荷斯坦牛关键奶流速指标筛选及影响因素分析

1

作者 陈少侃 罗汉鹏 +5 位作者 马烨桦 刘刚 王迪 郝科比 王雅春 郭刚 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期212-219,共8页

【目的】本研究旨在探究挤奶流速指标的群体表型变化规律、指标间相关性及主要影响因素,筛选荷斯坦牛关键奶流速指标。【方法】本研究收集了北京地区某规模化牧场2162头泌乳牛1181628条奶流速数据,包含班次奶量及11项奶流速指标(平均流... 【目的】本研究旨在探究挤奶流速指标的群体表型变化规律、指标间相关性及主要影响因素,筛选荷斯坦牛关键奶流速指标。【方法】本研究收集了北京地区某规模化牧场2162头泌乳牛1181628条奶流速数据,包含班次奶量及11项奶流速指标(平均流速、挤奶时长、高峰流速、慢速出奶时间占比、脱杯流速、0―15 s流速、15―30 s流速、30―60 s流速、60―120 s流速、前2 min产量和前2 min产量占比),并对班次奶量与上述奶流速指标进行了正态性检验、回归分析、相关性分析,以及影响因素分析。【结果】班次奶量与11项奶流速指标均呈正态分布;其中0―15 s流速、15―30 s流速、30―60 s流速、60―120 s流速、前2 min产量、高峰流速、平均流速和挤奶时长与班次奶量呈正向回归关系,且在各因素水平下变化规律一致;各指标间均存在显著的相关关系(P<0.05),相关系数在—0.80~0.95之间;相关性分析结果表明,平均流速和前2 min产量可作为关键奶流速指标,随着班次奶量的增加均呈现逐渐增加的规律,且在不同年份、季节、胎次、泌乳阶段和挤奶班次均差异显著(P<0.05)。【结论】平均流速和前2 min产量可作为奶流速指标考核的关键指标,但在实际生产管理中,需根据牛群结构和环境变化来设定指标的参考值。随着精细化管理,对于平均流速和前2 min产量可以逐步设定更高参考阈值来获取更高的产奶量,进而增加经济效益。 展开更多

关键词 奶流速 班次奶量 荷斯坦牛

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GnRH1基因多态性与奶牛繁殖、产奶和热应激反应性状的关联分析 被引量：1

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作者 高清 张海亮 +7 位作者 胡丽蓉 张帆 许静漪 徐昊祺 罗汉鹏 刘林 郭刚 王雅春 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期90-95,共6页

为探究GnRH1基因多态性与奶牛繁殖性状、产奶性状和热应激抗性的关系,本研究基于70头中国荷斯坦公牛的DNA混池测序,对GnRH1基因全序列及上下游2000 bp进行SNP位点扫描,在外显子2上发现1处同义突变位点g.72735118A>G,采用竞争性等位... 为探究GnRH1基因多态性与奶牛繁殖性状、产奶性状和热应激抗性的关系,本研究基于70头中国荷斯坦公牛的DNA混池测序,对GnRH1基因全序列及上下游2000 bp进行SNP位点扫描,在外显子2上发现1处同义突变位点g.72735118A>G,采用竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术对1160头泌乳期健康荷斯坦牛进行SNP分型,并采用GLM模型对SNP位点g.72735118A>G与繁殖、产奶和热应激反应性状的育种值进行关联分析。群体遗传学分析显示,位点g.72735118A>G符合哈代-温伯格平衡,基因型AA、AG和GG的频率分别为0.48、0.44和0.08,最小等位基因频率为0.30,多态性信息含量为0.42。关联分析表明,位点g.72735118A>G与初产日龄、首次配种受胎率、产犊至首次配种间隔、青年牛和经产牛首末次配种间隔等繁殖性状极显著相关,与头胎产奶量、乳脂量和乳蛋白量等产奶性状极显著相关,同时与直肠温度极显著相关。位点g.72735118A>G的不同基因型中,GG型个体的头胎产奶性状和繁殖性状均表现更优,但抗热应激能力较差;然而,AA型个体的产奶性状和繁殖性状表现较差,但抗热应激能力更强。综上,GnRH1基因是中国荷斯坦牛繁殖性状的重要候选基因,同时在奶牛的乳腺发育和体温调节上发挥着重要作用,可根据育种目标将SNP位点g.72735118A>G作为分子遗传标记应用于中国荷斯坦牛的分子育种。 展开更多

关键词 GnRH1 奶牛 关联分析 繁殖性能 泌乳性能 热应激反应

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基于智能项圈系统荷斯坦牛发情相关指标的遗传参数估计及全基因组关联分析

3

作者 杨明路 张海亮 +7 位作者 罗汉鹏 黄锡霞 张翰林 章施施 王炎 刘林 郭刚 王雅春 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期995-1006,共12页

