建立医疗机构诚信评价制度的实践与思考 被引量：5

1

作者 蔡正茂 李建南 +1 位作者 程逸文 汪红艳 《中国卫生事业管理》 北大核心 2009年第3期160-161,共2页

文章认为开展医疗机构诚信评价对促进机构规范化管理,促进行业长期可持续发展,减轻行政部门的工作负担,具有重要的现实意义。文章介绍了本地开展诚信评价的内容、方法、诚信评价的等级,并采用信息发布的形式公布评价结果,取得了良好的... 文章认为开展医疗机构诚信评价对促进机构规范化管理,促进行业长期可持续发展,减轻行政部门的工作负担,具有重要的现实意义。文章介绍了本地开展诚信评价的内容、方法、诚信评价的等级,并采用信息发布的形式公布评价结果,取得了良好的效果。作者提出应建立统一的诚信法规体系、开放的信息平台、透明的评价标准、严格的奖惩机制,从而建立诚信的医疗服务体系。 展开更多

关键词 医疗机构 诚信 评价 制度

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加强医疗广告市场监管的实践与思考 被引量：5

2

作者 蔡正茂 李建南 +1 位作者 程逸文 汪红艳 《江苏卫生事业管理》 2009年第2期27-28,共2页

虚假医疗广告欺骗患者,延误病情,增加医患矛盾,社会危害大,后果严重。但是目前违法现象普遍,令人堪忧。作者介绍了在医疗广告的现场审核、技术审核和日常监督管理的实践,取得较好效果。同时建议:要明确各相关部门职责,加大处罚力度,做... 虚假医疗广告欺骗患者,延误病情,增加医患矛盾,社会危害大,后果严重。但是目前违法现象普遍,令人堪忧。作者介绍了在医疗广告的现场审核、技术审核和日常监督管理的实践,取得较好效果。同时建议:要明确各相关部门职责,加大处罚力度,做到信息公开,实行违法广告的责任追究,标本兼治,综合管理,以净化医疗广告市场。 展开更多

关键词 医疗 广告 实践 思考

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羊源A型多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及生物学特性分析 被引量：5

3

作者 张振兴 陈巧玲 +6 位作者 程逸文 刘志勇 蒋俊明 陈思 满初日嘎 杜丽 王凤阳 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第17期6-11,140,共7页

为了解辽宁省朝阳市某羊场内绵羊体温异常增高、精神萎靡、食欲不佳、严重者1周内死亡的发病原因并提供用药推荐,试验对刚病死的绵羊进行解剖,采集心脏、肺脏和肾脏,收集胸腔积液和鼻拭子作为试验样品进行细菌分离培养、细菌形态学观察... 为了解辽宁省朝阳市某羊场内绵羊体温异常增高、精神萎靡、食欲不佳、严重者1周内死亡的发病原因并提供用药推荐,试验对刚病死的绵羊进行解剖,采集心脏、肺脏和肾脏,收集胸腔积液和鼻拭子作为试验样品进行细菌分离培养、细菌形态学观察、细菌16S rRNA鉴定、多杀性巴氏杆菌荚膜血清型鉴定、生化鉴定、药敏试验、耐药基因检测和致病性试验等。结果表明:导致该羊场羊发病的致病菌为羊源A型多杀性巴氏杆菌。该菌与多杀性巴氏杆菌Pm 5株(AY316314.1)的进化关系最近;且含有B类碳青霉烯酶(VIM)的耐药基因,对庆大霉素、卡那霉素等25种抗生素敏感。说明A型多杀性巴氏杆菌是导致该羊场绵羊死亡的病原菌,该菌携带B类碳青霉烯酶(VIM)耐药基因,对庆大霉素、卡那霉素等抗生素敏感;临床上推荐使用氨基糖苷类(庆大霉素和卡那霉素)和四环素类(四环素)抗生素。 展开更多

关键词 羊源A型多杀性巴氏杆菌 分离鉴定 药敏试验 耐药基因 生物学特性

原文传递

羊源多杀性巴氏杆菌重组酶聚合酶扩增诊断方法的建立 被引量：10

4

作者 刘昂 程逸文 +8 位作者 安琪 张振兴 李彬 陈杰 陈巧玲 杜丽 满初日嘎 王凤阳 陈思 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第10期3752-3760,共9页

