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巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02的毒理性与固氮能力
被引量:
5
1
作者
林标声
陈意
+2 位作者
罗茂春
张浣星
林占熺
《江苏农业科学》
2019年第24期258-261,共4页
为了研究巨菌草内生固氮菌(Klebsiella variicola)GN02的毒理性与固氮能力,通过小鼠经口毒性和大鼠经皮毒性试验,并以克雷伯菌(K.pneumoniae)特异性引物对GN02菌株进行血清型分型。结果表明,GN02菌株无明显的经口毒性和经皮毒性,不是临...
为了研究巨菌草内生固氮菌(Klebsiella variicola)GN02的毒理性与固氮能力,通过小鼠经口毒性和大鼠经皮毒性试验,并以克雷伯菌(K.pneumoniae)特异性引物对GN02菌株进行血清型分型。结果表明,GN02菌株无明显的经口毒性和经皮毒性,不是临床上流行肺炎克雷伯氏菌已有分型的强毒力菌株;GN02菌株在不同生长时期巨菌草根茎叶中均具有一定的固氮能力,其在各成熟期固氮率可达15%~27.27%,与其他禾本科植物所报道的固氮菌固氮效率基本相当。总之,GN02菌株安全、无毒,具有一定的固氮能力,可在农业生产中使用。
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关键词
巨菌草
内生固氮菌
Klebsiella
variicola
毒理性
固氮
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职称材料
巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
2
作者
林标声
张浣星
+2 位作者
何玉琴
罗茂春
林占熺
《湖北农业科学》
2020年第3期147-153,共7页
研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的...
研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的ORF,长度882 bp,编码293个氨基酸,NCBI GenBank登录号为MK131264。生物信息学分析表明,GN02菌株nifH基因具有高度保守性,与其他物种来源的nifH基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性均达到95%以上。nifH蛋白总相对分子量为31 970.73、理论等电点pI为4.72;跨膜模型倾向N-末端向外的由内到外的跨膜、整个多肽链表现为亲水性;有2个糖基化位点但无分泌信号肽,有可能存在螺旋卷曲结构;二级结构预测表明α-螺旋和无规则卷曲是其多肽链中的主要结构元件,延伸链散布于整个蛋白质中;在数据库中能对该蛋白进行三维同源建模。
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关键词
巨菌草(Pennisetum
giganteum)
内生固氮菌
KLEBSIELLA
variicola
NIFH基因
克隆
生物信息学
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职称材料
应用于水下生物识别的联合范数主成分分析算法
被引量:
2
3
作者
张浣星
王肖锋
武刚
《光电子.激光》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1067-1074,共8页
针对F范数对离群数据较为敏感,而L1范数能降低离群数据的影响,但无法有效控制重构误差的问题,本文将L1范数与F范数同时作为目标函数的距离度量方式,提出了二维主成分分析(two-dimensional principle component analysis,2DPCA)联合算法2...
针对F范数对离群数据较为敏感,而L1范数能降低离群数据的影响,但无法有效控制重构误差的问题,本文将L1范数与F范数同时作为目标函数的距离度量方式,提出了二维主成分分析(two-dimensional principle component analysis,2DPCA)联合算法2DPCA-F-L1,并给出了其非贪婪求解方法。该算法确保了对图像的分类能力,同时也降低了图像重构时的平均重构误差。本文将提出的2DPCA-F-L1算法在应用于水下生物图像识别时,可以抑制水下光学影像存在的噪声干扰。实验证明,该算法能够精确地识别水下生物的种类,并且在图像重构时相较于其他主成分分析(principle component analysis,PCA)算法具有更优的鲁棒性。
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关键词
主成分分析(PCA)
生物识别
图像识别
鲁棒性
联合范数
原文传递
题名
巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02的毒理性与固氮能力
被引量:
5
1
作者
林标声
陈意
罗茂春
张浣星
林占熺
机构
龙岩学院生命科学学院
福建农林大学生命科学学院
国家菌草工程技术研究中心
奥兰多(杭州)实业有限公司
出处
《江苏农业科学》
