目的用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)仪构建海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定数据库,评价自建库鉴定准确性并与国外同类产品进行比...目的用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)仪构建海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定数据库,评价自建库鉴定准确性并与国外同类产品进行比较。方法海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库的构建:收集海南患者标本分离10株类鼻疽伯克霍尔德菌用于建库,以VITEK MS RUO模式进行图谱采集及数据库构建,每株菌平行涂布共12个靶点,得到120张质谱图;分别将10株类鼻疽伯克霍尔德菌经35℃和25℃培养24 h,每株菌每个血平板和巧克力平板分别涂3个靶点,共涂了120个靶点,每个靶点采集1次,得到120张质谱图。培养48 h,再次进行同样的靶点采集120张图谱。将采集获得240张图谱按标准精选得到优质图谱109张。通过仪器建库参数确认,控制原始波峰数量,筛选特征峰并赋权予权重,调整质量数、谱峰强度在规定范围,经过SARAMIS软件分析生成海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌数据库。数据库验证:收集海南不同地区来源患者类鼻疽伯克霍尔德菌30株及其他伯克霍尔德菌20株,以16SrRAN基因测序为金标准,比较自建数据库与VITEK MS v 4.16数据库鉴定类鼻疽伯克霍尔德菌的准确性及图谱特征。结果构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库经30株类鼻疽伯克霍尔德菌验证菌株确认,基于自建数据库,种水平鉴定准确率为100.0%(30/30),高于VITEK MS v 4.16数据库准确率56.67%(17/30),差异有统计学意义(χ^(2)=11.08,P<0.005)。结论构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库质量达到临床常规鉴定应用要求,就海南病原流行株的鉴定准确率优于国外同类产品。展开更多
文摘目的用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)仪构建海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定数据库,评价自建库鉴定准确性并与国外同类产品进行比较。方法海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库的构建:收集海南患者标本分离10株类鼻疽伯克霍尔德菌用于建库,以VITEK MS RUO模式进行图谱采集及数据库构建,每株菌平行涂布共12个靶点,得到120张质谱图;分别将10株类鼻疽伯克霍尔德菌经35℃和25℃培养24 h,每株菌每个血平板和巧克力平板分别涂3个靶点,共涂了120个靶点,每个靶点采集1次,得到120张质谱图。培养48 h,再次进行同样的靶点采集120张图谱。将采集获得240张图谱按标准精选得到优质图谱109张。通过仪器建库参数确认,控制原始波峰数量,筛选特征峰并赋权予权重,调整质量数、谱峰强度在规定范围,经过SARAMIS软件分析生成海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌数据库。数据库验证:收集海南不同地区来源患者类鼻疽伯克霍尔德菌30株及其他伯克霍尔德菌20株,以16SrRAN基因测序为金标准,比较自建数据库与VITEK MS v 4.16数据库鉴定类鼻疽伯克霍尔德菌的准确性及图谱特征。结果构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库经30株类鼻疽伯克霍尔德菌验证菌株确认,基于自建数据库,种水平鉴定准确率为100.0%(30/30),高于VITEK MS v 4.16数据库准确率56.67%(17/30),差异有统计学意义(χ^(2)=11.08,P<0.005)。结论构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库质量达到临床常规鉴定应用要求,就海南病原流行株的鉴定准确率优于国外同类产品。