为建立适用于羊源多杀性巴氏杆菌的重组酶聚合酶扩增(RPA)诊断方法,本研究依据前期测序鉴定的羊源多杀性巴氏杆菌KMT1基因序列构建pET-28a(+)-KMT1质粒标准品。设计基于RPA技术的特异性引物及RPA荧光探针,建立实时荧光RPA方法的最适反... 为建立适用于羊源多杀性巴氏杆菌的重组酶聚合酶扩增(RPA)诊断方法,本研究依据前期测序鉴定的羊源多杀性巴氏杆菌KMT1基因序列构建pET-28a(+)-KMT1质粒标准品。设计基于RPA技术的特异性引物及RPA荧光探针,建立实时荧光RPA方法的最适反应体系。采用10倍梯度连续稀释的质粒标准品检测该RPA方法的敏感性并绘制相关性曲线;以10种不同菌株的基因组DNA为模板验证方法的特异性;用感染多杀性巴氏杆菌的山羊及小鼠组织样品对方法的可靠性进行验证。结果显示,本试验建立的实时荧光RPA方法最适反应温度为39℃,最佳引物为KMT1-Fe1,灵敏度达100拷贝/μL,检测下限为10拷贝/μL。与大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、副伤寒沙门氏菌、副溶血弧菌、绿脓杆菌、产酸克雷伯菌、布鲁氏菌S2株和鲍曼不动杆菌均无交叉反应。对13个组织样本进行检测,阳性率为76.9%,与实时荧光定量PCR检测结果的符合率达92.3%。综上所述,本研究建立的羊源多杀性巴氏杆菌实时荧光RPA方法具有特异性强、灵敏度高、可靠、快速便捷等特点,适用于多杀性巴氏杆菌的临床分子诊断。 展开更多

关键词 多杀性巴氏杆菌 KMT1基因 RPA检测 荧光探针 分子诊断

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基于潜在类别分析对不同年龄组患者新冠肺炎病因病机证候研究 被引量：4

5

作者 翟洪军 陈启光 +8 位作者 申春悌 陆炜青 王一 王池社 钱刘兰 程逸文 林杰 邹冲 黄亚博 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2021年第3期866-873,共8页

目的基于潜在类别模型的分析结果,探讨不同年龄组新冠肺炎普通型确认患者的主要病因病机和证候差异。方法对605例普通型新冠肺炎四诊数据按照老龄组和非老龄组采用多样本潜在类别分析,计算两个年龄组各类的类别概率和患者症状的条件概... 目的基于潜在类别模型的分析结果,探讨不同年龄组新冠肺炎普通型确认患者的主要病因病机和证候差异。方法对605例普通型新冠肺炎四诊数据按照老龄组和非老龄组采用多样本潜在类别分析,计算两个年龄组各类的类别概率和患者症状的条件概率。根据条件概率提取主要症状和两个年龄组各类别的共同症状和特异症状,进而分析两个年龄组各类患者的病因病机及证候。结果根据模型分析结果,感染新冠肺炎病毒后,老龄群体常见症状为神疲乏力、咳嗽、纳呆、发热、腻苔和咯痰,主要证型为"湿热伤肺、脾肾两虚"(51.6%);非老龄组则以发热、咳嗽、神疲乏力和咯痰为常见,主要证型为"热痰(湿)伤肺,脾虚不运"(40.0%)。结论老龄群体感染新冠肺炎后,首先出现气虚证,病性为气虚、痰湿和热毒,病位在肺、脾、肾。而非老龄群体则以发热为主症,病性以热毒、痰湿为主,伴有气虚,病位在肺、脾。 展开更多

关键词 新冠肺炎 病因病机 证候 年龄组 潜在类别分析

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中医药促进家庭医生签约服务提质增效的推进策略 被引量：6

