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2014-2018年新疆人感染H7N9禽流感分子流行病学特征分析
1
作者 郜振国 马合木提 +6 位作者 赵俊 黄佳 张璇 陈媛 丽娜·吐尔逊巴依 李泉希 马鑫 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期774-781,共8页
目的分析2014-2018年新疆14例人感染H7N9禽流感病例的分子流行病学特征,为防控及治疗提供科学依据。方法提取核酸后采用高通量基因测序技术获得基因组序列,并用生物信息学分析软件对基因组序列进行同源性分析、进化分析、变异位点分析... 目的分析2014-2018年新疆14例人感染H7N9禽流感病例的分子流行病学特征,为防控及治疗提供科学依据。方法提取核酸后采用高通量基因测序技术获得基因组序列,并用生物信息学分析软件对基因组序列进行同源性分析、进化分析、变异位点分析及同源建模。结果14例人感染H7N9禽流感病毒HA基因核苷酸同源性介于97.39%~100%,氨基酸同源性介于98.38%~100%;NA基因核苷酸同源性介于97.73%~100%,氨基酸同源性介于97.73%~100%,均属于长江三角洲谱系和低致病性禽流感病毒,分属于2个亚分支,与A/Hunan/02650/2016疫苗株最为接近。HA蛋白G186V、T160A全部发生了变异,Q226L中13株病毒发生了变异,NA蛋白4个关键的神经氨酸酶抑制剂耐药位点全部未发生变异。M2蛋白S31N和V27A位点全部发生了突变,PB1蛋白T368V位点全部发生了突变,PA蛋白位点K356R全部发生了突变。结论新疆H7N9禽流感病毒具有双受体结合性,对金刚烷胺类药物耐药,对神经氨酸酶抑制剂敏感,可在疾病发生早期及时使用神经氨酸酶抑制剂。需加强禽流感病毒基因组变化的监测,做好基因突变的应对措施。 展开更多
关键词 禽流感 H7N9 分子流行病学
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2018—2022年新疆维吾尔自治区手足口病流行特征分析 被引量：2
2
作者 尼格德力·阿力腾赛尔 张璇 +5 位作者 陈媛 李泉希 珲德孜·阿吾西 赵俊 黄蕊芳 马鑫 《热带病与寄生虫学》 CAS 2023年第4期191-194,215,共5页
目的分析新疆手足口病流行特征,为当地手足口病防控提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统收集2018—2022年新疆手足口病相关资料,从各地(市、州)疾病预防控制中心获取病原学资料,使用描述流行病学方法对新疆手足口病的三间... 目的分析新疆手足口病流行特征,为当地手足口病防控提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统收集2018—2022年新疆手足口病相关资料,从各地(市、州)疾病预防控制中心获取病原学资料,使用描述流行病学方法对新疆手足口病的三间分布和病原学特征进行分析。结果2018—2022年新疆累计报告手足口病22817例,其中重症11例,无死亡病例;平均发病率为18.69/10万,历年报告发病率为1.52/10万~42.90/10万。2018、2019和2021年发病呈双峰分布,分别为5—7月和9—11月两个高峰;2020年全年未出现发病高峰;2022年仅有4—7月一个发病高峰。男性报告病例数和平均发病率(13587例,22.64/10万)均高于女性(9230例,15.48/10万);5岁及以下儿童是发病的主要人群(18736例,占82.11%);不同职业中托幼儿童报告病例数最多(10386例,占45.52%),其后为散居儿童(9703例,占42.53%)和学生(2379例,占10.43%)。克拉玛依市、博尔塔拉蒙古自治州和塔城地区的发病率居全区前3位。报告的4350例实验室诊断病例中,肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV-A71)、柯萨奇病毒A组16型(coxasckievirus A16,CV-A16)和其他肠道病毒构成比分别为5.22%(227/4350)、25.59%(1113/4350)和69.20%(3010/4350),其他肠道病毒是造成重症病例的主要病原型别。结论新疆手足口病发病率总体呈下降趋势,其他肠道病毒取代了EV-A71和CV-A16成为主要病原体。应进一步落实各项防控措施并加强对手足口病病原的监测。 展开更多
关键词 手足口病 流行病学特征 病原学特征 新疆维吾尔自治区
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2022—2023年新疆甲型H3N2流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因特征分析
3
作者 陈媛 张璇 +3 位作者 李泉希 尼格德力·阿力腾赛尔 米日扎提·努尔买买提 马鑫 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2024年第4期334-339,共6页
