香猪CD9基因结构变异多态性及其对基因表达的影响

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作者 梁才康 兰隽儿 +5 位作者 孙勇 庞玉莲 黄世会 牛熙 王嘉福 冉雪琴 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期290-295,共6页

通过比较基因组学分析,在香猪白细胞分化抗原9(Cluster of Differentiation 9,CD9)基因中检测到1个长度为315bp的结构变异(Structure Variant,SV)。该SV位于CD9基因的第2内含子中。为了探索CD9-I2-sv315的多态性是否对基因表达有影响,... 通过比较基因组学分析,在香猪白细胞分化抗原9(Cluster of Differentiation 9,CD9)基因中检测到1个长度为315bp的结构变异(Structure Variant,SV)。该SV位于CD9基因的第2内含子中。为了探索CD9-I2-sv315的多态性是否对基因表达有影响,本研究通过在该SV上下游设计特异性引物,通过PCR验证CD9-I2-sv315在大白猪和香猪中的群体分布;采用生物信息学技术分析CD9-I2-sv315区域是否存在影响基因表达的功能元件;采用实时荧光定量PCR方法检测香猪主要组织及不同CD9-I2-sv315基因型之间CD9基因的表达变化。结果表明,香猪群体中CD9-I2-sv315位点检测到2种基因型,分别为DD型和ID型(D为缺失基因,I与参考基因一致),其中D等位基因频率为84.5%;大白猪群体中存在3种基因型,II型、ID型和DD型,D等位基因频率为55%。本文比较了香猪主要组织中CD9基因的表达量,得出肺组织的表达量最高。生物信息学分析提示CD9-I2-sv315区域中包含一个短散在元件(Short Interspersed Element,SINE)和36个miRNAs结合位点,可能影响CD9基因的表达效率。进一步检测肺组织中3种基因型的相对表达量,得出:DD型>ID型>II型。本文研究结果提示,香猪CD9基因的结构变异CD9-I2-sv315以DD型为主,DD型中CD9表达量高于其他基因型,可能与香猪较强的抗病力有关。 展开更多

关键词 香猪 CD9基因 结构变异 多态性 肺

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宰后猪肉成熟过程中基因表达变化及其与肉品质的相关性分析 被引量：1

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作者 黄永棚 冉雪琴 +3 位作者 牛熙 李升 黄世会 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1573-1581,共9页

【目的】研究宰后成熟对猪肉品质的影响,以及宰后成熟过程中基因表达规律与猪肉品质变化的相关性,以期更好地阐释鲜肉成熟过程中肉品质变化的机理。【方法】以4℃条件下贮藏的大白猪背最长肌为研究对象,测定贮藏0、1、2、4、6、8和10 d... 【目的】研究宰后成熟对猪肉品质的影响,以及宰后成熟过程中基因表达规律与猪肉品质变化的相关性,以期更好地阐释鲜肉成熟过程中肉品质变化的机理。【方法】以4℃条件下贮藏的大白猪背最长肌为研究对象,测定贮藏0、1、2、4、6、8和10 d时肉品质变化状况;利用实时荧光定量PCR测定宰后猪背最长肌中单磷酸腺苷脱氨酶3(AMPD3)、肌球蛋白结合蛋白C2(MYBPC2)、肌球蛋白轻链3(MYL3)、左旋氨基酸转运体(SLC7A8)和原肌球蛋白3(TPM3)等基因的表达变化,并分析其与肉品质指标的相关性。【结果】大白猪宰后背最长肌pH在2 d时达到极限值6.5,显著低于4、10 d(P<0.05);蒸煮损失和滴水损失均呈现先升高后降低的趋势,而贮藏损失在10 d时达到最高值12.52%,显著高于0.5~6 d(P<0.05);剪切力在宰后成熟1~10 d显著低于0~1 d(P<0.05);硫代巴比妥酸反应物(TBARS)值随成熟时间的延长逐渐升高,且8~10 d显著高于其他时间点(P<0.05)。实时荧光定量PCR结果表明,宰后肌肉组织中基因的转录丰度仍然存在,AMPD 3基因在贮藏6 d时表达水平显著高于0、0.5、2和10 d(P<0.05);MYBPC 2、MYL 3和TPM 3基因0~10 d表达量均呈时间依赖性上调,在贮藏10 d时表达水平显著高于0~2 d(P<0.05);SLC 7 A 8基因在贮藏2 d时表达量达到峰值,显著高于其他时间点(P<0.05)。相关性分析表明,AMPD 3基因与猪肉品质指标间没有相关性(P>0.05);MYBPC 2基因表达量与TBARS值和贮藏损失呈显著正相关(P<0.05);MYL 3基因表达量与TBARS值、剪切力、滴水损失及贮藏损失呈极显著或显著正相关(P<0.01;P<0.05),与蒸煮损失呈极显著负相关(P<0.01);SLC 7 A 8基因表达量与pH呈显著负相关(P<0.05);TPM 3基因表达量与TBARS值、滴水损失及贮藏损失呈显著或极显著正相关(P<0.05;P<0.01),与蒸煮损失呈显著负相关(P<0.05)。【结论】宰后猪肉成熟过程中基因表达变化与肉品质指标间存在相关性,基因表达的差异影响着动物屠宰后不同的代谢类型和生理功能,进而影响肉品质。 展开更多

