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基于SDP和改进SAM⁃MobileNetv2的滚动轴承故障诊断方法研究
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作者 张天缘 孙虎儿 +1 位作者 朱继扬 赵扬 《机械强度》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期787-794,共8页
针对传统的滚动轴承故障诊断方法难以准确高效的实现故障分类,提出了一种融合对称点模式(Symmetrized Dot Pattern,SDP)和改进SAM⁃MobileNetv2的滚动轴承故障分类方法。首先,将轴承振动信号通过SDP算法转化为含有丰富特征信息的二维图... 针对传统的滚动轴承故障诊断方法难以准确高效的实现故障分类,提出了一种融合对称点模式(Symmetrized Dot Pattern,SDP)和改进SAM⁃MobileNetv2的滚动轴承故障分类方法。首先,将轴承振动信号通过SDP算法转化为含有丰富特征信息的二维图像。然后,将二维图像输入到改进SAM⁃MobileNetv2网络模型中,对故障特征信息进行提取和分类。在改进SAM⁃MobileNetv2网络中,使用自适应激活函数ACON(Activate or not)对SAM⁃MobileNetv2中的ReLU6激活函数进行替换,提高模型分类性能。最后,将本模型与多种网络模型做对比。试验结果表明,本模型可以准确高效地实现对滚动轴承故障的分类,使用凯斯西储大学轴承故障数据的准确率为99.5%,使用渥太华大学轴承故障数据的准确率为97.2%。 展开更多
关键词 滚动轴承 对称点模式 SAM⁃MobileNetv2模型 故障诊断
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集胞蓝细菌PCC6803中非生物胁迫响应的核心基因分析
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作者 程亚蕊 黄世鹏 +2 位作者 张天缘 建猛 王锋尖 《高师理科学刊》 2023年第11期50-55,共6页
以集胞蓝细菌PCC6803的多组转录组数据为对象,鉴定蓝细菌在非生物胁迫下共同表达的核心差异基因(CDGs).结果表明,9个对氮、铁、碳、磷缺乏响应的CDGs被鉴定.京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析表明,氮代谢、ABC转运蛋白和氨基酸代谢与... 以集胞蓝细菌PCC6803的多组转录组数据为对象,鉴定蓝细菌在非生物胁迫下共同表达的核心差异基因(CDGs).结果表明,9个对氮、铁、碳、磷缺乏响应的CDGs被鉴定.京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析表明,氮代谢、ABC转运蛋白和氨基酸代谢与营养缺乏有关.研究还鉴定了热激处理下共同表达的CDGs,并且代谢通路ABC转运蛋白和碳固定也与热胁迫相关.同时构建了CDGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络,以预测基因在应对胁迫可能的响应机制.这些候选基因库将有助于加速理解蓝细菌在应激中的调控模式. 展开更多
关键词 集胞蓝细菌PCC6803 非生物胁迫 核心差异基因 KEGG 蛋白互作
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中国紫苏籽粒性状及对品质产量的影响分析 被引量:2
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作者 商志伟 杨仕梅 +9 位作者 张天缘 徐静 王仙萍 温贺 杨森 田飞 王文华 沈奇 《种子》 北大核心 2021年第12期61-67,74,F0002,共9页