6

作者 程逸文 《智慧健康》 2018年第27期15-16,共2页

家庭医生签约服务是以全科医生为核心,通过签约的方式,与签约家庭建立起一种长期、稳定的服务关系,对签约家庭的健康进行全程维护^([1])。《中医药法》提出应当发展中医药预防、保健服务。全面推进中医药融入家庭医生签约服务有利于提... 家庭医生签约服务是以全科医生为核心,通过签约的方式,与签约家庭建立起一种长期、稳定的服务关系,对签约家庭的健康进行全程维护^([1])。《中医药法》提出应当发展中医药预防、保健服务。全面推进中医药融入家庭医生签约服务有利于提升家庭医生签约服务质量,改善居民健康水平。 展开更多

关键词 家庭医生签约服务 中医药 推进 对策 分析

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羊源D型多杀性巴氏杆菌感染小鼠脾脏转录组分析 被引量：1

7

作者 李彬 陈巧玲 +10 位作者 程逸文 陈杰 张振兴 安琪 黄惠娴 刘志勇 翟哲 满初日嘎 王凤阳 杜丽 陈思 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第12期4391-4402,共12页

试验旨在探索羊源D型多杀性巴氏杆菌入侵宿主脾脏组织中引发的免疫应答途径。首先利用羊源D型多杀性巴氏杆菌(HN01菌株)感染小鼠,建立羊源D型多杀性巴氏杆菌感染的动物模型;之后利用转录组测序技术获得感染小鼠与正常小鼠的脾脏转录组数... 试验旨在探索羊源D型多杀性巴氏杆菌入侵宿主脾脏组织中引发的免疫应答途径。首先利用羊源D型多杀性巴氏杆菌(HN01菌株)感染小鼠,建立羊源D型多杀性巴氏杆菌感染的动物模型;之后利用转录组测序技术获得感染小鼠与正常小鼠的脾脏转录组数据,并使用COG、KOG、eggNOG、GO、KEGG数据库对测序结果中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行功能注释与分析,同时对于显著富集到关键免疫通路的差异表达基因使用STRING软件和KEGG mapper进行蛋白互作分析,筛选出核心通路中起关键作用的基因;最后选取关键的10个基因进行实时荧光定量RT-PCR验证。转录组分析结果显示,与正常组相比,感染组中筛选出3380个差异表达基因(P<0.01,log_(2)|FoldChange|≥0.5),其中1691个基因上调,1689个下调。基因功能富集分析结果表明,感染组脾脏中的差异表达基因主要发挥信号转导的功能,其主要参与的生物途径包括细胞因子与细胞因子受体互作通路、趋化因子信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路。蛋白互作分析筛选出约28个核心差异表达基因,结合实时荧光定量RT-PCR验证后,其中9个基因的表达结果与测序一致,分别是C3、Cd4、Cxcl13、Lck、Gnai1、Grap2、IL-6、Cxcr6及Serping1基因。本研究初步证明了脾脏在抵抗多杀性巴氏杆菌入侵中参与了一系列免疫应答反应,为进一步研究羊源D型多杀性巴氏杆菌与宿主之间相互作用的分子机制奠定理论基础。 展开更多

关键词 多杀性巴氏杆菌 转录组分析 脾脏 免疫应答

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公立医院医药价格综合改革下的经营管理变革探索 被引量：1

8

作者 程逸文 《中国卫生产业》 2018年第35期192-194,共3页

公立医院改革的内容与人为涉及到运行管理体制、调整服务价格、医保支付以及人事管理和医药价格等。该文对试点医院进行调查,研究公立医院综合改革内容以及对医院经营管理产生的影响和存在的问题,并在此基础上就如何积极应对配合综合改... 公立医院改革的内容与人为涉及到运行管理体制、调整服务价格、医保支付以及人事管理和医药价格等。该文对试点医院进行调查,研究公立医院综合改革内容以及对医院经营管理产生的影响和存在的问题,并在此基础上就如何积极应对配合综合改革,加强经营管理,提高医院效益,分享个人的观点与认识。 展开更多

关键词 公路公立医院 药价改革 经营管理 对策 研究

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互联网医院推动中医药优质资源辐射的探索与实践 被引量：7