关键词 猪肉 宰后成熟 肉品质 基因表达 相关性

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11种肉及肉制品动物源性成分PCR检测技术 被引量：2

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作者 陈勇勇 黄世会 +3 位作者 牛熙 李升 冉雪琴 王嘉福 《中国动物检疫》 CAS 2023年第5期107-114,共8页

为建立准确的动物源肉制品检测技术,采用生物信息学方法,针对猪、牛、马、山羊、小鼠、大鼠、兔、犬、鸡、鸭、鹅等11种动物肉类的特异性基因,建立了特异性PCR检测技术。该技术可高特异性检测猪、牛、马、山羊、兔、犬、鸡、鸭、鹅源肉... 为建立准确的动物源肉制品检测技术,采用生物信息学方法,针对猪、牛、马、山羊、小鼠、大鼠、兔、犬、鸡、鸭、鹅等11种动物肉类的特异性基因,建立了特异性PCR检测技术。该技术可高特异性检测猪、牛、马、山羊、兔、犬、鸡、鸭、鹅源肉样,并可鉴别掺入的大鼠、小鼠等违禁肉类成份,最低检测限为1.00 ng/μL基因组DNA,以及低至1%的肉类添加量。运用该技术在市场中随机抽检3种初加工肉制品各10份进行验证,结果在每种肉制品中均检出掺假样品,不同种类肉品的掺假率为10%~20%。本研究建立了具有高灵敏、准确、低成本、适用范围广等优势的肉制品动物源性成份检测技术,为消费市场肉制品质量检测提供了技术支撑。 展开更多

关键词 肉制品 动物源性成分 聚合酶链式反应 检测技术

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香猪ADCY2基因结构变异鉴定及其与生长性状的关联分析 被引量：1

4

作者 刘钦 齐芬芳 +4 位作者 黄世会 牛熙 李升 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期197-201,共5页

为了探究香猪腺苷酸环化酶2(Adenylate Cyclase,ADCY2)基因结构变异与香猪生长性状的关系,本研究以233头断奶香猪为实验动物,定期测量体尺指标,采集耳组织提取基因组DNA,利用PCR技术分析香猪ADCY2基因结构变异的遗传多样性,并与香猪体... 为了探究香猪腺苷酸环化酶2(Adenylate Cyclase,ADCY2)基因结构变异与香猪生长性状的关系,本研究以233头断奶香猪为实验动物,定期测量体尺指标,采集耳组织提取基因组DNA,利用PCR技术分析香猪ADCY2基因结构变异的遗传多样性,并与香猪体尺指标进行相关性分析。结果显示,香猪ADCY2基因中存在1个长度为305 bp的结构变异位点(ADCY2-I2-SV305),该位点检出3种基因型:纯合缺失DD型、正常的II型和杂合的ID型,其中II基因型频率(67.09%)显著高于ID和DD基因型;I等位基因为优势等位基因。ADCY2-I2-SV305位点与香猪多个日龄的体宽、胸围和腹围显著相关,且II基因型的香猪个体各项体尺指标均显著高于ID和DD型个体,提示该结构变异的缺失型不利于香猪生长发育。对ADCY2-I2-SV305变异位点的功能元件分析发现,该位点中含有1个简单重复元件和1个SINE元件,以及5个miRNA结合位点,推测该位点的缺失突变将导致这些重复元件的丢失,不利于ADCY2基因的表达,进而影响香猪生长发育。综上,ADCY2基因的ADCY2-I2-SV305结构变异与香猪生长发育显著相关,可作为香猪良种选育的分子标记。 展开更多