为了明确紫苏籽粒表型性状与其分类、品质产量间的相关性,为紫苏资源开发及品种选育提供依据,对431份中国紫苏的籽粒形态特征(大小、千粒重、颜色、脊纹、硬度),品质(含油量及亚麻酸)及产量进行考察及分析。结果表明,供试6个指标变异系... 为了明确紫苏籽粒表型性状与其分类、品质产量间的相关性,为紫苏资源开发及品种选育提供依据,对431份中国紫苏的籽粒形态特征(大小、千粒重、颜色、脊纹、硬度),品质(含油量及亚麻酸)及产量进行考察及分析。结果表明,供试6个指标变异系数从大到小分别为单株产量、千粒重、硬度、含油量、籽粒大小、α-亚麻酸含量。相关性分析表明籽粒千粒重、大小、硬度与籽粒含油量品质相关性较高。产量与品质性状也表现为显著正相关。通过籽粒特征进行的聚类分析可以有效的对材料进行分类利用。籽粒特征聚类与种质分类有一定的联系,但是种质来源地点与籽粒特征聚类联系不大。主成分分析表明,千粒重、种子大小、含油量及单株产量指向相近。以上分析表明可以采用籽粒表型指标作为品质育种的初判指标,且在育种中可选择兼顾大粒、高油及高产的选育目标。 展开更多
关键词 紫苏 籽粒性状 品质 产量 聚类分析
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基于核基因分子多态性的葡萄属物种鉴定 被引量:1
4
作者 张天缘 王白石 +8 位作者 宋驰 燕君 徐小玉 杨雪莹 刘开会 彭笑天 裴黎 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期569-574,共6页
葡萄属(Vitis)植物主要分布于东亚、北美洲以及欧洲至中亚地区。由于葡萄主要采用无性繁殖方式,地区间品种交流较多,同名异物及同物异名现象较为普遍,给葡萄属物种的分类、鉴定造成一定困难。本研究通过序列同源性比对的方法对葡萄属4... 葡萄属(Vitis)植物主要分布于东亚、北美洲以及欧洲至中亚地区。由于葡萄主要采用无性繁殖方式,地区间品种交流较多,同名异物及同物异名现象较为普遍,给葡萄属物种的分类、鉴定造成一定困难。本研究通过序列同源性比对的方法对葡萄属4种植物基因组的保守编码区进行比对,挖掘保守序列93条,经过验证,找到了一条可用于开发多态性分子标记的KOG3174同源序列,并根据该序列设计得到3对引物,可用于4种葡萄的分类、鉴定。 展开更多
关键词 葡萄属 单核苷酸多态性 保守序列
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紫苏EST-SSR分布特征及标记开发 被引量:4
5
作者 张天缘 宋莉 沈奇 《贵州农业科学》 CAS 2017年第9期114-118,共5页
为了解紫苏属植物的遗传多样性,为种质资源的开发利用提供依据,利用软件MISA对从NCBI上获取的5 435条EST序列进行紫苏SSR分析。结果表明:在1 206条EST序列中得到符合条件的SSR为22.19%;共检出1 526个SSR位点,平均覆盖深度为28.87%;EST-... 为了解紫苏属植物的遗传多样性,为种质资源的开发利用提供依据,利用软件MISA对从NCBI上获取的5 435条EST序列进行紫苏SSR分析。结果表明:在1 206条EST序列中得到符合条件的SSR为22.19%;共检出1 526个SSR位点,平均覆盖深度为28.87%;EST-SSR有32种重复基元,以二核苷酸重复基元AG/CT最多,占检出总SSR的34.73%;包含低级基元单核苷酸重复、二核苷酸重复和三核苷酸重复,其长度在20bp以上的EST-SSR有386条。最终设计获得包含单核苷酸重复、二核苷酸重复和三核苷酸重复低级基元的SSR引物723条。 展开更多
关键词 紫苏 EST-SSR 分子特征 标记开发
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基于i5系统的柔性加工单元刀具寿命管理系统 被引量:1
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作者 赵科学 赵元 +4 位作者 刘业峰 陆潇俊 李合川 张天缘 成建峰 《工具技术》 2020年第8期34-38,共5页
在柔性加工自动线内,刀具受环境影响的因素较多,刀具状态不易监控。针对以上问题,基于i5系统搭建一套柔性加工单元的刀具寿命管理系统,并融合了MES系统、i5智能机床和柔性加工单元等先进技术。该系统利用雷尼绍接触式测头采集自动线内... 在柔性加工自动线内,刀具受环境影响的因素较多,刀具状态不易监控。针对以上问题,基于i5系统搭建一套柔性加工单元的刀具寿命管理系统,并融合了MES系统、i5智能机床和柔性加工单元等先进技术。该系统利用雷尼绍接触式测头采集自动线内的刀具数据,并利用EntherCat总线通过MES系统远程监测刀具破损状态。该刀具测量与磨损评价系统已经在端盖产品柔性加工单元中稳定运行,试验结果表明:整体硬质合金钻刀具在端盖产品加工410件以内时,符合三坐标检测要求;刀具寿命与基于泰勒展开的刀具磨损理论计算相符。 展开更多