9

作者 罗立波 程逸文 +1 位作者 张彤 夏小润 《江苏中医药》 CAS 2021年第7期68-70,共3页

中医药服务涉及预防、保健、养生、医疗、护理、康复全过程和全生命周期。我国中医药医疗资源供给相对不足,中医医院通过树立互联网思维,建设互联网医院,可以推动中医药优质资源辐射。常州市中医医院是江苏省首批互联网医院试点单位,对... 中医药服务涉及预防、保健、养生、医疗、护理、康复全过程和全生命周期。我国中医药医疗资源供给相对不足,中医医院通过树立互联网思维,建设互联网医院,可以推动中医药优质资源辐射。常州市中医医院是江苏省首批互联网医院试点单位,对建设中医互联网医院进行了大量有益的探索,如拓展互联网医院治未病服务、融合线上线下中医医疗服务、优化全天候中医在线复诊、延伸“互联网+护理”“互联网+康复”“互联网+中药”服务、创新中医药文化传播途径等。通过这些实践,打造具有中医药特色的互联网医院。下一步可从以下方面深化互联网中医医院建设:注重互联网中医医院与人工智能结合,进一步推进互联网+名中医诊疗模式运行;注重互联网中医医院基于平台建设的整合与运营;注重互联网医生的规范化培训和互联网医院的监管。 展开更多

关键词 互联网医院 中医药资源 健康服务 知识传播 资源配置

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家户储蓄对本地农村劳动力具有吸附力吗?——基于CLDS2018的实证分析 被引量：1

10

作者 李丹 高正昊 +1 位作者 程逸文 马玉波 《农业经济与管理》 CSSCI 北大核心 2022年第4期91-100,共10页

把握影响农村劳动力流动的影响因素,对于合理分配人力资源,促进经济高质量发展具有重要的现实意义。基于2018年CLDS数据个体及家户样本,利用Logit分类评定模型及中介效应模型分析农户大额消费需求、家户储蓄、回迁行为之间的内在逻辑关... 把握影响农村劳动力流动的影响因素,对于合理分配人力资源,促进经济高质量发展具有重要的现实意义。基于2018年CLDS数据个体及家户样本,利用Logit分类评定模型及中介效应模型分析农户大额消费需求、家户储蓄、回迁行为之间的内在逻辑关系。结果表明,家户储蓄对农村劳动力回流行为具有显著正向促进作用和显著中介效应,农村劳动力为了追求更高的储蓄以满足其远期大额消费而选择回流,医疗、养老、安置三项大额消费需求是农户追求高储蓄从而进行回迁的深层动机。因此,要加强政策支持、优化农村信贷环境、完善农村金融服务体系,利用储蓄的综合引导、经济渗透与串联作用促进农村劳动力在地域间合理分配。 展开更多

关键词 家户储蓄 农户大额消费 农村劳动力回流

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牛源鲍曼不动杆菌的分离鉴定 被引量：1

11

作者 杨资冬 程逸文 +5 位作者 张振兴 吴昊天 王成强 陈巧玲 陈思 满初日嘎 《热带生物学报》 2021年第4期435-440,共6页

牛源鲍曼不动杆菌属于机会性致病细菌,不仅感染动物,还可通过接触传播感染人,引起严重的医源性感染。为了预防人畜感染鲍曼不动杆菌,并为治疗提供理论依据,本实验鉴定了海南省东方市某牛场病死牛致病菌,深入探究该牛场牛病死具体原因,... 牛源鲍曼不动杆菌属于机会性致病细菌,不仅感染动物,还可通过接触传播感染人,引起严重的医源性感染。为了预防人畜感染鲍曼不动杆菌,并为治疗提供理论依据,本实验鉴定了海南省东方市某牛场病死牛致病菌,深入探究该牛场牛病死具体原因,对该患病牛肺脏组织进行采集,分离纯化致病菌株,通过16S rDNA及生化鉴定等方法确定致病菌遗传背景,同时测定该致病菌对6周龄昆明小鼠的半数致死量及其药物敏感性。实验结果表明:该致病菌株与鲍曼不动杆菌的同源性高达99.8%;对实验小鼠体致病力强,对半数致死量为8.89×10^(7) CFU·mL^(-1);药物敏感试验表明,该菌株对羧苄青霉素、氧氟沙星、环丙沙星敏感。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 生化鉴定 药敏试验