关键词 香猪 ADCY2基因 结构变异 生长性状 关联分析

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青黛复方制剂调节猪免疫力的作用机制分析 被引量：1

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作者 吴丽娟 张红辉 +5 位作者 陈勇勇 黄世会 牛熙 李升 冉雪琴 王嘉福 《饲料研究》 CAS 北大核心 2023年第15期55-63,共9页

试验旨在应用网络药理学方法,探究青黛复方制剂调节猪免疫力的分子机制。从Tcmsp数据库中筛查青黛复方制剂含有的化合物,得到有效活性成分,预测有效活性成分作用的靶基因,制作“活性成分-靶基因”网络分析,筛出主要活性成分。通过Omim... 试验旨在应用网络药理学方法,探究青黛复方制剂调节猪免疫力的分子机制。从Tcmsp数据库中筛查青黛复方制剂含有的化合物,得到有效活性成分,预测有效活性成分作用的靶基因,制作“活性成分-靶基因”网络分析,筛出主要活性成分。通过Omim等数据库分析免疫相关基因,与活性成分的靶基因取交集,得到复方制剂靶向的猪免疫相关基因。利用String数据库构建蛋白互作网络图(PPI),运用Cytoscape筛选PPI的核心蛋白;通过David数据库分析靶基因富集的基因功能和KEGG通路;用Autodock和PyMol进行分子对接,验证核心活性成分与核心靶点蛋白的相互作用。结果显示:青黛复方制剂含有330种化合物,其中有效活性成分为62种,主要的活性物质有β-谷甾醇、豆甾醇、常春藤皂苷元、山柰酚、异牡荆素等10种;有效活性成分作用于64个猪免疫相关基因以及SLC6A4、ESR1、TNF等20种核心靶蛋白,通过IL-17信号通路、TNF信号传导途径、NOD样受体信号传导途径等调节天然免疫和特异性免疫系统功能,提高香猪的抵抗力。青黛复方制剂主要通过β-谷甾醇、异牡荆素等主要活性成分,影响白细胞介素-2(IL-2)、肿瘤坏死因子-α(IFN-α)、干扰素-γ(IFN-γ)的表达水平。分子对接分析表明,这些活性成分能够与靶蛋白有效结合,可为中药增强机体免疫力的物质基础和作用机制等研究提供参考。同时,网络药理学分析结果可为全面解析青黛复方制剂增强猪免疫力的作用机制提供依据。 展开更多

关键词 青黛复方制剂 猪 靶点 免疫力 分子对接

原文传递

香猪MAP3K4基因结构变异多态性和基因表达研究

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作者 徐婷婷 齐芬芳 +5 位作者 黄世会 牛熙 李升 冉雪琴 王嘉福 谢健 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期5046-5055,共10页

基于前期比较基因组学分析,在香猪的丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶4(mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4,MAP 3K4)基因第15内含子中发现一个189 bp的结构变异(MAP3K4-I15-sv189)。为探究该结构变异(structural variation,... 基于前期比较基因组学分析,在香猪的丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶4(mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4,MAP 3K4)基因第15内含子中发现一个189 bp的结构变异(MAP3K4-I15-sv189)。为探究该结构变异(structural variation,SV)在香猪群体中的多态性分布及其对基因表达的影响,本研究设计一对特异性引物,建立MAP 3K4基因SV的PCR检测技术,分析香猪群体中该结构变异的基因类型;采用RT-qPCR研究结构变异不同基因型之间基因的差异表达。结果显示,香猪群体中MAP3K4-I15-sv189位点存在两种基因型,DD型和ID型(D为缺失基因,I与参考基因一致),其中D等位基因的频率为97.35%;大白猪群体中检测到3种基因型,DD型、ID型和II型,D等位基因频率为80%。相比之下,香猪的D等位基因频率显著高于大白猪的相应值(P<0.05)。采用生物信息学方法分析结构变异区域得到多种剪接元件和重复元件,可能影响MAP 3K4基因的表达。比较香猪各组织中MAP 3K4基因的表达量,发现该基因在肺组织的表达量最高。进一步检测肺组织中3种结构变异类型的相对表达量,显示:DD型>ID型>II型,表明SV的缺失可能促进MAP 3K4基因的表达。本研究表明,香猪MAP 3K4的结构变异MAP3K4-I15-sv189以缺失型为主,缺失型可促进肺组织MAP 3K4基因的表达。研究结果有助于解析香猪易感肺部疾病的分子机制。 展开更多

关键词 香猪 结构变异 MAP 3K4基因 多态性 肺

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发情周期对香猪卵巢生物钟相关基因表达的影响

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作者 唐靓婷 黄世会 +3 位作者 牛熙 李升 王嘉福 冉雪琴 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期67-84,共18页