关键词 刀具寿命管理 柔性加工单元 i5智能系统
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紫苏密码子偏好性分析及fad3基因的异源表达预测 被引量:1
7
作者 张天缘 沈奇 宋莉 《山地农业生物学报》 2017年第5期14-21,共8页
紫苏α-亚麻酸(ALA)含量极高,其合成相关基因偏好性及异源表达宿主的阐明,是揭示紫苏不饱和脂肪酸调控机制及表达生产的重要前提。本研究从密码子特性、有效密码子数、相对使用度、最优密码子、碱基相关性、奇偶偏好性及异源表达特性等... 紫苏α-亚麻酸(ALA)含量极高,其合成相关基因偏好性及异源表达宿主的阐明,是揭示紫苏不饱和脂肪酸调控机制及表达生产的重要前提。本研究从密码子特性、有效密码子数、相对使用度、最优密码子、碱基相关性、奇偶偏好性及异源表达特性等方面,对不同形成时期的紫苏种子转录组序列进行密码子偏好性分析,并对筛选出的pf FAD3s基因进行三种微生物异源表达预测分析比较。结果表明:紫苏转录核酸序列中的GC含量为45.85%,大部分基因密码子偏好性相对较弱,其蛋白编码基因密码子偏好以A/T结尾;pf FAD3s基因异源表达的适宜微生物宿主为酿酒酵母。分析结果为进一步研究紫苏ALA合成的分子调控奠定了基础,并为其微生物基因工程生产提供了一定依据。 展开更多
关键词 紫苏 密码子偏好性 异源表达
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山药根际土壤微生物16S rRNA多样性及影响因素 被引量:18
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作者 红霞 舒雅 +1 位作者 玉涛 张天缘 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1235-1246,共12页
通过采集山药连作2年的植株根际土壤及根茎,采用高通量测序技术研究根际土壤细菌多样性,分析7个样本中菌群的组成、丰度、α多样性、β多样性、菌群差异性。采用典型相关分析(Canonical Correlation Analysis,CCA)分析优势菌群与土壤化... 通过采集山药连作2年的植株根际土壤及根茎,采用高通量测序技术研究根际土壤细菌多样性,分析7个样本中菌群的组成、丰度、α多样性、β多样性、菌群差异性。采用典型相关分析(Canonical Correlation Analysis,CCA)分析优势菌群与土壤化学因子、根茎糖类物质的关系,探讨根际土壤中细菌群落与土壤化学指标、根茎糖类物质的相关性。结果表明:山药根际土壤细菌优势群落为变形菌、绿弯菌、酸杆菌、放线菌;土壤pH是影响细菌群落结构及分布的重要因子;酸杆菌和硝化螺旋菌与土壤中蔗糖酶、脲酶活性及总有机碳、碱解氮呈正相关,奇古菌和绿弯菌与土壤总有机碳、碱解氮呈正相关,土壤中碳、氮养分又与山药根茎中可溶性糖、粗多糖及淀粉呈正相关关系,说明这些微生态环境因子可能对山药根茎糖类物质积累有促进作用。 展开更多
关键词 山药 根际土壤 细菌群落 多样性 相关性
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百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析 被引量:5
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作者 丘日光 张天缘 +2 位作者 杨仕梅 宋莉 赵德刚 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期466-475,共10页
