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基于专利文献计量学的陇药专利信息研究
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作者 吴雪 赵信科 +2 位作者 卢维杰 柏婷燕 李应东 《中国中医药图书情报杂志》 2024年第2期137-142,共6页
目的通过陇药专利申请情况分析陇药的研发能力,为甘肃省陇药的开发利用和创新提供战略建议。方法以专利之星数据库、中国知网为检索平台,以计量学手段,对专利申请总量、申请地域、主要发明人、前沿热点等方面进行分析,利用Origin2021、V... 目的通过陇药专利申请情况分析陇药的研发能力,为甘肃省陇药的开发利用和创新提供战略建议。方法以专利之星数据库、中国知网为检索平台,以计量学手段,对专利申请总量、申请地域、主要发明人、前沿热点等方面进行分析,利用Origin2021、VOSviewer2022软件进行可视化展示。结果2012-2022年全国陇药专利共16417件,甘肃省陇药专利1743件,涉及陇药的国际专利有195件,专利量2016-2018年达到高峰期。申请量较多的有宁夏回族自治区和甘肃省,其研发力量主要集中在高校和科研院所,技术热点主要在活性成分、提取、制备等方面。结论陇药专利申请能力与陇药资源储备极不匹配,应当提高专利申请质量,“产、学、研”结合,提升陇药产品的研发能力及技术创新,增加市场的竞争力,提高国内外对陇药的认可度。 展开更多
关键词 陇药 专利计量学 可视化
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基于生物信息学未分化甲状腺癌LncRNA基因与免疫浸润机制及中药预测的研究
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作者 易希善 柏婷燕 +3 位作者 肖国庆 杨维杰 王苑铭 康学东 《辽宁中医杂志》 CAS 北大核心 2024年第2期6-11,I0001,I0002,共8页
目的基于GEO数据库对未分化甲状腺癌基因数据进行差异分析、基因富集分析和免疫浸润分析,为深入了解未分化甲状腺癌免疫相关机制及治疗提供理论依据。方法利用GEO数据库检索有关ATC的芯片,根据样本数量及芯片类型,筛选出符合条件的芯片... 目的基于GEO数据库对未分化甲状腺癌基因数据进行差异分析、基因富集分析和免疫浸润分析,为深入了解未分化甲状腺癌免疫相关机制及治疗提供理论依据。方法利用GEO数据库检索有关ATC的芯片,根据样本数量及芯片类型,筛选出符合条件的芯片,借助R语言软件筛选出符合条件的差异基因,筛选ATC中差异表达的lncRNA,构建LncRNA-miRNA-mRNA网络图,并构建蛋白质-蛋白质相互作用关系网络(PPI)并进行GO富集分析和KEGG通路分析。同时利用CIBERSORT反卷积法对22种免疫细胞在未分化甲状腺癌中的浸润情况进行分析。并通过Coremine Medical进行治疗中药预测。结果经检索GEO数据库找到编码为GSE65144的基因芯片,利用R语言分析筛选出LncRNA差异基因127个,其中上调基因51个,下调基因76个,并对差异基因绘制ceRNA网络;将得出的LncRNA进行PPI网络分析,筛选出核心基因20个,排名靠前的有MYC、JUN、EGLN3、KIF23、YWHAH。GO富集分析显示其参与了RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、细胞增殖的正调控、细胞迁移的正调控等生物学过程,KEGG主要富集通路为癌症信号通路、MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路等。免疫浸润结果显示甲状腺未分化癌(anaplastic thyroid carcinoma,ATC)中巨噬细胞M0和巨噬细胞M2显著增高,而浆细胞和T细胞γ-δ显著减少。单核细胞和中性粒细胞呈显著正相关(r=0.90),活化的肥大细胞和中性粒细胞呈显著正相关(r=0.88),活化的肥大细胞和单核细胞呈显著正相关(r=0.72),嗜酸性粒细胞和CD_(4)T细胞呈显著正相关(r=0.72),T细胞γ-δ和滤泡辅助T细胞呈显著正相关(r=0.71)。并且,巨噬细胞M2和浆细胞呈显著负相关(r=-0.70),T细胞γ-δ和活化的树突状细胞呈显著负相关(r=-0.68),T细胞γ-δ和巨噬细胞M0呈显著负相关(r=-0.56)。预测中药主要集中在清热解毒药和补虚药,归经主要为肝、脾、肾经。结论ATC患者基因差异表达和免疫细胞浸润率的个体差异比较显著。在ATC肿瘤组织中具有高比例浸润的免疫细胞是其治疗的潜在目标。中药治疗是一个新的方向,有待后续的临床及基础实验加以验证。 展开更多