【目的】探究基于奶牛智能项圈系统产生的发情指数和活动峰值指标的群体规律及其影响因素,对其进行遗传参数估计,并利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘与奶牛发情相关指标的遗传标记,以期为从遗传育种角度... 【目的】探究基于奶牛智能项圈系统产生的发情指数和活动峰值指标的群体规律及其影响因素,对其进行遗传参数估计,并利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘与奶牛发情相关指标的遗传标记,以期为从遗传育种角度制定选育策略提高奶牛繁殖力提供有用信息。【方法】试验以北京市某规模化牧场健康的泌乳期荷斯坦牛为研究对象,收集了该牧场2017年7月至2020年5月2 074头泌乳牛的发情记录,包括发情指数和活动峰值,同时收集了试验牛的产犊记录;采用SAS 9.4中MIXED过程,分析了非遗传因素对发情指数和活动峰值的影响;基于DMU软件DMUAI模块,使用双性状动物模型估计了发情指数与活动峰值的遗传力及遗传相关,并计算了发情指数与常规繁殖性状的近似遗传相关;以逆回归育种值为关联分析的表型,利用Farm CPU软件分别对发情指数和活动峰值进行了GWAS。【结果】荷斯坦牛发情指数为(71.77±19.13)au,活动峰值为(105.94±30.73)au/2h。发情指数遗传力为0.04±0.01,活动峰值遗传力为0.19±0.04,均为低遗传力性状;发情指数与活动峰值之间的遗传相关为0.45±0.03;发情指数与经产牛首末次配种间隔、首次产犊日龄和青年牛首末次配种间隔的近似遗传相关分别为0.37、-0.41、-0.55。两个性状的GWAS共找到7个在全基因组水平上显著的SNP位点,分别位于7条染色体上,显著位点附近(300 kb内)共发现基因31个。【结论】通过项圈系统获得的发情指数和活动峰值是可遗传的,两者之间存在中等遗传相关,活动峰值为中低遗传力,且能够一定程度上反映奶牛的发情指数,活动峰值和发情指数为研究奶牛的发情行为以及提高母牛的繁殖力提供了新的方向。GWAS鉴定到的候选基因PTGS1(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase1)和NDUFA8(Ubiquinone Oxidoreductase Subunit A8)的功能与供体胚胎总数有关,VEGFA(Vascular Endothelial Growth Factor A)基因功能与奶牛繁殖有关,可作为奶牛发情相关指标的候选基因进行深入研究。 展开更多

关键词 繁殖性状 发情指数 活动峰值 遗传参数 全基因组关联分析

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奶牛育种中的长寿性状 被引量：8

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作者 张海亮 刘澳星 +4 位作者 米思远 李想 罗汉鹏 鄢新义 王雅春 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第19期4070-4082,共13页

长寿性状是奶牛育种中最重要的功能性状之一,除产量性状之外,长寿性状具有最大的经济价值。由于遗传力低、数据分布特殊和性状表现晚等特点,长寿性状也是选育难度最大的性状之一。自上世纪50年代起,长寿性状就进入了各国奶牛育种家的视... 长寿性状是奶牛育种中最重要的功能性状之一,除产量性状之外,长寿性状具有最大的经济价值。由于遗传力低、数据分布特殊和性状表现晚等特点,长寿性状也是选育难度最大的性状之一。自上世纪50年代起,长寿性状就进入了各国奶牛育种家的视野,针对长寿性状的研究持续进行;上世纪90年代后,各奶业发达国家陆续将长寿性状纳入其奶牛综合选择指数。目前,我国奶牛综合选择指数(CPI)中尚不包含长寿性状,对长寿性状的研究也处于起步阶段。文章通过整理分析奶牛长寿性状的有关研究,从性状定义、遗传评估方法、与其他性状的关系、遗传标记、性状选育策略等方面系统介绍了长寿性状的研究和选育情况。通过汇总有关长寿性状与其他性状遗传相关的研究,阐述了长寿性状与其他性状之间的复杂关系;通过收集各国奶牛选育方案中的相关信息,重点介绍了各主要奶业发达国家对长寿性状的选育策略。此外,本文还通过收集在我国奶牛群体中针对长寿性状开展的研究,概述了奶牛长寿性状在我国的研究现状。长寿性状有许多不同的定义,可使用不同的模型对其进行遗传评估,包括线性模型、阈模型、生存分析模型和随机回归模型等。长寿性状与产量、体型、繁殖、健康和管理类性状等存在低到中等的遗传相关,线性体型性状中,与泌乳系统有关的体型性状与长寿性状的遗传相关较高;繁殖和健康性状表现更好的奶牛,其长寿性状通常表现更好;长寿性状与其他性状之间的遗传关系受牛群选育方向的影响较大,在不同群体中,长寿性状与同一性状的遗传相关不尽相同。奶业发达国家的奶牛综合选择指数中均包含长寿性状,这些国家除了使用直接长寿进行选择之外,部分国家还同时采用间接选择的方法对长寿性状进行选育,常用于间接选择长寿性的其他性状主要包括泌乳系统、腰强度、尻角度、肢蹄和乳房炎抗性等。在不同群体中,均发现了大量与长寿性状相关的遗传标记,其中大多数标记都定位在已报道的与繁殖、疾病和体型等性状相关的遗传区域内。文章还提出了从数据收集、遗传参数估计、遗传标记挖掘、评估模型和选择策略探讨等方面针对我国奶牛群体进行长寿性状研究的必要性。 展开更多

关键词 奶牛 长寿性 遗传评估 遗传相关 遗传标记 遗传选育

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不同模型估计中国荷斯坦牛生产寿命遗传参数 被引量：9

5

作者 李想 鄢新义 +4 位作者 罗汉鹏 刘林 郭刚 王新宇 王雅春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1162-1170,共9页

