目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨川牛膝治疗继发性闭经(secondary amenorrhea, SA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TC...目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨川牛膝治疗继发性闭经(secondary amenorrhea, SA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索川牛膝的活性成分及作用靶点,从GeneCards数据库获取SA的疾病靶点,采用R软件得到两者的交集靶点。借助STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,通过Cytoscape 3.8.2软件进行聚类分析和拓扑分析从而筛选核心靶点。应用R软件进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析(P<0.05)。最后,采用Autodock Vina软件进行分子对接验证。结果:川牛膝活性成分4个,即槲皮素、β-谷甾醇、甜菜素、红苋甾酮;川牛膝作用靶点178个,SA相关靶点1 366个,两者的交集靶点56个;基于Network Analyzer插件的拓扑分析筛选得到9个核心靶点,包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threorine protein kinase, AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen activated protein kinase 1,MAPK1)、雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1)等。GO功能分析主要涉及对类固醇激素的反应、活性氧代谢过程、上皮细胞增殖等;KEGG通路135条,主要包括HIF-1信号通路、内分泌抵抗、雌激素信号通路等。分子对接显示,活性成分(槲皮素、β-谷甾醇)与核心靶点(AKT1、MAPK1)具有较好的结合活性。结论:川牛膝治疗SA具有多成分、多靶点、多途径的特点,其可能通过槲皮素、β-谷甾醇等成分作用于AKT1、MAPK1、ESR1等靶点,调控雌激素信号通路、内分泌抵抗等通路。展开更多
目的通过对肺炎球菌疫苗的不良反应信号进行挖掘与研究,为肺炎疫苗的临床安全合理使用提供参考。方法采用报告比值比法(ROR)和比例报告比值比法(PRR)对美国疫苗不良事件报告系统(VAERS)2010年1月1日至2019年12月31日收集的药品不良反应(...目的通过对肺炎球菌疫苗的不良反应信号进行挖掘与研究,为肺炎疫苗的临床安全合理使用提供参考。方法采用报告比值比法(ROR)和比例报告比值比法(PRR)对美国疫苗不良事件报告系统(VAERS)2010年1月1日至2019年12月31日收集的药品不良反应(adverse drug reaction,ADR)报告进行分析,挖掘其中有关肺炎球菌疫苗(23价和13价)的ADR信号。结果23价肺炎疫苗经ROR和PRR法检测得到36个信号,其中7个未在说明书中提及,信号强度最高的ADR是白细胞增多症。13价肺炎疫苗ROR和PRR分别得到103和102个ADR信号,其中36个信号未在说明书中提及,信号强度较高的ADR多为胃肠系统疾病、感染及侵袭类疾病、全身性疾病及给药部位各种反应等。结论临床使用肺炎疫苗时应密切监测患者的ADR,特别是说明书未提及的,应及时做出干预。展开更多
目的基于贝叶斯网状Meta分析方法比较临床常见干预方式治疗宫颈高危型HPV感染的疗效。方法检索PubMed、中国生物医学文献数据库等中英文数据库收录的从建库以来至2021年7月31日临床常见干预方式治疗宫颈高危型HPV感染的随机对照试验。...目的基于贝叶斯网状Meta分析方法比较临床常见干预方式治疗宫颈高危型HPV感染的疗效。方法检索PubMed、中国生物医学文献数据库等中英文数据库收录的从建库以来至2021年7月31日临床常见干预方式治疗宫颈高危型HPV感染的随机对照试验。按照纳入和排除标准筛选文献,Cochrane系统评价策略评价纳入文献的质量,RevMan5.3和Stata16.0软件进行Meta分析。结果纳入73篇RCTs,3642例患者,涉及8种干预方式。网状Meta分析结果显示,治疗后3个月转阴率排序为PTL>Anti-HPV BPD>ALA-PDT>Nr-C W S>B F K S>C S J Z S>r h I F Nα-2b>FUO;治疗后6个月转阴率排序为Nr-CWS>ALA-PDT>PTL>Anti-HPV BPD>BFKS>rhIFN>FUO>CSJZS;治疗后9个月转阴率排序为PTL>ALAPDT>BFKS>Anti-HPV BPD>rhIFNα-2b>FUO;治疗后12个月转阴率排序为Nr-CWS>ALA-PDT>Anti-HPV BPD>PTL>BFKS>rhIFNα-2b>FUO>CSJZS。结论就HPV转阴率而言,Nr-CWS和PTL具有较好的疗效,是目前较为理想的方案,但仍需今后高质量研究予以证实。展开更多