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江苏省常州市医疗联合体模式的构建与思考 被引量：6

12

作者 王莉 汪晓东 +2 位作者 岳健 程逸文 奚淑英 《中国医疗管理科学》 2016年第2期13-17,共5页

医疗联合体是公立医院改革的一项有效途径。介绍了常州市通过医疗机构管理模式、医疗保险支付模式和市民就医模式的综合改革,探索构建医疗联合体,并就其运行机制、发展目标、建设中出现的问题和原因进行了分析,提出了医疗联合体建设要... 医疗联合体是公立医院改革的一项有效途径。介绍了常州市通过医疗机构管理模式、医疗保险支付模式和市民就医模式的综合改革,探索构建医疗联合体,并就其运行机制、发展目标、建设中出现的问题和原因进行了分析,提出了医疗联合体建设要加强统筹和监管、注重顶层设计、相关部门要联动并予以配套政策支持、要有高效和完善的管理机制及医疗联合体内要建立质量管理和控制体系的建议。 展开更多

关键词 医疗联合体 分级诊疗 双向转诊

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奚向东运用“六神穴透刺十三针”治疗躯体形式障碍经验 被引量：1

13

作者 董华 程逸文 +1 位作者 邢文 奚向东 《湖北中医杂志》 2023年第7期21-24,共4页

躯体形式障碍(SD)是一种发病机制尚不明确,以无器质性病变的躯体症状为主要特征的疾病[1]。中医学常归属于“郁证范畴”。患有SD疾病的患者常伴有焦虑或抑郁等情绪改变,临床表现多样化,患者对躯体不适的描述可涉及多个器官系统[2],但躯... 躯体形式障碍(SD)是一种发病机制尚不明确,以无器质性病变的躯体症状为主要特征的疾病[1]。中医学常归属于“郁证范畴”。患有SD疾病的患者常伴有焦虑或抑郁等情绪改变,临床表现多样化,患者对躯体不适的描述可涉及多个器官系统[2],但躯体检查与实验室检查常无相关的器质性改变。近年来躯体形式障碍的发病率不断增加,造成医疗资源浪费的同时也给患者带来了巨大经济负担[3-4]。 展开更多

关键词 躯体形式障碍 郁证 六神穴 治神 形神同治

原文传递

ORFV感染条件下RSAD2影响宿主细胞免疫反应的研究

14

作者 蒋俊明 刘志勇 +8 位作者 程逸文 吴慧 潘浩举 陈巧玲 高宏岩 满初日嘎 陈思 王凤阳 杜丽 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2509-2519,共11页

为了探究RSAD2在羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)感染下的作用机制,本研究通过慢病毒系统构建RSAD2表达下调的山羊皮肤成纤维(goat skin fibroblast,GSF)细胞。在ORFV感染0、6 h时,分别对GSF细胞(空白对照组:C0、C6)、转染含无意义shRNA慢... 为了探究RSAD2在羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)感染下的作用机制,本研究通过慢病毒系统构建RSAD2表达下调的山羊皮肤成纤维(goat skin fibroblast,GSF)细胞。在ORFV感染0、6 h时,分别对GSF细胞(空白对照组:C0、C6)、转染含无意义shRNA慢病毒载体的GSF细胞(阴性对照组:N0、N6)以及RSAD2表达下调的GSF细胞(试验组:R0、R6)进行转录组测序,分析RSAD2影响GSF细胞的免疫应答反应。结果表明,R6 vs R0有1154个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并显著富集到NOD样受体信号通路和Toll样受体信号通路。RT-qPCR验证了8个DEGs的表达,包括ACKR3、IL-1A、CCL20、SDC4、SESN2、PCK2、GADD45A和MKNK2。另外,IL-6在ORFV感染及RSAD2干扰后,表达均呈下降的趋势。在蛋白质互作网络中,IL-6蛋白被鉴定潜在的核心蛋白之一,提示其可能与RSAD2蛋白协同抵抗ORFV感染。本研究阐述了RSAD2表达下调GSF细胞在ORFV感染条件下的免疫图谱,为后续RSAD2抗ORFV机制及宿主-ORFV相互作用研究奠定了基础。 展开更多