旨在估计中国荷斯坦牛生产寿命遗传参数,同时比较不同模型的预测可靠性和稳定性。本研究使用单性状动物模型、单性状公畜模型和多性状动物模型对北京地区29个牧场90049头中国荷斯坦母牛的生产寿命数据进行遗传参数估计,所有模型均考虑... 旨在估计中国荷斯坦牛生产寿命遗传参数,同时比较不同模型的预测可靠性和稳定性。本研究使用单性状动物模型、单性状公畜模型和多性状动物模型对北京地区29个牧场90049头中国荷斯坦母牛的生产寿命数据进行遗传参数估计,所有模型均考虑了场、出生年季、头胎产犊月龄组的固定效应,个体加性遗传效应(动物模型)或父亲遗传效应(公畜模型)的随机效应和残差效应。结果表明,单性状动物模型和单性状公畜模型估计的生产寿命遗传力分别为0.052和0.047,多性状动物模型估计的遗传力较为稳定,介于0.057与0.069之间,多性状动物模型的遗传相关在0.779~0.998之间。对于存在大量在群个体(删失记录)的数据,使用基于前三胎数据的多性状动物模型较为合适,模型预测稳定性更高。本研究对中国荷斯坦牛生产寿命进行了遗传评估,为提高牧场效益、实现平衡育种提供了理论基础。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 生产寿命 遗传参数 模型比较

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体况评分与步态评分对奶牛生产性能的影响 被引量：8

6

作者 成晓 罗汉鹏 +10 位作者 阮含章 左斌 蒋瑞祥 邵平平 徐伟 张震 许文明 连增建 魏俊飞 罗长松 王雅春 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第11期1-5,共5页

为探究奶牛体况评分和步态评分在奶牛管理中的作用,提高奶牛生产性能,研究对河南省362头泌乳天数在0-330 d的中国荷斯坦牛的体况和步态进行评分并收集了相应的DHI数据,利用固定模型分析牛只泌乳阶段、场-胎次、体况评分和步态评分四个... 为探究奶牛体况评分和步态评分在奶牛管理中的作用,提高奶牛生产性能,研究对河南省362头泌乳天数在0-330 d的中国荷斯坦牛的体况和步态进行评分并收集了相应的DHI数据,利用固定模型分析牛只泌乳阶段、场-胎次、体况评分和步态评分四个因子对产奶量和体细胞数（SCC）的影响,同时对影响体况评分的因素进行了分析。结果表明：体况评分对产奶量的影响显著（P〈0.05）,与体况评分为3.00-5.00的牛只相比,体况评分低于3.00时的奶牛日产奶量高了2.6-4.2 kg;步态评分对产奶量的影响极显著（P〈0.01）,与步态评分低于2.25的牛只相比,步态评分2.25-5.00的奶牛日产奶量低了4.1-6.1 kg。体况评分和步态评分对SCC的影响均不显著。场-胎次、泌乳阶段、步态评分对体况评分均有显著影响（P〈0.05）。对体况评分和步态评分之间的关系进行分析,发现步态评分与体况评分之间存在显著的回归关系,且回归系数为负值,即随着步态评分的升高,体况评分降低。由此可见,适宜的体况和步态有利于提高奶牛产奶性能,且体况评分和步态评分间存在对于生产有利的回归关系。说明对牛群的体况和步态进行评分,合理控制牛群体况、加强肢蹄健康管理,对提高奶牛生产性能具有重要意义。 展开更多

关键词 体况评分 步态评分 产奶量 体细胞数 生产性能 奶牛

原文传递

不同耐热性中国荷斯坦奶牛产奶量差异分析 被引量：7

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作者 罗汉鹏 李源韬 +6 位作者 刘嘉莉 徐伟 张海亮 董刚辉 李锡智 黄锡霞 王雅春 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第8期2263-2269,共7页

本研究通过评定热应激条件下奶牛呼吸评分和流涎指数,将中国荷斯坦泌乳奶牛划分为热应激耐受组(2 271头)和热应激易感组(2 024头),利用固定效应模型和混合效应模型考虑场、胎次和泌乳阶段等因素,比较热应激期奶牛直肠温度差异及奶牛在... 本研究通过评定热应激条件下奶牛呼吸评分和流涎指数,将中国荷斯坦泌乳奶牛划分为热应激耐受组(2 271头)和热应激易感组(2 024头),利用固定效应模型和混合效应模型考虑场、胎次和泌乳阶段等因素,比较热应激期奶牛直肠温度差异及奶牛在不同时期的产奶性能差异。结果表明,热应激耐受组奶牛直肠温度显著低于热应激易感组(P<0.05);在非热应激期(5月),热应激耐受奶牛与热应激易感奶牛的平均日产奶量接近,热应激耐受奶牛的较低(低0.68kg),但差异不显著(P>0.05);在热应激期(7~8月),两组奶牛产奶量均有下降,热应激耐受组奶牛平均日产奶量下降幅度(与5月相比)低于热应激易感组,尤其是在热应激最严重的8月(下降幅度分别为18.06%与23.01%)。以上试验结果表明,热应激环境下通过呼吸评分与流涎指数可有效判断奶牛的耐热性。本试验结果可为奶牛热应激反应评价及奶牛养殖过程中通过量化奶牛热应激反应,及时采取措施降低热应激的损失提供一定理论依据。 展开更多

关键词 荷斯坦奶牛 耐热性 直肠温度 产奶量

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奶牛乳房性状对泌乳性能的影响分析 被引量：5

8

作者 吴帆 徐伟 +7 位作者 罗汉鹏 杨影 张海亮 师睿 吴佳仪 董刚辉 郭刚 王雅春 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第8期12-15,19,共5页