关键词 未分化甲状腺癌 生物信息学 长链非编码RNA 免疫浸润机制 中药预测
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TXNIP在糖尿病肾脏疾病中的作用机制及相关中医药诊疗进展
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作者 易希善 柏婷燕 +3 位作者 肖国庆 杨维杰 王苑铭 康学东 《中国中西医结合肾病杂志》 2024年第4期369-373,I0004,共6页
糖尿病肾脏疾病(diabetic kidney disease,DKD)是糖尿病最常见的并发症之一,与糖尿病患者的死亡率增加密切相关。据统计,2021年, 全球糖尿病患者数达到惊人的5.37亿。预计到2030年和2045年,这一数字将分别增加到5.8亿和7亿 [1,2] 。 根... 糖尿病肾脏疾病(diabetic kidney disease,DKD)是糖尿病最常见的并发症之一,与糖尿病患者的死亡率增加密切相关。据统计,2021年, 全球糖尿病患者数达到惊人的5.37亿。预计到2030年和2045年,这一数字将分别增加到5.8亿和7亿 [1,2] 。 根据美国疾病控制和预防中心的数据,2021年每7名美国人中就有1人患有慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD),而一半以上的CKD是由糖尿病发展而来的 [3] 。 展开更多
关键词 糖尿病肾脏疾病 慢性肾脏病 中医药诊疗 CKD
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基于网络药理学探讨山楂叶抗高脂血症作用机制及其分子对接验证 被引量:2
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作者 柏婷燕 刘凯 +5 位作者 赵信科 蒋虎刚 易希善 卢维杰 赵晓彬 李应东 《中医临床研究》 2022年第29期12-18,共7页
目的:基于网络药理学,采用数据挖掘的方法分析山楂叶治疗高脂血症的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得中药山楂叶的有效成分及其靶点;运用GeneGards和OMIM筛选与高脂血症相关的基因靶点,构建山楂叶与高脂... 目的:基于网络药理学,采用数据挖掘的方法分析山楂叶治疗高脂血症的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得中药山楂叶的有效成分及其靶点;运用GeneGards和OMIM筛选与高脂血症相关的基因靶点,构建山楂叶与高脂血症靶点的交集,获得作用靶点;构建药物-有效成分-疾病-靶点网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络。进一步分析靶点对应的生物作用、疾病及相关的信号通路,阐述山楂叶治疗高脂血症的作用机制。结果:共筛选出山楂叶作用于高脂血症的有效成分6个,分别为异鼠李素、槲皮素、山柰酚、豆甾醇、谷甾醇、表儿茶素等。获得蛋白质-蛋白质相互作用核心靶点有白细胞介素(Interleukin,IL)-6、过氧化物酶体增生激活受体γ(Peroxisome Proliferative Activated Receptorγ,PPARG)、胱冬酶(Caspase,CASP)3等共54个,涉及基因本体论(GO)生物学功能81个;治疗高脂血症的作用机制与153条通路相关,主要涉及脂质和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Receptor For Advanced Glycation End Products,RAGE)信号通路以及磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路等。结论:网络药理学研究表明山楂叶通过重要靶点和多个信号通路有效治疗高脂血症。 展开更多
关键词 山楂叶 高脂血症 网络药理学 作用机制
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芪苈强心胶囊联合美托洛尔治疗慢性心力衰竭有效性及安全性Meta分析和试验序贯分析 被引量:2
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作者 赵晓彬 王新强 +4 位作者 韩金宴 柏婷燕 汪鸣 蒋虎刚 赵信科 《实用中医内科杂志》 2022年第2期6-10,I0004-I0006,共8页