生物钟在生物体(如猪)的生殖系统中起着重要作用。为研究发情周期对香猪卵巢生物钟相关基因表达的影响,本研究分析了香猪卵巢在发情期和未发情期生物钟相关基因的表达和可变剪接。结果在香猪卵巢中共检测到90个生物钟相关基因的表达,其... 生物钟在生物体(如猪)的生殖系统中起着重要作用。为研究发情周期对香猪卵巢生物钟相关基因表达的影响,本研究分析了香猪卵巢在发情期和未发情期生物钟相关基因的表达和可变剪接。结果在香猪卵巢中共检测到90个生物钟相关基因的表达,其中有33个生物钟相关基因在发情期和未发情期差异表达。从34个生物钟相关基因的转录本中鉴定出44个差异可变剪接事件。此外,还发现包括核心时钟成分arntl和cry1在内的20个基因仅在可变剪接水平上被差异调节,包括per1和clock在内的14个基因同时在基因表达和可变剪接水平被差异调节。通过RT-qPCR实验,证实了核心时钟基因per1、cry1、clock和arntl以及时钟相关基因ppp1cb和ntrk1在香猪卵巢中的表达具有节律性。结果表明,香猪卵巢生物钟可能通过转录和转录后调控水平在调节卵巢生理功能中发挥着重要作用。 展开更多

关键词 昼夜节律 香猪 卵巢 发情周期 可变剪接

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香猪皮肤转录组衰老相关病毒源基因的筛选和鉴定

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作者 张红辉 黄世会 +3 位作者 牛熙 李升 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期228-236,共9页

皮肤是哺乳动物抵御致病因素的第1道防线,在皮肤衰老的过程中,整合到哺乳动物基因组中的病毒源基因序列会被重新激活,影响宿主基因的表达,激起细胞对病毒的反应,引起慢性炎症、促进细胞衰老。本研究旨在探究病毒源基因表达与皱皮香猪皮... 皮肤是哺乳动物抵御致病因素的第1道防线,在皮肤衰老的过程中,整合到哺乳动物基因组中的病毒源基因序列会被重新激活,影响宿主基因的表达,激起细胞对病毒的反应,引起慢性炎症、促进细胞衰老。本研究旨在探究病毒源基因表达与皱皮香猪皮肤皱纹形成的关系,选取12~18月龄皱皮香猪和普通香猪各5头进行转录组测序和生物信息学分析,采用RT-qPCR方法对皱皮香猪中差异表达的病毒源基因进行验证。2组中皮肤组织差异表达基因与病毒整合位点数据库进行比对分析,筛选出612个差异表达的病毒源基因。以普通香猪为对照,得到上调基因182个,下调基因430个,这些差异表达的病毒源基因主要富集在皮肤发育、炎症反应等GO条目,以及长寿调控途径、FoxO信号通路、细胞衰老等KEGG通路。经猪-人同源基因转换,与免疫、衰老、人类皮肤相关的基因取交集,筛选出高表达的候选基因6个:AGT、CAT、CTNNB1、JUP、KRT75和LIPE,采用RT-qPCR验证了皮肤中这6个基因的差异表达,与转录组测序结果趋势一致。研究结果表明,皱皮香猪皮肤皱纹的形成与病毒源基因的异常表达有紧密联系,本研究可为后期皱皮香猪皮肤褶皱形成的分子机制及衰老分子标记物选择奠定理论基础。 展开更多

关键词 香猪 褶皱 衰老 病毒源基因 差异表达基因

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3份高羊茅材料吡咯琳-5-羧酸合成酶基因的结构及酶活性比较 被引量：1

9

作者 牛熙 冉雪琴 +1 位作者 王嘉福 陈超 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1546-1552,共7页