文摘目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨川牛膝治疗继发性闭经(secondary amenorrhea, SA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索川牛膝的活性成分及作用靶点,从GeneCards数据库获取SA的疾病靶点,采用R软件得到两者的交集靶点。借助STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,通过Cytoscape 3.8.2软件进行聚类分析和拓扑分析从而筛选核心靶点。应用R软件进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析(P<0.05)。最后,采用Autodock Vina软件进行分子对接验证。结果:川牛膝活性成分4个,即槲皮素、β-谷甾醇、甜菜素、红苋甾酮;川牛膝作用靶点178个,SA相关靶点1 366个,两者的交集靶点56个;基于Network Analyzer插件的拓扑分析筛选得到9个核心靶点,包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threorine protein kinase, AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen activated protein kinase 1,MAPK1)、雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1)等。GO功能分析主要涉及对类固醇激素的反应、活性氧代谢过程、上皮细胞增殖等;KEGG通路135条,主要包括HIF-1信号通路、内分泌抵抗、雌激素信号通路等。分子对接显示,活性成分(槲皮素、β-谷甾醇)与核心靶点(AKT1、MAPK1)具有较好的结合活性。结论:川牛膝治疗SA具有多成分、多靶点、多途径的特点,其可能通过槲皮素、β-谷甾醇等成分作用于AKT1、MAPK1、ESR1等靶点,调控雌激素信号通路、内分泌抵抗等通路。
文摘目的通过对肺炎球菌疫苗的不良反应信号进行挖掘与研究,为肺炎疫苗的临床安全合理使用提供参考。方法采用报告比值比法(ROR)和比例报告比值比法(PRR)对美国疫苗不良事件报告系统(VAERS)2010年1月1日至2019年12月31日收集的药品不良反应(adverse drug reaction,ADR)报告进行分析,挖掘其中有关肺炎球菌疫苗(23价和13价)的ADR信号。结果23价肺炎疫苗经ROR和PRR法检测得到36个信号,其中7个未在说明书中提及,信号强度最高的ADR是白细胞增多症。13价肺炎疫苗ROR和PRR分别得到103和102个ADR信号,其中36个信号未在说明书中提及,信号强度较高的ADR多为胃肠系统疾病、感染及侵袭类疾病、全身性疾病及给药部位各种反应等。结论临床使用肺炎疫苗时应密切监测患者的ADR,特别是说明书未提及的,应及时做出干预。
文摘目的基于贝叶斯网状Meta分析方法比较临床常见干预方式治疗宫颈高危型HPV感染的疗效。方法检索PubMed、中国生物医学文献数据库等中英文数据库收录的从建库以来至2021年7月31日临床常见干预方式治疗宫颈高危型HPV感染的随机对照试验。按照纳入和排除标准筛选文献,Cochrane系统评价策略评价纳入文献的质量,RevMan5.3和Stata16.0软件进行Meta分析。结果纳入73篇RCTs,3642例患者,涉及8种干预方式。网状Meta分析结果显示,治疗后3个月转阴率排序为PTL>Anti-HPV BPD>ALA-PDT>Nr-C W S>B F K S>C S J Z S>r h I F Nα-2b>FUO;治疗后6个月转阴率排序为Nr-CWS>ALA-PDT>PTL>Anti-HPV BPD>BFKS>rhIFN>FUO>CSJZS;治疗后9个月转阴率排序为PTL>ALAPDT>BFKS>Anti-HPV BPD>rhIFNα-2b>FUO;治疗后12个月转阴率排序为Nr-CWS>ALA-PDT>Anti-HPV BPD>PTL>BFKS>rhIFNα-2b>FUO>CSJZS。结论就HPV转阴率而言,Nr-CWS和PTL具有较好的疗效,是目前较为理想的方案,但仍需今后高质量研究予以证实。
