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题名铁皮石斛14-3-3基因家族鉴定及表达分析
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作者
江林琪
赵佳莹
郑飞雄
姚馨怡
李效贤
俞振明
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机构
浙江中医药大学药学院
浙江中医药大学中医药科学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期229-241,共13页
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基金
国家自然科学基金项目(32000257)
浙江省自然科学基金项目(LY23H280003)
+1 种基金
浙江省大学生新苗人才计划(2023R410041,2023R410044)
广东省自然科学基金项目(2020A1515410004)。
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文摘
【目的】14-3-3蛋白,亦称通用调节因子(GRF),由多基因家族编码,在植物生长发育和逆境应答发挥关键的作用。鉴定铁皮石斛(Dendrobium officinale)GRF基因家族,为铁皮石斛GRF基因功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】通过生物信息学的方法鉴定铁皮石斛14-3-3家族成员,分析其理化性质、染色体定位、系统进化发育、基因结构和启动子顺式作用元件等,同时通过荧光定量PCR技术检测它们在不同组织、低温处理及盐胁迫处理后的表达量。【结果】铁皮石斛有17个GRF家族成员,分为ε类和非ε类亚族,不均匀地分布在7条染色体上,且存在7对串联复制基因。同一亚族成员基因结构、保守基序和蛋白质二级结构相类似。DoGRF家族基因的启动子区域存在大量激素和环境胁迫应答相关的调控元件。DoGRF家族基因在铁皮石斛各组织中均有表达,具有组织表达特异性,大多数基因在花器官中表达最高,其次是茎和根。同时,在低温处理、盐胁迫处理下呈现差异化表达,可能受到低温和盐胁迫的调控,特别是DoGRF2在铁皮石斛逆境应答过程中起着关键的作用。【结论】在全基因组水平从铁皮石斛中鉴定出17个DoGRF家族成员,不同基因对非生物胁迫响应不一,并具有器官表达特异性。DoGRF2对低温和盐胁迫呈现正向响应。
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关键词
铁皮石斛
14-3-3家族
基因表达
非生物胁迫
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Keywords
Dendrobium officinale
14-3-3 family
gene expression
abiotic stress
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分类号
S567.239
[农业科学—中草药栽培]
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