吡咯琳-5-羧酸合成酶(Pyrroline-5-Carboxylate Synthetase,P5CS)是经谷氨酸途径合成脯氨酸的关键酶,脯氨酸的积累有助于提高植物的抗逆性。本研究以黔草一号高羊茅(Festuca arundinacea cv.Qiancao No.1,QC1)、黔草二号细叶高羊茅(F.ar... 吡咯琳-5-羧酸合成酶(Pyrroline-5-Carboxylate Synthetase,P5CS)是经谷氨酸途径合成脯氨酸的关键酶,脯氨酸的积累有助于提高植物的抗逆性。本研究以黔草一号高羊茅(Festuca arundinacea cv.Qiancao No.1,QC1)、黔草二号细叶高羊茅(F.arundinacea cv.Qiancao No.2n,QC2n)和黔草二号宽叶高羊茅(F.arundinacea cv.Qiancao No.2b,QC2b)为材料,经RT-PCR克隆得到P5CS基因,基因长2 151bp,含有完整的开放读码框(OpenReading Frame,ORF),编码716个氨基酸,与朝鲜碱茅(Puccinellia chinampoensis)P5CS基因的相似性为94%。对3份高羊茅材料P5CS基因编码的氨基酸序列进行比较,有6个氨基酸差异,这些氨基酸均处于P5CS蛋白的谷氨酸激酶(Glu-5-Kinase,G5K)功能区,其中第37、85及142位的氨基酸所带电荷发生了改变。比较干旱处理后3份高羊茅材料叶片的P5CS酶活性及其脯氨酸含量,QC1叶片的P5CS酶活性及其脯氨酸含量最高,其次为QC2n,QC2b最低。说明P5CS中谷氨酸激酶(G5K)功能区重要氨基酸种类的改变,可能影响高羊茅P5CS的酶活性及其脯氨酸的生成量,也是高羊茅抗逆性差异的主要原因。 展开更多

关键词 高羊茅 P5CS基因 酶活性 脯氨酸 抗旱

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务川臭蛙皮肤及指趾组织学特征 被引量：1

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作者 牛熙 徐云龙 +1 位作者 冉雪琴 王嘉福 《四川动物》 CSCD 北大核心 2012年第5期755-759,共5页

务川臭蛙仅分布于贵州省务川县溶洞内,属极危物种。以牛蛙为对照,通过形态解剖学和组织学方法对务川臭蛙的皮肤和吸盘结构进行研究,结果显示,务川臭蛙头部背侧、后肢背侧以及躯干腹侧皮肤总厚度分别为372.50μm±29.7μm、453.25μm... 务川臭蛙仅分布于贵州省务川县溶洞内,属极危物种。以牛蛙为对照,通过形态解剖学和组织学方法对务川臭蛙的皮肤和吸盘结构进行研究,结果显示,务川臭蛙头部背侧、后肢背侧以及躯干腹侧皮肤总厚度分别为372.50μm±29.7μm、453.25μm±13.9μm及237.92μm±31.8μm,各部分皮肤真皮层所占比例分别为(88.86±1.41)%、(90.65±0.81)%和(86.59±1.77)%,其中分布着大量的颗粒腺和粘液腺;前后肢每个指(趾)末端的吸盘,腹面有明显的柱状凸起表皮结构,其间有小孔和粘液腺,是务川臭蛙在溶洞壁上攀爬捕食的结构基础。务川臭蛙具有的特殊生理结构,是珍贵的遗传资源,应当加强科学保护。 展开更多

关键词 务川臭蛙 皮肤 吸盘 组织学

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两个高羊茅品种苗期抗旱性的比较 被引量：8

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作者 牛熙 王嘉福 陈超 《山地农业生物学报》 2012年第2期132-136,共5页

黔草1号(Qiancao No.1,QC1)和黔草2号(Qiancao No.2,QC2)是从贵州本地野生高羊茅(Festuca arundi-nace)中选育出的品种。用PEG6000(0 Mpa、-1.5 MPa、-2.5 MPa)处理两个高羊茅品种幼苗4d,以测定叶片中脯氨酸(proline,Pro)、丙二醛(malon... 黔草1号(Qiancao No.1,QC1)和黔草2号(Qiancao No.2,QC2)是从贵州本地野生高羊茅(Festuca arundi-nace)中选育出的品种。用PEG6000(0 Mpa、-1.5 MPa、-2.5 MPa)处理两个高羊茅品种幼苗4d,以测定叶片中脯氨酸(proline,Pro)、丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量和超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性。随着胁迫时间的延长,两个高羊茅的Pro、MDA含量均增加,SOD酶活性先增加再下降;同时,-2.5 MPa处理条件下各参数测定值最大,0 MPa处理最小且差异不明显。表明在干旱胁迫下两个高羊茅都是通过积累较多的脯氨酸、维持较高的SOD酶活性,以清除细胞中的氧自由基,减缓细胞中MDA的生成,保护细胞的结构和功能,叶片细胞对-2.5 MPa胁迫的响应程度高于-1.5 MPa胁迫条件。与QC2相比,QC1叶片中Pro含量和SOD酶活性较高、丙二醛含量较低。说明QC1的抗旱能力强于QC2。 展开更多