关键词 羊口疮病毒 RSAD2 转录组测序 IL-6

原文传递

基于潜在类别分析的新型冠状病毒肺炎患者中医证候分类研究 被引量：13

15

作者 陆炜青 钱刘兰 +9 位作者 翟洪军 黄亚博 王一 林杰 程逸文 沈春锋 黄晓珊 庄鑫 陈启光 申春悌 《中医杂志》 CSCD 北大核心 2021年第4期296-302,共7页

目的基于潜在类别分析方法对新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)患者的中医初始症状及现症进行分类,探讨新冠肺炎的核心病机。方法采集2020年2-3月18家医院650例新冠肺炎患者的中医初始症状及中医现症,根据阳性率纳入相关指标,对纳入的中... 目的基于潜在类别分析方法对新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)患者的中医初始症状及现症进行分类,探讨新冠肺炎的核心病机。方法采集2020年2-3月18家医院650例新冠肺炎患者的中医初始症状及中医现症,根据阳性率纳入相关指标,对纳入的中医临床症状的二分类信息进行潜在类别分析,识别其核心病机和中医证候诊断分类。具体分析过程包括概率参数化、参数估计与模型拟合、潜在分类与结果的中医理论解释。结果初始症状纳入分析的病例数为605例、症状指标23个,根据阳性率纳入初始症状指标17个,最终取3个类别的潜在类别模型。潜在类别1证候要素的病性为温(热)邪、痰湿和气虚,病位在肺;潜在类别2证候要素的病性为温(热)邪和气虚;潜在类别3证候要素的病性为温(热)邪、痰湿和气虚,病位为肺;综合分析,新冠肺炎发病时的主要证候要素病性为温(热)邪、痰湿、气虚,病位是卫表、肺。中医现症纳入分析的病例数为650例、症状指标55个,根据阳性率纳入现症指标43个,最终取4个类别的潜在类别模型。潜在类别1证候要素的病性为温(热)邪、湿邪、痰邪、气虚,病位主要在肺,分类命名为湿温(热)毒蕴、痰热郁肺;潜在类别2证候要素的病性为温(热)邪、湿邪、气虚,病位主要在脾,分类命名为湿温(热)毒蕴、脾失健运;潜在类别3证候要素的病性为湿邪、温(热)邪,病位主要在脾,分类命名为湿温(热)毒蕴、气阴两伤;潜在类别4证候要素的病性是温(热)邪、湿邪、气虚、阴虚,病位在脾、心,分类命名为湿温(热)毒蕴、心脾两虚。结论基于潜在类别分析方法,新冠肺炎发病初期的证候为湿温(热)毒袭卫表,继而犯肺,兼有肺气不足;其核心病机为湿温(热)毒蕴,兼见痰热郁肺、脾失健运、气阴两伤、心脾两虚。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 潜在类别分析 中医证候 证候要素 湿温毒疫

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一株羊源A型多杀性巴氏杆菌的全基因组测序及生物学特性分析 被引量：5

16

作者 张振兴 陈珍 +6 位作者 刘昂 程逸文 陈思 杜丽 满初日嘎 王凤阳 陈巧玲 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期4061-4074,共14页