为了发现有助于提高奶牛产奶量和乳房健康的关键乳房性状,为奶牛选种和管理提出建议,研究测定河北省定州某奶牛场一胎泌乳牛的乳头长度(859头牛的平均长度与均匀度)、乳房质地和乳房深度(1 630头),应用最小二乘法原理,配合线性固定效应... 为了发现有助于提高奶牛产奶量和乳房健康的关键乳房性状,为奶牛选种和管理提出建议,研究测定河北省定州某奶牛场一胎泌乳牛的乳头长度(859头牛的平均长度与均匀度)、乳房质地和乳房深度(1 630头),应用最小二乘法原理,配合线性固定效应模型,分析了乳头长度、乳房深度和乳房质地对产奶量和体细胞数的影响。结果表明:在头胎牛中,乳头长度对产奶量有极显著影响(P<0.01),对体细胞评分有显著影响(P<0.05),乳头越长、均匀度越高的个体,其产奶量越高,体细胞数越低;同时,乳房质地对产奶量有极显著影响(P<0.01),乳房较充盈硬实的个体产奶量较高;乳房深度和乳房质地对体细胞评分的影响虽然没有达到显著水平,但有乳房越深、质地越硬体细胞数越高的趋势。说明在生产中关注奶牛乳房性状,加强对乳房性状的选择与管理对于提高奶牛产奶性能、提高经济效益有着重要的作用。 展开更多

关键词 乳头长度 乳房深度 乳房质地 产奶量 体细胞数

原文传递

中国荷斯坦牛繁殖性状的基因组预测效果比较 被引量：2

9

作者 师睿 苏国生 +8 位作者 陈紫薇 李想 罗汉鹏 刘林 郭刚 张毅 王雅春 张胜利 张勤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期2944-2954,共11页

旨在比较不同方法对中国荷斯坦牛繁殖性状的基因组预测效果,选择最佳的基因组预测方法及信息矩阵权重组合(τ和ω)用于实际育种。本研究利用北京地区33个牧场1998—2020年荷斯坦牛群繁殖记录,分析了3个重要繁殖性状:产犊至首次配种间隔(... 旨在比较不同方法对中国荷斯坦牛繁殖性状的基因组预测效果,选择最佳的基因组预测方法及信息矩阵权重组合(τ和ω)用于实际育种。本研究利用北京地区33个牧场1998—2020年荷斯坦牛群繁殖记录,分析了3个重要繁殖性状:产犊至首次配种间隔(ICF)、青年牛配种次数(NSH)和成母牛配种次数(NSC)共98 483~197 764条表型数据。同时收集了8 718头母牛和3 477头公牛的基因芯片数据,根据具有芯片数据的牛群结构划分为公牛验证群和母牛验证群。随后,通过BLUPF90软件的AIREMLF90和BLUPF90模块利用最佳线性无偏预测(BLUP)、基因组最佳线性无偏预测(GBLUP)和一步法(ssGBLUP)对3个性状进行基因组预测,不同方法的预测效果根据准确性和无偏性来评估。结果表明,3个繁殖性状均为低遗传力性状(0.03~0.08);ssGBLUP方法中,各性状信息矩阵的权重取值能够在一定程度上提升基因组预测的效果;ICF、NSH和NSC在母牛验证群下的最佳权重取值分别为:τ=1.3和ω=0,τ=0.5和ω=0.4以及τ=0.5和ω=0;在公牛验证群下最优权重组合分别为:τ=1.5和ω=0,τ=1.3和ω=0.8以及τ=0.5和ω=0;基于最佳权重的ssGBLUP方法准确性较BLUP和GBLUP方法准确性分别提升了0.10~0.39和0.08~0.15,且无偏性最接近于1。综上,使用最佳权重组合的ssGBLUP时,各性状基因组预测结果具有较高准确性和无偏性,建议作为中国荷斯坦牛繁殖性状基因组选择方法。 展开更多

关键词 奶牛 繁殖性状 基因组选择 准确性 无偏性

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北京地区夏季体温变化对奶牛泌乳性能的影响分析 被引量：3

10

作者 张海亮 蒋宝成 +7 位作者 李想 徐伟 吴帆 罗汉鹏 曹露 董刚辉 郭刚 王雅春 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第2期5-9,共5页

为了探究夏季热应激状态下奶牛体温变化对产奶量和乳成分的影响,试验测定北京地区5个牛场1 691头中国荷斯坦泌乳母牛连续2 d上午和下午的直肠温度(RT)、体况评分(BCS)以及当月泌乳性能(DHI数据),在固定模型中考虑了测定年、场(年场效应... 为了探究夏季热应激状态下奶牛体温变化对产奶量和乳成分的影响,试验测定北京地区5个牛场1 691头中国荷斯坦泌乳母牛连续2 d上午和下午的直肠温度(RT)、体况评分(BCS)以及当月泌乳性能(DHI数据),在固定模型中考虑了测定年、场(年场效应)、胎次和泌乳阶段三个分类效应,且将下午直肠温度(RT_2)、上午下午直肠温度差(△RT)和BCS作为回归协变量。结果表明:校正奶量和日奶量对RT_2回归均极显著(P<0.01);△RT_2对日奶量有显著(P<0.05)的影响,对校正奶量有极显著(P<0.01)的影响;RT_2、△RT对乳脂率、乳蛋白率和脂蛋比均有显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)影响,乳脂率和脂蛋比随着RT_2的升高而增大,随着△RT的增大而减小;而乳蛋白率随着RT_2的升高而减小,随着△RT的增大而增大。说明直肠温度作为奶牛热应激反应较好的量化指标,同时与奶牛泌乳性能有密切关系,可以将其作为管理指标,密切监测提高管理效率。 展开更多

