目的应用高通量Affymetrix人类基因组U133A基因芯片,比较耐药细胞SKOV3/TAX与亲代细胞SKOV3间基因表达差异,筛查获得性紫杉醇卵巢癌耐药的相关基因,为进一步探讨卵巢癌肿瘤耐药机制及临床逆转耐药提供依据。方法取对数生长期SKOV3、SKOV...目的应用高通量Affymetrix人类基因组U133A基因芯片,比较耐药细胞SKOV3/TAX与亲代细胞SKOV3间基因表达差异,筛查获得性紫杉醇卵巢癌耐药的相关基因,为进一步探讨卵巢癌肿瘤耐药机制及临床逆转耐药提供依据。方法取对数生长期SKOV3、SKOV3/TPT细胞,按Trizol一步法抽提细胞总RNA,使用RNeasy Total RNA Isolationkit进一步纯化总RNA,合成双链cDNA,生物素进行标记,应用Affymetrix人类基因组U133A基因芯片,检测卵巢癌耐药细胞株SKOV3/TAX与敏感细胞株SKOV3细胞基因表达谱的变化,选择差异表达基因,在genbank中明确差异表达基因的功能,寻找与卵巢癌对紫杉醇耐药相关基因。结果基因芯片检测结果发现,与敏感细胞相比,有111条基因表达有显著性差异,包括45个上调基因和66个下调基因。涉及癌基因、DNA合成、修复、细胞信号和传递蛋白、蛋白翻译合成类以及细胞骨架和运动、离子通道蛋白、细胞代谢、发育相关等相关基因。与耐药有关的上调基因有CLU、BCL2L1、CD24、POR、BSG、SIRPA、PRKCA等;下调基因有YES1、CAV1、TGFBI、HSPH1等。结论部分基因表达差异与卵巢癌应用紫杉醇化疗耐药有关。展开更多
文摘目的应用高通量Affymetrix人类基因组U133A基因芯片,比较耐药细胞SKOV3/TAX与亲代细胞SKOV3间基因表达差异,筛查获得性紫杉醇卵巢癌耐药的相关基因,为进一步探讨卵巢癌肿瘤耐药机制及临床逆转耐药提供依据。方法取对数生长期SKOV3、SKOV3/TPT细胞,按Trizol一步法抽提细胞总RNA,使用RNeasy Total RNA Isolationkit进一步纯化总RNA,合成双链cDNA,生物素进行标记,应用Affymetrix人类基因组U133A基因芯片,检测卵巢癌耐药细胞株SKOV3/TAX与敏感细胞株SKOV3细胞基因表达谱的变化,选择差异表达基因,在genbank中明确差异表达基因的功能,寻找与卵巢癌对紫杉醇耐药相关基因。结果基因芯片检测结果发现,与敏感细胞相比,有111条基因表达有显著性差异,包括45个上调基因和66个下调基因。涉及癌基因、DNA合成、修复、细胞信号和传递蛋白、蛋白翻译合成类以及细胞骨架和运动、离子通道蛋白、细胞代谢、发育相关等相关基因。与耐药有关的上调基因有CLU、BCL2L1、CD24、POR、BSG、SIRPA、PRKCA等;下调基因有YES1、CAV1、TGFBI、HSPH1等。结论部分基因表达差异与卵巢癌应用紫杉醇化疗耐药有关。