三胺酸环延伸(TALE)蛋白是一类在植物生长发育过程中调控分生组织分化的转录因子。本研究通过生物信息学手段从豆科模式植物百脉根(Lotus japonicus(Regel)K.Larsen)全基因组中筛选出分布于6条染色体上的40条TALE家族基因,并对其保守结... 三胺酸环延伸(TALE)蛋白是一类在植物生长发育过程中调控分生组织分化的转录因子。本研究通过生物信息学手段从豆科模式植物百脉根(Lotus japonicus(Regel)K.Larsen)全基因组中筛选出分布于6条染色体上的40条TALE家族基因,并对其保守结构域、基因结构、系统进化、在染色体上的分布、理化性质以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。根据结构域不同可将百脉根TALE家族分为BELL和KNOX两个亚族;百脉根TALE家族在进化上较为保守,分化上与大豆存在较大差异;该家族基因有外显子4~6个,氨基酸序列长度在271~792之间,家族成员蛋白均为弱酸性蛋白。Realtime PCR分析表明该家族基因表达与motif元件数之间存在相关性;BELL亚族主要在顶芽表达,KNOX亚族则主要在根组织中表达。研究结果为进一步克隆百脉根TALE基因和分析其功能奠定基础。 展开更多
关键词 百脉根 TALE转录因子家族 生物信息学 系统进化 基因表达
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计算机网络技术在电子信息工程中的应用 被引量:1
10
作者 张天缘 《数字技术与应用》 2018年第6期52-53,共2页
当前的计算机网络技术以及电子信息工程的发展都比较迅速,两者的联系也日益密切。电子信息工程的发展是时代发展的产物,更是时代发展的需求,而在此过程中计算机网络技术的迅速成熟对电子信息工程的进步也起到了重要的促进作用。本文先... 当前的计算机网络技术以及电子信息工程的发展都比较迅速,两者的联系也日益密切。电子信息工程的发展是时代发展的产物,更是时代发展的需求,而在此过程中计算机网络技术的迅速成熟对电子信息工程的进步也起到了重要的促进作用。本文先对电子信息工程以及计算机网络技术进行简要阐述,然后就电子信息工程的特征以及安全问题加以叙述,最后探究电子信息工程当中计算机网络技术的实际应用。希望能借助此次理论研究分析,对实际计算机网络技术的应用发展起到促进作用。 展开更多
关键词 电子信息工程 计算机网络 技术应用
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杜仲SQS基因的特征信息分析 被引量:4
11
作者 雷跃 杨仕梅 +2 位作者 张天缘 赵德刚 宋莉 《山地农业生物学报》 2019年第6期1-7,共7页
鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶。为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化... 鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶。为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析。从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5~6个外显子;EuSQS蛋白含396~440 aa,相对分子质量为45.73~49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近。分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据。 展开更多
关键词 杜仲鲨烯合酶基因 萜类化合物 生物信息学 基因结构 功能预测
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大肠杆菌茶氨酸合成酶基因γ-GGT的生物信息学分析 被引量:4
12
作者 吕晶晶 张天缘 +2 位作者 杨仕梅 宋莉 赵德刚 《山地农业生物学报》 2019年第1期74-78,共5页