目的系统评价芪苈强心胶囊联合美托洛尔治疗慢性心力衰竭(CHF)临床疗效及安全性。方法计算机检索中国期刊全文数据库(CNKI)、万方期刊数据库(WanFang Data)、维普中文期刊数据库(VIP)、中国生物医学文献服务系统(SinoMed)、PubMed、The ... 目的系统评价芪苈强心胶囊联合美托洛尔治疗慢性心力衰竭(CHF)临床疗效及安全性。方法计算机检索中国期刊全文数据库(CNKI)、万方期刊数据库(WanFang Data)、维普中文期刊数据库(VIP)、中国生物医学文献服务系统(SinoMed)、PubMed、The Cochrane Library和Web of Science,检索时间均从建库至2021年2月所纳入的芪苈强心胶囊联合美托洛尔治疗CHF的临床随机对照试验(RCT)。采用Cochrane协作网的偏倚风险评估工具对纳入研究进行方法学质量评价,采用RevMan 5.3对结局指标进行Meta分析,并通过TSA0.9软件对临床总有效率进行试验序贯分析。结果共纳入17个RCTs,Meta分析结果显示:试验组在改善CHF患者左室射血分数(LVEF)[MD=6.40,95%CI(5.89,6.90),P<0.00001]、左室舒张末期内径(LVEDD)[MD=-5.27,95%CI(-6.93,-3.60),P<0.00001]、血浆脑钠肽(BNP)水平[SMD=-1.98,95%CI(-2.65,-1.32),P<0.00001]、静息时心室率(HR)[MD=-8.68,95%CI(-11.63,-5.72),P<0.00001]较对照组具有显著优势,且试验组较对照组不良反应发生率效小[RR=0.67,95%CI(0.52,0.89),P<0.01]。试验序贯分析显示,在临床总有效率方面,累计Z值均穿过了TSA界值和期望信息值,说明芪苈强心胶囊联合美托洛尔治疗CHF患者临床总有效率的Meta分析结果可靠。结论芪苈强心胶囊联合美托洛尔在改善CHF患者心功能及不良反应发生率方面较单纯应用美托洛尔具有优势。 展开更多
关键词 芪苈强心胶囊 慢性心力衰竭 META分析 试验序贯分析
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夏枯草治疗甲状腺结节的网络药理学分析及分子对接验证 被引量:10
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作者 易希善 康学东 +2 位作者 杨维杰 柏婷燕 肖国庆 《湖北民族大学学报(医学版)》 2022年第2期38-44,共7页
目的基于网络药理学,采用数据挖掘的方法分析夏枯草治疗甲状腺结节(Thyroid nodules)的作用机制。方法通过TCMSP平台获取夏枯草的活性成分及其作用靶点;在GeneCards和OMIM数据库中获取与甲状腺结节相关的基因靶点,与药物靶点相互映射,... 目的基于网络药理学,采用数据挖掘的方法分析夏枯草治疗甲状腺结节(Thyroid nodules)的作用机制。方法通过TCMSP平台获取夏枯草的活性成分及其作用靶点;在GeneCards和OMIM数据库中获取与甲状腺结节相关的基因靶点,与药物靶点相互映射,构筑共同作用靶点;利用Cytoscape 3.7.0软件和STRING数据库11.0获得相互作用(PPI)网络图并进行拓扑分析。进而对关键靶点行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,阐述夏枯草治疗甲状腺结节的作用机制。最后利用AUTODOCK 1.5.6软件进行分子对接可视化验证关键成分和蛋白的亲和力。结果共筛选出夏枯草作用于甲状腺结节的有效成分11个:槲皮素、木犀草素、山奈酚等。获得PPI核心靶点有白介素(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、胱天蛋白酶3(CASP3)等共68个,涉及GO生物学功能96个;治疗甲状腺结节的作用机制与117条通路相关,主要涉及PI3K-Akt、MAPK、TNF等通路。而分子对接结果显示关键成分如槲皮素、木犀草素、山奈酚与核心靶点IL-6、VEGFA、MAPK8、CASP3等有较高的亲和力。结论夏枯草通过多个靶点和多个信号通路发挥抗免疫、抗炎、抗病毒等作用有效治疗甲状腺结节。 展开更多
关键词 夏枯草 甲状腺结节 网络药理学 分子对接技术 作用机制
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基于网络药理学探讨甘姜苓术汤治疗纯湿型肥胖症的作用机制 被引量:1
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作者 易希善 康学东 +2 位作者 杨维杰 柏婷燕 肖国庆 《中医临床研究》 2022年第31期11-19,共9页