关键词 奶牛 直肠温度 产奶量 乳脂率 乳蛋白率 脂蛋比

原文传递

步态评分对泌乳性能、体况评分和体细胞的影响 被引量：3

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作者 杨影 吴帆 +7 位作者 师睿 张海亮 宋朗 王晔 罗汉鹏 徐伟 郭刚 王雅春 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第3期1-4,251,共5页

为了探究步态评分对奶牛校正日产奶量、体况评分和体细胞数的影响,以量化肢蹄健康对奶牛生产性能的重要作用和日常饲养管理中预防肢蹄病的重要性,试验应用最小二乘法原理,配合线性固定效应模型,分析了步态评分等级对1 070头奶牛校正日... 为了探究步态评分对奶牛校正日产奶量、体况评分和体细胞数的影响,以量化肢蹄健康对奶牛生产性能的重要作用和日常饲养管理中预防肢蹄病的重要性,试验应用最小二乘法原理,配合线性固定效应模型,分析了步态评分等级对1 070头奶牛校正日产奶量、体况评分和体细胞数的影响。结果表明:步态评分对校正日产奶量影响极显著(P<0.01),步态评分≥2分的牛群与步态评分为1分的牛群相比,其校正日产奶量降低了6.95 kg;步态评分对体况评分影响显著(P<0.05),即步态评分越低体况评分越高;而且步态评分与体况评分对泌乳天数的回归关系的互作效应极显著(P<0.01),即步态评分为1分时体况评分随着泌乳天数的增加而上升,而步态评分大于1分时体况评分随着泌乳天数的增加而下降;对体细胞数而言,步态评分的影响虽然不显著,但是体细胞数有随着步态评分升高而增多的趋势。说明通过适宜的饲养管理保证牛群肢蹄健康和良好步态对奶牛生产性能和牛场经济效益是非常重要的。 展开更多

关键词 步态评分(LMS) 校正日产奶量(HTACM) 体况评分(BCS) 体细胞数(SCC) 奶牛 相关性

原文传递

基于荷斯坦牛群体基因组数据填充软件的准确性比较(Minimac 3与Beagle 5.1) 被引量：2

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作者 罗汉鹏 窦金焕 +2 位作者 安涛 陈少侃 王雅春 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第5期1664-1671,共8页

为探究基因组数据填充软件准确性的影响因素和展示填充具体过程,本研究使用两款主要填充软件Beagle 5.1和Minimac 3对奶牛基因组50K芯片数据进行填充至150K,使用个体的填充结果和真实数据进行填充一致性计算,比较两软件的填充准确性和... 为探究基因组数据填充软件准确性的影响因素和展示填充具体过程,本研究使用两款主要填充软件Beagle 5.1和Minimac 3对奶牛基因组50K芯片数据进行填充至150K,使用个体的填充结果和真实数据进行填充一致性计算,比较两软件的填充准确性和一致性的差异及其主要影响因素。研究结果表明,Minimac 3软件需要使用其他软件进行基因定向后再进行填充,而Beagle 5.1软件可同时进行基因定向和基因组填充。Beagle 5.1与Minimac 3软件填充一致性的相关系数为0.98;Beagle 5.1软件平均填充的准确性(r^(2))为0.9841,一致性为0.9914,填充准确性与一致性的相关系数为0.39;Minimac 3软件平均填充的准确性为0.9782,一致性为0.9911,填充准确性(r^(2))和一致性的相关系数为0.36。由于软件计算填充准确性原理问题,填充的准确性(r^(2))受最小等位基因影响较大。填充的一致性在最小等位基因频率和位点杂合度上升时均呈下降趋势,当位点杂合度>0.6时显著下降(填充一致性低于0.8),但Beagle 5.1软件的填充效果在相同的最小等位基因频率和杂合度下均优于Minimac 3软件。本研究发现填充准确性(r^(2))受填充位点的杂合度影响较大,而Beagle 5.1软件进行基因组数据填充的准确性更高,基因组数据填充后使用填充一致性作为填充准确性的判断标准可避免删除过多有效填充位点。 展开更多

关键词 荷斯坦牛 群体 基因组填充 准确性

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单位代谢体重产奶量的非遗传因素分析 被引量：2

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作者 师睿 徐伟 +7 位作者 罗汉鹏 鄢新义 董刚辉 栾汝鹏 张震 王新宇 郭刚 王雅春 《中国奶牛》 2017年第1期16-21,共6页

为了更客观地衡量奶牛泌乳性能,本研究分别对荷斯坦牛4%乳脂校正日奶量(FCM)、305d产奶量(305M)、单位代谢体重4%校正日奶量(FCM/MBW)和单位代谢体重305d产奶量(305M/MBW)进行了非遗传因素分析。于2014年和2015年收集了分别位于河南、... 为了更客观地衡量奶牛泌乳性能,本研究分别对荷斯坦牛4%乳脂校正日奶量(FCM)、305d产奶量(305M)、单位代谢体重4%校正日奶量(FCM/MBW)和单位代谢体重305d产奶量(305M/MBW)进行了非遗传因素分析。于2014年和2015年收集了分别位于河南、北京两个地区的3个荷斯坦牛场685头泌乳牛的生产性能相关资料。使用SAS9.4软件的GLM过程,初步分析了场-年、胎次、泌乳阶段及其互作对上述指标的影响。结果显示,不同场-年305M差异极显著(P<0.01);305M与奶牛体重(BW)和体重二次项(BW2)有回归关系(回归系数分别为4.22、-4.23),但不显著(P>0.05);胎次对FCM/MBW及305M/MBW影响均不显著(P>0.05),且泌乳阶段也不影响305M/MBW(P>0.05)。本研究提出的FCM/MBW及305M/MBW能反映奶牛泌乳效率,且本研究结果显示305M/MBW只受场-年效应影响,因而这个指标用于衡量泌乳性能更客观。 展开更多