γ-谷氨酰转肽酶(γ-GGT)是催化L-茶氨酸合成的关键酶之一,对其编码基因的解析有助于进行茶氨酸的合成调控和异源表达生产研究,本论文利用生物信息学方法,对大肠杆菌(Escherichia coli)γ-GGT基因的结构和特性进行分析。结果显示,E.coli... γ-谷氨酰转肽酶(γ-GGT)是催化L-茶氨酸合成的关键酶之一,对其编码基因的解析有助于进行茶氨酸的合成调控和异源表达生产研究,本论文利用生物信息学方法,对大肠杆菌(Escherichia coli)γ-GGT基因的结构和特性进行分析。结果显示,E.coliγ-GGT基因编码580个氨基酸,主要氨基酸为甘氨酸和亮氨酸,γ-GGT酶蛋白等电点为5.38,分子量为61.7 kDa,属于酸性不稳定亲水性蛋白,具有信号肽序列和保守功能结构域,在细胞质周质中发挥作用,其二级结构元件主要是α-螺旋和无规卷曲,在微生物中进化较为保守。研究结果为进一步研究γ-GGT基因功能及其应用奠定了基础。 展开更多
关键词 大肠杆菌 γ-谷氨酰胺转肽酶 茶氨酸合成 GGT酶蛋白 生物信息学
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高性能直流调速器在提升系统中的作用分析
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作者 张天缘 集春 +2 位作者 姚凯 迟晓庆 陈龙 《科学技术创新》 2019年第5期35-36,共2页
传统的用继电器、接触器组成的控制的电路系统,因为使用了大量的继电器,如果开关接触不良,容易出现故障。而PLC高性能直流调速器用软件来代替一般电路中的继电器,只剩下与输入输出有关的硬件,接线比继电器系统少的多,因此接触不良的问... 传统的用继电器、接触器组成的控制的电路系统,因为使用了大量的继电器,如果开关接触不良,容易出现故障。而PLC高性能直流调速器用软件来代替一般电路中的继电器,只剩下与输入输出有关的硬件,接线比继电器系统少的多,因此接触不良的问题会少的多。本文采用s7300PLC作为提升机的控制系统,从而达到减速度恒定的目的,有助于其进一步发展。 展开更多
关键词 高性能 调速器 提升系统
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沼山供电所:务实争先促进管理提升
14
作者 张天缘 兵辉 舒陈恩 《中国电力企业管理》 2024年第14期86-87,共2页
为解决小负荷台区异常指标被忽视、优质服务指标关注不足、服务要求和人员意识不匹配、养殖户供电风险等问题,国网湖北电力鄂州市梁子湖区供电公司沼山供电所采取常态化开展低电压治理、提升网格化服务工作质效、建立网格化服务工作标... 为解决小负荷台区异常指标被忽视、优质服务指标关注不足、服务要求和人员意识不匹配、养殖户供电风险等问题,国网湖北电力鄂州市梁子湖区供电公司沼山供电所采取常态化开展低电压治理、提升网格化服务工作质效、建立网格化服务工作标准等措施,持续提高服务能力和管理水平,为公司转型和乡村振兴贡献力量。国网湖北省电力有限公司鄂州市梁子湖区供电公司沼山供电所秉承“务实争先”工作理念,针对当前管理中容易忽视的小负荷台区运行异常、鱼塘养殖户供电风险等问题,提出以数字化手段提升网格化服务质效、建立服务标准、解决用户诉求和防范服务舆情的管理措施,持续提高服务能力和管理水平。 展开更多
关键词 乡村振兴 供电公司 网格化服务 供电所 梁子湖区 异常指标 沼山 运行异常
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贵州杜仲栽培群体遗传多样性及亲缘关系的SSR分析 被引量:9
15
作者 林开勤 李岩 +3 位作者 邹冰杰 张天缘 何选泽 赵德刚 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1521-1529,共9页
杜仲为第三纪子遗树种,是我国特有的国家二级重点保护植物。贵州是杜仲的主产区之一,其多个地区均有栽培然而对其遗传背景尚不了解。本研究应用15个SSRs标记分析了贵州杜仲栽培群体的遗传多样性及亲缘关系,12个群体295个个体共检测到82... 杜仲为第三纪子遗树种,是我国特有的国家二级重点保护植物。贵州是杜仲的主产区之一,其多个地区均有栽培然而对其遗传背景尚不了解。