目的:运用网络药理学方法探讨甘姜苓术汤治疗纯湿型肥胖症潜在活性成分和作用机制。方法:依靠中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选甘姜苓术汤(茯苓、白术、干姜、甘草)有效成分,并在TCMSP平台上预测有效成分潜在靶点,同时利用Gen... 目的:运用网络药理学方法探讨甘姜苓术汤治疗纯湿型肥胖症潜在活性成分和作用机制。方法:依靠中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选甘姜苓术汤(茯苓、白术、干姜、甘草)有效成分,并在TCMSP平台上预测有效成分潜在靶点,同时利用GeneCards、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)数据库挖掘肥胖症相关靶点,将获取的活性成分靶点与疾病靶点取交集,得到甘姜苓术汤抗肥胖症的预测靶点。利用STRING平台构建预测靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络并结合Cytoscape 3.7.0探索其蛋白质功能模块;通过Metascape数据库对预测靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并以Cytoscape软件构建“药物-化合物-疾病-基因”网络,最后采用Antudock软件及Pymol软件对甘姜苓术汤的化学成分与重要靶点进行分子对接验证。结果:甘姜苓术汤抗肥胖的核心活性成分为松苓新酸、啤酒甾醇、α-香树脂醇、12α-甲基丁酰基-14-乙酰基-8-反式白术三醇等118个,核心靶点为雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、FOS原癌基因、网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A(RELA)、核受体共激活因子1(Nuclear Receptor Coactivator 1,NCOA1)、周期蛋白D1(Cyclin D1,CCND1)等。GO富集分析显示与对无机物的反应、细胞对激素刺激的反应、对酮的反应、对类固醇激素的反应等生物过程相关。KEGG富集共得到140条信号通路,涉及丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)信号通路、甲状腺激素信号通路、内分泌抵抗等。分子对接显示<-5.0 kcal/mol占总数的66.7%,验证结果显示多数成分与靶点结合活性稳定。结论:甘姜苓术汤抗纯湿型肥胖症具有多成分-多靶点-多通路的作用特点,尤其与内分泌抵抗、调节激素水平密切相关。 展开更多
关键词 甘姜苓术汤 网络药理学 分子对接 肥胖症 作用机制
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Ca^(2+)/CaM依赖性蛋白激酶Ⅱ在心力衰竭中的作用机制及中医药治疗应用进展
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作者 柏婷燕 易希善 +3 位作者 赵信科 刘凯 蒋虎刚 李应东 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第14期2023-2031,共9页
心力衰竭是一种常见的多发病,是各种心脏疾病发展的终末阶段,发病机制十分复杂,严重危害着人类健康。大量研究表明Ca^(2+)/CaM依赖性蛋白激酶Ⅱ(Ca^(2+)/Calmodulin dependent protein kinase Ⅱ,CaMKⅡ)在心力衰竭的发生发展中起着重... 心力衰竭是一种常见的多发病,是各种心脏疾病发展的终末阶段,发病机制十分复杂,严重危害着人类健康。大量研究表明Ca^(2+)/CaM依赖性蛋白激酶Ⅱ(Ca^(2+)/Calmodulin dependent protein kinase Ⅱ,CaMKⅡ)在心力衰竭的发生发展中起着重要的作用。中医药在防治心力衰竭方面具有独特优势和良好前景,其中有不少可靶向调节CaMKⅡ的复方和中药有效成分。本文就CaMKⅡ信号通路在衰竭心脏中的作用机制以及近年来中医药通过靶向调节CaMKⅡ信号防治心力衰竭研究进展作主要阐述,以期为临床中医药防治心力衰竭方面提供参考意见并拓展思路。 展开更多
关键词 心力衰竭 CaMKⅡ信号通路 作用机制 中医药 研究进展
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