关键词 代谢体重 FCM 305M 泌乳效率 单位代谢体重日产奶量

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不同选育方法对北京油鸡趾数性状育种效果的影响

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作者 初芹 晏志勋 +5 位作者 罗汉鹏 张剑 张尧 王海宏 耿爱莲 刘华贵 《中国家禽》 北大核心 2022年第2期19-23,共5页

为研究不同选育方法对北京油鸡趾数性状的育种效果,选择两个北京油鸡群体,分别对应五趾性状的分子选育和表型选育,同时以随机选育的保种群作为对照,比较了三个群体趾数类型的差异。结果发现,分子选育和表型选育,全群中双侧五趾个体比例... 为研究不同选育方法对北京油鸡趾数性状的育种效果,选择两个北京油鸡群体,分别对应五趾性状的分子选育和表型选育,同时以随机选育的保种群作为对照,比较了三个群体趾数类型的差异。结果发现,分子选育和表型选育,全群中双侧五趾个体比例分别达到92.59%和81.77%,比随机选育提升了13.99%和3.17%,分子选育的育种效果更明显。分子选育群中双侧多趾类型占全群比例累计达到了95.20%,极显著高于其它两个群体(P<0.01);并且在双侧多趾类型中,双侧五趾个体占比提高(P<0.01),而单五单六和双侧六趾个体的占比显著降低(P<0.05)。结果表明,鸡2号染色体rs80659072位点作为北京油鸡五趾性状遗传标记进行应用,育种效果显著。相比表型选育而言,分子选育可快速提升双侧五趾类型的比例,有助于降低六趾个体比例,提升趾数的一致性。 展开更多

关键词 北京油鸡 多趾 分子标记辅助选育 表型选育 随机选育

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新疆地区中国荷斯坦牛种公牛遗传评估

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作者 张梦华 罗汉鹏 +7 位作者 魏趁 胥磊 王丹 张晓雪 谭世新 李红燕 黄锡霞 王雅春 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第11期72-77,共6页

收集2010—2015年新疆地区的1557头中国荷斯坦种公牛的54085头女儿922753条DHI测定日记录数据,用于中国荷斯坦牛种公牛的后裔测定。运用SAS 8.1软件进行最小二乘分析和泌乳曲线拟合,从而确定测定日模型中的固定效应和子模型,利用DMU软件... 收集2010—2015年新疆地区的1557头中国荷斯坦种公牛的54085头女儿922753条DHI测定日记录数据,用于中国荷斯坦牛种公牛的后裔测定。运用SAS 8.1软件进行最小二乘分析和泌乳曲线拟合,从而确定测定日模型中的固定效应和子模型,利用DMU软件DMUAI模块结合随机回归模型估计方差组分。结果表明,胎次、测定场、产犊年份、产犊季节和泌乳天数均对产奶性状有极显著影响,各胎次泌乳曲线拟合度在0.9401~0.9804之间,新疆地区中国荷斯坦牛305 d产奶量、乳脂量、乳蛋白量和体细胞评分的遗传力在0.07~0.22之间,根据CPI2获得了排名前10的优秀种公牛,进而为推广应用优秀种公牛冻精提供数据支撑。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 遗传评估 种公牛

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宁夏地区荷斯坦牛青年牛繁殖性状遗传参数估计 被引量：17

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作者 陈紫薇 师睿 +7 位作者 罗汉鹏 田佳 魏趁 张伟新 李委奇 温万 王雅晶 王雅春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期344-351,共8页

旨在探究青年牛繁殖性状遗传能力群体遗传参数,评估不同配种季节间青年牛繁殖性状基因型与环境的互作效应(G×E)。本研究利用宁夏地区12个牧场2007—2019年荷斯坦牛繁殖事件信息记录,计算青年牛繁殖性状包括:首配日龄(AFS)、初产日... 旨在探究青年牛繁殖性状遗传能力群体遗传参数,评估不同配种季节间青年牛繁殖性状基因型与环境的互作效应(G×E)。本研究利用宁夏地区12个牧场2007—2019年荷斯坦牛繁殖事件信息记录,计算青年牛繁殖性状包括:首配日龄(AFS)、初产日龄(AFC)、首次配种后56天不返情率(NRR56)、首末次配种间隔(IFL)、妊娠期长短(GL)和首次配种受胎率(CR)共30645~44888条表型值数据。通过DMU软件的DMUAI模块使用单性状动物模型估计性状遗传力,使用双性状动物模型估计性状间遗传相关和不同配种季节间同一繁殖性状的基因型与环境互作程度(不同环境下同一性状间的遗传相关,r)。结果表明,AFS遗传力为0.483±0.013,AFC遗传力为0.231±0.015,青年牛NRR56、IFL、GL、CR遗传力及标准误分别为0.031±0.007,0.038±0.008,0.216±0.017和0.031±0.007;青年牛IFL、GL与AFC间有显著正相关(IFL-AFC:0.812±0.019,P<0.05;GL-AFC:0.119±0.053,P<0.05),NRR56和CR与AFC间有显著负相关(NRR56-AFC:-0.274±0.086,P<0.05;CR-AFC:-0.532±0.065,P<0.05)。除IFL在夏季与秋季间和CR、NRR56、IFL在秋季与冬季间无基因型与环境互作效应外(r>0.8),CR、NRR56、IFL在其他季节间均存在基因型与环境互作效应(r<0.8)。在CR中,春季配种与冬季配种间的遗传相关最低,在NRR56、IFL中则是春季配种与秋季配种的遗传相关最低。结果显示,青年牛生长发育能力和妊娠维持能力具有较大遗传选育潜力,而受胎能力易受环境影响。青年牛繁殖性状的遗传表现存在基因型与环境互作效应。因此,在进行遗传评定时需要考虑配种时的气候环境差异,优化评估模型以提高育种实践中遗传选育的准确性。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 青年牛 繁殖性状 遗传参数 基因型与环境互作