本研究应用15个SSRs标记分析了贵州杜仲栽培群体的遗传多样性及亲缘关系,12个群体295个个体共检测到82个等位基因,海个位点的等位基因数为3~10,其均值为5.467;每个群体的等位基因数na、期望杂合度He、Shannon指数Ⅰ的平均值分别为4.011、0.533和0.996,多态位点百分率PPL除LL群体和QNY群体为93.3%外其余10个群体的PPL都为100%,说明贵州杜仲群体具有较高的遗传多样性;湄潭群体MT和龙里群体LL的固定指数(F)平均值为负值,其余都为正值表明群体内的杂合子缺失,群体内存在近亲繁殖现象;群体间的遗传分化系数FST为0.0660,遗传变异主要分布在群体内;UPGMA聚类分析发现,聚类分组并未按地区位置而聚类,这可能是在栽培过程中人为选择的结果,QNY群体与其他11个群体的遗传距离最大,XY群体和RH群体的遗传距离最近。本研究应用SSR分子标记探明其遗传多样性与亲缘关系,为杜仲的合理保护、种质资源收集提供建议。 展开更多
关键词 杜仲 SSR分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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沼山供电所:以“组合拳”激发员工活力
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作者 舒陈恩 张天缘 刘恒 《中国电力企业管理》 2023年第8期74-75,共2页
国网湖北电力鄂州供电公司沼山供电所通过不断夯实管理基础,强化安全责任意识,拓展业务渠道,完善用电服务,多措并举,增强供电所综合竞争力。国网湖北省电力有限公司鄂州供电公司沼山供电所位于湖北省鄂州市梁子湖区的全国重点乡镇——... 国网湖北电力鄂州供电公司沼山供电所通过不断夯实管理基础,强化安全责任意识,拓展业务渠道,完善用电服务,多措并举,增强供电所综合竞争力。国网湖北省电力有限公司鄂州供电公司沼山供电所位于湖北省鄂州市梁子湖区的全国重点乡镇——沼山镇,该所辖区内含19个行政村(居委会),总户数16000余户。沼山供电所现有员工20人,平均年龄52.6岁,这让该所一度有“老年所”的称号。但就是这座“老年所”,却实现了供电可靠率99.9546%,并连续实现“200天线路零跳闸,两年设备零烧毁,三年客户零投诉、持续安全零事故”的“四零”目标。 展开更多
关键词 用电服务 总户数 综合竞争力 供电公司 供电所 安全责任意识 供电可靠率 湖北省鄂州市
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基于转录组数据对七叶树中三萜皂苷合成途径的研究 被引量:17
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作者 魏一丁 熊超 +6 位作者 张天缘 高翰 尹青岗 姚辉 孙伟 胡志刚 陈士林 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1135-1144,共10页
七叶树是七叶树科七叶树属高大乔木,集药用与观赏于一身。七叶树种子是其主要的药用部位,主要有效成分为齐墩果烷型三萜皂苷类化合物七叶皂苷。为了解七叶树三萜化合物生物合成的分子基础,该研究采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获... 七叶树是七叶树科七叶树属高大乔木,集药用与观赏于一身。七叶树种子是其主要的药用部位,主要有效成分为齐墩果烷型三萜皂苷类化合物七叶皂苷。为了解七叶树三萜化合物生物合成的分子基础,该研究采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得七叶树种子与花的转录组数据,并对其代谢途径相关基因进行挖掘;使用Trinity软件实现unigene的de novo拼接;并将转录组的测序结果运用KEGG数据库进行注释,从而预测七叶树三萜代谢的具体途径。结果显示七叶树转录组共有2个三萜代谢途径相关数据集,分别为萜类物质前体代谢途径(途径编号为ko00900)和倍半萜与三萜代谢途径(途径编号为ko00909),对应的基因分别有47,27条。进一步根据催化酶与活性产物的总结比较分析发现萜类物质前体代谢途径相关酶共有8种,三萜代谢途径相关酶有3种。该研究首次在七叶树中解析出5条与三萜环化酶对应的基因,它们可能参与β-香树精合成进而形成七叶皂苷。通过种子与花的转录组表达差异分析显示,ko00900和ko00909途径相关的差异基因有33个;相对于花器官,种子中有17个unigenes表达量上调,16个unigenes表达量下调。该研究运用qRT-PCR实验对SQE(Unigene25806),HMGS(Unigene36710),β-AS(Unigene33291) 3个差异显著的关键酶基因的表达进行了试验验证,实验结果qRT-PCR结果与转录组数据一致。该研究所发现的七叶树的三萜皂苷合成相关候选基因能对七叶树三萜代谢合成与调控方面提供理论依据。 展开更多