关键词 高羊茅 抗旱性 幼苗

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流式细胞仪在本科生“分子生物学”课程实验教学中的应用与实践 被引量：4

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作者 牛熙 李升 齐芬芳 《教育教学论坛》 2020年第45期379-381,共3页

为了能够让本科"分子生物学"实验课程更为新颖和丰富,提高大型仪器流式细胞仪的使用效率,根据分子生物学课程的实验教学特点,结合理论教学的同时,在实验课程教学中使用流式细胞仪开展细胞凋亡和细胞周期检测实验。通过实验课... 为了能够让本科"分子生物学"实验课程更为新颖和丰富,提高大型仪器流式细胞仪的使用效率,根据分子生物学课程的实验教学特点,结合理论教学的同时,在实验课程教学中使用流式细胞仪开展细胞凋亡和细胞周期检测实验。通过实验课的开展,锻炼学生基本实验技能,为今后科研工作打下良好的实验基础。 展开更多

关键词 流式细胞仪 分子生物学 实验课程

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香猪FSHR基因外显子10的多态性及其与产仔数间的关联分析 被引量：9

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作者 许瑶 刘畅 +2 位作者 牛熙 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第3期799-806,共8页

促卵泡激素(follicle-stimulating hormone,FSH)是垂体前叶分泌的一种糖蛋白,可通过卵泡刺激素受体(follicle-stimulating hormone receptor,FSHR)调节卵巢的功能。为了研究香猪FSHR基因外显子10的多态性及其与产仔数的关系,试验以从江... 促卵泡激素(follicle-stimulating hormone,FSH)是垂体前叶分泌的一种糖蛋白,可通过卵泡刺激素受体(follicle-stimulating hormone receptor,FSHR)调节卵巢的功能。为了研究香猪FSHR基因外显子10的多态性及其与产仔数的关系,试验以从江香猪为研究对象,采用PCR产物直接测序方法检测基因的多态性,分析基因型与香猪产仔数间的关系。对8个候选位点进行群体检测证实其中2个为SNPs位点,分别是rs322800083(C276T)和rs332115220(T601C),且新发现1个SNP位点novel 1(G-92A);rs322800083和rs332115220位点构成4种单倍型,其中C-T为香猪群体的主要单倍型(45.0%),且在香猪群体中紧密连锁(r2=0.334)。分析4种单倍型与香猪产仔数间的关系,在香猪的二胎产仔数中,单倍型C-T的总产仔数(total number born,TNB)最高,单倍型C-C的TNB最低,两者之间的TNB相差0.99头(P<0.05);在香猪的三胎产仔数中,单倍型C-T的TNB最高,与单倍型T-C、C-C间的TNB分别相差1.61和2.33头(P<0.01)。rs332115220位点的基因型与香猪的三胎产仔数呈弱的正相关关系(ρ=0.429)。本研究结果提示,单倍型C-T可以作为分子标记应用于香猪产仔数性状的辅助选育。 展开更多

关键词 FSHR基因 多态性 香猪 分子标记

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敌敌畏和高脂对香猪肝肾及动脉损伤机理分析 被引量：4

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作者 李升 徐霖 +2 位作者 牛熙 冉雪琴 王嘉福 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1322-1327,共6页

为了探讨亚中毒剂量有机磷杀虫剂长期作用对猪体造成损害的机理,选择香猪作为实验动物,随机分为对照组、敌敌畏处理组和高脂处理组,饲养12个月后,分析香猪的肝、肾、动脉病理切片和相关酶活性变化。经预试验确定敌敌畏的亚中毒剂量为2.5... 为了探讨亚中毒剂量有机磷杀虫剂长期作用对猪体造成损害的机理,选择香猪作为实验动物,随机分为对照组、敌敌畏处理组和高脂处理组,饲养12个月后,分析香猪的肝、肾、动脉病理切片和相关酶活性变化。经预试验确定敌敌畏的亚中毒剂量为2.5mg.(kg.2d)-1。以此剂量长期作用12个月后,敌敌畏能导致香猪严重的肝、肾细胞损伤,并使血清胆碱酯酶活性降低,对氧磷酯酶活性及其mRNA水平极显著下降(P<0.01),但对大动脉组织结构、血脂水平和体质量的影响不明显。高脂处理组中,香猪的体质量明显增加(P<0.05),同时血清胆碱酯酶活性、血清总胆固醇、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白水平均上升(P<0.05),对氧磷酯酶活性及其基因的表达量下降(P<0.05)。此外,大动脉血管壁内侧形成明显的脂质斑块和血栓;肝细胞受到一定损害,而肾组织受到的影响较小。研究结果提示,敌敌畏和高脂通过不同的途径刺激机体氧化应激反应,抑制对氧磷酯酶的活性;亚毒剂量的敌敌畏长期作用对肝肾造成的严重损害,提示应对猪场环境及饲料中的有机磷农药污染给予高度重视。 展开更多

