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口蹄疫病毒2c基因的克隆及表达 被引量：3
1
作者 江鹏斐 刘在新 +2 位作者 赵启祖 常惠芸 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期231-234,共4页
从O型口蹄疫病毒China98株病毒材料中克隆到了非结构蛋白 2C的基因 ,并成功地将该基因在大肠杆菌中进行了表达 ,为建立以基因工程产品为抗原、能区分人工免疫和自然感染动物的检疫方法提供了技术和材料条件。
关键词 口蹄疫病毒 非结构蛋白2C 检疫 基因克隆 基因表达 口蹄疫
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应用口蹄疫病毒非结构蛋白区分感染动物和注苗动物 被引量：10
2
作者 江鹏斐 谢庆阁 《中国兽医科技》 CSCD 1999年第12期47-48,共2页
关键词 口蹄疫病毒 动物传染病 非结构蛋白 注射疫苗
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2000年世界口蹄疫流行大事记 被引量：2
3
作者 江鹏斐 赵启祖 等 《预防兽医学进展》 2001年第3期49-53,共5页
关键词 2000年 口蹄疫 流行 防治 世界
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口蹄疫病毒株China/99 P3区一级结构及与参考毒株的比较分析 被引量：3
4
作者 张显升 赵启祖 +6 位作者 刘在新 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期606-610,共5页
用RT -PCR法 ,以口蹄疫病毒China/ 99感染的牛舌水泡皮为材料 ,扩增目的cDNA ,与pGEM TEasy载体连接并转化JM1 0 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,猪源毒在 3A基因内缺失 1 0个密码子 ,与牛源毒... 用RT -PCR法 ,以口蹄疫病毒China/ 99感染的牛舌水泡皮为材料 ,扩增目的cDNA ,与pGEM TEasy载体连接并转化JM1 0 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,猪源毒在 3A基因内缺失 1 0个密码子 ,与牛源毒的核苷酸和氨基酸序列差异较大。A G和T C的转换率较高 ,而且A G转换导致氨基酸变异的几率大于T C转换 ,它们是影响氨基酸稳定的因素之一。China/ 99P3区编码产物在第 8、1 2 0、1 2 1、1 2 7、1 32、1 93、493、50 1和 538位具有特征性氨基酸 ,可能与该毒株的表型如毒力等有关。 3A基因突变率较高 ,3B、3C和 3D较低 ,3D最为保守 ,这对维持 3C和 3D蛋白酶和 展开更多
关键词 口蹄疫 病毒株 China/99 P3区 一级结构 参考毒株
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口蹄疫病毒基因组内部核糖体进入位点一级和二级结构分析 被引量：3
5
作者 张显升 赵启祖 +6 位作者 刘在新 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期142-148,共7页
以口蹄疫病毒 (foot-and -mouthdiseasevirus,FMDV)强毒China/ 99株牛舌水泡皮为材料 ,用RT -PCR法提取RNA及扩增目的cDNA ,然后与 pGEM -TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和 EcoRI酶切鉴定。用DNAstar软件比较了... 以口蹄疫病毒 (foot-and -mouthdiseasevirus,FMDV)强毒China/ 99株牛舌水泡皮为材料 ,用RT -PCR法提取RNA及扩增目的cDNA ,然后与 pGEM -TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和 EcoRI酶切鉴定。用DNAstar软件比较了内部核糖体进入位点 (IRES)的序列差异 ,并用RNAdraw软件绘制和分析了该区段的二级结构。 8株FMDVIRES核苷酸序列比较表明该区段较为保守 ,并对非保守区域进行了分析。二级结构分析表明 ,FMDVIRES至少有 3种二级结构图形 :第一型有 5个结构域 ,与Pilipenko等报道的一致 ;第二和三型分别有 6和 11个结构域 ,与Pilipenko等报道的结果不同。无论FMDVIRES二级结构如何不同 ,但单链区大部分核苷酸序列或基序相同 ,如AACUCC、GAAA、CUUU、AGG、AACC、GUAA等。茎环柄部核苷酸对维持二级结构的空间构像具有十分重要的作用 ,环中或单链区序列 (基序 )在维持其功能方面具有很重要的作用 。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 基因组 内部核糖体进入位点 二级结构 一级结构
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口蹄疫病毒强毒株China/99 P2区核苷酸序列测定及比较分析 被引量：2
6
作者 张显升 赵启祖 +6 位作者 刘在新 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期496-500,共5页
以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸... 以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸差异率分别为 7 78%、6 6 2 %和 13 19%。推导的氨基酸序列差异率分别为 1 2 3%、1 84%和 5 73%。 4个毒株序列比较发现 ,China/99、O1K和TW 45三毒株的 2A/2B连接处为甘氨酸 /脯氨酸 ,A12 为精氨酸 /脯氨酸 ,而且T C转换率和A G转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸。氨基酸差异主要存在于 2B和 2C蛋白中 ,2A基因较为保守。 2B蛋白的第 1 4,6 3 6 7,73 78,83 91,116 12 1和 12 6 131区域 ,2A蛋白的第 4 9区域和 2C蛋白的第 9 13,2 2 2 5 ,91 96 ,15 0 15 9,179 188,2 0 1 2 0 7和 2 5 8 2 6 2区域可能是重要的活性中心。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 China/99P2区 核苷酸序列 比较分析
