旨为了解艾比湖湿地土壤中古菌的多样性及其群落结构组成。以艾比湖湿地博乐河入口土壤为样本,首次利用古菌特异性16S r DNA引物构建克隆文库。使用限制性内切酶AfaⅠ和MspⅠ对目的片段进行酶切分型(amplified r DNA restraction analys...旨为了解艾比湖湿地土壤中古菌的多样性及其群落结构组成。以艾比湖湿地博乐河入口土壤为样本,首次利用古菌特异性16S r DNA引物构建克隆文库。使用限制性内切酶AfaⅠ和MspⅠ对目的片段进行酶切分型(amplified r DNA restraction analysis,ARDRA),每种谱型随机选取若干阳性克隆子进行测序,序列比对构建古菌16S r DNA系统进化树。结果显示,测序得到的117条序列划分为61个OTUs,通过序列比对及系统发育分析归类为广古菌门(Euryarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)两大门类。广古菌门的盐杆菌科(Halobacteriaceae)为第一优势菌群,包括盐微菌属(Halomicrobium)、盐碱球菌属(Natronococcus)、盐碱团菌属(Halalkalicoccus)等10个属,共48个OTU(78.7%),阳性克隆子77个(63.6%)。艾比湖湿地博乐河入口土壤古菌多样性丰富并存在大量的潜在新种。展开更多
文摘旨为了解艾比湖湿地土壤中古菌的多样性及其群落结构组成。以艾比湖湿地博乐河入口土壤为样本,首次利用古菌特异性16S r DNA引物构建克隆文库。使用限制性内切酶AfaⅠ和MspⅠ对目的片段进行酶切分型(amplified r DNA restraction analysis,ARDRA),每种谱型随机选取若干阳性克隆子进行测序,序列比对构建古菌16S r DNA系统进化树。结果显示,测序得到的117条序列划分为61个OTUs,通过序列比对及系统发育分析归类为广古菌门(Euryarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)两大门类。广古菌门的盐杆菌科(Halobacteriaceae)为第一优势菌群,包括盐微菌属(Halomicrobium)、盐碱球菌属(Natronococcus)、盐碱团菌属(Halalkalicoccus)等10个属,共48个OTU(78.7%),阳性克隆子77个(63.6%)。艾比湖湿地博乐河入口土壤古菌多样性丰富并存在大量的潜在新种。