2019年第24期258-261,共4页
基金
中央引导地方科技发展专项(编号:2018L3003)
福建省大学生创新创业训练计划(编号:201811312007)
文摘
为了研究巨菌草内生固氮菌(Klebsiella variicola)GN02的毒理性与固氮能力,通过小鼠经口毒性和大鼠经皮毒性试验,并以克雷伯菌(K.pneumoniae)特异性引物对GN02菌株进行血清型分型。结果表明,GN02菌株无明显的经口毒性和经皮毒性,不是临床上流行肺炎克雷伯氏菌已有分型的强毒力菌株;GN02菌株在不同生长时期巨菌草根茎叶中均具有一定的固氮能力,其在各成熟期固氮率可达15%~27.27%,与其他禾本科植物所报道的固氮菌固氮效率基本相当。总之,GN02菌株安全、无毒,具有一定的固氮能力,可在农业生产中使用。
关键词
巨菌草
内生固氮菌
Klebsiella
variicola
毒理性
固氮
分类号
Q945.13 [生物学—植物学]
S182 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
2
作者
林标声
张浣星
何玉琴
罗茂春
林占熺
机构
龙岩学院生命科学学院
福建农林大学生命科学学院
奥兰多(杭州)实业有限公司
国家菌草工程技术研究中心
出处
《湖北农业科学》
2020年第3期147-153,共7页
基金
中央引导地方科技发展专项(2018L3003)。
文摘
研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的ORF,长度882 bp,编码293个氨基酸,NCBI GenBank登录号为MK131264。生物信息学分析表明,GN02菌株nifH基因具有高度保守性,与其他物种来源的nifH基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性均达到95%以上。nifH蛋白总相对分子量为31 970.73、理论等电点pI为4.72;跨膜模型倾向N-末端向外的由内到外的跨膜、整个多肽链表现为亲水性;有2个糖基化位点但无分泌信号肽,有可能存在螺旋卷曲结构;二级结构预测表明α-螺旋和无规则卷曲是其多肽链中的主要结构元件,延伸链散布于整个蛋白质中;在数据库中能对该蛋白进行三维同源建模。
关键词
巨菌草(Pennisetum
giganteum)
内生固氮菌
KLEBSIELLA
variicola
NIFH基因
克隆
生物信息学
Keywords
Pennisetum giganteum
endophytic nitrogen-fixing bacteria
Klebsiella variicola
nifH gene
cloning
bioinformatics
分类号
S543.9 [农业科学—作物学]
Q939.113 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
应用于水下生物识别的联合范数主成分分析算法
被引量:
2
3
作者
张浣星
王肖锋
武刚
机构
天津市先进机电系统设计与智能控制重点实验室
机电工程国家级实验教学示范中心
出处
《光电子.激光》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1067-1074,共8页
基金
国家重点研发计划(2018AA0103004)
天津市科技计划重大专项(20YFZCGX00550)资助项目
文摘
针对F范数对离群数据较为敏感,而L1范数能降低离群数据的影响,但无法有效控制重构误差的问题,本文将L1范数与F范数同时作为目标函数的距离度量方式,提出了二维主成分分析(two-dimensional principle component analysis,2DPCA)联合算法2DPCA-F-L1,并给出了其非贪婪求解方法。该算法确保了对图像的分类能力,同时也降低了图像重构时的平均重构误差。本文将提出的2DPCA-F-L1算法在应用于水下生物图像识别时,可以抑制水下光学影像存在的噪声干扰。实验证明,该算法能够精确地识别水下生物的种类,并且在图像重构时相较于其他主成分分析(principle component analysis,PCA)算法具有更优的鲁棒性。
关键词
主成分分析(PCA)
生物识别
图像识别
鲁棒性
联合范数
Keywords
principal component analysis(PCA)
biometric recognition
image recognition
robustness
joint norm
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02的毒理性与固氮能力
林标声
陈意
罗茂春
张浣星
林占熺
《江苏农业科学》
2019
5
下载PDF
职称材料
2
巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
林标声
张浣星
何玉琴
罗茂春
林占熺
《湖北农业科学》
2020
0
下载PDF
职称材料
3
应用于水下生物识别的联合范数主成分分析算法
张浣星
王肖锋
武刚
《光电子.激光》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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