(2)=2.345,P=0.504);男性检出率高于女性(χ^(2)=4.546,P<0.05);不同年龄组中,除了5~17岁青少年组未检测到HCoV-229E,其他年龄组间HCoV-229E检出率差异无统计学意义(χ^(2)=1.927,P=0.588)。在38例HCoV-229E阳性病例中有23例(60.53%)为混合感染病例,和HCoV-229E单一感染病例相比,包括肺炎病例在内的下呼吸道感染病例在混合感染病例中比例增高。本研究共获得9条2019-2021年HCoV-229E刺突蛋白(Spike protein,S)基因序列,结合从GenBank中下载的90条HCoV-229E S基因代表性序列共同构建系统发育树。结果表明,全球HCoV-229E序列可划分为Genogroup1~6共6个组,具有明显的时间聚集性。Genogroup 6是目前全球流行的主要优势谱系,位于HCoV-229E系统发育树的末端。本研究所获得的9条HCoV-229E序列均隶属于Genogroup 6,但位于不同分支。S基因分子进化速率约为7.32×10^(-4)替换/位点/年,S蛋白处于负向选择压力下(ω<1),但仍有个别正向选择位点存在,S蛋白多个位点上发生氨基酸突变和N-糖基化位点突变,其中部分突变发生在S蛋白受体结合结构域的3个受体结合环中。本研究通过开展中国内地部分地区ARI病例中HCoV-229E感染情况和病毒基因特征分析,阐述了我国HCoV-229E流行病学特征和病毒分子进化特点,为我国HCoV-229E感染的控制与预防提供基线数据。 展开更多
关键词 人冠状病毒229E 流行特征 系统发育分析 分子进化
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2019—2023年吉林省长春市儿童急性呼吸道感染住院病例中人偏肺病毒的基因型别和流行特征分析
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作者 谢智博 崔爱利 +6 位作者 孙立伟 王雅各 张瑶 王利武 夏百成 孙馨 张燕 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期862-868,共7页
目的了解吉林省长春市儿童急性呼吸道感染(ARI)住院病例中人偏肺病毒(HMPV)的基因型别和流行特征。方法采集2019年6月至2023年6月长春市儿童医院ARI住院病例的咽拭子标本,收集病例的流行病学和临床信息。采用荧光定量RT-PCR方法鉴定HMP... 目的了解吉林省长春市儿童急性呼吸道感染(ARI)住院病例中人偏肺病毒(HMPV)的基因型别和流行特征。方法采集2019年6月至2023年6月长春市儿童医院ARI住院病例的咽拭子标本,收集病例的流行病学和临床信息。采用荧光定量RT-PCR方法鉴定HMPV阳性病例,并对阳性病例的病毒核酸进行G基因扩增及亲缘关系分析。结果共纳入儿童ARI住院病例3311例,年龄范围为0~17岁,年龄M(Q_(1),Q_(3))为2(1,3)岁;男性患儿1811例(54.70%)。共检出HMPV阳性病例167例,检出率为5.04%,其中<5岁病例占92.81%(155/167)。2019年HMPV检出率为6.37%(30/471),2020年降至最低(2.31%,10/432),2021、2022年有所回升,检出率分别为4.70%(60/1277)和4.56%(21/461),2023年HMPV检出率升高至6.87%(46/670),不同年份间的检出率差异具有统计学意义(P<0.05)。不同年份HMPV的流行高峰也存在差异,表现为单峰或双峰流行。共获得79条HMPV的G基因序列,A亚型和B亚型分别占48.10%和51.90%,其中A亚型均为A2c重复插入变异株,B亚型以B2基因型为主。HMPV在不同年份中可表现为A、B亚型的单独流行或共流行,存在亚型更替模式。结论2019—2023年不同年份间长春市ARI儿童住院病例中HMPV检出率差异较大,且存在HMPV的A、B基因亚型更替模式。 展开更多
关键词 呼吸道感染 儿童 人偏肺病毒 流行病学特征
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2021—2022年我国风疹流行病学及其病毒基因特征分析
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作者 钱程 刘莹 +10 位作者 蔡建林 崔爱利 李立群 范丽霞 刘李 周淑洁 陈瑛 崔晓娴 毛乃颖 张燕 朱贞 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2024年第1期49-57,共9页
目的了解2021—2022年间风疹流行病学及其病毒基因特征, 为我国风疹防控提供基础科学数据。方法自中国疾病预防控制信息系统中的传染病监测模块和监测报告管理模块获取2021—2022年间全国风疹发病数据;从全国麻疹/风疹实验室网络获得阳... 目的了解2021—2022年间风疹流行病学及其病毒基因特征, 为我国风疹防控提供基础科学数据。方法自中国疾病预防控制信息系统中的传染病监测模块和监测报告管理模块获取2021—2022年间全国风疹发病数据;从全国麻疹/风疹实验室网络获得阳性风疹病毒(rubella virus, RuV)分离株, 通过逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR)扩增并测定位于E1基因的两个核苷酸(nucleotide, nt)片段[F1-480(8 633~9 112 nt)和F2-633(8 945~9 577 nt)], 整理拼接后获得靶基因序列(E1-739), 将其与已报道的基因型/亚型参考株构建系统发育树以鉴定基因型别, 同时从GenBank数据库中下载我国2018—2020年间流行的RuV病毒株序列开展系统发育分析。结果 2021—2022年我国风疹发病率均为0.06/10万(2021年:840例;2022年:784例), 病例主要集中于西部和南部省份。病例年龄分布分析显示, 2021—2022年风疹发病主要以<5岁儿童为主(2021年:34.17%, 287/840;2022年:42.09%, 330/784), 其中以0~2岁患儿占比最高。进一步分析病例免疫史发现, 8~23月龄的病例中, 仅接种了1剂次含风疹成分的疫苗(rubella containing vaccine, RCV)幼儿的发病比例较高;2~14岁年龄组病例主要分布在接种了2剂次或以上RCV的儿童中;然而, >15岁病例主要集中在未接种RCV或免疫史不详的人群中。全国病毒学监测数据显示, 2021—2022年间从我国6个省市共获得22株RuV病毒分离株, 分属于1E-L2(11株)和2B-L2c(11株)基因亚型, 并与2018—2020年间流行的RuV病毒株具有很高的同源性。结论 2021—2022年间我国风疹发病维持在较低水平, 流行的RuV为1E-L2和2B-L2c基因亚型。 展开更多
关键词 风疹 流行病学 基因特征
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