目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨槲皮素在治疗宫颈高危型人乳头瘤病毒(high—risk human papilloma virus,HR-HPV)中的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology d...目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨槲皮素在治疗宫颈高危型人乳头瘤病毒(high—risk human papilloma virus,HR-HPV)中的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP,https://tcmsp—e.com/)获得槲皮素相关靶点,利用GeneCards数据库获得HR—HPV疾病靶点,通过Venny2.1.0获得槲皮素治疗HR-HPV的潜在治疗靶点,利用String数据库构建蛋白质相互作用(protein—protein interaction,PPI)网络,利用Cytoscape进行蛋白质相互作用网络的可视化和构建,利用R语言进行基因本体(geneontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。使用AutoDock Vina软件进行分子对接。结果:从TCMSP数据库中鉴定出232个槲皮素相关靶点,从GeneCards中获得3421个疾病靶点。使用Veeny2.1.0软件获得139个潜在靶点。PPI分析显示,蛋白激酶B1(protein kinase B1,Akt1)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase1,MAPK1)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、信号转导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)和表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)可能是槲皮素治疗宫颈HR-HPV的中心靶点。GO和KEGG分析表明,槲皮素参与了多种功能途径、生物过程、分子类别和信号通路,包括Th17信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、EGFR信号通路、PI3K(磷脂酰肌醇-3激酶,phosphoinositide 3-kinase;PI3K)-Akt信号通路等。分子对接显示槲皮素与中心靶点结合良好。结论:槲皮素具有多方面的特性,靶向多种组分、途径和靶点,在治疗HR-HPV中主要通过调节炎症反应、氧化反应和凋亡过程进行干预。展开更多
文摘目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨槲皮素在治疗宫颈高危型人乳头瘤病毒(high—risk human papilloma virus,HR-HPV)中的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP,https://tcmsp—e.com/)获得槲皮素相关靶点,利用GeneCards数据库获得HR—HPV疾病靶点,通过Venny2.1.0获得槲皮素治疗HR-HPV的潜在治疗靶点,利用String数据库构建蛋白质相互作用(protein—protein interaction,PPI)网络,利用Cytoscape进行蛋白质相互作用网络的可视化和构建,利用R语言进行基因本体(geneontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。使用AutoDock Vina软件进行分子对接。结果:从TCMSP数据库中鉴定出232个槲皮素相关靶点,从GeneCards中获得3421个疾病靶点。使用Veeny2.1.0软件获得139个潜在靶点。PPI分析显示,蛋白激酶B1(protein kinase B1,Akt1)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase1,MAPK1)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、信号转导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)和表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)可能是槲皮素治疗宫颈HR-HPV的中心靶点。GO和KEGG分析表明,槲皮素参与了多种功能途径、生物过程、分子类别和信号通路,包括Th17信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、EGFR信号通路、PI3K(磷脂酰肌醇-3激酶,phosphoinositide 3-kinase;PI3K)-Akt信号通路等。分子对接显示槲皮素与中心靶点结合良好。结论:槲皮素具有多方面的特性,靶向多种组分、途径和靶点,在治疗HR-HPV中主要通过调节炎症反应、氧化反应和凋亡过程进行干预。