关键词 亚中毒剂量 敌敌畏 对氧磷酯酶 胆碱酯酶 氧化应激

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可乐猪乳头数性状全基因组关联分析 被引量：9

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作者 谢健 喻昌燕 +3 位作者 许瑶 牛熙 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第11期2866-2872,共7页

乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一,与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP60K芯片对22头可乐猪进行基因分型,通过Plink 1.07软件,基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经... 乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一,与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP60K芯片对22头可乐猪进行基因分型,通过Plink 1.07软件,基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经过严格的质量控制和多重检验之后,共鉴定出全基因组水平潜在关联的SNPs位点4个(P<2.06E-5);染色体水平显著关联位点3个,潜在关联位点18个;在关联SNP位点可能连锁的上、下游1cM区间内检索到304个基因,其中Wnt及Fgf信号通路中的候选基因BTRC、FGF5、FGF8和BMP3、RASGEF1B、HMGB3可能影响猪的乳头数性状或繁殖性状。通过全基因组关联分析策略发掘出的关联SNP位点及潜在候选基因,将为可乐猪的选育保种奠定基础。 展开更多

关键词 SNP芯片 全基因组关联分析 乳头数

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教育生态学视域下分子生物学实验课程教学研究

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作者 牛熙 《河南农业》 2020年第24期15-17,共3页

以教育生态学理论为基础,从教育生态学视域审视分子生物学实验课程教学活动,对实验课程教学效果的全面提升、提高学生自主学习的能力具有重要的意义。以贵州大学为例,分析目前分子生物学实验课教学中存在的问题,结合教育生态学理论,在... 以教育生态学理论为基础,从教育生态学视域审视分子生物学实验课程教学活动,对实验课程教学效果的全面提升、提高学生自主学习的能力具有重要的意义。以贵州大学为例,分析目前分子生物学实验课教学中存在的问题,结合教育生态学理论,在讨论研究现有教学问题的同时,提出改革教育理念、构建生态化的师生关系、营造舒适有效的生态教育环境、建立生态化教学评价等措施,进一步推进分子生物学实验课程教学改革的方向,全面提升教学效果,提高学生自主学习的能力。 展开更多

关键词 教育生态学 分子生物学 实验课程 教学改革

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香猪SNP位点rs80894395的多态性及其与体尺指标之间的关联研究 被引量：3

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作者 王洋 梅子凌 +6 位作者 喻昌燕 牛熙 谢玲玲 牛秋锦 仇志浪 王嘉福 冉雪琴 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第5期1294-1301,共8页

为了探究影响香猪生长发育的功能基因,本试验利用Illumina Porcine SNP60K芯片筛选出N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2,GALNT2)基因内含子10中一个与腹围呈弱相关的单核苷酸多态性(single nucl... 为了探究影响香猪生长发育的功能基因,本试验利用Illumina Porcine SNP60K芯片筛选出N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2,GALNT2)基因内含子10中一个与腹围呈弱相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs80894395。在此基础上应用等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)技术检测520头雌性香猪群体中该位点的基因型,并与43头大白猪、36头柯乐猪相比较。结果表明,从3个猪群体中检测到rs80894395位点的CC、CT和TT 3种基因型;其中香猪群体以CT为优势基因型,且基因型与香猪的体重、体长和腹围呈弱的正相关;大白猪群体以CC基因型为主,T等位基因频率较香猪极显著减少(P<0.01);柯乐猪群体中CC与CT基因型频率相等,与香猪和大白猪的基因频率间的差异不显著(P>0.05)。生物信息学分析表明,rs80894395位点可能影响GALNT2基因的剪接过程。rs80894395与香猪的生长发育可能有一定的联系。 展开更多

关键词 香猪 体尺 内含子剪接 SNP GALNT2基因

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香猪对氧磷酯酶基因家族的克隆及序列分析 被引量：2

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作者 李升 牛熙 +2 位作者 徐霖 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第7期15-19,共5页