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口蹄疫病毒基因组IRES和Poly(C)之间功能未知区一级和二级结构分析 被引量：2
7
作者 张显升 赵启祖 +7 位作者 刘在新 常惠芸 江鹏斐 陈应理 李冬 魏怀录 戈银生 谢庆阁 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2001年第11期5-9,共5页
用RT PCR法 ,以口蹄疫病毒 (FMDV )WH/ 99株牛舌水泡皮为材料 ,提取RNA及扩增目的cDNA ,然后与pGEM TEasy载体连接并转化JM 10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定 ;用DNAstar软件比较功能未知区的序列差异 ,以RNAdraw软件... 用RT PCR法 ,以口蹄疫病毒 (FMDV )WH/ 99株牛舌水泡皮为材料 ,提取RNA及扩增目的cDNA ,然后与pGEM TEasy载体连接并转化JM 10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定 ;用DNAstar软件比较功能未知区的序列差异 ,以RNAdraw软件分析它们的二级结构。结果表明 ,7株FMDV的功能未知区序列长度介于 2 0 7— 2 5 6个核苷酸 ;序列分析表明 ,WH/ 99与AsiaⅠ 63 / 72、A2 4 /Cruzeiro、TWTY/ 97和TWCP/ 97的序列差异最大 ,预示此区段可能与病毒感染嗜性有关 ;二级结构分析表明 ,A2 4 /Cruzeiro、AsiaⅠ 63 / 72和TWCP/ 97均有 5个结构域 ,WH/ 99和TWTY/ 97具有 6个结构域。TWTY/ 97和TWCP/ 97二级结构的差异可能是TWTY/ 97功能未知区第 2 0位插入的“C”所致 ,而O1K/66和O1Campos仅有 3个结构域。 2株猪O型FMDV功能未知区 5′端存在着连续的核苷酸缺失现象 ,最多达 5 2个 ,唯有3株牛O型FMDV(O1K/ 66、O1Campos和WH/ 99)在上述位置无任何缺失。 展开更多
关键词 口蹄疫 病毒株 参考毒株 序列分析 一级结构 二级结构 RT-PCR
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口蹄疫病毒非结构蛋白P3区的基因序列及分析 被引量：5
8
作者 刘在新 赵启祖 +6 位作者 张显升 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《中国病毒学》 CSCD 2002年第2期153-157,共5页
以口蹄疫Akesu/ 5 8分离株的 5 3代牛舌皮病料为材料 ,采用RT PCR法 ,扩增和克隆了两个约 1.5kb的DNA片段。核酸序列测得结果对接后 ,涵盖了全部P3区的基因序列。口蹄疫Akesu/ 5 8分离株基因组P3区的核酸序列共计 2 ,72 4nt,包括一个终... 以口蹄疫Akesu/ 5 8分离株的 5 3代牛舌皮病料为材料 ,采用RT PCR法 ,扩增和克隆了两个约 1.5kb的DNA片段。核酸序列测得结果对接后 ,涵盖了全部P3区的基因序列。口蹄疫Akesu/ 5 8分离株基因组P3区的核酸序列共计 2 ,72 4nt,包括一个终止密码子TAA ,共编码 90 7个氨基酸 ;其中非结构蛋白 3A的基因是 45 9nt,编码 15 3个氨基酸 ;3个 3B(VPg)基因分别是 6 9、72和 72nt,氨基酸分别为 2 3、2 4和 2 4;3C是 6 39nt,2 13个氨基酸 ;3D是1,413nt ,471个氨基酸。各蛋白间由Glu/Gly(Ser)连接。序列比较显示 :3A的C端易变 。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 非结构蛋白P3区 基因序列
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口蹄疫病毒株China/99L区段核苷酸序列测定及比较分析
9
作者 张显升 赵启祖 +7 位作者 刘在新 刘相涛 常惠芸 江鹏斐 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《中国病毒学》 CSCD 2002年第2期158-162,共5页
以口蹄疫病毒株China/ 99RNA为模板 ,反转录并扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,提取的重组质粒用电泳、PCRampos和EcoR1酶切法鉴定。该毒株与A10、O1K、O1Campos和TW 45毒株的核苷酸序列差异率分别为 15 .2 7... 以口蹄疫病毒株China/ 99RNA为模板 ,反转录并扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,提取的重组质粒用电泳、PCRampos和EcoR1酶切法鉴定。该毒株与A10、O1K、O1Campos和TW 45毒株的核苷酸序列差异率分别为 15 .2 7%、15 .5 6 %、15 .5 6 %和 15 .49% ;氨基酸序列差异率分别为 8.2 9%、8.76 %、9.2 2 %和 10 .14%。五个毒株的L/P1连接处均为苷氨酸 (Gly) /异亮氨酸 (Ile)。序列比较表明 ,T C、A G和A C转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸 ,是影响氨基酸稳定的因素之一。第 43 5 3、95 10 5、10 8 111、146 15 3、16 1 173、183 188和 182 187区域极有可能是L蛋白酶的活性中心 ,第 48位的H、5 1的C、6 5位的E、95位的H、10 9位的H、138位的H、148位的H和 16 5位的E可能是L蛋白酶的活性位点 。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒株 China/99L区段 核苷酸序列测定 比较分析
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