目的分析新疆2022—2023年甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征,为流感防控提供科学依据。方法从新疆15家国家级流感监测网络实验室分离上送的甲型H3N2流感毒株中随机选取15株,用二代... 目的分析新疆2022—2023年甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征,为流感防控提供科学依据。方法从新疆15家国家级流感监测网络实验室分离上送的甲型H3N2流感毒株中随机选取15株,用二代测序技术进行HA和NA基因组序列测定,用Mega X和BioEdit软件进行基因序列特征及同源性分析。结果15株甲型H3N2流感病毒HA和NA基因序列与世界卫生组织推荐疫苗株A/Darwin/9/2021相比,核苷酸同源性为98.2%~98.4%、99.3%~99.4%,氨基酸同源性为97.8%~98.0%、99.3%~99.5%;系统进化树分析表明,甲型H3N2流感毒株与疫苗株有较高的亲缘关系,共同归属于3C.2al分支。所有分离株HA基因共涉及8个氨基酸突变位点,仅I156K(15/15)涉及HA蛋白的B区,N138D(12/15)发生在受体结合位点130环,其余6个均为非关键位点的改变;NA基因共发生3个氨基酸位点突变,但均不属于已报道的与耐药相关的关键性突变位点。结论2022—2023年新疆甲型H3N2流感病毒株的HA和NA基因与世界卫生组织当年推荐的疫苗株亲缘关系较近,未出现抗原漂移和耐药毒株。 展开更多
关键词 甲型H3N2流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 基因
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2006⁃2020年新疆分离的H3N2亚型流感病毒HA基因特征分析 被引量：4
4
作者 赵俊 张璇 +6 位作者 陈媛 郜振国 丽娜·吐尔逊巴依 尼格德力·阿力腾赛尔 李泉希 珲德孜·阿吾西 马鑫 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期971-979,共9页
分析新疆2006⁃2020年甲型H3N2流感病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)基因的遗传变异特征。选取新疆2006年10月⁃2020年3月分离的32株H3N2流感毒株,进行核酸提取、HA基因扩增和测序,用CExpress软件进行拼接,MEGA⁃X软件进行数据整理,beast软件... 分析新疆2006⁃2020年甲型H3N2流感病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)基因的遗传变异特征。选取新疆2006年10月⁃2020年3月分离的32株H3N2流感毒株,进行核酸提取、HA基因扩增和测序,用CExpress软件进行拼接,MEGA⁃X软件进行数据整理,beast软件构建系统进化树,用P⁃epitope模型评估疫苗的有效性。新疆2006⁃2020年检测阳性样本中H3N2亚型在2006⁃2007、2010⁃2011、2012⁃2013、2014⁃2015、2016⁃2017、2019⁃2020年占比分别为77.78%、57.16%、64.53%、80.48%、87.35%、74.56%。H3N2流感病毒优势流行株2011年前以为A/Brisbane/10/2007类似株分支和A/Perth/16/2009(group1)分支为主,2011年后以3C分支为主。系统进化树分析显示,同一监测年度的流行株基本呈现集中分布。分子特征显示与疫苗株A/California/7/2004相比HA蛋白共有55个氨基酸位点变异,其中HA1和HA2分别占45和9个,HA1氨基酸的变异位点中28个位于抗原决定簇,5个抗原决定簇均发生变异,受体结合位点在135、137、225发生变异;2013⁃2020年RBS左侧壁发生N225D回复突变,128、138、193位存在回复突变分别为T⁃A⁃T、S⁃A⁃S、S⁃F⁃S,2014⁃2015年本地流行株与疫苗株A/Texas/50/2012相比A区、B区发生A138S、R142G、N145S、N128A、F159S突变,2015⁃2016年本地流行株与疫苗株A/Switzerland/9715293/2013相比A区、B区发生S138A、R140I、G142R、N144S、A128T、S159Y、K160T、V186G突变,2019⁃2020年本地流行株与疫苗株A/Kansas/14/2017相比A区、B区发生T135K、S137F、K144S、S159Y、K160T、N190D突变;糖基化位点自2006年10月⁃2020年3月变化增加,糖基化位点最多的集中在3C分支存在13个糖基化位点,3C分支均增加了45NSS糖基化位点,仅3C.2和3C.2a1分支存在158NYT且114NNS消失。新疆2006⁃2020年甲型H3N2流感病毒HA基因不断发生突变,出现了抗原漂移,部分流行株与当年推荐疫苗株匹配程度降低,流感网络实验室连续开展流感监测,有助于及早发现流感病毒的变异特征。 展开更多
关键词 甲型H3N2流感病毒 血凝素 分子特征 进化分析
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2021年新疆Z幼儿园一起由GⅡ型诺如病毒引起的急性胃肠炎疫情调查 被引量：3
5
作者 张璇 陈媛 +6 位作者 赵俊 李泉希 苏静 美丽坎 郭旭 穆巴拉克 马鑫 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2023年第1期87-91,共5页