采用RT-PCR技术,从香猪的肝脏总RNA中克隆了3个对氧磷酯酶(paraoxonase,PON)基因:PON1、PON2、PON3,其cDNA分别长1164、1212和1080bp,各包含1个完整的开放阅读框,分别编码355、354、354个氨基酸组成的前体,其N-端的15、23、23个氨基酸... 采用RT-PCR技术,从香猪的肝脏总RNA中克隆了3个对氧磷酯酶(paraoxonase,PON)基因:PON1、PON2、PON3,其cDNA分别长1164、1212和1080bp,各包含1个完整的开放阅读框,分别编码355、354、354个氨基酸组成的前体,其N-端的15、23、23个氨基酸为信号肽。香猪PON1基因中有1个碱基变异,不改变编码的氨基酸,为无义突变;香猪PON2基因中有2个碱基改变,导致成熟肽发生Q234R、V269I替换;香猪PON3基因中有1个碱基变化,使成熟肽出现R127H替换。经三维结构预测分析,这3个氨基酸位点的变化将影响蛋白质内部区域的微环境,影响对氧磷酯酶的功能,可能与香猪的抗逆性有一定的联系。 展开更多

关键词 香猪 对氧磷酯酶 PONs基因家族

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利用miRNA芯片筛选不同月龄香猪肝脏中差异表达的miRNA 被引量：2

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作者 李升 许亚楠 +1 位作者 牛熙 冉雪琴 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第3期673-678,共6页

为研究miRNA在香猪发育时期的调控功能,试验对3和7月龄香猪肝脏组织中存在表达差异的miRNA进行了筛选。提取3和7月龄香猪肝脏组织总RNA,通过与miRNA芯片杂交,经统计学分析,以变化倍数≥2倍(P<0.05)为阈值,筛选3和7月龄香猪肝脏中表... 为研究miRNA在香猪发育时期的调控功能,试验对3和7月龄香猪肝脏组织中存在表达差异的miRNA进行了筛选。提取3和7月龄香猪肝脏组织总RNA,通过与miRNA芯片杂交,经统计学分析,以变化倍数≥2倍(P<0.05)为阈值,筛选3和7月龄香猪肝脏中表达丰度差异的miRNA,并运用实时荧光定量PCR进行验证。结果发现,与3月龄相比,7月龄香猪肝脏中有11条miRNA表达下调和9条miRNA表达上调,下调倍数最多的是miR-27b,上调倍数最多的是miR-155。对选取的4条差异表达的miRNA进行实时荧光定量PCR反应,结果显示,4条miRNA表达变化趋势与芯片结果一致。本研究结果表明,不同月龄香猪肝脏中的miRNA表达丰度有差异,其中一些可能参与了机体生长发育时期肝细胞的脂肪代谢过程。 展开更多

关键词 miRNA表达谱 香猪 肝脏

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三个猪品种为父本对大约克母猪繁殖性能的影响 被引量：5

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作者 张兆强 徐云龙 +3 位作者 王嘉福 冉雪琴 牛熙 王三铭 《山地农业生物学报》 2011年第5期395-399,共5页

选择长白猪、杜洛克猪和可乐猪3个猪品种为父本,以大约克猪纯繁(大约克×大约克)和杜洛克猪纯繁(杜洛克×杜洛克)组为对照,研究大约克母猪繁殖性能的变化。结果表明:可乐猪为父本时,大约克母猪的妊娠期缩短了2 d,仔猪的有效乳... 选择长白猪、杜洛克猪和可乐猪3个猪品种为父本,以大约克猪纯繁(大约克×大约克)和杜洛克猪纯繁(杜洛克×杜洛克)组为对照,研究大约克母猪繁殖性能的变化。结果表明:可乐猪为父本时,大约克母猪的妊娠期缩短了2 d,仔猪的有效乳头数略有下降,但产活仔数(11.0±1.41)头/窝、断奶仔猪数(9.7±1.45)头/窝、断奶育成率(94.41±2.826)%均为最高(P<0.05),死胎数(0.3±0.25)头/窝和死胎率(3.25±3.250)%显著低于其他试验组(P<0.05),总产仔数最高(11.3±1.81)头/窝,说明有良好适应性的可乐猪为父本可明显提高后代的成活率;从窝重上来看,可×大杂交组的初生窝重(14.850±2.443 2)kg/窝、20日龄窝重(45.700±12.3641)kg/窝、断奶窝重(67.500±9.565 7)kg/窝均高于其他试验组。相关性分析显示,死胎数影响仔猪的初生窝重、20日龄窝重及断奶窝重。这些结果说明以可乐猪为父本,可明显改善大约克猪的繁殖力,值得在毕节地区推广应用。 展开更多

关键词 可乐猪 大约克猪 杜洛克猪 长白猪 产仔数 杂交

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