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冷热应激对北京地区荷斯坦牛产奶性能及血液生化指标的影响 被引量：33

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作者 胡丽蓉 康玲 +7 位作者 王淑慧 李玮 鄢新义 罗汉鹏 董刚辉 王新宇 王雅春 徐青 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第19期3791-3799,共9页

【目的】分析冷热应激对北京地区荷斯坦牛产奶性能和血液生化指标的影响,评估可指示荷斯坦牛冷热应激反应的候选血液生化指标,为该地区奶牛的生产管理及耐应激个体选育提供理论依据。【方法】本试验以北京市三元绿荷金银岛牧场的健康泌... 【目的】分析冷热应激对北京地区荷斯坦牛产奶性能和血液生化指标的影响,评估可指示荷斯坦牛冷热应激反应的候选血液生化指标,为该地区奶牛的生产管理及耐应激个体选育提供理论依据。【方法】本试验以北京市三元绿荷金银岛牧场的健康泌乳荷斯坦牛为研究对象,连续监测了热应激期(2014年8月份)、非应激期(2014年11月份)和冷应激期(2015年1月份)牛舍THI,并分别采集了178头、120头和126头荷斯坦牛的血样,测定了14种血液生化指标,同时收集了试验个体的7项产奶性能数据,采用SAS9.2中的MIXED模型分析了荷斯坦牛在冷热应激下产奶性能和血液生化指标的变化规律,并通过Logistic过程分析了荷斯坦牛在冷热应激下显著变化的血液生化指标指示奶牛个体冷热应激反应的准确性。【结果】牛舍8月份的平均温度为31.80℃,平均THI达到了81.57,且该月THI大于78持续时间超过8 h的天数达到了21 d,表明本试验群体在8月份长期处于中度热应激状态;11月份的平均温度为12.76℃,该月平均THI为55.43,表明本试验群体在11月份处于非应激状态;1月份的平均温度为-6.70℃,平均THI为25.63,且该月有21 d的温差大于12℃,表明试验群体在1月份处于较严重的冷应激状态。与非应激期比较,热应激下荷斯坦牛AMY下降了1.34 kg,奶样中FP、PP、F/P和SP极显著降低(P<0.01),LP显著降低(P<0.05),SCS则极显著增加(P=0.01);血清中GH、LD、PRL和SOD极显著升高(P<0.01),而BUN、CRP、LDH、LPO、NE和K^+极显著降低(P<0.01);ROC曲线分析显示PRL、GH和CRP的AUC值大于0.80,分别为0.91、0.85和0.83。与非应激期比较,冷应激下荷斯坦牛AMY下降了1.13 kg,奶样中FP和SP极显著下降(P<0.01),F/P显著下降(P<0.05),SCS则极显著增加(P<0.01);血清中COR、CORT和K^+极显著升高(P<0.01),而CRP、DA、GH、PRL和SOD极显著降低(P<0.01),ATCH显著降低(P<0.05);ROC曲线分析显示仅SOD的AUC值大于0.80,其值为0.84。【结论】研究结果表明北京地区荷斯坦牛在8月份和1月份均处于较严重的应激状态,且冷热应激已极大地影响了该地区荷斯坦牛的产奶性能和生理状态,PRL和GH可作为监测荷斯坦牛早期热应激的候选指示指标,SOD可作为监测荷斯坦牛早期冷应激的候选指示指标。 展开更多

关键词 荷斯坦牛 冷热应激 产奶性能 血液生化指标

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中国荷斯坦奶牛体况评分及其影响因素分析 被引量：7

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作者 巨星 黄锡霞 +4 位作者 葛建军 张晓雪 罗汉鹏 帕尔哈提·木铁力甫 马光辉 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2019年第4期49-52,共4页

为及时发现饲养管理中存在的问题并掌握奶牛的营养状况,本研究对呼图壁种牛场3个牧场的3 289头荷斯坦牛进行体况评分,对场、胎次、月龄嵌套胎次以及泌乳阶段等因素对奶牛体况评分的影响进行方差分析。结果表明:不同场、月龄嵌套胎次、... 为及时发现饲养管理中存在的问题并掌握奶牛的营养状况,本研究对呼图壁种牛场3个牧场的3 289头荷斯坦牛进行体况评分,对场、胎次、月龄嵌套胎次以及泌乳阶段等因素对奶牛体况评分的影响进行方差分析。结果表明:不同场、月龄嵌套胎次、泌乳阶段对体况评分的影响极显著(P<0.01),胎次对体况评分影响显著(P<0.05)。在实际生产过程中,要结合牛场本身的实际情况以及奶牛的生理时期和泌乳阶段的体况评分来调整饲养管理水平,以提高奶牛的生产性能。 展开更多

关键词 体况评分 荷斯坦奶牛 泌乳阶段 月龄 胎次

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中国荷斯坦牛产后0～35d繁殖疾病遗传参数估计 被引量：6