目的 调查分析2021年5月新疆Z幼儿园诺如病毒聚集性疫情流行特征、传播途径和危险因素,为疫情防控提供参考。方法 采用现场流行病学调查方法查明本次疫情发生的原因,通过描述性流行病学方法和病例对照研究分析本次疫情的流行特征及暴发... 目的 调查分析2021年5月新疆Z幼儿园诺如病毒聚集性疫情流行特征、传播途径和危险因素,为疫情防控提供参考。方法 采用现场流行病学调查方法查明本次疫情发生的原因,通过描述性流行病学方法和病例对照研究分析本次疫情的流行特征及暴发的危险因素,采集病例及部分教职员工粪便样本及环境涂抹物,用实时荧光PCR方法检测诺如病毒。结果 本次疫情中病例包括41名幼儿和2名教师,罹患率分别为8.49%(41/482)和3.70%(2/54);病例涉及4个班级,主要分布在大四班,罹患率63.41%(26/41),男女性罹患率差异无统计学意义(χ^(2)=0.0004,P>0.05);病例症状以呕吐(97.67%)、恶心(81.4%)、腹痛(67.44%)和发热(58.14%)为主;首末例病例发病时间分别为5月17日3∶00和5月21日23∶00,发病高峰集中在19-20日,流行曲线显示为点源模式。采集病例和病例所在班级老师、食堂工作人员粪便样本59份,及16份环境涂抹物,其中20份粪便和1份大四班水桶把手涂抹物为GII型诺如病毒核酸阳性。病例对照研究显示,60.47%(26/43)的病例近距离暴露于患者呕吐物,为暴发危险因素(OR=4.77,95%CI:1.70~13.34,P<0.05),其余危险因素与发病无统计学关联。结论 本次疫情为GII型诺如病毒感染引起的暴发疫情,排除食物、水引起的传播,近距离暴露于患者呕吐物及呕吐物处置不规范是引起本次疫情扩散的可能原因。 展开更多
关键词 诺如病毒 疫情 急性胃肠炎 病例对照
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2021—2022年新疆乙型流感病毒Victoria系耐药基因分析 被引量：1
6
作者 陈媛 张璇 +4 位作者 赵俊 尼格德力·阿力腾赛尔 李泉希 珲德孜·阿吾西 马鑫 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2023年第3期206-211,共6页
目的分析新疆乙型流感病毒Victoria(BV)系耐药基因位点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病防控提供科学依据。方法从新疆15家流感监测网络实验室2021—2022年分离上送至新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心的506株BV系流感毒株中随机选取30... 目的分析新疆乙型流感病毒Victoria(BV)系耐药基因位点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病防控提供科学依据。方法从新疆15家流感监测网络实验室2021—2022年分离上送至新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心的506株BV系流感毒株中随机选取30株,用荧光发光法检测病毒对奥司他韦和扎那米韦的敏感性,同时用RT-PCR方法扩增神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因,用Mega X和BioEdit软件进行NA基因特性分析。结果未发现对奥司他韦和扎那米韦耐药的流感毒株;与世界卫生组织推荐疫苗株B/Washington/02/2019相比,核苷酸同源性为98.8%~99.1%,氨基酸同源性为98.3%~98.9%;进化树显示,30株流感毒株与疫苗株聚为同一分支,共同归属于Victoria Clade 1A分支,远离国内外BV系流感耐药株;30株BV系流感毒株NA区域核苷酸序列全长1401 nt,编码466个氨基酸,所有毒株的NA蛋白催化活性位点和辅助位点均未发生氨基酸替换。结论30株BV系流感毒株均对神经氨酸酶抑制剂药物敏感,但仍应加强对流感病毒的耐药性监测,及时发现敏感性下降和耐药的流感毒株。 展开更多
关键词 乙型流感病毒 耐药性 神经氨酸酶 神经氨酸酶抑制剂
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2021—2022年新疆乙型流感病毒Victoria系血凝素抗原性及基因特性研究
7
作者 陈媛 张璇 +3 位作者 赵俊 尼格德力·阿力腾赛尔 李泉希 马鑫 《职业与健康》 CAS 2023年第11期1473-1478,共6页
目的 了解新疆乙型流感病毒Victoria系(BV)血凝素(hemagglutinin,HA)抗原性及其基因特性。方法 从新疆15家流感监测网络实验室分离上送的BV系流感毒株中随机选取30株,以世界卫生组织推荐的BV流感疫苗株B/Washington/02/2019(2021—2022... 目的 了解新疆乙型流感病毒Victoria系(BV)血凝素(hemagglutinin,HA)抗原性及其基因特性。方法 从新疆15家流感监测网络实验室分离上送的BV系流感毒株中随机选取30株,以世界卫生组织推荐的BV流感疫苗株B/Washington/02/2019(2021—2022)为参考进行抗原性分析,并对上述毒株进行流感病毒全基因组测序,应用MEGA X和BioEdit软件分析HA基因进化特征。结果 与疫苗株相比,20.00%(6/30)流感毒株为类似株,80.00%(24/30)为低反应株;30株流感毒株HA基因在进化上与疫苗株亲缘关系较近,以162~164位三缺失为分支特征。与疫苗株相比,核苷酸和氨基酸同源性范围分别是93.0%~98.9%和94.0%~98.3%;30株流感毒株与疫苗株HA基因上共10个位点发生氨基酸变异,分别为D129K、R133G、E136R、E198K、A202K、K56T、T73V、Y179H、E183K、和N233D。结论 2021—2022年新疆流行的乙型流感毒株HA基因上与疫苗株亲缘关系较近,但因HA氨基酸位点发生多处变异可能导致疫苗保护效果不佳。因此,持续开展BV系流感病毒毒株抗原性分析及基因监测十分必要。 展开更多
关键词 乙型流感病毒 抗原性 基因特性
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