【背景】多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)是一种革兰氏阴性菌,可引起动物和人类的呼吸道疾病和败血症等。本实验室前期分离鉴定一株A型Pm HN02菌株。【目的】通过对HN02菌株的全基因组测序及生物信息学分析,扩充多杀性巴氏杆... 【背景】多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)是一种革兰氏阴性菌,可引起动物和人类的呼吸道疾病和败血症等。本实验室前期分离鉴定一株A型Pm HN02菌株。【目的】通过对HN02菌株的全基因组测序及生物信息学分析,扩充多杀性巴氏杆菌的基因组数据库信息;通过毒力基因鉴定和系统进化树分析,明确该菌株含有的毒力基因和遗传进化关系,为临床预防和诊断提供理论依据。【方法】使用单分子实时测序(Single Molecule Real Time Sequencing,SMRT)技术对Pm HN02菌株进行全基因组测序,利用Illumina测序校正后进行基因功能注释和生物信息学分析。使用PCR鉴定菌株毒力基因,并构建进化树进行分析。【结果】Pm HN02菌株全基因组大小为2 333 292 bp,GC含量为40.15%,预测到的编码基因有2 389个,包含19个rRNA (6个23S rRNA、6个16S rRNA、7个5SrRNA)、62个tRNA基因、5个sRNA;含84个串联重复序列、66个小卫星DNA、2个微卫星DNA、9个基因岛、9个前噬菌体;分别有1 648、2 190和1 917个基因注释在GO、KEGG和COG数据库中,而且大部分富集于Pm的代谢过程;还有85个III型分泌系统效应蛋白、191个表型突变基因、165个毒力因子相关基因。根据分析结果绘制该菌株的全基因组圈图,并将基因组信息提交至NCBI后获得登录号cp037865。PCR鉴定发现该菌株含有fimA、toxA等14个毒力基因,缺失了tadD等毒力基因。系统进化树分析发现该菌株同北京的Pm3菌株(MH150895.1)进化关系最接近。【结论】研究完成了A型Pm HN02株的全基因组测序和生物学特性鉴定,揭示了其同国内外Pm分离株的进化关系,为预防Pm疾病流行和探索Pm致病机制提供了参考。 展开更多

关键词 A型多杀性巴氏杆菌 基因组测序 生物信息学分析 毒力相关基因 系统进化树分析

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多杀性巴氏杆菌攻毒小鼠肺脏的转录组分析 被引量：1

17

作者 陈杰 陈巧玲 +9 位作者 陈思 程逸文 刘志勇 李彬 刘昂 满初日嘎 王凤阳 杜丽 李昌 金宁一 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期778-788,共11页

多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)可感染多种动物宿主并引发败血症和呼吸道疾病,危害动物健康,给养殖业带来严重经济损失。本研究为探究多杀性巴氏杆菌感染期间对宿主肺脏基因表达的影响,选取羊源A型多杀性巴氏杆菌对小鼠(Mus mus... 多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)可感染多种动物宿主并引发败血症和呼吸道疾病,危害动物健康,给养殖业带来严重经济损失。本研究为探究多杀性巴氏杆菌感染期间对宿主肺脏基因表达的影响,选取羊源A型多杀性巴氏杆菌对小鼠(Mus musculus)进行攻毒实验,攻毒后72 h采集小鼠肺脏组织并提取总RNA。基于转录组测序,与对照组相比,攻毒组获得2443个差异表达基因,其中有1437个基因上调,1006个基因下调。对2443个差异表达基因进行GO富集分析,结果显示,差异基因显著富集的GO terms主要有B细胞稳态、T细胞迁移的正调控、整合素复合物和胶原蛋白结合;KEGG富集分析结果显示,差异基因显著富集于11条免疫炎症信号通路,包括细胞因子与细胞因子受体互作、趋化因子信号通路等;免疫炎症相关信号通路中,差异基因经蛋白质-蛋白质互作分析,结果显示,C3、C3ar1、C5ar1、Cxcl10、Cxcr2和Gng11基因处于网络中心,说明这些基因在多杀性巴氏杆菌感染过程中发挥了重要作用;从11条免疫炎症通路的基因中挑选10个进行实时荧光定量PCR验证,发现有8个基因表达趋势与测序结果相符,说明测序数据可靠。本研究展示了小鼠在多杀性巴氏杆菌感染过程中参与免疫反应的关键基因,为探索宿主抗多杀性巴氏杆菌感染分子机制提供了理论依据。 展开更多