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作者 董祎鑫 李想 +5 位作者 亓建刚 罗汉鹏 窦金焕 刘林 李锡智 王雅春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期280-286,共7页

旨在估计中国荷斯坦牛产后0～35d的繁殖疾病遗传参数。本研究收集了1993-2017年间北京地区27个场中国荷斯坦牛产后0～35d25 026条繁殖疾病记录,统计分析发病规律,采用阈模型和线性模型,以场年、胎次和产犊季节为固定效应,个体加性遗传... 旨在估计中国荷斯坦牛产后0～35d的繁殖疾病遗传参数。本研究收集了1993-2017年间北京地区27个场中国荷斯坦牛产后0～35d25 026条繁殖疾病记录,统计分析发病规律,采用阈模型和线性模型,以场年、胎次和产犊季节为固定效应,个体加性遗传效应和永久环境效应为随机效应得到遗传参数来探究中国荷斯坦牛产后0～35d繁殖疾病遗传规律,同时尝试单独对子宫疾病进行遗传参数估计。结果显示,奶牛产后0～35d繁殖疾病记录占整个泌乳期繁殖疾病记录的54%;使用线性模型和阈模型所得奶牛产后0～35d遗传力分别为0.015 2(0.001 9)和0.094 4(0.01),使用SAS计算两个模型繁殖疾病EBV排名秩相关达95%(P<0.01);在繁殖疾病中,子宫疾病占48%,且主要集中于产后0～35d,利用线性模型估计得到产后0～35d子宫疾病遗传力为0.010 7(0.001 6)。根据线性模型得到的EBV计算繁殖疾病遗传趋势,发现自2000年以来,公母牛繁殖疾病、子宫疾病估计育种值均呈现下降趋势。本研究结果可为中国荷斯坦牛繁殖疾病的遗传育种工作提供参考。 展开更多

关键词 繁殖疾病 子宫疾病 遗传参数 阈模型

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荷斯坦牛泌乳早期体细胞数对生产性能的影响及遗传参数估计 被引量：3

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作者 竹磊 张海亮 +5 位作者 陈少侃 安涛 罗汉鹏 刘林 黄锡霞 王雅春 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期403-414,共12页

【目的】探究荷斯坦牛泌乳早期(6—35 d)体细胞数(SCCel)的群体特征及其与不同泌乳阶段体细胞数(SCC)及产奶量(MY)之间的关系,并对荷斯坦牛泌乳早期体细胞评分(SCSel)进行遗传参数估计,以期为我国荷斯坦牛乳房炎抗性选育提供新的思路。... 【目的】探究荷斯坦牛泌乳早期(6—35 d)体细胞数(SCCel)的群体特征及其与不同泌乳阶段体细胞数(SCC)及产奶量(MY)之间的关系,并对荷斯坦牛泌乳早期体细胞评分(SCSel)进行遗传参数估计,以期为我国荷斯坦牛乳房炎抗性选育提供新的思路。【方法】收集了141个牧场2008—2018年182 378头牛的2 783 046条生产性能测定记录。质控后,共得到150 864头牛的1 869 976条测定日记录。将有表型的母牛至少向上追溯三代(父母、祖父母、外祖父母),通过追溯,获得用于遗传分析的系谱文件,共包含6 451头公牛和103 452头母牛。利用SAS软件的GLM过程分析了牧场测定规模、测定季节、测定年份、泌乳天数、胎次等因素对SCSel的影响;利用SAS软件的REG过程分别分析了SCSel与不同泌乳阶段的SCS和日产奶量之间的回归关系;基于DMU软件,使用单性状重复力动物模型、单性状动物模型和双性状动物模型分别估计了SCSel的遗传参数。【结果】荷斯坦牛产后前2周SCCel变化幅度较大,荷斯坦牛SCCel随着泌乳天数的增加呈逐渐下降的趋势;牧场规模、测定季节、胎次和泌乳天数均对SCSel有显著影响(P<0.05),泌乳早期年均测定规模1 000头以上牧场的奶牛SCSel显著(P<0.05)低于年均测定规模1 000头以下的牧场。SCSel随胎次的增加呈先下降后上升的趋势,奶牛在夏季SCSel最高,在冬季最低。SCSel与泌乳期各测定日SCS之间均存在极显著的回归关系(P<0.01),回归系数范围为0.06—0.19;SCSel与泌乳期各测定日产奶量之间均存在极显著的回归关系(P<0.01),回归系数范围为-0.46—-0.16,泌乳早期SCSel对泌乳期乳房健康状况及生产性能均有影响。荷斯坦牛1胎、2胎、3胎及各胎次SCSel的遗传力分别为0.05±0.005、0.07±0.01、0.04±0.01和0.03±0.01,SCSel为低遗传力性状;不同胎次的SCSel性状之间存在中高遗传相关,遗传相关估计范围为0.54—0.87。【结论】荷斯坦牛泌乳早期(6—35 d)SCC受胎次、季节等影响,泌乳早期SCC具有不同于泌乳期测定日SCC的群体特征;泌乳早期SCC处于较高水平会影响荷斯坦牛在随后整个泌乳期内的健康状态和生产性能。本研究为牧场在母牛产后利用SCCel进行差异化管理提供了理论依据,为探究荷斯坦牛在泌乳早期体细胞数差异的遗传机制奠定了基础,通过开发泌乳早期SCS新性状有助于完善我国荷斯坦牛乳房炎抗性选育。 展开更多

关键词 荷斯坦牛 泌乳早期 体细胞数 产奶量 遗传参数

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