关键词 七叶树 转录组 β-香树精 差异表达 QRT-PCR 三萜代谢
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番茄TPS基因家族鉴定与分析 被引量:6
18
作者 杨仕梅 张天缘 +2 位作者 丘日光 宋莉 沈奇 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第16期5215-5223,共9页
萜类合成酶(terpenoid synthase, TPS)是植物中催化萜类物质合成的关键酶,在植物的生长发育及抗性调节中发挥着重要作用。本研究旨在对番茄萜类合成酶基因家族进行系统的鉴定及分析,为TPS基因的功能研究和利用提供数据参考。基于番茄的... 萜类合成酶(terpenoid synthase, TPS)是植物中催化萜类物质合成的关键酶,在植物的生长发育及抗性调节中发挥着重要作用。本研究旨在对番茄萜类合成酶基因家族进行系统的鉴定及分析,为TPS基因的功能研究和利用提供数据参考。基于番茄的全基因组测序结果鉴定TPS基因家族,运用生物信息学方法构建系统发育树,对其基因结构、染色体定位及进化选择压力等进行分析。共鉴定获得31条番茄TPS基因,包括7条未报道基因。系统发育树分析表明其分为5个亚族,且不均匀分布在11条染色体上,呈现串联重复。蛋白理化性质分析表明,番茄TPS基因为酸性的亲水性蛋白。对来源于TPS-a亚家族基因进行Ka/Ks分析,结果表明番茄TPS基因间在进化时主要受纯化选择作用。顺式作用元件分析表明其主要含有光响应,水杨酸响应及防御和应激反应顺式作用元件。通过对基因表达分析发现有18条TPS可表达,其中部分基因在根,茎,叶中均有上调表达。本研究对番茄TPS家族基因进行系统鉴定,预测及进化分析,对萜类合成及调控的研究具有重要的意义。 展开更多
关键词 番茄(Lycopersicon ESCULENTUM Mill.) TPS基因 基因家族 系统发育 表达分析
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大肠杆菌应激诱导基因表达谱芯片分析
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作者 周辉 唐静锋 +2 位作者 张天缘 宋莉 赵德刚 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期650-656,共7页
应激是影响微生物发酵生产的重要因素。为挖掘细菌耐热和化合物胁迫等调控相关基因,揭示微生物应激反应调控的分子机制,采用Affymetrix全基因组表达谱芯片,对42℃热激和0.1 mol/L CaCl2处理的大肠杆菌E. coli基因谱进行分析。结果表明,... 应激是影响微生物发酵生产的重要因素。为挖掘细菌耐热和化合物胁迫等调控相关基因,揭示微生物应激反应调控的分子机制,采用Affymetrix全基因组表达谱芯片,对42℃热激和0.1 mol/L CaCl2处理的大肠杆菌E. coli基因谱进行分析。结果表明,应激处理菌体中共有583个差异表达基因,包括374个表达量上调和209个表达量下调差异基因;GO功能分类将差异表达基因分为34类,大部分差异基因的分子功能覆盖结合、催化和转运等生物学活性;差异基因KEGG分析显示富集在28个通路,以ABC转运蛋白、鞭毛组装、双组分系统、尿素循环和氨基酸新陈代谢以及Ⅲ型分泌系统等通路为主要代表;应激胁迫的E. coli主要通过噬菌体休克蛋白操纵子(psp)基因进行逆境适应性转录调节,同时伴随着酶和氨基酸的合成基因以及细胞氧化还原态平衡基因的调控变化。 展开更多
关键词 大肠杆菌 应激 基因表达谱 芯片分析
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