关键词 多杀性巴氏杆菌 小鼠肺脏 转录组 实时荧光定量PCR

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羊源多杀性巴氏杆菌ExbD基因克隆、原核表达及生物信息学分析 被引量：4

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作者 程逸文 安琪 +3 位作者 张萌萌 王成强 王凤阳 杜丽 《畜牧与兽医》 北大核心 2020年第5期107-111,共5页

旨在克隆和表达羊源多杀性巴氏杆菌的ExbD基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析。试验通过PCR成功扩增出目的基因片段,将所回收片段与pET-28a(+)载体进行连接,构建pET-28a(+)-ExbD重组质粒,将所得pET-28a(+)-ExbD重组质粒经双酶切鉴... 旨在克隆和表达羊源多杀性巴氏杆菌的ExbD基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析。试验通过PCR成功扩增出目的基因片段,将所回收片段与pET-28a(+)载体进行连接,构建pET-28a(+)-ExbD重组质粒,将所得pET-28a(+)-ExbD重组质粒经双酶切鉴定后转至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,通过自诱导表达,SDS-PAGE和Western blot鉴定表达产物。结果显示:扩增出390 bp的目的基因,诱导表达得到约为19 ku的重组蛋白。经生物信息学分析,该蛋白为疏水性酸性蛋白,属于稳定蛋白,分子式为C656H1068N160O193S3,分子质量约为14.44 ku,消光系数(L·mol^-1·cm^-1=280 nm)为6990,理论等电点是5.16,不稳定系数为35.28(<40),总平均疏水性(GRAVY)为0.145,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。本试验通过对ExbD基因的克隆、表达和分析,为进一步探究该基因的功能提供了基础和参考依据。 展开更多

关键词 多杀性巴氏杆菌 ExbD基因 克隆 原核表达 生物信息学分析

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布鲁氏菌脂多糖刺激山羊支气管上皮细胞的全转录组分析

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作者 吴昊天 张振兴 +11 位作者 陈思 刘志勇 安琪 陈杰 程逸文 刘昂 何美荣 蒋俊明 陈巧玲 王凤阳 杜丽 满初日嘎 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1851-1861,共11页

布鲁氏菌(Brucella)的细胞壁成分脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)是布鲁氏菌逃避宿主免疫的主要毒力因子之一,由于LPS具有较低的免疫原性,因而不会激活宿主Toll样受体。本研究采用猪布鲁氏菌S2株(Brucella suis S2,B.suis S2)的LPS刺激... 布鲁氏菌(Brucella)的细胞壁成分脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)是布鲁氏菌逃避宿主免疫的主要毒力因子之一,由于LPS具有较低的免疫原性,因而不会激活宿主Toll样受体。本研究采用猪布鲁氏菌S2株(Brucella suis S2,B.suis S2)的LPS刺激山羊(Capra hircus)支气管上皮细胞,通过全转录组测序技术筛选响应B.suis S2 LPS刺激的宿主差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)和差异表达miRNA。通过筛选结果中|log2fold change|>1且P<0.05的基因和miRNA,在LPS刺激组和对照组间共产生97个差异基因和3条差异miRNA,其中包括58个上调基因和39个下调基因,3条差异miRNA均为下调。通过基因本体论(gene ontology,GO)注释和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集发现,DEGs主要富集于ATP代谢、RAGE受体结合、IL-12受体活性、趋化因子信号通路、细胞凋亡、细胞黏附分子、白细胞跨内皮迁移、B细胞受体信号通路、FcγR介导的吞噬作用等通路。蛋白质互作网络图可以将DEGs编码的蛋白质分为4个聚类,分别代表神经内分泌相关蛋白、核糖体相关蛋白、呼吸作用相关蛋白和免疫系统相关蛋白。此外,筛选到的chi-miR-1与INPP5D在B细胞受体信号通路上存在潜在相互调控作用。经RT-qPCR验证,基因表达量变化趋势和测序结果一致。该结果为进一步研究布鲁氏菌LPS在布鲁氏菌免疫逃逸以及宿主免疫应答中的功能奠定基础。 展开更多

关键词 布鲁氏菌 脂多糖 转录组 免疫逃避

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